ta-siRNA 131 details

ID131
SequenceAACCGCATTGGGCTGCATCAGACA 

Targets of siRNA 131

LuluDB transcript

Target start position

Target end position

Target sequence

BLAST target sequence

Target details

Ll_transcript_90371; 68 91 AGTCTGATGCAGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_29455; 50 73 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_129110; 208 231 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_69168; 265 288 AGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_139064; 751 774 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_69181; 64 87 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_69180; 64 87 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_69176; 64 87 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_178497; 14 37 GGTCTGATGCAGCTCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_178496; 482 505 GGTCTGATGCAGCTCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_197399; 16 39 GGTCTGATGCAGCTCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_197401; 16 39 GGTCTGATGCAGCTCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_148937; 89 112 GGTCTGATGCAGTCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_242731; 255 278 GGCTTGATGCAGTCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_23915; 841 864 GGTCTGGTGTAGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_62375; 792 815 AATTTGATGTGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_90372; 81 104 GGTTTGATACGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_178502; 538 561 GGTTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_237338; 42 65 GGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_23934; 124 147 AGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_172414; 886 909 GGTCTGATGCGGCCTAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_172416; 886 909 GGTCTGATGCGGCCTAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_172412; 886 909 GGTCTGATGCGGCCTAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_172418; 886 909 GGTCTGATGCGGCCTAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_238504; 141 164 ATCCTGATGCAGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_23367; 491 514 GGCTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_126298; 23 46 GGCTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_126289; 23 46 GGCTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_19400; 166 191 TGAGATCGATGCGGCCCAGTGCGGTT BLAST
Ll_transcript_110515; 142 167 TGACATCGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_69168; 296 320 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_250772; 216 240 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_250769; 216 240 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_265510; 63 86 AGTCTAATGTGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_241759; 4939 4963 AATCCGATGCAGCCCAAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_241765; 5046 5070 AATCCGATGCAGCCCAAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_241760; 5372 5396 AATCCGATGCAGCCCAAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_241766; 5479 5503 AATCCGATGCAGCCCAAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_482974; 1004 1027 AGTCTGATGCAGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_482976; 1226 1249 AGTCTGATGCAGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_526873; 33 56 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_306306; 159 182 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_473277; 182 205 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_466061; 309 332 AGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_405011; 729 752 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_405008; 989 1012 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_405022; 1121 1144 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_526876; 837 860 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_405019; 1674 1697 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_526880; 837 860 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_526886; 837 860 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_405012; 2274 2297 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_526869; 837 860 GGTCTGATGCGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_377358; 1241 1264 GGTCTGATACAGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_377364; 1241 1264 GGTCTGATACAGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_390885; 440 463 GGTCTGATGCAGCTCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_434650; 48 71 GGTCTGGTGTAGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_517714; 133 156 AATTTGATGTGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_517713; 208 231 AATTTGATGTGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_316384; 91 114 GGTTTGATACGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_316385; 91 114 GGTTTGATACGGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_477075; 206 229 AGTCTCATGCTGCCCAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_437520; 540 563 GGTTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_294752; 143 166 AGTCTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_462064; 855 878 GGTCTGATGCGGCCTAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_462072; 855 878 GGTCTGATGCGGCCTAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_462062; 855 878 GGTCTGATGCGGCCTAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_528942; 316 339 ATACTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_528941; 316 339 ATACTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_528940; 316 339 ATACTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_528945; 316 339 ATACTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_404720; 70 93 GGCTTGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_330594; 2948 2971 ATCCTGATGCAGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_330606; 3048 3071 ATCCTGATGCAGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_330592; 3090 3113 ATCCTGATGCAGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_330599; 3172 3195 ATCCTGATGCAGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_330595; 3181 3204 ATCCTGATGCAGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_330598; 3314 3337 ATCCTGATGCAGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_330590; 3323 3346 ATCCTGATGCAGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_330603; 3361 3384 ATCCTGATGCAGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_330608; 3405 3428 ATCCTGATGCAGCCCGATGCGGTC BLAST
Ll_transcript_340958; 40 65 TGACATCGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_363214; 54 79 TGACATCGATGCGGCCCGATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_482684; 167 192 TGAGATCGATGCGGCCCAGTGCGGTT BLAST
Ll_transcript_466061; 340 364 AGTCTGATGCAGCCCAAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_327229; 1 24 GTCTGATGCAGCCCAAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_378882; 4925 4949 AATCCGATGCAGCCCAAATGCGGTT BLAST
Ll_transcript_378875; 5032 5056 AATCCGATGCAGCCCAAATGCGGTT BLAST

Expression of siRNA 131


Labels

FPAB_1 abscising flower pedicels (replicate 1)      PAB_1 abscising pods (replicate 1)      PW2_1   pods wall stages 4-6 (replicate 1)
FPAB_2 abscising flower pedicels (replicate 2)      PAB_2 abscising pods (replicate 2)      PW2_2   pods wall stages 4-6 (replicate 2)
FPNAB_1   non-abscising flower pedicels (replicate 1)        PNAB_1   non-abscising pods (replicate 1)        PW3_1   pods wall stages 7-8 (replicate 1)
FPNAB_2   non-abscising flower pedicels (replicate 2)        PNAB_2   non-abscising pods (replicate 2)        PW3_2   pods wall stages 7-8 (replicate 2)
LF1_1 lower flowers stage 1 (replicate 1)      PS1_1 seeds stages 1-3 (replicate 1)      UF1_1 upper flowers stage 1 (replicate 1)
LF1_2 lower flowers stage 1 (replicate 2)      PS1_2 seeds stages 1-3 (replicate 2)      UF1_2 upper flowers stage 1 (replicate 2)
LF2_1 lower flowers stage 2 (replicate 1)      PS2_1 seeds stages 4-6 (replicate 1)      UF2_1 upper flowers stage 2 (replicate 1)
LF2_2 lower flowers stage 2 (replicate 2)      PS2_2 seeds stages 4-6 (replicate 2)      UF2_2 upper flowers stage 2 (replicate 2)
LF3_1 lower flowers stage 3 (replicate 1)      PS3_1 seeds stages 7-8 (replicate 1)      UF3_1 upper flowers stage 3 (replicate 1)
LF3_2 lower flowers stage 3 (replicate 2)      PS3_2   seeds stages 7-8 (replicate 2)        UF3_2 upper flowers stage 3 (replicate 2)
LF4_1 lower flowers stage 4 (replicate 1)      PW1_1   pods wall stages 1-3 (replicate 1)        UF4_1 upper flowers stage 4 (replicate 1)
LF4_2 lower flowers stage 4 (replicate 2)      PW1_2   pods wall stages 1-3 (replicate 2)        UF4_2 upper flowers stage 4 (replicate 2)