| Id Trinity | TRINITY_DN48937_c3_g2_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_437025 |
| Sequence | CTCTTTCACACCCTCCTCTCCATAAAGGTGGTAGTAGATTGATATTATAAATGGTAGAGTGGTCCATGAAAACTTTCTATGGCCATACTCATAATCTCAC CCCTCCTTTACTCTCTTATGCTAAAGCCTCATTCTTCCTTACCCTCTATTTTTACCTCCCTCACCCTGCACCTTTCACTTTTCAATGTATATATATTATA CATAACTCAGTTGAGATTTGAGATCCAAGGCTCAATTCTTGTGTTCAAGTCCTGTTCATACTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTATGCATCTTAAAC TTCTCCATGGTCAGAATCTTAAGCCCTAGAAGTTCAAGAAAGCTGTGGGAGAATATGGCAACTTAGGCTTTGTAGTTCCTACTCCTTGACCCTTATCATT TCATCTCATCAATATATCACGATGGTGGGAAAGACTCGCTTTACCAGAATCCAACACTCCTGTTTTCAGTCAGAAAAGGTGAATCCACATCTTCTCCTAC ATTTCTGTGAAAAAGGTTAACCTCTGTCACTGCATGACATCATTTTTTTAACCACTCCTCTCTTTCCTGACATCATTTGGCCTATTGATTGATTCCTTGT AACCCCCTCTCTCATGTTTGGCTGTCTCTTTCTCTCTACAAATTCATGTTGGCGCTGAAATCATGGGTAATTTATCATACTTGTTGTCTCGTGTTCTTCA CTTGTCACTAGATTTTCAACCGTATTACAGTTTTACACATCACACATATACTGACTGCATTGTTGTGCAGAGCTAAATAATAGTAAATAGAAACAATTCA GAATACAAGTATAAAATCAACAAAATTTTCACCTAAACACACTAAACTTTTCGGTGTAGCAGCAAATCTTTTGCATTAGTGAAGCAAGAAAATCATGAAG ATTGTGCTTAGAGATAAAGTTTAGAAGCAGAAAAAGAGAGAGAGAACCTTTAGCAAATAGAAGGGATAAAATTTAGATACAGTATAAAGTTTTAGCCAAA GGGAATGCAACAAGTTGTACACATAAGAGTAGGACCACCTAAATTCAGATTTAATCAGCAGGCAGGCACAGAGGCATGGTACTTCTGTGCTTCTTTCTAC AAAGAAAATACATCATAAAATATATACACCATGTCATTATTAATTGCTTATGCAAAAATTTATATATAGATAAGCTTGACGAGAAAAAAATTAAGACACT AACTGTATGCATAGTGAAACCTTCAATGACATGAACTGAATCCTGGGCCAAATTTCCTAGTACGGGTATACATTGCTTTTGAGCATTGACATCACTGTGG AATAAATATTATAATATTATATATACAAAGGAAGGAAGAAAAAAGTGTGGTAGTATATTTCGTATGTCTGAGGGTAAACAGGAACATTTCATTTGCCATG CAGTGTAACTTGCCCTCGTGATCTTTCTGACCATTTTTACTATATTAACCTAAAATCCACTATGGAAACATTTTACTCAATGCAATATTGTCAATGAAAC TCTGGCACCACTCACGTACGTACCTCAACAAAGGTATATTGGAATGTTCAGATTAAATTTGCTTTCAATGCTAACTAGAAGCCCAAAATACTGTTTTTAA TTACTGCGTTTCTAGAAATAATTAAAGTCTTTTAGCATCAAAGTAAAAAACCTACCCTATCTTTAAGAAAGGAAACTTATAAGTTATAAGCATAATGTGC ATGAAGCTAGCAGAAAATATAATCACCAATAACCATTTACAACATTACAACCCAACAAAGTACATTACCATTAGGTGAAATTAAAAGGGAATACTGCAAG CTAGATAGGCACAAACAATTAAAAAGAAGTACGCATACTTAGTTCACGTGATTGAGTAAAAGTTTGTATAGGTTACATTATCCGAAAAATCAATAAACAT AATGGGAAAATTGTATTTGATGTTTTTGGTTTTTGTATCTTATCCGTTAATTGTTCTGGGAGAGATTAAAACAGATTTTCTTGGGTACAAAAAATAGATT ATGAGATGCAATGTATATAGTATAGAACTTTTATTTGTCATTTCTCTCTGTAATTTAACCTTTCTTTATTCCTGTCCGTAAGAATAATAGTTGTTGTTTT TTTAAAACAAAGCCATTCACCTCATCTACATATTGAAACTCCAATCCAGTAAACTAGTGAAGTAGTCAACCTCTCTCTAATATAACCTTTCTTTATTCCA ATCCAGTAGTAATAATTAGTTTGGTCTAATGGTTATGGAAACGGATTTAATTAATAAAGTGAAAGAGATTAAGAATTTGAGTTTTACTTAGAACAAAATT CTAACATTCTAAAATTTGCCAATAAAATAAGAATTAACTTACAATAATTAGCTTATTGAAACTCCAATCCAGTAACAAAGTCATTAATGTTCTTTTTAGG TGTTAGCACCGATTATGTTCTTAATCCAATTGATTATAAAAAAATTCCAAATAAAATAAAATTAAAGATGTAAGCTGTAATAAAAAAATCCTTGCCTTTG ATTTCTACTTTATCTCCAAAGATGTTTTCATCTTTACCATATGGGCCTTGTGTAGAATGTATAGAATGGAAAGAAGAGTAAGTATAAAAATTTGAAGCGG TTCTCTCCTACTTAGAAAATTGTGCAAAACAAAAATTCAGTAAGAAGGTGGATATCGTCCTATAAAAATGTATCACTCTATGTACTTCCATTCCATTTAT GATTGGTCAGAAATATAATTAATCATTATTTTTTTAACTTAGATACATTTTTTTTCAACTAATAACATGTGATGACACATGAAGGGTACACTTTGTGGAT GTGCTCCCCAGTAAGAAGTGGTCGGTAAGACATATTAGAGTGTTCGATCTCAAATTAGAATATACACCATCTCTAATTTTTTTTATTTTATTTGTATCAT CTAATTGAAAAAACAGATAATATATTTTATATTAGTTGAATATAATTAACTTGAGACATAGACTATAAATTTGTTAGGACATATGTTCTTCAAATTAAAC TAGAAAGTGATTTAAAAAACCTAAAACCAATCTAAACTTCAACTTTTTGGTTTAGATTAGATTTTTAAAGAAAAAATTGTATTGAATAATTGATATTTGT TCTTATTCTTTTTCTGGTAAGCAAAAATACTTCAAAAATTAAAAAACAAGTTAAAAATAACAAGTAGTACTCATATTTACATAATATATGTAGATCTAGT ATAGCCTTATAGTATTAAATAAACTCCTTAATATTCAATATATATTATCCTTGATAAAAGATCAATATTTATATTTTCAAATATTAAAACTAAACCTAGT TAGAAGATCATCATTTTAGTGGCAAAAGATTGTCTCTTACGGGAGATGATCTGTTTGCAATTTAAATTTTGGAATGAAAGTAAAGAAAATAGAAGGTTTT TAAATTTTTTCACCAATATATTTTAGGATTCTCAAGTCCTTGATTTATTTTCTTTCCTATCTAAAACTAAACTAGTAAATAGATCTTAAGTTACCACTTA AATTCTCCAAAGATGAAATGTCCATTAAGCTTAAACTCCTCAAGATGAAGTCTAATAGGACGACTAATATGATATTAATATCAAATTTCAGGTCAAAAGT TGGTGTAAAAACAATGATGCAAAAGGACCTCTTGGGATTTGTACATATTCTTCAATAATTTTTTATAAAAAAATATAGGTGAGTTTGGATTTGAGGCCCC ACCAAAACTATGAAAGGCCCCATATTTCTATGAGCGCTTTTTTGAGGTGAGATATTAATTAACCTGTCAACAATTTTCATTCTTTGCAAGTAGAATTTAT GGCCATGATCTTGTGGACACTGAGATAAATACTTACCAGCTGGATCAATTTCCATGGAGAAAAATAGATACAAGTAATAAAGGTATAAAATACGGATAAA GATCTTTTGTCTCAAACTCTGTCCCAAATTCTGTCCTAAACGAATAGCAACATGCCACGTCAGTTAAAAAAATTAAATATTCATGTTTTTCTTTATTCTG ATTGGCATGGTACATT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_165220; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_437025
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | gma-MIR396k (MI0019764) |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019462641.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | MIR396 (RF00648) |
| GO | - |