ta-siRNA 241 details

ID241
SequenceAACACGTCTTGAACTAAAACCTTA 

Targets of siRNA 241

LuluDB transcript

Target start position

Target end position

Target sequence

BLAST target sequence

Target details

Ll_transcript_118411; 91 114 TATGGTTTTAGTTCAAGACGTGTT BLAST
Ll_transcript_188735; 112 134 CAAGTTTTAGTTCAAGACGTGTC BLAST
Ll_transcript_188723; 112 134 CAAGTTTTAGTTCAAGACGTGTC BLAST
Ll_transcript_256222; 107 130 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_256225; 107 130 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_204782; 41 64 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_204784; 46 69 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_111389; 28 51 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_50968; 49 72 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_151188; 4 27 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_256220; 69 92 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_256224; 77 100 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_256214; 107 130 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_50949; 117 140 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_1141; 163 186 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_50972; 133 156 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_949; 424 447 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_248353; 314 337 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_154048; 14 37 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_264744; 393 416 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_50954; 272 295 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_248345; 314 337 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_50963; 372 395 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_63101; 55 78 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_222604; 537 560 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_23920; 698 721 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_107806; 24 47 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_176943; 38 61 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_119092; 363 386 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_119099; 363 386 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_119106; 363 386 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_119098; 432 455 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_256215; 617 640 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_222592; 398 421 TAGGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_69261; 147 170 TAGGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_69272; 147 170 TAGGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_1835; 38 61 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGCT BLAST
Ll_transcript_111384; 6 29 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_100803; 37 60 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_69254; 708 731 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_148633; 652 675 TAAAGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_92846; 988 1011 TACGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_130857; 37 60 TAAAGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_92845; 1064 1087 TACGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_1844; 1825 1848 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_1839; 1861 1884 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_1837; 2070 2093 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_1836; 2210 2233 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_1838; 2246 2269 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_1840; 2455 2478 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_67924; 643 666 TGAGGTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_76260; 29 52 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_175241; 8 31 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_50938; 157 180 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_50937; 157 180 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_121729; 34 57 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_121730; 34 57 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_121734; 34 57 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_218354; 664 687 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_218360; 1101 1124 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_218356; 664 687 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_215685; 81 104 TAAGGTTTTCGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_237252; 211 234 TAAGGTTTCAGTTCAAGACGTCTT BLAST
Ll_transcript_49919; 15 38 TAAGGTTATAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_70364; 107 130 TAAGGTTTTAATTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_133019; 409 432 TAAGGTTTTTGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_43109; 1033 1056 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_43107; 1393 1416 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_43095; 1463 1486 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_43099; 1033 1056 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_43103; 1393 1416 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_43114; 1463 1486 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_179826; 34 57 TAACGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_179825; 34 57 TAACGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_179824; 34 57 TAACGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_51318; 120 143 TAAGATTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_372191; 13 36 TATGGTTTTAGTTCAAGACGTGTT BLAST
Ll_transcript_421315; 112 134 CAAGTTTTAGTTCAAGACGTGTC BLAST
Ll_transcript_421325; 112 134 CAAGTTTTAGTTCAAGACGTGTC BLAST
Ll_transcript_409116; 43 66 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_529253; 31 54 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_475810; 24 47 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_403948; 47 70 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_475766; 221 244 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_326948; 28 51 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_303808; 64 87 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_436565; 255 278 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_520743; 247 270 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_345404; 53 76 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_493066; 34 57 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_531677; 329 352 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_311597; 51 74 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_483834; 578 601 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_339263; 698 721 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_483836; 702 725 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_483844; 718 741 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_397769; 838 861 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_326943; 756 779 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_483831; 895 918 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_407211; 721 744 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_483835; 995 1018 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_407212; 721 744 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_345781; 33 56 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_407215; 721 744 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_326937; 1230 1253 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_483821; 1378 1401 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_483833; 1478 1501 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_483838; 1512 1535 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_436569; 1646 1669 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_483845; 1628 1651 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_436546; 1694 1717 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_436545; 1799 1822 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_409093; 2202 2225 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_409100; 2845 2868 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_345402; 53 76 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_382017; 3441 3464 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_345405; 53 76 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_397787; 120 143 TAGGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_345741; 680 703 TGAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_314677; 89 112 TAGGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_345740; 937 960 TGAGGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_369926; 13 36 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_382796; 252 275 TAAAGTTTTAGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_423470; 47 70 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_405635; 84 107 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_326916; 1491 1514 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_311581; 977 1000 TACGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_311612; 995 1018 TACGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_326930; 1798 1821 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_326942; 1876 1899 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_326934; 2043 2066 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_326919; 2183 2206 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_326940; 2428 2451 TAAGATTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_397778; 591 614 TAAACTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_510105; 2523 2546 TGAGGTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_510099; 2523 2546 TGAGGTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_528940; 560 583 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_436558; 34 57 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_423484; 128 151 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_423478; 128 151 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_528945; 560 583 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_360029; 1063 1086 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGAT BLAST
Ll_transcript_423476; 128 151 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_423475; 128 151 TAAGGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_326923; 1230 1253 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGCGTG BLAST
Ll_transcript_369933; 221 244 TAAGATTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_311598; 77 100 TAAGGTTTTACTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_384908; 261 284 TAAGGTTTCAGTTCAAGACGTCTT BLAST
Ll_transcript_527563; 419 442 TAAGGTTTTTGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_423899; 1383 1406 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_423895; 1434 1457 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_423907; 1685 1708 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_423902; 1702 1725 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_423896; 1736 1759 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_423901; 1823 1846 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_423892; 2004 2027 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_423905; 2125 2148 TAGGCTTTTGGTTCAAGATGTGTT BLAST
Ll_transcript_405603; 82 105 TAAGATTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_497796; 775 798 TAACGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_497788; 775 798 TAACGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_497787; 775 798 TAACGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_497798; 775 798 TAACGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_497794; 775 798 TAACGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_497782; 775 798 TAACGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_497785; 775 798 TAACGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_497777; 775 798 TAACGTTTTGGTTCAAGACGTGGT BLAST
Ll_transcript_409116; 43 66 TAAGGTTTTAGTTCAAGACGTGGT BLAST

Expression of siRNA 241


Labels

FPAB_1 abscising flower pedicels (replicate 1)      PAB_1 abscising pods (replicate 1)      PW2_1   pods wall stages 4-6 (replicate 1)
FPAB_2 abscising flower pedicels (replicate 2)      PAB_2 abscising pods (replicate 2)      PW2_2   pods wall stages 4-6 (replicate 2)
FPNAB_1   non-abscising flower pedicels (replicate 1)        PNAB_1   non-abscising pods (replicate 1)        PW3_1   pods wall stages 7-8 (replicate 1)
FPNAB_2   non-abscising flower pedicels (replicate 2)        PNAB_2   non-abscising pods (replicate 2)        PW3_2   pods wall stages 7-8 (replicate 2)
LF1_1 lower flowers stage 1 (replicate 1)      PS1_1 seeds stages 1-3 (replicate 1)      UF1_1 upper flowers stage 1 (replicate 1)
LF1_2 lower flowers stage 1 (replicate 2)      PS1_2 seeds stages 1-3 (replicate 2)      UF1_2 upper flowers stage 1 (replicate 2)
LF2_1 lower flowers stage 2 (replicate 1)      PS2_1 seeds stages 4-6 (replicate 1)      UF2_1 upper flowers stage 2 (replicate 1)
LF2_2 lower flowers stage 2 (replicate 2)      PS2_2 seeds stages 4-6 (replicate 2)      UF2_2 upper flowers stage 2 (replicate 2)
LF3_1 lower flowers stage 3 (replicate 1)      PS3_1 seeds stages 7-8 (replicate 1)      UF3_1 upper flowers stage 3 (replicate 1)
LF3_2 lower flowers stage 3 (replicate 2)      PS3_2   seeds stages 7-8 (replicate 2)        UF3_2 upper flowers stage 3 (replicate 2)
LF4_1 lower flowers stage 4 (replicate 1)      PW1_1   pods wall stages 1-3 (replicate 1)        UF4_1 upper flowers stage 4 (replicate 1)
LF4_2 lower flowers stage 4 (replicate 2)      PW1_2   pods wall stages 1-3 (replicate 2)        UF4_2 upper flowers stage 4 (replicate 2)