Ll_transcript_106056

• Id Trinity: FTRINITY_DN52994_c3_g2_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_106056
• Sequence: GGATTAATCAAATTAAAAATTTATAATTTCTAAGGTGAACATCATATATTTAATATAATTATGTCTGCTATTTATTGTTTGGGTTATTAAACAAGTGATC TAATTTCTGACAACATATAAGACTTCTAAAAGTGGTAATAAATATGAGCTTAATGAGTGGATACCCAAACAGTTAACTCATAGGGGTAATGAGAACCTTA TACGTTAACATATCAGGAATGATTATGGTCCCCAATATACCAAATCACACATAGTTTTCATCTATCCCCATCAGATATAAGACGAAGGTCCCATAAGGAA TCAAGGATTTGGTTGAGGAAGACTATCATACCAAAACGCTTTATGAAAACACACAAAAGGAACAGAGCCGAGAACATGAATTCAGGTATGCTATTGAAAT CCTATTTTATCATATTTGTGAGAATCATGAGATTCAAGATTGGTGTTACACCGATCATAAGGAATATCTAACGCGTGTATGATTTAATATTAATTAGTTT ATTCCGAATTATTGATAAGGATAAGATTATATTCATACATTTGTATAGGAACACGAAGCTGTTATGGTGTTTATGGTCCTATCCATGATGGGCTTGTGCG GACCATGCATGTAACTTGTCTTGTGGGTTAACAAGTTGGAATATTGTGGACATATGGTGTTATTCATTTACTTGAATTCCTTTACTAGGTCTCTTTTGGA TAAACAGAGAGGAGAGGTTTTATCCCTTAGGTCCCATATTTTTTTTAAATAACATTTAAAATGATGTGAGGGGAGCAAAAACAAAATGAAAGCATTTAAA GGGAAATTATCCTACAAAATTTGAGCTTAGGTTTACATTAAACAGTAAATATATAATCTTTTAGAAACATAATAATGATACAAGAATCTGATGTCCCGAA CTCTGTCCCAAAACATGTACCAAGTCAATAAAAATATGTCACATCAGTTAAAAAAATTAAATATTCATATTTTCTTTTATTTTTCCTTTACTCTAATTGG CTTGGTACATGGTTGGGGATATACTTTGGACAGCTGATCCCCATATGCTAATTACACAATGATAATTGGTCCAAAATATTTACAATTGTTTTGTTGATAA CTTTATTGTGCATGTGCATGTGAGTTGATAATTTAGAAGGAGATTTTGGAACCGGCCATTAAAGGGACAGTTAATGTGCTGAAAGCAGCAAAGGAAGCAG GGGTGGAACGTGTGGTGGCAACATCATCAATCTCATCCATAATGCCAAGTCCTAATTGGCCAGCTGATAAGATTAAGGGTGAGGACTGTTGGACCGATCT TGAATACTGTAGGGAGAAAGGGTTATATTATCCCATTGCAAAGACTCTTGCGGAGAAAGCAGGTTGGGATTTTGCCAAGGAGACAGGTTTTGATGTAGTG ATGATAAATCCTGGCACAGCCTTAGGCCCTCTGATTCCACCAAGAATAAATTCCAGCATGGCTGTGCTTGTTAAGGTTCTCAAAGGCGACAAAGAGACGT ACGAAGATTTCTTTATGGGAACAGCCCACTTTAAAGACATAGCCTTGGCACATATTTTAGCCTATGAGAAAAAGAACGCTGCTGGAAGACACTTGTGTGT TGAAGCAATTCGTCACTATGGTGATTTAGTGGCCAAGGTTGCTGAGTTATACCCTGAATATAATGTGGCTACGTGAGTATTATTCTACACAATTGCATAT AAGCTAAGAGTTCAATTTGGAAGGAAAAACTTAATTAAATTTCCATCTATGTTAATACAAAGTTTAATTGAACACATAATGAAAGAGAAATTAATGACAC GGAACTGCTTGCTAGTTGTTTTCTACATTGGTTAATCAACTACAAAGTAGAAAGCACTATGTCCCCCCAAAAAACTATAAAGCACAATGCACCCAAAAAT TGTAGAAAGCACTATGTCCCCCCAAAAAACTATAAAGCACAATGCACCCAAAAATTG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_29817;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_106056

FPKM

• FPAB: 0
• FPNAB: 0.1
• LF1: 0.1
• LF2: 0.7
• LF3: 0.3
• LF4: 0.3
• UF1: 0.4
• UF2: 0.2
• UF3: 0.2
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_106056

• Blastp: Cinnamoyl-CoA reductase 1 from Arabidopsis with 40.43% of identity
• Blastx: Cinnamoyl-CoA reductase 1 from Arabidopsis with 41.34% of identity
• Eggnog: Nad-dependent epimerase dehydratase(COG0451)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G15950)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019439258.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;