| Id Trinity | FTRINITY_DN51779_c0_g1_i11 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_26129 |
| Sequence | TGTTTTATTGAGAAGTGGAAAATGTATGCCAGTTTCTTTTACATTGACTTTCCTTTTTATTTTATACTTTACCTGCCATCATTTGGTTCTGTAATTTTTC AAATTTCCAGCACAAGAGAAATCTTCAATAAGCATGCACTTGGAGGAACTGGATGATTCACAAAAAATTGAAGACGGGGGTGCCAAGGTGATCACGTGGC AGGAGTATGTTTCTCGACTACATGAGCTCAAAGATGAAATTAATCGTTCTTGGCTTGCTGAAGATCGTGTAACATCCTTGAGGTTATCCATAAAGGTTGC TAAGCTTCTGATGGATACGTCAGTTTCTGAGTTTTATCCTACACTTTTTGTCCTTGTCACAGATATCATGGACATGCTCGGGGATCTGGTTTGGCAACGC ATAAGGAGGAAAGCTGAGTTTTCTGAGGAGGGAACTTTACTGTGCAACTTACCAGAAAACTTTGGAGCAATTGATATTTGTGCTGATGCGAAAGAAACTT GCAATAACTGGTTCATCAAAATTGGTTCTGTACAAGAGCTTCTTCCACGCATGTGAAGTCCTTATCCTTCCCTATGTATTTAATTTTTGTTCTCTGTTTG AGTCTGTCTGAGACTTTATGATGCCATGTCCACTATTATTTTCTTCTTAATCACAATTGGAAATCCAAGAATCTACTTTTAAAAGGCTGTTCATTATTGC ACTCTTACAAAAATCACAAGCAACTAGATTTCCATAGTCTTAAAGCTAAACCTAAATCCACATCAACAAAGAAATAGCTTCTTTGCTACAATCATATTGC ACATGGCTACATTTTTGGATGAAAAGCACCTTTTTAAATATTAAAACCGTTCCCGAGTCTGAATCTATGTGTGCATGCTTTTGGATAATTTGGTTCCTAA AAAGCTACCAAAGCTTATTTGATCAAGTAATCTGAAATTTATTCTTTTTCTCTCGTTCTTTAGTAGAAGACTGGTTTTGCAAGAATACGATGCCATTGTT TGATCCGTGTAGCCTTGTTAAATATAAAATTAGTTCCTGGGTCTGCAATTAAATGCTTATGCATTTGCGATAATTTGATGCTTGGCAATCTATGGAAGCT TTTCCATGAAGTATTCTGGCATTTGATAATTTTTCTCTTGTTCTTCTGATTGAATCAAAATTTTATTACGAAGTTGGTTTTTGACGGAACACAATATGGT CATTTGATCGATGTACCCGATCCCACCAAGCTAGAAAAGGCTATGATTGTTGTTATAAGATTTGAATAGTCACTGTTTTGTTCATGCATTTGCCCAAAAA GGCTTCCATATTAAGGATAGAAGCTAATCTTGCACCTAGTGGTGTACTCTTTTGGGATGATTTGGTTTCAGCTAGAAATTAGGCCAGTGGATGGTGAATA TATGTGAACTACATGAGCTTTGATGGTAAATAAGTTGGACTGGATACATGTTGTCGGAGATTTTTGGGCAGTGTTACTTGGAACTGGCAATATTGCCTTG CTGGCGCTTTCTGCTTGATCAACCTGCAGACAGTCTCCGGCGTTTGGTAATGATGACAAGAGGATTAGGAGATCCAGTGGCTTCTGCATATTGCCGTCTA TACATGGCTCACTGTGCTCAGAAGCTGCCTGCACATGATATTGGTTACCTTGTTACTTGTGTTAATGACATCACATATATATTGATGCAAATGTTGTCAG CAAAAGAAAGCACTCATGGAAATGTTCAAAGCTTCAAAAAATTACAAGTTAGTCAGATGGAACCAACCATTCAGTATATTATGAAGTGTATATTTAATGG GTTGTCTCAGAGACAAGTCAGTGAAGTTCTCGTGGAGCTTGGATTTATGAAGAGTCAACAGGATTTTCCGAGGGTCTCAGTTGTTCTTCATCATTTACTG AAGGAACTCCCTATCGAAGTTGTTTGTTCAAATGCTCTGCAGATCCTTCATCTCATTGAATTTAGCAAGGATAGTTCCTTTGATCAGCACATGAATTACA GATTGGTTGGATTCAGGCTGTATGAGATGAAACCTCCAGTTGACGTTCTCAATGCTGTATTAGATAAAGTCATTCAGGTTATTACTCAGTATGAGAGCCT TGATGAGTACTTGAAGGTTGTAGATGCTTATGCTGATCTTATTCTTCAGAATCAGATGGATAACATTTTGAACACCATTTTGGAAGGCATTTCACAGCGT GCTAGGAATAAAGGAGTTACAGAAGATGAAATGCCAAGCTTGCAATCTCTCTTGGTGAAGCTTCTGTCTCATTTTAAGTGTCTGGAAGATGTGTTTTGTC TGAATTGCTTTCCTGAAATCTTAGATATGATGCGTGGGAATTCACGCGATGTTGTCTTTTTGCACATCCTTAATATGGCAACAAGGAAAGGTAACATCAG TGACGCGACGAGCATACAATTGCTTTTTGAAATTTCTCAAACTCTACATGACAATTTGGAATTCATGAATGTGAAAGATGATGATAGACTAGTGGCACGT TCAATCACTCGCTTTGTGCACATGGTAGATTATGGAGCAGAGATGGAACGCCATTTAGCATTTTTGGTTGATTGCAGAGGAGCTTTTGGTAAATTAAATG AGCTTAAGGAAGCTCTTGTTCATTCTAGCAACTATTTAGCAATTCAAGCTTTGAAATGTCCTAAGAAACTTCCAAGTTGTTTTTTTAAATCCTGCATCAC ATTTAGCGAAGTCACAATACCTTCCGTTACTGCTCAGGGTAGGCAATTTGATCTATATCTAGAGACTACAGAGGTTGCACTCTTAGGGGGCTTGATTTCT CATTCAGATGGATTGATTGATTCAGCAATTGGCTATTTGTGTACCGTTAACATATTGGATGCCTTTCGGATGCCGAGTGATGTTGAAGGACTAGTTTCAT CAATTAGAAAGCTTTGTGGCATCTTAGTTCTGGTTCCAGGTAATTTTACTCTACCTGCCACCGATGTCCCAAACAACTTATTTACATTGATCAGCTCCCA ATCATGGTAAGTTTTCTCTCGGGTATATCATATGATTGAAACCTCTTTCTTGTTTGTTGATGTCTGTGGAGAACACTAACCTTGTTATTTTAATTTCTCT TTTCCCTTTCTGTATCTTGTTTGATGAATGAATTGAAAAACCCTTGTAGTTATGAACCAAAAATGAGGACAAAGATTTTTTCTGCAATCATATTACTATT GACAACTTTATCACAGGAGACTTTTCCATATCATGCAAATATACAGGTATGGCTTTACCTTTCCTTAATGTATTCTGCGATTGAAAGTAATTGTTAATGT AAGTTTAATGGAATAAAAATGACATACCATTGGTCCTAGTCCTACAATCTAAAATGGACAAAATGGAACATCAAAGTTTTTTAAAGAGTATTTAGGAAAG TCTCATGAGTCATAATGGGTATAAGTATCATTTGGTGTCCATATCTCCAAAATTTAGTCTAGGATTAGCACTTACGTGCTACAACTATTTTGAGCCACTT TAGTGAATCTATATTACTTTCATCTCACTTTTCTCTTTCAAAATATCCATGCTTCTCTTAATCCTATGACTCATATTAACAAAGTTCAGTAATGCCTTGT CATGCACTGATCTTCCCTAGTGACTAACCAATAATGAACCTAACGTTACCTGCTAAGGCCTTTTTCCACCTCTAGGCGCGCTCTGTACAGAGCTTTTCGA AGGTGAGACTATGTTACCATTATCCTCTACATTGGGTCATCTTTGAAATGAATATCACCAATTGTCTGGGGAAGCCATAATCCCTCTTTCAATTATAATG CCATGCACTATCTTAGTTATGATAAGCAGTTTCTAGCCATGACGCTGCTTGAGTTTTACCTTTTTTTCATACTTACACTGGCTATAATAAGTGCAATGGT TTATGATTTTGTAAATCGCAGTCTTCCTGATCAGTCTACTAACTTTTATTGTATATCTTAATTCCCAAAGCGATGTATTTTTTCCTTTCCAGATTCCCAG AAATGACACGTTATATTATGGGGATTTATCTTATAAGCAAGAACTTGTTTCTCTGTCTAAACTTGTTCTTGAGAACCTGATTAGTGCAGTTCAAGAAGAA AGTTCCAAGGTATGATCATTTTTACTTAATTAATGTTGTTTGGTTTGTAGACCAATCATAATCATACTGAAATACTATGCTAAAATGATGGCTGTGTTAA AATATTTATAAAGTATCTTAAAGGCAGAGAATAATGCCTAGTAGATTAATATATAATTTTTGTATCATATTTATTTTAGGGACAATTGTGTCACCTTATA TTTAGTAGTCTTTTCCTTTTAGGAATCTTGTTCTTAGGGATATTAGCTTATTTTTTAATAATTTCAACAGGCTGTTCGAGGAATTATTGCACTTGAAGCT TGCAATTGCATTGCATCATCTTTCAGGGCAAGCGAGGAATTATTGAGTGTTTGCCAGATGCTAATTGAGACGGCCAAGTCATGTTTGAGTCCCACAGATA AATACCTCCACTCTACCATTCTATTTCTAACCAACCAATCCACCACTTCTCTATAATTTGTGTTCTATATGCTCATAGCATAGCTTTTTATACATGTATA TTGTAACATTATCATCATTAGTAATACTTATCCTCCTTTTTTGGGGGGAAAGAGATTCTTTATTTAATTTCATTTAATTTTGTTTTTGTGCATTTTGAAG AGATAAAAAATGTCGATACATGTTGATTTAACGATCATTATCAAACAAGTAGTGAAATTTTGATCTGAACTTGTTCATAGTAGTTATAATATAAAAATGT GAACAAAGAGAACTATACTAATCATCCCTCTAGATGTTAATCGAGAATTGATGGACTTGTTTGGATCTAGCCATTGAGCATGTTTTTTGGTTGGTATTTG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_22868; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_26129
| Blastp | UPF0505 protein from Dictyostelium with 23.56% of identity |
|---|---|
| Blastx | UPF0505 protein from Dictyostelium with 23.56% of identity |
| Eggnog | Chromosome 16 open reading frame 62(ENOG410XQR5) |
| Kegg | Link to kegg annotations (DDB_G0273473) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019456613.1) |
| Pfam | Vacuolar protein sorting-associated protein 35 (PF03635.16) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |