Ll_transcript_130912

Id TrinityFTRINITY_DN57598_c3_g3_i1
Name TranscriptLl_transcript_130912
SequenceCAAGATCCTTCATCTGATGATTCCTCTGATGGTTTTACTGAGGTAGGCTCGTGCTCTAAAACCCTTTTCGTGTGTTCACATTTTGCTTACTGTTAAGTAC TATATACTTAACCGGGTCTTTTGTGTTTTATGGTGTAGTTGCCATTTCAGTCATGCTCTATTATTATCATATCCTTTCTCTTATGTCTTGGTAATAAATG AATGGAGAGGTTTTACTTTATTTAGATTATAATGACATTGATGCACCACCCCTGCTAGTTTACAGAGTATAATACTTACTACTCAGCTTAACATTGTTAA AGTTCTAATAAATGTATTATGAAAGACGTTGTTTCATATATTGTACTGATTGAAGTGTGTTTTTGGACATGTTTGGCAAAAGTGATGGTATATTTCACCC AAAATTTAAGGAGGTAGTTAGTTTTGCATTTTAAATGTCTTGCATTATTCATTGTTTAAAGGAACTGGTTAAATTTCACAATGAAAGTGTAAGTATATAG AAACATTATGTGGCAATTCATTGGAATATTGGCCAGAATGCTCACGGACTATGTGGTGTTATTTCGGCTTCGGTGTCTCTGGCAATGTATCGCTGGTGAA AGAGTCCCAGCAACCCATTTTTGTGAAAAAGATCAGTGAAAGTGCGGAGTGAAGAGGAGTGAGAACCAGATGTGAACATTGGCTTCATAAATCAAGTTGC CAATTTCGTAATAACCAGTTTAGTTCATAACTGCTTGACGAAATGTAGAGTTCTGTTTTCTAATTAAAAGGTGGCCCAATGCATGAGGCTGCCACCTAGT GGGGTACGGGGAGGGTAAATGTATGCTGGCTTACACTTGCAATCGAAGAGTTGTTTCCAAGATTTGAACGCATGACCTCCTCGGTCACAAGGCAAACAAC CTTACAATTGCACCGACTATCACTCTCGGAACTTCAGTTTTCTAATTACCATCTAAAAATCCCCTTTCCAAAAACTGTGCGGTTTGAGAATCAGTTCTAA AAATTGGTTTGACTCCATTTTGGTTTATGAACCATGCCAAGCCATGAACAACCCTAATTATATCCACTTTTGCCTTGGTTTAAATTCTATAGCAGTCGAG CTAATATCGCATTTCTTGATTGTTGTTGCTGTCATTTTGAAGATTTTGCTTCAAGGTGGTCTACTAATGGGGGGACGATTAACTAGGCACGACCGGTTCC GACGCTTGAGACTTGATATTGATAACATGTCATATGAGCAATTGCTTGATCTCGGTGAAAGAATCGGTTATGTGAACGCTGGACTTAAAGAAGATGAGAT GGGACGCAACATAAGGAAGACTAAGTTTAAATTTTCACACGATGCATCAAAGAATCAAGTAGATAGAAAGTGCACCATTTGTCAGGAAGAGTATGAAGCA GATGATGAACTGGGGAAGCTGAATTGCAAACATAGCTATCATGTTCGGTGTATAAAACAATGGGTTGCGCAGAAAAATTTCTGTCCAGTTTGCAAGCAAC AAGTCATGGCTCGACACTGAGTGTCACAATCCTGATGTGTTTTTTGGGACTACTTATTCTCATCCTTACGTTGGTGCATAGATTTTCAGATAAAATACAA GTTTAAGATTTTTTCGGTTTTTGCTATGTTTTTCTCAGCCTCCTTTGCTAGGAATCTGGAACACATGTTATTGGGTAAAGGTTTCATAATTGGATGAGAA CTTGGCATATTATAAACATGAGTTGGCCTTGCCTTTGAGCAAGTAATCATTTTTATGTAGTTTGTGGTAGTGTTTATATTTCTGATGCTTATCATCTGCC CCCATTTCGTGTTTATGCTAATTGTCTGTGTTGCAAAAACTCAGCTTGAGCATTAAGAACACCCCATTAAGGAGCAAGGTCCATACCCGATCTCAAAGAT GAGGTTCTCACCTCATGATGCATGGGGATGAGAGTACATCTGCTGTCCTACATGTTGTGCCATGTTGTGCCACTGGATGTACCACGAGCCCATGATTGAT TGAAAAATGTTTTTTAAATTAAAAAAATAATAATTTATTATTTTTTTGACTAATCACAGCTGATGATACATGTAGTGGGACATGCAATGTCAAAGAATCA ATTTGGTCCCTCAAGCTTTTCACTTGTATCAATTTAGTTCTTAAAAACTGTGAAACAAAGATATTAAATTTTGGTCAAATTAATCATTTTTAGTATTATA ACTAATTCTTTCTTACTTTAGTTCCTACCAATGATTATATTGGTCCATATTCATGATACTAGTTTGAACTGAATATTCAGTTTTCTTTTGAGTGTGGGAT GGCACCACTTGTATAATATTAAAGTTTGAATGAAATATCTATATGTTTTTTTTAATATAGAATTTGGGTGGGGATTTATTTACTCTAAGAGTAAGTTTTT TAAACTTAAGAGTAAGTTTTTTAAACTTATTCCACATCTTATCCATAAATTTTAGGGAAATCCAATGGTTTAAATTAGTGAGTAGATCTAAATCATTAGA ACTCATTAGAATTGATGGTTAAGATGTAAAGTAAATTTAAAAATCTTACTCATTAGAATAAGTGGATCCCGGCTCATAAAATTTTATACATACTAATACA GGTTAAAGTGGACAAGGTGGGTTATTTGAGTCATGTCTTTAGAAACTATGGTCCTATTCCAGGCACATCATTTTCTAGCTGTATTTGATGAATCAAACTA TTTCAATTTTTTATGTCAATAGTGGTGGCTAACAACTAGGGCCCCTTATTGTTTTGAATTTGCATTGAGGTCACATTATTGCTAGATGGCACCCATTTTG CTGATAATTATGGCATTTTTGTGGTACAGAAAAAAAGTTGCACAAGTTCATTGTTTTCTTACATTTGTAGCACTTTTTTCCATGGGAAAAAATGGTAATC AAATATTGAAAAAAATAGGGAGAAGAAAGAATACTACAAACTACAGAGAATTTGTATGGGTCCTAGAGAGCGCTATTAATAGAGACATGAGTCCAATATA CACAAATTTTCCATTCTAATACTAGATAATATAGGATATCTTAGAAAATCTACACAAGAATCTTCATCGTACCGAATAAAAGCAGCTTGGCATAAAATCT AAAACTATCTGAACTCCCTCCCATACTCTCACCATGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTACTATCTATATGATGTGTTTTTGAGTTTCAGAGGTGAAGACACTC GCAATAACTTCACTTCTTCTCTCTACTCAGCTCTCACTGATCTCAACATCAATACCTTCATGGACAAGAATCTTGATAAAGGAACAAAGGTGAAACCTGA ATTATATAGAGCAATAGAAGGATCTAGAATATCCATGGTTGTTTTCTCACCAAGGTATGCGGGATCAAGATGGTGCCTTGATGAACTTGTGAAGATTATG GAGTGTCATAGAAGTAATGGTCAACTTGTTGTTCCAGTCTTCTATAACGTTGACCCTGCACATGTACGCCATCAGATTGGTGACTTTGGTGATTCTTACA CACAGCTTCTAAGGAAACAGAGATGGGTCAATCATGCAAATGTCTTGGCTGAATGGAAGACAGCACTCACTGATGCTGCTAATTTTGTTGGTTGGCCTGT TAAATCCGACAATTACAATGTCATCAAGCTTATTGCTCAGGATATTTACAGAAGGTTAGACAAAACATCCTTGCCTATTACAGATTTTCCAGTTGGGTTA GAATCTCGTGCCGGTGATGTGATTAAGCTTTTGAAAGGACAAGCAAGCGCCGTTCGTATAATAGGGATATGGGGAATGGGAGGATCTGGTAAAACAACCT TAGCCAAAGTTATCTTCAACCAAATTCATAGGGATTTTGTAGGTACAAGTTTCCTTGCTAATATTAGAGAAGTTTGGGAGACAAAGGGAGGCCAAACTGA TCTACAAGAACAATTACTTTTTGATATCCATAAGTTAGAAAAGATGAAGATACATAACATTGAGTTGGGAAAGGCTATGATCAAGGGAAGACTGTGTGGA ACTAGAGCACTTGTGGTACTTGATGATGTAAGTAAAGACGAGCAATTACGAGCCCTATGCGGAAATCGTACATGGATTGGTCCAAAAAGTGTAGTAATCA TTACAACCAGAGATGTGCGTGTACTTAATGTACTCAAAGTTGACCATGTCTTCAAAACAAAGGAATTGGATAAAAGTGAGTCCCTTGAGTTGTTCAGTTG GCATGGGTTTAGGGAAGAAAGACCAAAAAAAGACTTCATTGAACTCTCAACAAATGTAGTAGCTT BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_70027; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_130912

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_130912

BlastpTMV resistance protein N from Nicotiana with 41.49% of identity
BlastxTMV resistance protein N from Nicotiana with 41.49% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019425579.1)
PfamTIR domain (PF01582.19)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;