miRNA 88 details

Id Micro88
SequenceCCTCGTTCCATACATCATCTAG 
Annotated namesmtr-miR1507-3p; 
Annotated pre-miRNANone

Targets of miRNA 88

LuluDB transcript

ID Trinity

Target start position

Target end position

Target sequence

BLAST target sequence

Annotation method

Target details
Ll_transcript_161997; FTRINITY_DN53255_c1_g5_i1 835 856 TTGGACGATGTATGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_162004; FTRINITY_DN53255_c1_g5_i2 937 958 TTGGACGATGTATGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244782; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i22 2763 2784 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244762; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i10 3044 3065 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244779; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i21 3143 3164 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244785; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i24 2896 2917 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244765; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i12 3035 3056 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244789; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i27 2896 2917 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244758; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i7 3177 3198 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244783; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i23 3192 3213 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244777; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i19 3316 3337 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244749; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i3 3177 3198 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244776; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i18 3192 3213 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244760; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i8 3277 3298 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244767; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i14 3473 3494 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244756; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i5 3473 3494 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_244787; FTRINITY_DN53326_c1_g1_i25 3558 3579 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_82933; FTRINITY_DN5290_c0_g1_i1 49 70 ATTGAAGGTGTATGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_57129; FTRINITY_DN57876_c2_g1_i7 1144 1165 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_57125; FTRINITY_DN57876_c2_g1_i3 1628 1649 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_57145; FTRINITY_DN57876_c2_g1_i13 1902 1923 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_57123; FTRINITY_DN57876_c2_g1_i1 2880 2901 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_57137; FTRINITY_DN57876_c2_g1_i10 3154 3175 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_57133; FTRINITY_DN57876_c2_g1_i8 3562 3583 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_57151; FTRINITY_DN57876_c2_g1_i15 3836 3857 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_169776; FTRINITY_DN85048_c0_g1_i1 202 223 CTGGATGGGGTATGGAACTAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_273667; FTRINITY_DN54225_c2_g1_i3 1669 1690 GCAGATGATGTATGGTATGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_218710; FTRINITY_DN56338_c0_g1_i6 1322 1343 TAGGATGATTTATGGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_218702; FTRINITY_DN56338_c0_g1_i2 1427 1448 TAGGATGATTTATGGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_218704; FTRINITY_DN56338_c0_g1_i3 1877 1898 TAGGATGATTTATGGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_218706; FTRINITY_DN56338_c0_g1_i4 1982 2003 TAGGATGATTTATGGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_78389; FTRINITY_DN85758_c0_g1_i1 119 140 TACAGTGATGTGTGGAGTGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_206035; FTRINITY_DN51183_c0_g1_i1 278 299 CATGATGGTGTAAGGGATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_206036; FTRINITY_DN51183_c0_g1_i2 339 360 CATGATGGTGTAAGGGATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_40840; FTRINITY_DN87034_c0_g1_i1 203 224 ATTGATCATGTATGGAATGACG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_4828; FTRINITY_DN48835_c0_g3_i1 452 473 AGCAATGAGGTATGGGATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_66856; FTRINITY_DN21967_c0_g1_i1 966 987 CTAGATGATGTATGGAGAGGGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_208838; FTRINITY_DN52633_c3_g1_i4 568 589 TTGGATGTTGTATTGAACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_208850; FTRINITY_DN52633_c3_g1_i10 1817 1838 TTGGATGTTGTATTGAACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_208843; FTRINITY_DN52633_c3_g1_i7 1817 1838 TTGGATGTTGTATTGAACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_154573; FTRINITY_DN56526_c1_g3_i1 202 223 AGAGATGATTTTTGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_99689; FTRINITY_DN57105_c4_g1_i5 131 152 TTCGATGATGTATGGGACAAAG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_16104; FTRINITY_DN59233_c1_g1_i7 10 31 TTGGACAATGTATGGAACGATG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_99690; FTRINITY_DN57105_c4_g1_i6 1125 1146 TTCGATGATGTATGGGACAAAG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_99684; FTRINITY_DN57105_c4_g1_i1 1125 1146 TTCGATGATGTATGGGACAAAG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_99687; FTRINITY_DN57105_c4_g1_i3 1125 1146 TTCGATGATGTATGGGACAAAG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_273666; FTRINITY_DN54225_c2_g1_i2 1819 1840 GCAAATGATGTATGGTACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_273668; FTRINITY_DN54225_c2_g1_i4 1845 1866 GCAAATGATGTATGGTACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_273669; FTRINITY_DN54225_c2_g1_i5 1879 1900 GCAAATGATGTATGGTACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_99686; FTRINITY_DN57105_c4_g1_i2 1125 1146 TTCGATGATGTATGGGACAAAG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_204880; FTRINITY_DN56989_c1_g1_i4 2593 2614 ACGGGTGATGTATGGGACGTGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_99688; FTRINITY_DN57105_c4_g1_i4 1125 1146 TTCGATGATGTATGGGACAAAG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_204878; FTRINITY_DN56989_c1_g1_i3 2907 2928 ACGGGTGATGTATGGGACGTGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_15944; FTRINITY_DN59205_c2_g1_i19 380 401 GAGGATGATGGATTGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_101592; FTRINITY_DN54981_c5_g5_i1 870 891 GAAGATGAAGGATGGAGTGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_15948; FTRINITY_DN59205_c2_g1_i22 967 988 GAGGATGATGGATTGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_15942; FTRINITY_DN59205_c2_g1_i18 1062 1083 GAGGATGATGGATTGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_57946; FTRINITY_DN57897_c2_g2_i1 141 162 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_57952; FTRINITY_DN57897_c2_g2_i2 221 242 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_85733; FTRINITY_DN56694_c0_g1_i1 352 373 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_85714; FTRINITY_DN56651_c2_g8_i1 698 719 GATGGTGATGTATTGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_228402; FTRINITY_DN52720_c1_g3_i8 240 261 AGGGTTGATGTATTGAACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_228395; FTRINITY_DN52720_c1_g3_i4 249 270 AGGGTTGATGTATTGAACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_126320; FTRINITY_DN55680_c3_g1_i1 469 490 TCTCATGATGTATGCAGTGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_509028; TRINITY_DN48114_c0_g4_i5 811 832 TTGGACGATGTATGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_509014; TRINITY_DN48114_c0_g4_i1 913 934 TTGGACGATGTATGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_385304; TRINITY_DN47239_c3_g1_i3 208 229 GACGATGATGTATGGAGCGAGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_389308; TRINITY_DN64584_c0_g1_i1 151 172 ATTGAAGGTGTATGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_420965; TRINITY_DN48784_c1_g1_i5 2243 2264 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_420977; TRINITY_DN48784_c1_g1_i9 2465 2486 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_420964; TRINITY_DN48784_c1_g1_i4 2550 2571 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_420959; TRINITY_DN48784_c1_g1_i1 2824 2845 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_420963; TRINITY_DN48784_c1_g1_i3 2882 2903 TGAGGTGATGTATGTAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_290564; TRINITY_DN49163_c2_g3_i2 1669 1690 GCAGATGATGTATGGTATGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_290575; TRINITY_DN49163_c2_g3_i8 1805 1826 GCAGATGATGTATGGTATGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_467911; TRINITY_DN49298_c3_g1_i1 680 701 TAGGATGATTTATGGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_467921; TRINITY_DN49298_c3_g1_i11 1139 1160 TAGGATGATTTATGGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_467916; TRINITY_DN49298_c3_g1_i6 1244 1265 TAGGATGATTTATGGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_467913; TRINITY_DN49298_c3_g1_i3 1311 1332 TAGGATGATTTATGGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_467917; TRINITY_DN49298_c3_g1_i7 1416 1437 TAGGATGATTTATGGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_467918; TRINITY_DN49298_c3_g1_i8 1811 1832 TAGGATGATTTATGGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_467919; TRINITY_DN49298_c3_g1_i9 1916 1937 TAGGATGATTTATGGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_277359; TRINITY_DN45771_c1_g1_i4 717 738 CATGATGGTGTAAGGGATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_277356; TRINITY_DN45771_c1_g1_i1 717 738 CATGATGGTGTAAGGGATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_491769; TRINITY_DN52808_c3_g1_i5 1571 1592 CATGATGGTGTAAGGGATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_277361; TRINITY_DN45771_c1_g1_i5 717 738 CATGATGGTGTAAGGGATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_277357; TRINITY_DN45771_c1_g1_i2 717 738 CATGATGGTGTAAGGGATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_277363; TRINITY_DN45771_c1_g1_i7 717 738 CATGATGGTGTAAGGGATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_491771; TRINITY_DN52808_c3_g1_i7 2714 2735 CATGATGGTGTAAGGGATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_277362; TRINITY_DN45771_c1_g1_i6 717 738 CATGATGGTGTAAGGGATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_428017; TRINITY_DN60810_c0_g1_i1 960 981 CTAGATGATGTATGGAGAGGGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_313041; TRINITY_DN46939_c1_g1_i2 2 23 TTGGATGTTGTATTGAACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_508946; TRINITY_DN48156_c2_g4_i2 1251 1272 TTGGATGTTGTATTGAACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_313056; TRINITY_DN46939_c1_g1_i3 2 23 TTGGATGTTGTATTGAACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_508937; TRINITY_DN48156_c2_g4_i1 1855 1876 TTGGATGTTGTATTGAACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_379049; TRINITY_DN50712_c1_g3_i4 3658 3679 AGAGATGATTTTTGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_379059; TRINITY_DN50712_c1_g3_i10 3814 3835 AGAGATGATTTTTGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_379052; TRINITY_DN50712_c1_g3_i7 3580 3601 AGAGATGATTTTTGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_379053; TRINITY_DN50712_c1_g3_i8 3567 3588 AGAGATGATTTTTGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_379046; TRINITY_DN50712_c1_g3_i2 3723 3744 AGAGATGATTTTTGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_379056; TRINITY_DN50712_c1_g3_i9 3567 3588 AGAGATGATTTTTGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_379051; TRINITY_DN50712_c1_g3_i6 3723 3744 AGAGATGATTTTTGGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_394492; TRINITY_DN53484_c0_g1_i1 160 181 GGAGATCATGAATGGAACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_438717; TRINITY_DN48313_c0_g1_i7 29 50 TTGGACAATGTATGGAACGATG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_438716; TRINITY_DN48313_c0_g1_i6 29 50 TTGGACAATGTATGGAACGATG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_438723; TRINITY_DN48313_c0_g1_i13 29 50 TTGGACAATGTATGGAACGATG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_290572; TRINITY_DN49163_c2_g3_i6 1690 1711 GCAAATGATGTATGGTACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_530103; TRINITY_DN51011_c4_g1_i7 1599 1620 TTCGATGATGTATGGGACAAAG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_466815; TRINITY_DN49248_c0_g1_i14 2204 2225 ACGGGTGATGTATGGGACGTGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_290571; TRINITY_DN49163_c2_g3_i5 1811 1832 GCAAATGATGTATGGTACGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_530101; TRINITY_DN51011_c4_g1_i6 1225 1246 TTCGATGATGTATGGGACAAAG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_530104; TRINITY_DN51011_c4_g1_i8 1225 1246 TTCGATGATGTATGGGACAAAG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_530099; TRINITY_DN51011_c4_g1_i4 1225 1246 TTCGATGATGTATGGGACAAAG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_466809; TRINITY_DN49248_c0_g1_i10 2595 2616 ACGGGTGATGTATGGGACGTGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_466817; TRINITY_DN49248_c0_g1_i16 2635 2656 ACGGGTGATGTATGGGACGTGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_466811; TRINITY_DN49248_c0_g1_i11 2681 2702 ACGGGTGATGTATGGGACGTGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_530096; TRINITY_DN51011_c4_g1_i1 1225 1246 TTCGATGATGTATGGGACAAAG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_466805; TRINITY_DN49248_c0_g1_i6 2909 2930 ACGGGTGATGTATGGGACGTGC BLAST psRNATarget
Ll_transcript_480897; TRINITY_DN52700_c1_g1_i20 585 606 GAGGATGATGGATTGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_480877; TRINITY_DN52700_c1_g1_i6 834 855 GAGGATGATGGATTGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_480891; TRINITY_DN52700_c1_g1_i15 834 855 GAGGATGATGGATTGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_480883; TRINITY_DN52700_c1_g1_i9 929 950 GAGGATGATGGATTGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_480894; TRINITY_DN52700_c1_g1_i18 929 950 GAGGATGATGGATTGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_289905; TRINITY_DN51371_c1_g2_i10 285 306 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_480885; TRINITY_DN52700_c1_g1_i11 929 950 GAGGATGATGGATTGAATGAGG BLAST psRNATarget
Ll_transcript_289892; TRINITY_DN51371_c1_g2_i2 285 306 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_289901; TRINITY_DN51371_c1_g2_i7 285 306 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_289897; TRINITY_DN51371_c1_g2_i5 285 306 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_289904; TRINITY_DN51371_c1_g2_i9 318 339 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_289891; TRINITY_DN51371_c1_g2_i1 528 549 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_289908; TRINITY_DN51371_c1_g2_i11 528 549 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_289899; TRINITY_DN51371_c1_g2_i6 318 339 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_289896; TRINITY_DN51371_c1_g2_i4 528 549 TATGATGATGTGTGGAGAGAGA BLAST psRNATarget
Ll_transcript_450962; TRINITY_DN50692_c0_g1_i10 622 643 GATGGTGATGTATTGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_450973; TRINITY_DN50692_c0_g1_i20 622 643 GATGGTGATGTATTGAATGAGT BLAST psRNATarget
Ll_transcript_478201; TRINITY_DN44411_c0_g1_i1 353 374 TCTCATGATGTATGCAGTGAGG BLAST psRNATarget

Expression of miRNA 88


Labels

FPAB_1 abscising flower pedicels (replicate 1)      PAB_1 abscising pods (replicate 1)      PW2_1   pods wall stages 4-6 (replicate 1)
FPAB_2 abscising flower pedicels (replicate 2)      PAB_2 abscising pods (replicate 2)      PW2_2   pods wall stages 4-6 (replicate 2)
FPNAB_1   non-abscising flower pedicels (replicate 1)        PNAB_1   non-abscising pods (replicate 1)        PW3_1   pods wall stages 7-8 (replicate 1)
FPNAB_2   non-abscising flower pedicels (replicate 2)        PNAB_2   non-abscising pods (replicate 2)        PW3_2   pods wall stages 7-8 (replicate 2)
LF1_1 lower flowers stage 1 (replicate 1)      PS1_1 seeds stages 1-3 (replicate 1)      UF1_1 upper flowers stage 1 (replicate 1)
LF1_2 lower flowers stage 1 (replicate 2)      PS1_2 seeds stages 1-3 (replicate 2)      UF1_2 upper flowers stage 1 (replicate 2)
LF2_1 lower flowers stage 2 (replicate 1)      PS2_1 seeds stages 4-6 (replicate 1)      UF2_1 upper flowers stage 2 (replicate 1)
LF2_2 lower flowers stage 2 (replicate 2)      PS2_2 seeds stages 4-6 (replicate 2)      UF2_2 upper flowers stage 2 (replicate 2)
LF3_1 lower flowers stage 3 (replicate 1)      PS3_1 seeds stages 7-8 (replicate 1)      UF3_1 upper flowers stage 3 (replicate 1)
LF3_2 lower flowers stage 3 (replicate 2)      PS3_2   seeds stages 7-8 (replicate 2)        UF3_2 upper flowers stage 3 (replicate 2)
LF4_1 lower flowers stage 4 (replicate 1)      PW1_1   pods wall stages 1-3 (replicate 1)        UF4_1 upper flowers stage 4 (replicate 1)
LF4_2 lower flowers stage 4 (replicate 2)      PW1_2   pods wall stages 1-3 (replicate 2)        UF4_2 upper flowers stage 4 (replicate 2)