Id Trinity | TRINITY_DN50130_c3_g1_i18 |
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Name Transcript | Ll_transcript_278617 |
Sequence | ATAAAAATAAAATAGAAAATAACACCAACGCAAGACAATAATGCTATTGAGTACAGTTTTGTTCCAATGTCACTCTCATCTTGTTGCAATCTACGAGGAA TTTTCATATCAATCTCTGCGATATTTTCATCATCTGTTTCAGTTCCTTAATCATTGCTTCCACAGACAAAACAAAACCTCTGTTTTTGTGTCAGCTAGTT CTTATTCTTTGTCCATATTTTCCTTCTCTTTCTCTCTCCTTTCTCTTTGGAATTCATTTTCTGATAAAAATGGTGCTTGGAAGAAGAGTCATGAGTTGGA GAAGGGTTGCTAAGACCCTTCAAGCTCTCATAGCTCATGCTTTACTCTTTTCCTTCACTCTTATCCTTTCTCTCAAGCTTGATCATCTTCTTCCGTACAA ATGGACATGGTGGGTTGTATTTTCTCCTCTTTGGCTTTTTCATGCTGTAGTAGCTCGAGGCAGGTTTTCATTGCCTGCCCCTTTGATGCCTCGTGGCCGC CAATGGGCTCCTTCTCATTCAATCCTAGCAACACCGTTACTTGTTGCATTTGAGCTACTTCTCTGTATGCATCTTGGAAGCAGTTACGCGGTGAATTTAA AGATTGTCTTCTTACCCCTTATAGCTTTTGAAGTGGCGATTTTGATTGATAACATCAGGATGTGTAGAGCTTTGATGCCCGGAGATGATGAAAATTTGAC CGATGAAGCCGTTTGGGAAACTCTTCCTGTAAGATATTATTCATTAGTTGATTAATTAGTGCTTGGTGACATGCTCTGAAGTAGAATAAAGTGAGGTCAC TCAGTAATATTGCGGAAATAGGCACCTAATGCTCTCTACTGGCATCTGCCTGGTGATTTAAAGTATTCAGTTTTGGTGGTTTATAGTAAAATACTAACAT TAGTTAAAATTTCGGATTGAAATTTGGAATGCTATTATTATAGAGGGATGGTAAACGCGAAACAACGATAAGAATATGATTTTATCCAGAATTAAAAACA CATTTTCTGAGTATGGGTATAGATGATACTTTATCTTGGTTGAAATGAATTACTAATCAAAATTAAGTCTCTGTATTTTCATTTTATGGCAAGTAAAAAA ACCAAGAGAACTATTATTTATAAAGGAAGTTCAACTTTCCTTTTCCTGTTGTTTATGCCCTTGACCATTGTTTCGCACTATGTTGACATTTATTATCTTT ATTTATCGAGTGTGGCTTGCTAACTCTAGGTGGAAGTCTCATACACTGGGCTGCCATTTCTGTGTGTTGTTGGTTCAATCAACCCCACCTAGTGATAATA AGGCTTGGTTGTTGTTGTTGTTGTGTTGGTGGTTGACATCAATGTGGCATTGTTTTGGTCATTCATATCATTGTCCGATCAACACTCAAGATGAATAATA TTTCACATTTCATTCTTATAAATAATACATACTGCCCAATTTTTTGTGCATGAACAGCTTTCATAAACAGGATTTTCTAGGGTATATTATAATTCGTGCC GTTCTGTTATGGAAGAATGCTACATGATTGACATGGATATCCACTGTGAATCTGTAATATGGCTAATTGGCAGTTTTGCAATGTACATGTACATTTCACC ATTGGGATCTCTATATATTAATCTCACAGGAAGTTGATTGAAAACAAATGAACTTCACTATTGGCATATGTTTTGTTATTAAGTGTTGGTGTCTTTATAG TTTAACCCAAAAGTGCAGAACACTGTTATAAGGGTGAGAAACCTTATCTCGTCCATGTTGGTGTGTTCAATCTCATACCAATGTCAATAGTAGTTTCTAA GATAAGAACTCTTCAATTCCAAGATTCCTTGGTGGTGTGAAATGGTAGAGCCTTGCAGATATTGATTGCATATGTCATCTTGTGCATCGACAGTTGTTAT ATTAAACATCTTTATGCCCCATCTATAGAGAGCGTCAGAGTGCTGATCTGTCTTCAATGTGAATGGGATTGATGTTTCCTTGCATTGAGGTTGTCATGTA ATCTTTGTGCATTCATCATGATTATGTCGCTTCAGTATTTCATTTCTCTTTCATGCAATACAGGGATGTATATGGAGGAAAAGGAGGATTACTGATACTC CATTTAACACATTTTGTCCATCTTAATAATTGACATTACCAAAAAATTTCTACTACGAAGAGAACTTTCTTAAGTCTGTTGATCAGAAGATTATGTGATC TTGATTTTGTTTTTATTTAACCAAAAACCCATACTAAATCACGCACTTCTATTTTCTAGCACTTCTGGATTTCAATATCCATGGTCTTCTTTGTTGCTGC TACAGCATTCACCCTTCTAAAGATATGTGGTAAGTTTTTATTTTCTTGCAAAAACATTTGGTAATTAGCTTTTGTCCAGTCTAATTTTCTTGACCTCATA TCAATTATCTGTGACTCTGTGATGTTGGTTAATATCAATTATCTGTGACTCTGTGACCTCTATTTTCATCATGCATATATTACCTTTGTCTAATACAATA TTCTTGGACAATGAGAATATTGCTTTAAATTTAAGGAACAATGTACAAAATTTCGGGTCCTTGTGTTGTAAAGGTGTTCTTCCATTATTAATACTCAATA GAGGTTCTATTCCATGTTTGATTAGGATTTCACTATGTTGTTAACTATTATATTTTTTTTCTGTCTATGAGATGAGGGGAGTTTGGGATTTTAAATAATC ACTTGTCAAATAGTTACTGTTGCAAATTGTAATCTGATGAAGAGATATTCCTATTTTTTGTTTGTTTTCTGAAACGAAAATTGAAACTATTTGACATGGG TGACCATTAGATAATAATGAATTGTGAAATCTTAGTTGATATATTGGTCATGATATAAGCTGTATATATCTTGAGTTGTGAAATCTTAGTTCCTTGAGAG GCCGATGTACAGCGAAGGAAAAACATCGAATAATGCTTTTAGTGTCTGGTCCTGAATTATGATTGGTCCTGAATTATGATCAACATAACATATATATTGC AGATTTGCAGTGTATTTTGCTGAGAACATTTTAACGCGTTGCTTAGAAATGTTTGCTGTTAGACAGACTTTTGGAAATGTTATATTTAGTTATTTCATGT AAAGTTGTTTTTGTCAATATAATTTTTTTCATGTAAATTGCACATGGATGGGATGTCATAACTAACTTTCTAGAACCTTTCTAATGAAGCTTAATATCAA CTAAAGTTCAAGTAAATAAATAAAGGCAAAGAGAGACAGAGGGAGAAAATCGGAGAATGTGAAGGCATGGCACTGATACTCCAGGGAAGAGTACTAAAAG AGAGTAGTATCTGGAGTAGGAAACACTTGAAGATATACTTCAACAAAATACAACACAGTGTAGTAAAATGATATATTCTAATAGTCTTGATTCACAAAAG TGAAAAGAATAAATAGATTAGATTCCTGTGTGTTCCTTGCTCACCGACAAATAAGTATGAATATTTATGGTGAGCAGTAAGCAGTATAAATGCATTGGTT GACTGTGAGTGATACTTAATCTTTTTGTTCCTAAGTTTCTTTGAAATACTTGCAGGTGATGTTGCTGCTCTAGGTTGGTGGGACTTATTTATTAACTTTG GCATTGCACAGTGCTTTGCATTTCTTGTTTGTACCAAGTGGCACAATCCAACAATTCACGGAAACAGTCACATTATAGAACCGTGTTCGTCATCAAGTAG CTTACGATATTCATCGTCAAATACCATAAGATACATGGAATGGAATAGTACAAGCTTTCTCATTTCCTCAAGTGAAGATAGGCAGCAAAATGGGTTCTGC GGTCTACAGGACATTGGAGGGCATTTTATGAAAATTCCATTCATCTGTTTCCAATTGCTTCTTTTTATGCATTTAGAGGGAACACCATCAGATGCAAAAT ATATGCAACATCGGATCATATTTTCTCCTCTTCTTTTGCTGCAAGGAGCCGGGGTGTTATTTGCAGCATATAGATTAATAGAGAAGATTGTTCTTTTACT CTACAGTGGAGATGTTCCTAGAACATACACATCTATAGCATCAAAATCCCGTGATTGCTTTGGGTTCTTTCATCACGGATCAAGGTTGCTTGGTTGGTGG TCAATAGATGAAGGAAGTAGAGAGGAAGAAGCTAGGCTTTATTGTGCTAGGAGTTCCGGGTATAATACTTTCTCCCCTGATACAGTGAAGACAATGCCTA GAGCAGATCTTGTTGACGAGATTTGGAGACTACAAGCTGCATTGGGTGAGCAAACAGAAGTTACAAAATATAGCCAGGAGGAGTATGAAAGACTTCAAAA TGAGAAGATCTTATGTAGAGTTTGCTTTGAAGATCAGATTAATGTGGTCCTGCTTCCCTGTAAGCATCACATTATTTGCCGTACTTGCAGCGAAAAATGT AAAAGGTGCCCTGTCTGCCGTGTCGTGATTGAGGAACGAATGCCGGTATATGATGTGTA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_174867; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_278617
Blastp | Kinesin-like protein KIN-7D, mitochondrial from Arabidopsis with 36.49% of identity |
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Blastx | Baculoviral IAP repeat-containing protein 8 from Pan with 36.47% of identity |
Eggnog | Kinesin family member(COG5059) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G39050) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019435109.1) |
Pfam | Transmembrane Fragile-X-F protein (PF10269.8) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |