Ll_transcript_230878

• Id Trinity: FTRINITY_DN52375_c6_g3_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_230878
• Sequence: CTATAACTGGTATGCAACATTAACCTTACCTTCAATATTTGAGGGAAGAGAGAAAGTGATAGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAACAATGATGACAACTT CAGCAGTTTCATTTGGTAACAACTTTGCTCAATGTTTTCCCAAAACCAAAACTTGTTCATCATCTTCAACAAAGGACCTTGCTTTCATCACCTCACAGTT GAGTGGTCTAAGAATCTCTTACAACCCTTCACCCAAATTACCCTCTTCCATTGTTGCTTCACCAATCATTCCTGTTTTGAAGCCTCTTGCTAGTAATTCC TTTACCCTTTTCATTGATTTCACATATTGGGTTTTAATTTCAGTGAATTATTTGTTTTTTTAATGGTTAGTTCTCTGTTTTTTGTGGCTTTGGATTTGGA ATTGTTTGGTTTCATGTGTTTTCCGGTGTTTTAAATTGTGGTTGTGGGTACTGCACTTGCGGTTGTGGAAAATTATGGGAAAATGCGGCCGCTATTGTGG AGACTAATGAAACTGCAATATTGCGGCCGCAATTGCCATTGTAGAGTGCAATTTAAAACACTGGTATTTACGAGAATTTCATGGAATTTGGTGAAGACCC TTTAATCTTTTCCTGCCGTTTTATACTCTGAATCTCTGATGATTTCTTGTGGAATTAGTAAGAATTTGATAGAGGTACTGGTGTGTGGTTCATCACTTTG CATATTGTATTTCAAGATTTTCATTCTTTAAGGTAGACTTGGTATTGTTTTCTACTGTTTTTTGTGCTTAGAAATTTGGACAGGCTTATTTTGAAGAAAA TTTGGATAGGCTTACTCATGAAAATTTGGATTGGCTTATTCTGATGAAAATTTGGATTGGCTTATTCTGATGAAAATTTGGATTGGCTTATTCTGATGAA AATTTGGAATTCTGCCTAATGACTGACTATGGTTGCAAAGAAACTTTGTGGAATTTTTAATTTTGTTGGCTTTGAATCGTATCAATGTTGTGGATCTAAC AAGAATAAACCATTATAAAACGGCGGCTTGGTGAACAGCTCTCACCTAGTGAGGTCCGGGAAGGATAGATGTACACTGTCTATCTTGGCAAGCGAATAGA CTGTTTTTCAATATTTGAACTCATGACCTCCATATACAAGGCAAGCAATCTTATCGTTGCGCTGAGGCTCAGCCTCAAAAATGAATCATCATAAAGTAAC TCAATTAGCTAGGTATTTCGATGCTTGAGTCAGAGTCCTTTCTATGCTACTGATGACATGATAGATTGGGTTTCTTTTGGGATCCAATGGAAGTCAACGA AAAAGCGATCAAGGCGTGAAAACGGAAATATGTTTGTGTTCATAATGTTGCTTCATTCTTTCTGTTTTCCCCTTTTCTATCTTTGTTTTTGACATTCTAA ACATTAGTAGTTAGGCATGTGATAAGTCTTGCTTTGCTTTGACTGTATATATGACTATATTACTAAAAAGTTCTTATTCAATATGGAGCCAGCTTTGTAT CGGTCCATTTTTTCCGGTACGATCCCGCATAGGGACTTTATCAAGTTCTTGGCAACTTTAGTCAGCACAAAATAATATGACAGTAACTATAACACAAACC CTTGTTTTCTATCAGTTGAGTTCATGGCTTCCCATGTATCCAAAATCCTTCTTAATGATTCCCTTCATTTCTTATTTTTGGTTTCCCGCTATAAAGAAGC ATCATCGATCTTCTTCCTAGGGTAGGGTTTGGTTAGGTTGTGATCCTTCGAGCTCGAACCATCTTAAATGGTTTTTGCAGGATTCTTTTCAATCTTCTAA TAATTCCAATCCTAACTGTAGATTCCTAGTTAGGTTTTACTTTAGCATAAAATTGTTTCTACTTAGTAATACGGCTTATAGAGAATGGCGGATTCTATGG TACAGCCTCGGTTTATAACAACGCGCCACGAGAATGATCATTGAAATGATCACAATCTGTGTCTTGAAACTTTGAGAATGGGATGGCATATTCGATACAC TGCCGATGTCATTTTCAAAGAGGATAGTTGTGCACCTGAGCTGTACCTAGAAGCCACTATGGAGAATTTTGTTATGTTTTATGTTTTGCTAAGAATCCTC TATAAAGAAATTGCATACATAAGATGTAGAATAGAACTACTGAGAAACAATAAGTACTGCTGCAATGATCATGTGATATTGGTTCAGTCTGAATCTATTT ATCTGGTGAAACTCATGTCGGGTGTGTAAAAAAATACGTAAAAAGGGCAGCCTAATGCACGAGGCTTCCACGTATTGTAGTCCAGGAAGATCTGGAAATA AAACAGACACACATGGTCATGCTCCCTGGCCATGTGTGCTTGTTTGTAGTCTTTTTAACATGTTGATGATTAATATATATTACCTTATTATTTTCTTGGA TAGAAAGGACTAACACTAATATTCTCTAGCTCTTGCTTCATCTTACAGTGACACATTATTGTCTTGTTAATTTATGTTGGCCAACAAAAAATGTTTCATT TGATCGGTAGGAATAGTAGAATATTTTTTGTTGGTAGTATCAATTGTATCTCCTCACCCTATGGATAAGGAACTAATTTTTTTCGGAGTACGCGACAGCC CCTCTCAGGAATCAAATCCTTGACCATTTGGGCATCCCGGGGATCTAGTAAGGTCTTACACCACTAGACCAACGTCTTGTTGGTAGGATATGCATAAAAG TTTGTTAACACCAAGCTACAATTGCAATCATGATAAAGGGTCATTTTGGTATAAAAAAAGAGTGTGATTGATTCTTATGGTACTTTGAATTCATTTTTGT TAGGGAGAGTGTGCCCCTTCACTGGAAAGAAAGCAAACAGGGCCAACAAAGTGTCATTTTCAAACCACAAGACAAAGAAATTGCAGTTTGTAAACCTTCA GTACAAGAGAATATGGTGGGAAGCTGGGAAGCGCTTTGTGAAGCTTCGTTTGTCTACAAAAGCATTGAAGACCATAGAGAAGAATGGTCTTGATGCTGTT GCAAAGAAAGCTGGAGTTGATCTTAGGAAGAAATAAGTGTACTTTGTTATGATTGTAATTGTGTGGAAGAACAAGTTCAAGTTCACTTGTGTTGTTAGTT GATTTTTGTCAAACCTTTCTCTTTACTTGAAAACGGATTCTTAATGGTTTTGAAGTTTTTCTTTTCTATTCATTTCTCTCTAAAACCAAACTTTTAAACA GACCCTTATGACCTTTTTGCGAGTTACGTTTTGGAAGGGAATGAAAGGAAAAAACTTGAATATGGACAAAAAAACCAACTGACAACCTTAATTCTGGTTA TGGTCAAAAGCAACATATAAATCTTGAGATGGTAATTTATAGGAATATCACAATTGGTAGCCTCCTCATGGTGTTGGTTTAATGGTATATGGTCTCATTC GATCTTTAAGGTCAATGGTTCAATTCCAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_25160;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_230878

FPKM

• FPAB: 0.9
• FPNAB: 0.5
• LF1: 0.3
• LF2: 0.1
• LF3: 0.5
• LF4: 0.5
• UF1: 0
• UF2: 0.1
• UF3: 0.7
• UF4: 0.6

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_230878

• Blastp: -
• Blastx: 50S ribosomal protein L28, chloroplastic from Arabidopsis with 83.15% of identity
• Eggnog: 50s ribosomal protein L28(COG0227)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G33450)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019449899.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;