ta-siRNA 118 details

ID118
SequenceACCGCATTTGGACTGTATCGGGCC 

Targets of siRNA 118

LuluDB transcript

Target start position

Target end position

Target sequence

BLAST target sequence

Target details
Ll_transcript_29455; 81 104 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_69200; 160 183 GGTCCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_182118; 20 43 GGCTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_54977; 139 162 GGTCTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_218145; 992 1015 GGTCTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_230846; 369 392 GGTTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_230845; 1169 1192 GGTTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_244803; 19 43 GGACTCGATACTGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_244805; 19 43 GGACTCGATACTGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_272687; 873 896 AATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_272691; 1036 1059 AATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_272689; 873 896 AATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_272693; 1036 1059 AATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_110516; 5 28 ACATCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_242696; 1233 1256 AATTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_235673; 66 89 TACCCGATACAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_178497; 45 68 GGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_178498; 69 92 GGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_8362; 18 41 GGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_238504; 151 174 AGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_91552; 614 637 GGCTTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_146346; 31 54 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_91547; 715 738 GGCTTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_91536; 991 1014 GGCTTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_10651; 1 23 GCCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_190553; 68 91 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_201072; 44 67 GGGCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_10296; 656 679 GGTCTGACGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_262899; 18 41 GGCATGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_262923; 18 41 GGCATGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_235391; 109 132 GGCATGATGCTGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_220076; 1670 1693 GACTCGATGCTGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_224765; 59 82 GGCCTGATGCAGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_53735; 1036 1059 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_53735; 1057 1080 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_217682; 738 761 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_217635; 832 855 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_217676; 980 1003 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_217670; 1022 1045 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_210692; 61 84 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_210696; 61 84 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_217660; 1729 1752 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_217656; 1971 1994 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_210694; 61 84 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_210701; 61 84 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_204094; 299 322 AATCTGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_69168; 296 319 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_250772; 216 239 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_250769; 216 239 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_45446; 1109 1132 TGTCTGATACGGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_204155; 57 80 GGTCTGATTCAGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_204159; 85 108 GGTCTGATTCAGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_58549; 937 960 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58550; 984 1007 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58556; 937 960 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58536; 984 1007 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58565; 937 960 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58545; 984 1007 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58563; 937 960 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58530; 937 960 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58569; 1023 1046 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58591; 984 1007 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58588; 984 1007 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58542; 1070 1093 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58590; 937 960 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58572; 937 960 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58557; 984 1007 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58538; 937 960 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58567; 984 1007 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58571; 937 960 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_58562; 1023 1046 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_192976; 355 378 GGTCCGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_192975; 355 378 GGTCCGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_64853; 44 67 GGCTTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_3346; 31 54 GGCCCAATATGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_89305; 138 161 GGTCTGGTATGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_214061; 313 336 GGCCCAATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_54974; 272 295 GGCTTGATGTAGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_146319; 353 376 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_142545; 622 645 AGCCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_54935; 334 357 GGCCTGTTGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_180102; 3 26 GGCCTGTTGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_72211; 410 433 AGTCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_10600; 954 977 GGCCCAATGCTGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129282; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_10601; 3076 3099 GGCCCAATGCTGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129283; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129280; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129278; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129275; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_129279; 977 1000 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_23017; 83 106 AACTCGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_306306; 190 213 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_405011; 760 783 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_405008; 1020 1043 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_405022; 1152 1175 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_405019; 1705 1728 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_405012; 2305 2328 GACCTGATACAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_477076; 49 72 GGCTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_283038; 275 298 GGTTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_315445; 836 859 AATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_315444; 999 1022 AATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_296824; 55 78 AATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_365815; 28 51 ACATCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_387906; 1227 1250 AATTTGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_379151; 82 105 TACCCGATACAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_316383; 45 68 GGATTGATACAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_526856; 15 38 GGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_388897; 164 187 GGCCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_435310; 51 74 GGCCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_435305; 890 913 GGCCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_330594; 2958 2981 AGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_330606; 3058 3081 AGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_330592; 3100 3123 AGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_330599; 3182 3205 AGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_330595; 3191 3214 AGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_330598; 3324 3347 AGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_330590; 3333 3356 AGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_330603; 3371 3394 AGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_330608; 3415 3438 AGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_514067; 129 152 GGCTTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_312041; 345 368 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_369828; 637 660 GGCTTGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_378096; 24 47 GGTCTGATGTAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_389794; 66 89 GGCTTGATGTAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_366941; 1149 1172 GGCCCAATACGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_366948; 1295 1318 GGCCCAATACGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_366949; 1592 1615 GGCCCAATACGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_329562; 129 152 GGCCCGATGGAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_329564; 129 152 GGCCCGATGGAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_403779; 207 230 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_403787; 1287 1310 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_403785; 1287 1310 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_403784; 1284 1307 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_403789; 1284 1307 GGTCCGATGCCGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_421353; 1806 1829 GACTCGATGCTGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_482455; 88 111 GGCCTGATGCAGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_349654; 99 122 GGCTTGATACGGTCCAAATCCGGT BLAST
Ll_transcript_345827; 1142 1165 GGTCTGATGCAGTCAAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_345840; 1226 1249 GGTCTGATGCAGTCAAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_345835; 1313 1336 GGTCTGATGCAGTCAAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_345842; 1397 1420 GGTCTGATGCAGTCAAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_415879; 1229 1252 GGCATGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_375478; 559 582 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_375478; 580 603 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_375440; 559 582 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_375440; 580 603 GGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_415870; 1229 1252 GGCATGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_415867; 1229 1252 GGCATGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_415866; 2357 2380 GGCATGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_518119; 85 108 GACCCGATGCAATCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_338109; 10 33 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_338106; 10 33 GGCCTAATACAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_311821; 619 642 AATCTGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_311818; 701 724 AATCTGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_311823; 703 726 AATCTGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_349881; 56 79 AATCTGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_349877; 56 79 AATCTGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_349875; 56 79 AATCTGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_349871; 56 79 AATCTGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_349878; 56 79 AATCTGATATAGTCCAAATGTGGT BLAST
Ll_transcript_466061; 340 363 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_327229; 1 23 GTCTGATGCAGCCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_329546; 1109 1132 TGTCTGATACGGTCCAAATGCAGT BLAST
Ll_transcript_291844; 26 49 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_291835; 99 122 GGCATGATATAGTCCAAATGCGAT BLAST
Ll_transcript_305990; 549 572 GGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_388885; 162 185 GGTCCGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_388880; 162 185 GGTCCGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_420266; 98 121 GGTCTGGTATGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_495081; 129 152 GGCCCAATATGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_502013; 37 60 GGCTTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_301573; 499 522 GGCCCAATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_454092; 20 43 GGCTTGATGTAGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_437838; 420 443 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_308800; 629 652 GGCTTGATGTAGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_284241; 658 681 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_284240; 658 681 GGTCTGATGCGGTCCAAATGCGGC BLAST
Ll_transcript_329984; 1218 1241 AGCCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_489570; 3121 3144 GGCCTGTTGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_341350; 661 684 GGCCCAATGCTGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_341351; 2126 2149 GGCCCAATGCTGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_319840; 944 967 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_319816; 944 967 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_319847; 944 967 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_319818; 944 967 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_319828; 944 967 GACCTGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_316357; 419 442 AACTCGATGTGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_89305; 138 161 GGTCTGGTATGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_272691; 1036 1059 AATTCGATGCAGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_526856; 15 38 GGCCCGATGCGGTCCAAATGCGGT BLAST
Ll_transcript_420266; 98 121 GGTCTGGTATGGTCCAAATGCGGT BLAST

Expression of siRNA 118


Labels

FPAB_1 abscising flower pedicels (replicate 1)      PAB_1 abscising pods (replicate 1)      PW2_1   pods wall stages 4-6 (replicate 1)
FPAB_2 abscising flower pedicels (replicate 2)      PAB_2 abscising pods (replicate 2)      PW2_2   pods wall stages 4-6 (replicate 2)
FPNAB_1   non-abscising flower pedicels (replicate 1)        PNAB_1   non-abscising pods (replicate 1)        PW3_1   pods wall stages 7-8 (replicate 1)
FPNAB_2   non-abscising flower pedicels (replicate 2)        PNAB_2   non-abscising pods (replicate 2)        PW3_2   pods wall stages 7-8 (replicate 2)
LF1_1 lower flowers stage 1 (replicate 1)      PS1_1 seeds stages 1-3 (replicate 1)      UF1_1 upper flowers stage 1 (replicate 1)
LF1_2 lower flowers stage 1 (replicate 2)      PS1_2 seeds stages 1-3 (replicate 2)      UF1_2 upper flowers stage 1 (replicate 2)
LF2_1 lower flowers stage 2 (replicate 1)      PS2_1 seeds stages 4-6 (replicate 1)      UF2_1 upper flowers stage 2 (replicate 1)
LF2_2 lower flowers stage 2 (replicate 2)      PS2_2 seeds stages 4-6 (replicate 2)      UF2_2 upper flowers stage 2 (replicate 2)
LF3_1 lower flowers stage 3 (replicate 1)      PS3_1 seeds stages 7-8 (replicate 1)      UF3_1 upper flowers stage 3 (replicate 1)
LF3_2 lower flowers stage 3 (replicate 2)      PS3_2   seeds stages 7-8 (replicate 2)        UF3_2 upper flowers stage 3 (replicate 2)
LF4_1 lower flowers stage 4 (replicate 1)      PW1_1   pods wall stages 1-3 (replicate 1)        UF4_1 upper flowers stage 4 (replicate 1)
LF4_2 lower flowers stage 4 (replicate 2)      PW1_2   pods wall stages 1-3 (replicate 2)        UF4_2 upper flowers stage 4 (replicate 2)