ta-siRNA 317 details

ID317
SequenceAACCGCATCGGGCCGCATCAGACC 

Targets of siRNA 317

LuluDB transcript

Target start position

Target end position

Target sequence

BLAST target sequence

Target details

Ll_transcript_237338; 42 65 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_178502; 538 561 GGTTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_23934; 124 147 AGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_23367; 491 514 GGCTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_126298; 23 46 GGCTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_126289; 23 46 GGCTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_110515; 145 167 CATCGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_178502; 507 530 TGTCTGATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_71475; 18 41 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_249944; 100 123 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_193832; 1725 1748 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_193835; 2144 2167 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_101275; 37 60 GGTCTAATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_123011; 194 217 ATACTGATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_66777; 1 22 ATCGATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_43911; 100 123 GGTCTGATGCGGCCTGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_43920; 100 123 GGTCTGATGCGGCCTGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_43902; 109 132 GGTCTGATGCGGCCTGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_29455; 50 73 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_178498; 38 61 GGTCTGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_129110; 208 231 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_85692; 124 147 GGTCTGATGCGGCCCGATGGGGTT BLAST
Ll_transcript_238476; 95 118 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGATT BLAST
Ll_transcript_139064; 751 774 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_69181; 64 87 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_69180; 64 87 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_69176; 64 87 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_69168; 265 288 AGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_29452; 1 23 GTCTGATGCGGCCCGACGCGGTT BLAST
Ll_transcript_121894; 100 123 GTTGCGATGCGGCCTGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_227056; 91 114 GGTATGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_268168; 375 398 GGGCCGATGCGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_234589; 302 325 CCTTTGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_234596; 302 325 CCTTTGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_234592; 302 325 CCTTTGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_42843; 28 50 CATCGATGCGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_200987; 247 269 TATCGATGCGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_20812; 12 34 CATCGATGCGGCCTGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_198037; 34 57 GGTTTGGTGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_178498; 59 82 GTTGCGTTGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_197075; 377 400 GGTTGACTGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_178497; 35 58 GTTGCGTTGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_235392; 951 974 GTTACGTTGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61172; 941 964 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61181; 1021 1044 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61194; 941 964 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61202; 1021 1044 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61185; 1073 1096 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61186; 941 964 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61198; 1021 1044 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61187; 1073 1096 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61190; 1540 1563 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61173; 1616 1639 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61175; 1652 1675 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61199; 1728 1751 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61184; 1540 1563 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61167; 1616 1639 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61203; 1652 1675 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_61193; 1728 1751 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_106580; 51 74 GGTCTGATGTGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_58526; 814 837 GGTCTGATGTGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_235391; 78 101 GGTCTGATGTGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_217867; 591 614 GGTCTGATGTGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_105306; 1 23 GTCTGATGTGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_209985; 36 59 GGTCTGATGCAGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_121893; 140 163 GGTCTGATGTGGCGCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_122077; 963 986 GGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_122076; 780 803 GGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_122071; 963 986 GGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_122084; 963 986 GGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_122080; 963 986 GGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_90372; 81 104 GGTTTGATACGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_214101; 80 104 GGTTGTGTTGCGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_92332; 147 171 GGTTGTGTTGCGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_92331; 175 199 GGTTGTGTTGCGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_90365; 278 301 ATTCTGATGTGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_90371; 68 91 AGTCTGATGCAGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_127410; 10 33 AATTTGATGCGGCCCGATGCGGCC BLAST
Ll_transcript_54977; 171 194 GTTGCGTTGCGGCTCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_62375; 792 815 AATTTGATGTGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_42608; 152 175 GTTGCGTTGCAGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_197075; 502 526 GGTTCCACTGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_437520; 540 563 GGTTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_294752; 143 166 AGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_404720; 70 93 GGCTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_528942; 316 339 ATACTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_528941; 316 339 ATACTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_528940; 316 339 ATACTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_528945; 316 339 ATACTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_340958; 43 65 CATCGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_363214; 57 79 CATCGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_437520; 509 532 TGTCTGATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_473293; 182 205 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_483979; 45 68 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_355402; 6 29 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_526856; 5 28 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_473274; 96 119 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_305990; 539 562 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_366821; 85 108 GGTCTGATCCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_500125; 44 67 GGTCTAATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_499085; 380 403 GGTCTAATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_515121; 83 106 GGTCTGATACGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_378127; 798 821 GGTCTAATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_424159; 10 33 GGTCTAATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_424162; 10 33 GGTCTAATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_377007; 194 217 GGTATGATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_417144; 132 155 ATACTGATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_501251; 171 194 GGTCTGATGCGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_378119; 390 413 GGTCTGATGCGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_378106; 390 413 GGTCTGATGCGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_528926; 44 67 GGTCTGATGCGGCCTGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_528925; 44 67 GGTCTGATGCGGCCTGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_526873; 33 56 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_306306; 159 182 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_473277; 182 205 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_514077; 65 88 GGTCTGATGCGGCCCGACGCGGTT BLAST
Ll_transcript_405011; 729 752 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_405008; 989 1012 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_405022; 1121 1144 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_526876; 837 860 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_362920; 862 885 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGATT BLAST
Ll_transcript_362932; 878 901 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGATT BLAST
Ll_transcript_362929; 968 991 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGATT BLAST
Ll_transcript_405019; 1674 1697 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_526880; 837 860 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_526886; 837 860 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_405012; 2274 2297 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_526869; 837 860 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_437517; 95 118 AGTTTGATGCGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_437518; 95 118 AGTTTGATGCGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_466061; 309 332 AGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_318773; 106 129 GTTGCGATGCGGCCTGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_318770; 106 129 GTTGCGATGCGGCCTGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_318772; 106 129 GTTGCGATGCGGCCTGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_359248; 403 426 GGGCCGATGCGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_310678; 641 664 CCTTTGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_310686; 641 664 CCTTTGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_310679; 641 664 CCTTTGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_310673; 641 664 CCTTTGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_310684; 641 664 CCTTTGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_310685; 641 664 CCTTTGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_310683; 641 664 CCTTTGATGCGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_378119; 432 455 GTCCAAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_366827; 47 70 GGTTTGGTGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_528942; 337 360 GTTGCGTTGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_528941; 337 360 GTTGCGTTGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_528940; 337 360 GTTGCGTTGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_528945; 337 360 GTTGCGTTGCGGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_344993; 338 361 GGTTGACTGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_344990; 367 390 GGTTGACTGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_284253; 100 123 GTTACGTTGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_312705; 941 964 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_312703; 1021 1044 GGCCTAATGTGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_291736; 64 87 GGTCTGATGTGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_522566; 51 74 GGTCTGATGTGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_533170; 492 515 GGTCTGATGTGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_533151; 495 518 GGTCTGATGTGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_533156; 498 521 GGTCTGATGTGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_312070; 47 70 GGTCTGATGTGGCGCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_415691; 932 955 GGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_415692; 932 955 GGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_415688; 1672 1695 GGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_415690; 1672 1695 GGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_415684; 1672 1695 GGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_415685; 1672 1695 GGTCTGATGGGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_316384; 91 114 GGTTTGATACGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_316385; 91 114 GGTTTGATACGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_319811; 66 90 GGTTGTGTTGCGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_319813; 79 103 GGTTGTGTTGCGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_526874; 145 169 GGTTGTGTTGCGGTCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_319810; 79 103 GGTTGTGTTGCGGCCCGATGTGGTT BLAST
Ll_transcript_291315; 66 89 ATTCTGATGTGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_291303; 66 89 ATTCTGATGTGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_291328; 66 89 ATTCTGATGTGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_291325; 66 89 ATTCTGATGTGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_291321; 66 89 ATTCTGATGTGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_291305; 66 89 ATTCTGATGTGGCCCGATGCAGTT BLAST
Ll_transcript_482974; 1004 1027 AGTCTGATGCAGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_482976; 1226 1249 AGTCTGATGCAGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_378126; 86 109 GATGTGATGTGGTCCGATGCGGTT BLAST

Expression of siRNA 317


Labels

FPAB_1 abscising flower pedicels (replicate 1)      PAB_1 abscising pods (replicate 1)      PW2_1   pods wall stages 4-6 (replicate 1)
FPAB_2 abscising flower pedicels (replicate 2)      PAB_2 abscising pods (replicate 2)      PW2_2   pods wall stages 4-6 (replicate 2)
FPNAB_1   non-abscising flower pedicels (replicate 1)        PNAB_1   non-abscising pods (replicate 1)        PW3_1   pods wall stages 7-8 (replicate 1)
FPNAB_2   non-abscising flower pedicels (replicate 2)        PNAB_2   non-abscising pods (replicate 2)        PW3_2   pods wall stages 7-8 (replicate 2)
LF1_1 lower flowers stage 1 (replicate 1)      PS1_1 seeds stages 1-3 (replicate 1)      UF1_1 upper flowers stage 1 (replicate 1)
LF1_2 lower flowers stage 1 (replicate 2)      PS1_2 seeds stages 1-3 (replicate 2)      UF1_2 upper flowers stage 1 (replicate 2)
LF2_1 lower flowers stage 2 (replicate 1)      PS2_1 seeds stages 4-6 (replicate 1)      UF2_1 upper flowers stage 2 (replicate 1)
LF2_2 lower flowers stage 2 (replicate 2)      PS2_2 seeds stages 4-6 (replicate 2)      UF2_2 upper flowers stage 2 (replicate 2)
LF3_1 lower flowers stage 3 (replicate 1)      PS3_1 seeds stages 7-8 (replicate 1)      UF3_1 upper flowers stage 3 (replicate 1)
LF3_2 lower flowers stage 3 (replicate 2)      PS3_2   seeds stages 7-8 (replicate 2)        UF3_2 upper flowers stage 3 (replicate 2)
LF4_1 lower flowers stage 4 (replicate 1)      PW1_1   pods wall stages 1-3 (replicate 1)        UF4_1 upper flowers stage 4 (replicate 1)
LF4_2 lower flowers stage 4 (replicate 2)      PW1_2   pods wall stages 1-3 (replicate 2)        UF4_2 upper flowers stage 4 (replicate 2)