| Id Trinity | FTRINITY_DN52577_c0_g1_i14 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_251982 |
| Sequence | AGCTCCTCCGCCATGCCTACCAGGTAATTTTGACATCGCTCTTACCGTCTTTTTCTATGGTTTTTTAATTTATTATTACTCCACAGGTTACAATTTTTTT CCGTAGTTTTAAGTTTCTGGCGTTTTAGAATTCCAATAAATAATTATACATTATTTTTCAATTACATTCTTATTATTTTTAGATTTTTATATCATGTGGT TTTTTATACTACAGATATGAAATTAAACACAAGGTTTAAAAGACATAGAAGGGTGGTTGACCTAATTAAATTTCTTAAACAAACGACGGTTCAGTTATGT GATAATGCAATGTGAAAAAGGTTAAAAATTAAAACAGTGAAGCGCGTGGTCCTCACCTCGCTGATTGTGATTTAATCGTGAGCGGCTCGGGAAGTAAAAC AGTTGGAGGGAGTAAATGAAACGACACTACAACTCATTTGCAGTAATATTTTGATTGGATATACAAATGTAAACCCCTTGAGAACAATAAATAAACACAA CTTTCTAAAGCAAATTGATAATTTTGCTGCAGATAAAATAAGTGATAGTTTAGATGAGAGTATGATTAACAAAGATTAGTAATATTTTTCCATATCACAA CTTTGATTGTAGTGAGATGGTGTTGCTAAAGCTTGCTCACCTCAAAAACGAACCCGACACAGGAGATAATGTCTCAATAATTTTGGGACCCATGAAAATA CACTTTCTAATTTCCTAGGCTAACTTTTTTGTTCTTTTACTTTATGCTCCTTTGTGAGTTAAAACAAAGGAAATTGAAAGAATTTGAGAGTAATTTTAAA AATGTATCTCATGATTTTCAAATATTTTTTTTTTCTTTCATAAAGATCTGGTGAATGTGTTGTGAGTTGATTTTGGAGCAGAAAAAAAGAAGCTTAGTAA CCATAAAATAAAGTTGTTATATAATTGTAAACTTTTTTTTTCAACATAAAACTCTTTGTTTCCCTTTTCTAATAATAGCTAAACAAGTGTGAAACTGAAA ATATTGTTTTTATCCTTTCATATTATTTTTCTCACTAGTAACTAGTATAATAGTATGATAAAGATTGTGGTCCAAGGATAAATTTGGTTTGTTCTTTTAA ATGTGAAGACGGACCAAAAAGTAAAGCTACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATGGGTTGTGAAGTGTCAGTTTTGCCCTTTATCACTAACAGATCCTTTT TGACCGTACAAATAGATCTTTATGAGGTACCAGCTCCTAACCGTCCCCTTGAAGGGATTCACAAAGGCCAAAAACAAATTTCGTTATTTGCCAAAATGGA TTTGTATTGGACTAGTAGAATATGAGAGGATTTAGTTTTTAAAAAAGTTTAATTTGAAAAACAATAAAATCTGGACGACTGCAATTTTGTTTTGCCGTTA AACCATGTCATGTGGCTATGCTGTCGGTGCTATCCCTCACTGTTTTTTCCTTTTCTGGCCCAAGAAAGTACACTCTTCGTTGGTGTGGTTGGCTTCTGGC TCGCAATTTAATGTCTAAATTTTAATAATTACTAAATTATTAACTAAAAAACTATACCATACATTATTGGAATATATTTAATAATTGATTATATAAATTA TTTAATATTTATAACAGAGAGATTCCATAAATGTTAATTTAAGAAGCTTCAAGTTACTTCCTAGTTGCTTTAGACCTGCTTTTCCGCTATCATAGATACC TCTTACTTTACTTTTTGACTTGCCTCCTGATTCTATTCTCGTTTCTGTCACTATTCCTATTAGGTGAAGAACATGTTGCATTTAATTGATCATTTATTAT TGTTGGACATTATGGGTCATCCTTGTTCTGAGTCTGAGACTGATTCCTCCCATATGGGGCAACGTAGTTGCATCTAATAAATGAGCGGATCAGAAGGATC TCAACCATTCAAATTAGATTTTGGATGCAGAGGTGGTCATACAGGCCAAATAAATGAGCATACCAAATGGGTTCATTCAATAAATGCTTTATGGTCTAAT ATAATATTAGAAAAATGGTTATCGTATGTAAAAGTTTTGTACACCGTCAACATATCTGAACATTGACTCTAGGATAATACTAATATACATATATGTTGGT CGTGTAAAAACTTTATATTGTTAATAAAAAGATATTTAAGTCATCCTATTAAACTAATATGGTGAATGAAATTAATGGTAGTCCATTCTATTTTTCACCT GGACCTGCTCATCTGATTTTCAATTGTTTTTATCAAATTTCAGTTATTTGATTTTGCGGATAAATACAGAGGCAAATATGACAGCAGCATCACTGTTGCC CAGAAGTATTATAAATCCATTAGTGGCTACAATGTAAGTTTTCTTATCGACATTTGTCTTTATTTGCCCCAATCAACTTCTTTTGAAGCAATTAAAAAAG TTCCTATTTAAAATATTGAAGAAGTTAATATGCATGTCCAAGTATTACTTGAATTAACAAACCAATTCATGAGATAAAGAAAAAAACAAAATTTACAGTT AACTCATTTTGATTAAGTTTTGGTAATTATATGCACAGGATGAGTTGCTATGGGCTGCTGCATGGTTATATCAAGCATCTAACAATTAGTATTACTTAGA TTACCTTGGTACAAATGGTGACTCCATGGGTGGAACTGGTTGGGGCATGACTGAATTTGGTTGGGATGTTAAGTATGCTGGGGTTCAAACCTTAGTAGCC AAGTTCCTTATGCAAGGGAAAGCTGGTCATCATGCAGCAGTGTTTGAGAAATATCAACAGAAGGCTGAGTATTTTATGTATTCCTGTCTTGGTAAGGGTT CTAACAATGTCCGGAAGACTCACCGTGGCCTCATTGGCAACTAATCTGGCCTTGTGCCTCTCAAGGGATCCATCAGCATGGAATTTTGTCTTGTAAACCC ATTTGCAGCCTATGGGAACCTTCCCTGCAGGCAAGGGTACCAAAGACCATGTCTCATTTTGAGCTAGTGCCAACAACTCATCATGCATAGCCTGTTGCCA ATGAGACATTTTGACTGCTTGTGTGTAAGTAACAGGATCAGGATTGCTAGAAACAGCAAAGCAAAAGTTCTTGTAACCAGGTCAACAATTAGAATAATCC AAGACAGATGACAAAGGATAGAGAACCTTTGGATCAGGTCTAGTGTTGGTAACCATTGTATGAGCAAGAGTACAATGATAATCTTGTAGATGAGAAGGGG GTCTTCTCTGTCTACTAGATTGCCTAATAGGAGCAGCAGGACTAGAAGTGATAGATTGAGATGGAGATGAAGATGTATTGGACTCAGTGAGAGGAATTGT GTTTGACTCAGAAATTGTGTTTGACTCAAGTGTATGAGGTGACTCAAGAGTATCAGAAGAAGGAGTAGTGTTTGACTCAAACAGAAGAGATGAATTAGGA TTAGAATTAGGAAGGTTGGATGACAAGGGAAAGACAGTTTCATAGAAAACAACATCCCTAGAGAGAAAAACTTCATGTGAGGTGAGATCATACAGAATGA ATCCTTTTGTTCCATCCTTATATCCTAGAAACAAACACTTTCTAGCTCTAGGGTCAAATTTGCCTCTCCCTGCTGCAACAGTACTAGCATAGGCTAAACA ACCAAAGACTTTCAAAGTGTCCAAATTTGGTAAGGAACCATATAGTAATTGGTAGGGGCTGGAATTCTTAATCAAAAGACTAGGAAGTCTATCAATGATG TGAATAGCATGCTGTATGGCAAAATTCCAGAGATTAGGGGTCAAAGAAGATTGAAAAAATATAGCTCTTGCTACATTGAGAATATGCTGGTGTTTTCTCT CAACTACCCCATTTTGTTGAGGAGTATAGACACACGACCTTTGATGAATGATTCCCTTGGAAGAGAAGAAATCATTCATCAAAAATTCTGGTCCATTGTC ACTTCTTATGGTTTTCACTCTAGTGCTGAACTGA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_26575; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_251982
| Blastp | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 from Nicotiana with 32.06% of identity |
|---|---|
| Blastx | Endoglucanase 6 from Arabidopsis with 80.81% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019416693.1) |
| Pfam | Integrase core domain (PF00665.25) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |