ta-siRNA 61 details

ID61
SequenceATAGTCTGCTTGCACAATTTGGGC 

Targets of siRNA 61

LuluDB transcript

Target start position

Target end position

Target sequence

BLAST target sequence

Target details

Ll_transcript_90289; 15 38 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_114374; 277 300 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_90312; 59 82 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_114376; 82 105 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_255738; 1067 1090 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_255739; 2558 2581 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_255737; 3558 3581 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_255740; 3651 3674 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_255733; 3681 3704 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_255741; 3774 3797 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_255734; 4681 4704 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_255735; 4774 4797 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_115721; 1396 1419 GCCTAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_193376; 17 40 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_193379; 17 40 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_50427; 5140 5163 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_50433; 5538 5561 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_50432; 5540 5563 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_50434; 5563 5586 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_50436; 5938 5961 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_50431; 5961 5984 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_90315; 916 939 GCCCAAGTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_90287; 1007 1030 GCCCAAGTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_255736; 146 169 GCCCAAATTGTGCAAGGAGACTAT BLAST
Ll_transcript_225069; 1658 1681 GCTAAAATTGTGCAAGCAGATTAT BLAST
Ll_transcript_225063; 1660 1683 GCTAAAATTGTGCAAGCAGATTAT BLAST
Ll_transcript_205781; 1236 1259 GATAAAATTGTGCAAGCAGGCTAT BLAST
Ll_transcript_53223; 325 348 GCCCAAAATATGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_13512; 88 112 GCTGAAAGTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_112334; 131 155 GCTAAAATTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_112318; 131 155 GCTAAAATTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_112315; 496 520 GCTAAAATTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_112328; 438 462 GCTAAAATTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_171205; 5085 5109 GTCAAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_171209; 5400 5424 GTCAAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_193377; 55 78 GCCCAAAATGTGCAAGTAGACTAT BLAST
Ll_transcript_49913; 317 340 GTTTAAATCGTGCAAGTAGACTAT BLAST
Ll_transcript_19584; 84 113 GCCGATTTACAAAATGTGTAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_193397; 1756 1780 GCCTAAAAATGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_193386; 1756 1780 GCCTAAAAATGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_4150; 4 27 ACCTAAACTTTGCAAGCAGACTAC BLAST
Ll_transcript_490406; 229 252 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_312167; 62 85 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_455752; 589 612 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_480585; 883 906 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_480575; 882 905 GCCCAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_429191; 4059 4082 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_429181; 4214 4237 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_429180; 4459 4482 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_429179; 4590 4613 GCTAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_312157; 77 100 GCCCAAGTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_493083; 68 91 GCCCAAGTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_493098; 106 129 GCCCAAGTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_493078; 106 129 GCCCAAGTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_493095; 106 129 GCCCAAGTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_312166; 166 189 GCCCAAAATGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_460535; 99 122 CCCCAAAATGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_460500; 1 19 ATTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_455729; 667 690 GCCCAAATTGTGCAAGGAGACTAT BLAST
Ll_transcript_455728; 1096 1119 GCCCAAATTGTGCAAGGAGACTAT BLAST
Ll_transcript_493076; 1723 1746 GCTAAAATTGTGCAAGCAGATTAT BLAST
Ll_transcript_493063; 1725 1748 GCTAAAATTGTGCAAGCAGATTAT BLAST
Ll_transcript_493065; 1956 1979 GCTAAAATTGTGCAAGCAGATTAT BLAST
Ll_transcript_493072; 2271 2294 GCTAAAATTGTGCAAGCAGATTAT BLAST
Ll_transcript_493069; 2382 2405 GCTAAAATTGTGCAAGCAGATTAT BLAST
Ll_transcript_493074; 2502 2525 GCTAAAATTGTGCAAGCAGATTAT BLAST
Ll_transcript_493073; 2613 2636 GCTAAAATTGTGCAAGCAGATTAT BLAST
Ll_transcript_493070; 2942 2965 GCTAAAATTGTGCAAGCAGATTAT BLAST
Ll_transcript_373110; 1292 1315 GATAAAATTGTGCAAGCAGGCTAT BLAST
Ll_transcript_373131; 1292 1315 GATAAAATTGTGCAAGCAGGCTAT BLAST
Ll_transcript_312172; 427 450 GCCCAAAATATGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_460532; 118 142 GCTAAAATTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_460522; 118 142 GCTAAAATTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_460509; 118 142 GCTAAAATTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_460504; 118 142 GCTAAAATTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_460525; 118 142 GCTAAAATTTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_299974; 4215 4239 GTCAAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_299975; 4267 4291 GTCAAAAATTGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_359171; 190 213 GCCCAAAATGTGCAAGTAGACTAT BLAST
Ll_transcript_359172; 74 97 GTCCAAAATGTGCAAGCAGATTAT BLAST
Ll_transcript_385459; 562 585 GCCTAAAATGTGCAAACAGACTAT BLAST
Ll_transcript_478291; 702 731 GCCGATTTACAAAATGTGTAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_460530; 1653 1677 GCCTAAAAATGTGCAAGCAGACTAT BLAST
Ll_transcript_460513; 1694 1718 GCCTAAAAATGTGCAAGCAGACTAT BLAST

Expression of siRNA 61


Labels

FPAB_1 abscising flower pedicels (replicate 1)      PAB_1 abscising pods (replicate 1)      PW2_1   pods wall stages 4-6 (replicate 1)
FPAB_2 abscising flower pedicels (replicate 2)      PAB_2 abscising pods (replicate 2)      PW2_2   pods wall stages 4-6 (replicate 2)
FPNAB_1   non-abscising flower pedicels (replicate 1)        PNAB_1   non-abscising pods (replicate 1)        PW3_1   pods wall stages 7-8 (replicate 1)
FPNAB_2   non-abscising flower pedicels (replicate 2)        PNAB_2   non-abscising pods (replicate 2)        PW3_2   pods wall stages 7-8 (replicate 2)
LF1_1 lower flowers stage 1 (replicate 1)      PS1_1 seeds stages 1-3 (replicate 1)      UF1_1 upper flowers stage 1 (replicate 1)
LF1_2 lower flowers stage 1 (replicate 2)      PS1_2 seeds stages 1-3 (replicate 2)      UF1_2 upper flowers stage 1 (replicate 2)
LF2_1 lower flowers stage 2 (replicate 1)      PS2_1 seeds stages 4-6 (replicate 1)      UF2_1 upper flowers stage 2 (replicate 1)
LF2_2 lower flowers stage 2 (replicate 2)      PS2_2 seeds stages 4-6 (replicate 2)      UF2_2 upper flowers stage 2 (replicate 2)
LF3_1 lower flowers stage 3 (replicate 1)      PS3_1 seeds stages 7-8 (replicate 1)      UF3_1 upper flowers stage 3 (replicate 1)
LF3_2 lower flowers stage 3 (replicate 2)      PS3_2   seeds stages 7-8 (replicate 2)        UF3_2 upper flowers stage 3 (replicate 2)
LF4_1 lower flowers stage 4 (replicate 1)      PW1_1   pods wall stages 1-3 (replicate 1)        UF4_1 upper flowers stage 4 (replicate 1)
LF4_2 lower flowers stage 4 (replicate 2)      PW1_2   pods wall stages 1-3 (replicate 2)        UF4_2 upper flowers stage 4 (replicate 2)