| Id Trinity | FTRINITY_DN54624_c3_g4_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_1160 |
| Sequence | GGCTGTTGTTGCCAGTTACTCTTGACTGTCGACCCCAGTGATTAAGACTTGGTTGTTGTTGTTGCACATGGTCAATTTCAAGATATAAATATTTTACCCA GATGTGTGGTGGTTCATGTCTGAATGATGCTTAATTAAATCTGTTCAGCCATTTTGTGAGTAACCTTGGATTCAGTGTCTAGCTACGGTAACCTGATTGG CATCTTTAAAGCTGTTAACTAGTCCATATCAAAAGATATCTTACTTGCTCGCAATTTGGATGTGCCCCATTTCTGAGGGTTAACAATTTAACATAACACA CACAAAGGCTAAGTTAAAATGTGCTGCTCTGATGAGATTCCAAATGTTGAGCAATTGTTATTATACAATGTTACAATCTTGTGGCCTGATAATTATATAC CATGCTTCTCAGGGTTAGGAGGAGGAGCCATTACCTTGTAGAAATCTTATGTTAACTATTGAATTCACCTGTCTCCTTGAGCCATCTGGTTTTATTATCT ATTCATATGACCTCAAAGTTTCCAATTCCAACATATTATACATTTGACTGAAGATGAAAGACTGTTATTTTCTGAAGTGTGGTGCAGCATGGCTTATACT TCAATGCTGTTGTAGAATCTTTATGATCAAGATTGTTTGCTCAACTTATTTACCTTGCAGTCTTGGACTTCTATGAATGAGCTATAGTGAAAGAAATGAG CCACTTGACCTTATTTTTGTTAGATATCTTCATTATTGTAGACTTCAAAATGTCTAAAATCAACAGAGGGGGGTCTAGCCTCTGTCCACTGTCATCAATT GAAGCCATTTGAAAGGTAAGGAGAACGAAATATTTCTACCCGCCTATTAGTTGGAATGATGATATGAAATTTAATGCATGAAAGGAAAGGACATCATGCA TGGACATGGCATAAAAAGTTGAGGAAAATGAAATTGGAGCTATAGATGTAATTGCATTTATACTTCAAATAGCCTCTGTATACTGAGGCATGTTCTTCAT TCATTCCGTGGCAGAGTGTGGAAAAAATAGTTTCAAGTAGAATCAGCAAAAGTAGAAAGGCTAAAATCTACTTTGATCATGGTTATATAGCCACTAGTAA GAGAGGGTAATGTTATGGTAGGAAAAGAAATAAAATTAAAACTTATGGGTCTTAAATTAATAAAGTTGGCACACTATATAGTGGTCCTAAATTCACCCAT CTTGCTCCACTATAGGGGACCTGGGCAGTTGGCACATCCATTGAGATCTAACTTCTGAGCTGTTTTTGGTTGTTTTAGTTTCCTTTTCGGTCTTTAACTA ATTTTTTGATCTGGTTTATGTTTACTTTCAGTTTAACGGATTTACCTAAATAATGGGGCCTGAAACAAGTAAATATAAGAGCCAATATCTGCAAACTTCC TTCCTCCAAATTATGTATAACTCTTTCTACCTTTTTTACCTTTGTCATAAAATGTCAAAGTTAACAAAAATAGTGGCACATGGAGTTAACATCATATTTT CTTGGGTCCTGAATGGCCCTAAAAACACTTGTTCATGAATGCAAAGATAGAAAACCTTGAATATACCATTTCATTTTTCTGATGCAATATTTTTGGGTTT AAAAAAAACTCATGTGCAAAAACCCATATTGCAATTAAAGGTTTTTTTAACATCATATTGCAAAAACCCATATCGCAACTCTTTGTTTGATTCCTCTCAA TTTTGTCTATCTCCCTCTTAATCTTTCTTCATCTGTAAATTAGAGAGTGAAGTTTGAAACTTTTTTGAATTGGGTCAAAAAATCACGAGGAAAAGTCTGT AACTTTGTTGAGATAAGAGAAACTAGAAAGTTTTGATTTTAACTTTAAGAGAGAGAGAAAAGAAAGGATGAAGATTCAATGTAACGTGTGTGAAGCTGCA GAGGCTAAGGTCCTGTGCTGTGCAGATGAGGCAGCACTGTGCTGGGAATGTGATGAGAAGGTTCATGCAGCTAACAAGCTCGCTAGTAAGCACCAGAGAG TCCCTCTTTCTATTTCAGCTTCTCCGATGCCCAATTGTGACATATGTCAGGTACCTACCTTCGATATTCTTCAATGAATATGTGGATTGTGGAATCATAT ATTGGGCATGTATGTGTATCATTGCACTTTAGTGTATAGATTGTAGAATCAATTAACTTTGCTAAATTTTCGGAAATAGAACATGGGGTATGATCAGAAG ATGGTGTAATACACTGCAAGATACTTACAAGGTTACTATTGCTAGCTTGTAATCCTAATGCTGCTGATTTTGGTATTCAGTAATGTAGTACTAATATGGA TTTCTCTTATCTATTAGGATACCTAAAACTTCGACTGATCTGTTTAATAGTGCTTTTACTTTATAATCTCACTTTGCATTTAGTGAGAAATGCATCCTAT TTGATATTGTAAATTGTGTAAATTGCATCCACTTTAATTTTATTGGAGAAGATTCACACATATAACTTCAGTCTTTATGGAAGATATAATCTCACATTTG AATATCTTTTTGGAGCTTGAAAAATCCTTCTCTATCCAGTGTTCTTTTATGTTTGATTAATACTTGACATCTGCAGAATCTGACATAAACTTTATTCTGT TGTTATACAAAGACCAGTGCTCTTTTATTTAACCTCTGGGATTTATGTAGTGATATCATCATCGTCTTGACATCTCCATTTAATGTATTTGTAAATTTTG TCACGCCAATCTTCATGCGACTCGGATCCATTGTTGGCCTTGTTGTTGAGTATGAACCTTCTTGTTTTGTTATTTGCTATGGTTCTGTTATATATGTTTT GAGTATCTCCCATTTTAGATAGCTCGTGATGGTAAAGTCTGCTGCTACTTACAGGATACAGTTGGCTATTTCTTCTGTTTGGAGGATCGGGCTTTACTAT GCAGGAATTGTGATGTAGTAATACACACAGTAAATGCCCATGTCTCTGCACATCAAAGGTTTCTGCTTACTGGTGTAAGAGTAGGCCTTGAAGCTACCAA GCCTGGTTCTTCCACATCTCTTGCAAAATCACATTCTGAGGAGAAAATTTCAAACACTAAATCTTCTTCCATCTCAGGAAATGTTTCCCCAATGCCTCAG CCATTCAATCACAATGAAGTGTTACCCATTCAAGTTGGAAGAGTTGGGGAGTTTCCACCACCTAAAGTGTCCTATGGTGTTGATTCTACAGTTGGAAACG TCTCGCACTGGCCCGTTGATGAATTTCCGTGGTTGAGTGAGTTCGGTCAGAATTATAATTGCATGAGTGGATCATCCAAGGTACGTTTATGATTGCAATA TAACCTTTGGGGTCCCCTGTTCATATTCACATACATTGCACAGAATTGAACAAGTGGTGCTTGTGAGTCTGTTTCCTAGAGCTTTGCTCTTTGATAAAGG TGTAACAATGATTTCCCTTTGAGCTCCATTCTTTCCTGATGAACTTATGCAGGTTGACAGTGGTAAACTTTGGGATTCTGATTCTTCTCTTGTAAGAACG TGTGAAGCGGAAATGGACAATGATGATTTCTTGGGGAGTGTTCCAGATTCGTGCTGGACAGTTCCACAGATTCCTTCTCCTCCTACAGCATCGGGGTTGT ATTGGCCGAAAGATTCTCAGTATACATCCGATGCTATGTTTGTTCCTGACATATGCTTTTCTCACATGCAATAGCCAGACAATACTCGGAATAATCCTAT TTCTTCAAAAAGGAGGCAACTGTAATTTGCTTAATATAAGATGTTGTGTTTTATTAATCTGGTATATGTGGGGGAACTTTTTAAGTTCTCTGCCCCTTCA GTGCAGTTTGAGTTAATTTGCCACATGGTTCATGGATGTCTCAGTTTCTTCTTCTTGGGAGTAAATTATAAATATATAACTCTTTTTGTCATCTAAGTTT GATTCCAAGAATTCAATATATGCATTCATGCATTTATTTGGTTATCAAAGAGGTCTTGATCAATATTAGCTGGATAGGTTAGTTAAATGTTTTGCCC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_44349; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_1160
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | B-box zinc finger protein 22 from Arabidopsis with 86.89% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G78600) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019449227.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |