Ll_transcript_325773

• Id Trinity: TRINITY_DN48050_c5_g6_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_325773
• Sequence: GGCTTATTTGCACCTACTGTGTAGAAAAGGCAGAAACACGTTTCTCCTATAAACAGAAAAAGATTATGACTCACCCCAACCTACCTAAAGAGATAGGACA TAAATCTCATATATTTAGAGGCACTGATGACATGCCACCGAAAATTGAAGTATCCCATGTGTTAACTCCATTATCACAATAATAGCAACCATATTATTGC TCAATCACCACACTACAAAAGCCTTTCCACCACTTCAAACTTCCACCTACAAAACACTTGCCCAAGTTGTTTCTTCAAGTTTCAGTTTGGAAGAGAACAA ATATGTCTTCTTTTTAATAAAGATGTCTCTGCATAGAGATATCTCTTTCTTCTGTTCCTTGGATTTTTTCATACTTGGCCTAAGGGAGAAAAGGGGTCAG GGATTCTATACAAGTATTGAGAGTTTGAGAGTTGATATCTTATTATAAAGATCATATCTTTGTAGTAGCAGAAGCCAGAAGGTTTCAGCTGAAAGAAATA AAAATAGATAGATGACAATACTATGTGGTTCAGTTTTGAAGGACAACTATGATAACAGTATATGACAAAGGTAGAGGAAAACCAAGAAATAGAACTAGTA CATATGCTATGCAATAAGTCCATGGATGAATTACCTGGCTCTGTGGGCACTAGTGCCAGCTTCAGTCTGAGATTGGGCCAGACCATATTCTCTTCTTCTT CCCTTCTCTTTATGTCTTTTGGTGTTGAATTCTACAGCTACACAGCTTTCTGGTACTTCTTTTTACCCTTTCCTTTTTTTTCCTCTTTAATTTCTGGTCC CCTTTTTTATTCTAATACAAGGGGTAGTTGACTTTTGGTATTCTTTAATGTTGTTTTGGTTTATCTAATATTACTCCCCATGTGATTCTGCAGAGTTTTT AGGCTCATTATTAACTATATATTATTTATAAAAAAGAAGAAAAAAATATTGACTATATACTAATAAGTTCATTTAGCTGATCATGCCTCCTCAACTGACT TTGCCAAATATGATATTTGTGCATGTGTCACTGGTGGTTAATCTCTAATAGCAAAGACTATAGTGGTGGATGTGTTACTATGTTTAATTTCAAAGCAAGA ATAGAATACTGTTGTAGTAGTAATTGGCATCATACATCTTTAATACTAACAATTTTCAACTAAAATATGAACTGTCTAATTCTACAAAAGCACCAATGTT CTGTCCAAAACATAGCTTCTGAGAGTGGTCTTGGTGGATCCACTAACTAATTCGGGTCGGTTTTAGAGTTGGTGAAAGACTTGATAGTCATAAAATATAT CTATGAGATGATTCTAAAGTCTTTCGTTTCTTTCATTTTCGCTAAAATTCAACTCACGAACAGACACTTAAAGTGCTGCCTATCTTAGACTTACTCGGAA ATTAATATGAATTTCTCTCCTAGAAAATCATGTCAGCAAGAAAGTAGTTTCCATTAGTTCTGTACAGCAGGGTTTTGACACCAAATCCTAAACAAAGTTT AGTTTTCATTTTTAATTATCAATCACATGTGTAATTTTCCTCTATTCCTTTGCTAGTTATATATGCCTGCATTTTTGCTTCTGTTATTTGCATCACATAA ATAGGTAGAACACTAGAACCTGAACAGATACCAACTGCATAAGTGCATTTGTTGCATCTTGTGTTAATTAACTGATTGACTTTATTCTTTACTGTGGGTA TCCAAGCTATTTGGTAACAGTGATGGGTTTGGTGATACCTTGGAGTTTCACATTAGCACTGGTAGATGGATACTCAGTTCTGGTAAAATGCCCCATTCGC CAACCAGGAATACTGCTGATTATTTTTGTTGGAGATTGGGTATGTTATGTAGCTTCTGATCTAACTGTTAGACTGTTATGATTTGACATAGGGGAACACA CGTCACCTGTCCCTGAGGTCGACTTATTCTCTATCTCGGACCAATAAGATATTGTCACATAAATAAAAAGTAACATTTTTATATTATTTTTAAAATCTGA TTGGCCCGAGACAGAGAATAAGATAGCCTTCGGGAGAGGTGATTCATGTTCGACATAGGGATAGTTAATACTATCAATCATCTATTGGTAACTAACTATA GTTCATTTGTTACAGGTATTATCAACTCTCACATTATCTGCAGCTTGCTCAGCAGCTAGTGTTGTAGATCTGCTGCTACAGTCTCATGGACCCTTTTGTC CTCCAAAACTTTGCAGCAGATATAAGATATCTGCAATTATGGCCTTTTTTTCTTGGCTTCTATCTTTGGCATCCTCTCTGTTTAACCTTTGGCTATTACC CTCTTTGTGATTCTCATTTAATTACCTTGTAGAGTGCTAAAGATTTCACATCATTTATTCTGTAAATTAGTTTTTTTTGTTTTGTCAATTATAGCATGAG AATCCTGGGGATGTCCAAAATATTTGGTAAAAGTCTTATAATTTTGTTCAAAGCATGTAGAGATACTCAATATTAAAGTGTACATAGGATGGCAATTGGT AATGATGTCAATTTAAAACAGGGCACTTCCATGAAAAACCGGAGTTAGGCTCTTCTATATTACATGAGAGACAAGTGTCACACAATAACAAATAAAAGAT ATGTAATAAACTTTTATCATTTTATTAATCATGAAATAGAAACAAATTTTGTATTATGGAGAGGATCCTTTTTCGAAAAACTGATGGTAACTATAATAAG ACTTATCACTTAGGTAATTTATAGGAGTCACATCTTCTGTCCCAAAGTTTGTACCACTAATGTACCCCATGTTTTTTATTGG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_157772;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_325773

FPKM

• PAB: 8
• PNAB: 1.6
• PS1: 5.6
• PS2: 0.8
• PS3: 2.1
• PW1: 2.1
• PW2: 2.3
• PW3: 4.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_325773

• Blastp: -
• Blastx: CASP-like protein 5C1 from Oryza sativa with 55.36% of identity
• Eggnog: CASP-like protein(ENOG410YMN0)
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019412871.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;