Ll_transcript_139731

• Id Trinity: FTRINITY_DN55247_c0_g1_i8
• Name Transcript: Ll_transcript_139731
• Sequence: CTTCTGAACGTTTCTTCTCTCTTTTCTGAAACCCGTTGGTTGAAAGTTGTTAGTGAATAATGGATTTTGATGCAGATGATTTTTTCAGAGACGATGACGA TGATCTTCATAATCAATTCTCTCTCGAAAAAGAAACAAGCAAAGAATTCGTGGTTTACCTAGTTGATGCTTCACCCAAAATGTTCACCACTACTTCTCCT TCGGAAGAAGAAGGAAAAGATGAAACTCATTTCCACATTGCTACCAGTTGTATTTCTCACTCATTGAAGTCTCAGATCATTAACAGATCCTATGATGAAA TTGCCATTTGCTTCTATAACACAAGGGAGAAGAAGAATATACAAGACTTAAATGGTGTTGTTGTATTTAATGTTGCCGAAAGAGAGTTTTTGGACAGGCC AAATGCCAGGCTCATTAAAGAATTTGACTCTATTGAGGAAACTTTTTCTAAAAACATTGGAAGCAAGCAAGGCATCGTGTCTGCGACTCGAGAAAATTCC CTCTATAATGCTATCTGGGTAGCACAAGCACTTCTTCGTAAAGGGTCAGCAAAGACAGTAGATAAGCGCATGCTTTTGTTCACAAATGAAGATGATCCTT TTGGGAGTATGAATGGGGCTATAAAATCAGACATGACAAGAACGACACTGCAGAGAGCTAAAGATGCACAGGATCTTGGCATCTCTATTGAACTTCTTCC CTTGAGTTGCCCTGACGAAGTATTCAATGTTTCTCAATTCTATGCTGATTTGATTGGGCTGGAAGGAGATCATCTTGTTGACTTTATGCCATCAGCAGGA AACAAATTGGAGGATATGAAAGATCAGCTAAGAAAACGCATGTTTACAAAGCGCATAGTCAAAAGGATTAAATTTATGATAGCGAATGGGATATCTATAG ATCTGAATTCATATGCCTTAATTCGTCCCACTGTGCCGGGAGCAATCACATGGCTTGATTCTGTTACGAATCGTCCTTTGAAGAGTGAAAGAACTTTCAT TTGTGCTGATACTGGTGCCCTGGTGGAAGAATCTTCTAGACGATTTCATCCATATAAAAAGTATGCAGTTGATTTGATGCTTATATCTTTATCTTATTTA CCATTTTGAGTGTTTTGCACTATTTTCTCAGGTATTCGTTTTTCTAAGAAGATTGGACTTCGCTAATTATAGCAACCCTACTAAGTAGGCCATCACTTTG CTCTGACAATAGGAGTTTCTTGGATGTTGATTACATTGGGTTCTATGTTGTGGGAAAATGTTCTCTATAAAAAGCAGGAAGTGAAATGACTTTATTAATT AGGAAATTCCTTTGAGTGATAATTCTTAGTCCGTTTCATTTTGGCATTATGTTCTTGATAAGGTCTCTAAGAATTTGGATAATTGGAAGGGTGTTTTTTC TGGTTGGTCTACGGTCATATTATTATATTCTGTCCTGCTTGTTTAGTGACACCTTTTATTTCTTTTCCTCAGATAGTACTTGGAGAGAATCATAGGTTGG ACAATTATTCTGGGTTTTCTGTGGTCATGGGTGAGGGTAACAATAGTGTCTTGTTATGGATAGATCTAGTTAGAATTTAGAAAATGTTTTTTTTTATTCT TACAAAAAGAAGCTAATGCTCTTTGGAATGGTTTGTTTGCATTTGTTGATGAAGTAGACTGACTACTCATAGGCAAGATTGGGGTATCAGGCTACAAATC AAACTTATGAGTTTGTTGAAGCCGAGTGCTTTATTGGACACTCACATAAATTTGCTTGCTAACTACATCTGCCTGGGGGAATACCTCGAATGCCCTTATT CTAATTTTTGAAGTTGTGTTGTTTCCTTTTGTTTTTAGTTATGATGTAACATTTATTTGTGTATATTTTTCAGCCAGAATATTACATTTTCAATGAAGGA ACTGATTGAAATTAAAAGAGTTTCTACTGGACATCTACATCTTTTAGGGTTCAAGCCACTAAATTGTTTGAGAGATTATCACAACCTGAGGCCATCAACT TTCCTTTACCCAAGTGATGAGGTTATTGTTCTTCTAGTCATCAATCAAACCATTGATTGCATTTTTAGTCATCAACAATTTTTGGTTTTAATTGCAGTTT GCCTACCTGGCACTGCTTTCTTATCCCATTCTTTTAATAGTTTAATTTTGGTAACAAATCATAATTATACCACTTTAAGCTTCCTTCAAGTTATCGTTCC ATGTTAAAGCATATGATATATCCAAATCATCAAATGAGTGCTTATACTGTCCTAGTGTCCTATTGGACAATGAAAGTTACAAAGCTCATCAATAAAAATA TCAGAAAATAATATGTCTTTTTAGGGTGAGACGCAACGCATCAGTAAGGTTGTTTCCTTGTAACTTGGAGGTTACAAGTTCAAATCCAGAAAGGCAGAGA CACCTTTGCTAGTTTGCTTGCGAGGTGAGTTTGCATAAATTTCCCTGTCCAGACCTCACCATGTGAGAGCCTAATGCACTGGGCTTCCTTTGTCCATACT GTATCAGACATTCTAAACTGTGAGCACTTAATCCTTATGACAGTTTACTTCAATACAGTTTTCTGTTGGTCTCATTAGTACAAAGGATTTTATAGTGATA ATTCTTTTGTGTTCTTACTCTGATATTCTTTCAACTTTTTGTCCTTTGCTCATGTTCTTCTTTCACCAGTTCCTCTGCCCTCAGTTTAAAACTAACATAG ATCCTTTTAATTTAGACATTTTAGAAACTTGTCTTGATTTATGGTCGAACCAAAAAACTAGTTGAAGGTGTTGATCATGTCTATCTTCCAATTTATGGTA GACAACATGAAGTGATATTCTTATATACTGACCTGTCTGTATTATGCAAAAAAATTGTGCAGTTAGTAATTGTTCCCAAGTGTATCTTATATGCTTCTCT TTTTTGTATTATTCTCTATTTATTATGTCCTTGTAATGTCTCATTTTGTTTTGCAGGGTATGGATGGTAGCATGTGTATCTTCGTTGCCCTCCATAGGTC CATGATACAGCTCAATCGGTATATTTGAAACTAAGGCTTTACATATCTGTTGAAATTGTATATGTCTAGGATCGTAAAACAGCATTTACGGACACTAGAC ACTTATTGGAAGTTAAACGAAAAGGACTCCCCCTAATAGGGAACCATAAGACAAACACATCTGAAAGAGATAACGGAAAAAATGAACCATCATATCTGTC CCAAAACCAACGAAGGAATTCCCCTCCCCAAAACCATATTTAACAAAACTTTCTGATCAAGCTTCCCAGATATCTGCATTCTCTTTTCTTTTCTCTATGA GGGGGATTTGTATAAAGCTGTAATCCATATCAAGTTAGGCAGTGTATATTTACCAGACATAAAAAGATATCAAGGTCTTCTTACTAATTTAAATAACACA TGTAGTATTGTAGGTTTTTTAATTTTAACATTGCTTATTGTTAAATAGCTTTCTGATCAAAGTAATGCATGGTGTGTCTCAGTTTTGCGCTTGCATTTTA TGGTAGTTCCTCTAGACCTCAAGTGGTTGCCCTTATTGCACAGGTATGATATATTTACTGCTCGAATTTTTTCGTGTGATGATTAATAGTTGTTTTCTTG AATTCAAGAGCTTGCATGTAATGTTTTAATTCAGCAGACGTGTTTTTAAAGTTTGCTATGCTGCCAATGGTTGCTTATATCAATGTATTTGGATAATTTG TCTGTATGGCAGAGTTGGGTTAGGCTTTTTTGGGTTCTTATTTTATAAAAGGGATTTGGTTGTTATGAATTAAATTTATGCTTTGAGCTTTCACAAACTT AAAATTTCAGTAGTAGTATATCAGTACTCTAATCAGGCATTGTGGTTTTGTCAGCTTGTTTTCATTAGTAAGTTTTAGTTAAATTGCAAGTCTATCAAGT AAATTGGAAATTTTGGATCTCTGTTGTGCTTTCATTTTATTTGAGTTTTTAACATTCTTAACTTGTGTCCATGATTGTAGGATGAGGTTATCCAATCAGG TGGTCAGATTGAGCCGCCTGGAATTCACATGATTTATCTTCCATATTCTGATGACATCAGACTTATTGAAGAGCGTTTTTCAGATTCTAGTGGGATGGTG CCTAAAGCAAGTGATGATCAAATAAAAAAGGCAGCTGATTTAATTAAGCGTATTGACTTGAAAGATTTTTCTGTATGCCAATTTGCCAACCCTGCCTTGC AGAGACACTATGCAGTATTGCAGGCTTTAGCTCTGGAAGAGGACGAGATTCCAGAAATGAAAGATGAAACATTACCTGATGAGGAAGGCCTGGCCAGGCC AGGAGTAGTGAGGGCGATAGAAGAATTCAAGACCTCTATATATGGGGAGAATTATGATGAGGAAAGCGAACAACCCGCAGGGAAGCCATCTGAAACCTCC AGGAAACGAAAAGCCATTGCCGAGTTTGCAACAAAAGAGTGTGGAAACTATGAGTGGGGCGATCTTGCTGATACCGGAAAGTTAAAGGATTTGACTGTGG TGGAGTTGAAATATTATCTCGCAGCTCATGATCTTCCTGTTTCTGGGAAGAAGGAGGCCTTAATTAGCCGAATATTAACTCACATGGGAAAATGAGCATG CAGGGGTCAACATCTTCATTCATGATTTTGAAACCTCGATAACTAGAATGTCCAAGACTCTAGGTGCAAGTTACAAGTTTTGCTGAAATTTGGTTCTTTA TATTAGAACTCGTTTTTGGATGAAGATACTTATGTCTGCTTTTTCACTAATTAACTTGGAAGTTGCGGAAATGTGTAATAGAATATATTTTACCCTGTTA AATACTAAATCAACCTAACTTAAGTTGACATGCCTTTTATATACTGAATGATTATCCTTTTTATTGATTAAATGGCAAATATTACATACCAAGAATGGTG CTGATATGAACATCAGATCTCGAACAAGTGGCATGAGAAACTATGATCATGATACTTATATTTACAGAAAGTCCTAATGTACTAACTATACAAAAGGAAA AGGAATATGATC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_49787;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_139731

FPKM

• FPAB: 1.3
• FPNAB: 0.4
• LF1: 0.6
• LF2: 0.8
• LF3: 0.6
• LF4: 0
• UF1: 1.3
• UF2: 0.3
• UF3: 0.4
• UF4: 0

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_139731

• Blastp: ATP-dependent DNA helicase 2 subunit KU70 from Arabidopsis with 68.99% of identity
• Blastx: ATP-dependent DNA helicase 2 subunit KU70 from Arabidopsis with 69.6% of identity
• Eggnog: X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6(ENOG410XNXU)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G16970)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019441578.1)
• Pfam: Ku70/Ku80 N-terminal alpha/beta domain (PF03731.14)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;