| Id Trinity | FTRINITY_DN53014_c0_g2_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_242225 |
| Sequence | CGTCATCTTCTTCTCTGTGCCACGTCCTCTCCTTTTTCTTTAGCTATCTGACATTTTCAAAGCATGGATTTCTCTGGTGGTCACAAAAATAGAGGGGAAT TGAGAATTCATGAGAGTTTGGATGAGCTAAGGACTGATTTGGCAGATCACATTGCTGAATTATCAGATGCATCTGTGAAGGAGCGCGGATATTTTTCCAT TGTTTTATCTGGTGGTTCTCTCATTGGCTTAATGGGGTATCTGTATCTTATCTTTTTACATATATAATTATTTTTTTGGTTTTTATGATTTGGTGTTGGT TTAAAACTTGTGGGTTGCAAACAGAAAACTCTTTGAAGCACCTTATATCAAGACAGTGGACTGGTCCAAGTGGTATATATTCTGGGCCGATGAGCGTGTT GTGGCGAAAAACCATGCTGATAGCAATTATAAGCTCGCCAAAGATGGCCTTCTGTCCAAGGTTGTACCCTCAAGTCAGCATGTTTCTTTAAAGAATGGTT GTTCTCGGAATATTTTGGAGGATAATCAGATAATGATACAATCAAGTTTTGAGTATTTAACTGTTCTTTACTAATTTAACTTCTTTCCTGGTTGCTTCTT AAAAGGGAAAATCAAACAAAAATGGAACTAGTATATCAAATTTTCAAAAGTTGATGGGCTTTGATTTCTTCTTTTATTGCTAAATGACTGAGAAAATTCA ATTGCTGTTTTAATTTTGAGCATCTTTAGATAACCTTCTTGAATTGCTTTGTTCACATGAAATATAAGATTTTTACTTCAAGGTAACTCTTTTTGAATGT CCATTTATTTATATATTCAATATTGAGTACTTTTTGAATGTCCACTTATTTAGCTGTTTGGGTCTCATTTTAACTAGTTACCTTATTGAGATTTACATTT ATTCTGATGTGGATGTTGAGCGTACTGAGAGTTGATAATGATATTTTGTTTACCCTTTCTAGTTCATTGAATTTGGAGACATACATAATAGTTTAAGTTT TAGATATGTTAGAAGTAGAGTTCTAATCCTGATAAGGATTGACCTTGATAAAGAGTCTGTGCTGACAAGCATGAGATTACTACCTAACCTTACTGGGCTT GGGCCAAATAAACCAGTAGATTTGTACAGTGCACTTGCACCCCAACTCAGTATTCGACGAGTCTAGTTACAGGGCGAGTTGTACACTGGGATGTATGAAC GAATCTCAATTATTTGGTTCCAAAAACTTCACTGTTGTGGTTGCGTAGCTGAAGATAGGAGAGCTACGGGATCGGGATAGAACATTTAGTTGGCTTCATG AGCTTTTGAAGGTTGACATCGACCATATTGAGTTGGTTTGATGTGTTCATGGGAGATAAACCATGGTTGCATCGACAAGATGACTGGTGCATGGTACGGT GGACTTTCAGGATTGATATCAACTGTTATCACATCAGCGAGATGCTGAGGGCACCAGCTTGGTGTGTTGGCTGTGGTGTAAGTGCACTGATTTTGATCGA TAAGATTTGACGAGGATTAATGTATCAGATTATATTATTAAATAGAAAATTAAGACTTGGTTAGATTATAGGATTGAGATTGAAAGAGTCTTGAGTTGCA TGCCTGATTGTTTGTTGGCACCAGAGTGACCGGAACCTTGATGCTTTGGCAAGTTGGCGAGAGACACGGTCATGAGCATTGGTAATTCATGATGACAAGG AGGTAGATCAATTTCTGTGCCAATCTTCATTGATCCTAAAAGCGTATATTTTATGTTTCATAAGATGGAATTTAACTAAAATAATGTTCATTTTTAACCC AATTCCATGTCTTATGGGTGAGGTCTCCAGTTTCAAATTCACTGGTATCGACCCAAGTTGTATTTAATTTTTTGGTATTCTTCTGAAAATCTTCCCAAGC AAGCATCTTTGTAAAGGAGATTTCCCCATATTCTAAGAAAATATAGATCTTGGGATATCATCTTGACGTCTGATTTGGGTATTACTTGTGATCCTCCTTT GTAATCCTTAGACATTATTGGATAATCTTTATTTCAATATCGAATTATTATTTGTCACCCTGATGTGCAGTTCTAAAATTTCTGAACCACTTTGAATTTA TGGAAAAAGATTGTTGGATATAAAACCATTCATGAGCCTTCACCTAACAGCTTAAGCTTTTAGTATAGTTGGTCCTTGACATGGTAATAGTGCATCTATG ACCAAGTGGCCAAGAGTTTATTCTTGCCCTTCCACTCCAACAGTTTTTAATTGTATTGCTACACACAAAGGGAATATGTTTCCCGTCAGCAGCAAATGCC TTCAATTTTTCCAACTCCCTTCCATTACAAGAAGTTCAGGTACTGATTTCAGAATAAAGGTCTCAGCAGTGCTGAGGACCCTTATAGTTGACAATTATGC TTGTAGGTTGTAGACTTGTGGCATTCTTGACTGCGATAAGCCGATACTATGAGAACCCTCTGAAGCAAAGCAGATAATCTCGTTCATCTGGTTTCTTTAG ATTTTGAGCAGATTCTGAGTTAAAGGATTGTGTGTCAGTGTCAATTAACTATGCAGACCATGTTTATTCTAGGAAAAGGCATCTCAATCAAACATTCCAG TCCATCCTCAAGATCACAGCTTTAAGACCTTCTGTAATGCTCTGCATCAGTGCATCCAATTAGATGCATCTTTTCAACATATAGGTTATGATACCAACCA TAATAAAGCACATAAAATTTACTATATGCTTTCCCTGTAAGATATAGTTGTGCAGATGCAATTACAAGAAGCATTTTTTCTGTTATTCAGCTTTGGCATG TTATGAAGAGTGAGAATTTCTGAAAGAAAGAGAAACTATCTTGGAGCCTCATTTATCACCAAGTTTTAGAAATGATTTCTTAATGACAGTTTTATCAGTG CCCACCAAATTAGTTTTAGAGTAACCGTATTATAGTTGGTTGAACCTGAAAAAATTCCTGAGAGTATCGTGCACAATGAAAACCCATACAGTGCAATATG CAGTACTATAAGGTTGCCATGCCAAGTCGATCTAGACCTGTATGTCTATAACCCGTTATCCATGAGTATTTTCTTAAAATGTATATAGGTATTAAAGAAT ACGAGGAATGGCTGCTGGAAGACATTTCAAGTAGTCTTGAAATGAGTGGGTGAAGATAATATGCCTCCAATGCTTGGTTATCTAATTTGGTTTCATTTTG TTTATCTTGTCTTTGGTCATATATCATGTGAACTAATATTCCATGATTTCTTGGTTCATAGTTAATAGAATATCCCCTCGTTTTGTGTTCAATTATTATT AAGCACGGTATCTAAATATCTAGTAAGACTAAATTCCACCCATCTCTAAATATCTAGTGAGATTACAGCTTGGTTGGTTGTTTTTATCTCTAAATATCTA GCTGTTTACCTTTTGTGTTAGTCCTACTATTGTCAAGTTTATGTTTGCTGCATCTTCTAAATTAGCTGAAATTTATTTTTTGTCCTAATTTGTTCTTTTT TCCATCTTGCAGTGTCCTATAAATTGAAATGTATGTTATCTTCTTGAAATCATAGGCCACACTGAATTAAACTTTCTAGCTATAAGTGTGATTATAACGA AACAGATGACAGCCCTTGATGGTCATAATGTACTGAGGAATAGTGGTGGGAAGAGGGAGTTCTTAGAATCTTGCATGTTTGGCCCTTGAGCAGATTATGT GTTTGCTATGTAAAAATTCCTTCTAGCAATTCAAGAAAATTGTTTTTTTATCACAGGTTAAGTAGCAATATAAGATGCACGATAATATTCCACCGGTGCA CAACTTACTCTTGATGTATATCTGGATTTGTAACAGCTATTAATCAGGCCTTGGGTTTATGTCTTATATATTATCTTTTGTTCATTTGGGTTCTTGTCTG ATTCTGTTCTGAATCCATATGTTCAAGATATTGTTCAACTTTTGTATGATATTTTCCTATGTTGCAGCAGCTATAATAACTAGAAAACGATTAAGAAAGA AATTGTGTATGTTTCCTGGTTGGTAGTGCCCTTTTTTATGTCAGACACCATATGGAAACTCAGAATCGGATTTCTTTTTCAAAATATAAAAATACATGAG ATGTTTGTCGACATGTTCCTTACCGACTTTTTGCTTGCTTTCTATTTAAAAGTTTAGTTCAACAAAAGCAACATACATGGGAGTCTCTAATATAAATAAA TATTTTGCCTTGATATTAAAACCACTCTCCTTTTCTCTGCCTCTACATGTGTGTCTTTTGTTATCCGCATTAGTTTTAACTTAGTTACTACTTAATATTT CTACCTCTTATAATATGTTTGTTATATAAACAGGTGCCTATTGTCCACAGTCATGTGCATTCAATTAATGATTCAGTGTCAGCAGAAGATGCTGCCGATG ATTATGAGTTTTCCATCCGGCAGTTGGTGAAAACCCGGGTGGTCAGTGTATCTGAGATAAATGACTGCCCCAAGTTTGATCTTATTCTGCTTGGATTGGG TCAGGATGGCCATGTTGCCTCTTTATTCCCTAATCACTCAGCACTCAATGAGAGGGAAGAATGGGTAACTTTTATCACCGATTCCCCCAAACCCCCTCCT GAGAGAATCACATTCACCTTGCCCGTTATCAATTCTGCATCCAATGTAGCAGTGGTTGCCACAGGCGACAGCAAAGCGGAGGCTGCACACTTGGCAATAG ATGTTGTTGGACCAGAGTGCCCATTAATACCGGCGAGAATGGTCCAACCAGCTACGGGGAAGTTGGTGTGGTTTTTGGACAAGCTGGCTGCCTCAAAACT TGAAGATTCCAATTTGAACAACAAAGTAGGATGATGATGCCTATGCATAAGTGTAAGTTTGTATGTAGTGTTAAGAGACTTAACAAAGTGTCTATCCATA GAATCTGGCTATTTCTTTTCTATGGGATAGAAAGTCTTTTGTTTTGGTTTTTGTTGCTCTGTCATTAGTGGAAGTTTGGTATAGGTTTTGTAAGTGGCCA ATAAAAGTTGTGGAGAGCATCATTCCGACTGTGCCTTCTTTCTTTCTGATTCCTCTTTTGGTTATTGGTTATGATGATGGTCTCAACTGTTTGCAATTTA AAAAGGAAAATCAGGTTCATGTAGTGTAATAGTTCACTTTCATTCACCCTCAAATTATTGTTTATCTATTGTGTTTAAATCTTAATATAATCTCTATCTA TTTTGAGGAATCCTCTTTTGGTACTTGGATGAGGTTCTTCTAAAGTGCTGCTTGCACCTGTAAACTGTGTGAATCTAAACCAAATTCCA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_30000; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_242225
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Probable 6-phosphogluconolactonase 2 from Oryza sativa with 68.9% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428719.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |