| Id Trinity | FTRINITY_DN53160_c4_g2_i5 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_224404 |
| Sequence | AATAGATTGTGTGGTGAGAGAAAGAATAGTTGAAGGAAAATAAGACAAGTCACAATGATGTTATCATTCTGTTACAATTCTCCTTCCATAACTCCATTTT CATCTCCAAACACCAATACCCCATTTTTGACCACTCTTAACTTCAACAATAGGACTTTGGCTTTCAATAATAGATTCAGAATTCTTTCAAATTCACAAAA ACAACAACAACAAAACTCTACTTCCCTTCTCTCTTTTCTCTGTCCATTGCTCAAGCTTTTCTCTGTAACTCACTATCCGTACCTTCTAATATTTTTATTA TTATTATTATTGTTGGTTTGTTATTGTGGGACCCACAATCTCCATGTTATTTAATATTATTTCTACTTAGGGGTGAACATAGGTCGGGTTGGGACACGTT ACCGAGTCTAACTTTGAACCCAACACTAGACCTGATGAAATTGGGGCATACCGGATGAGTGGATAGGATTGGGTCATGCTCACCCCTATTTCCGGTGTTT AAAATTGTAGTTACATTGCGTTTATCATAATTGTTATTGTGGGAGTGTAATTTAAAACATTGGTAGAAAAAGTTGCACTTGTTAGTTGTTACTATTCCAG CTGAAAAAGTTGTTCTTTAAATTCAGTAACACACTTTGTACATGTTATTCTTAGTTTTATCATATTTCTTGTATATTATCTTCCTCATGTAACATACTTT ATGTGTTTCCTTTTCACATGCTATTCTTTAACTAGTATTGATTTTCTGATACATCACTTTGATGTTTAATAGTATTTTTCATCTGTTGCTTCTGGTAGGG AGGGGATCCTTCTGGACAACGCAATTTTACTTTGGAGGTGATCTCTTTATCCCATTAGGCAGGGTCGGCTACATGGATCGAATGATGTATTATATCAGAT AAAATGTACCTATTCACCATATTATGTTGTGTCAACCAACACGACGTCATTTGATCTATGTTATTGACTATCCTATTATGGTGTCATTTTATTAGAATAT GATTAGGATATGTTATTTCTTTAGTATTCACGGTTCCTATATATTGGAACCTTCGGTAACCTTTGTAATCATCAAAAATAAAATAGAATAATAAGAATAT TTCTATCCTCTCTTCTCTCTTCTTCTTTCCCAAATTCTTCTTCTCCTTTCTCACTCTCTTCATCACACAATACCTTCAGTTTCTTACTTTCACACATTTG AAGTGACTAACCTTTAGGTTTCCATAATCATACTGAATGGTAGGTAGCAACATCTTCCTTGGCTAGCTTGTCAAGGTTTGCTTGGGGATCAAACTCCAAA GTTGAGAGTTCGAATCTTCCTACCACTTTGCAGCTTTTCGAATTTGGTATGCTTCTTCCACTCTAGGTTGATGCTAAGGAAGAATCCTTGGTTATGCTGC TGATAATAATGTGCAAAATATTTTCCTTCTTTGAATTAGTTATTAAAATTCGTCAACATTCCGGTAGTTAATTCATTTATCCTGAATATATTACTATCGC CGAGCATTAGTCTTGGCCTCGATGTTTATAATACTAATCATGATGAAGTGGCTTCTTGTACTTGTCCTTCCCTGCATCTTTATTTCTTATGGCTCTTACC GCTTACATATTACTGTTAATGTATATCGTAAACTCTTCTAAATGTTCTATGTTAAATCGTTCGAATATTTTTTTGTCAACAGAAGCATGTCCTTTTTGTA GAAGGGTGCGAGAGGCCCTGACCGAACTAGACCTTTCAGTAGAGGTCTATCCTTGTCCTAAGGGTTCTGTAAGACACAGAGAGGTGGTCAGAAAATCTGG TGGCAAAGAGATGTATGTGGTTCTTTATAACATGCTGTTTCTTCTTATCTGCTGGTCCTACTAAAACAATTTCAATAGGACCATTTTTATTTGTACAGTA TTTACATGCATATATTTTCAACTTATCTTACACAACTAAAATAGATTGATGTTCTCCTTGTCTTTTCAAATAGTCCTATTTATAATATTTTGCAGGTTTC CTTTCCTCATTGATCAAAATAGTGGTATTTCTATGTATGAAAGTGGTAAGTCAGGAAGCTTTCTCCCGATTATTTTTCCAAAATCCAAATCATCACTGTT ATCTTGTTTAATGGAAATGCTATATACCAATGTAATTTATCTTATTTTTAAGTAGTTTTGGTTGATTCATGTGAAGGATCTATTGTTGTTATGCTCTATA GGCTAGATACAATTCAAAACTGATACATAAGTTGCCATTGTTTGTTATAACATTAAGTGCTTGAAGCTAATTCAGTCCATTGAATGTTGTGTATTTATTT TATTTATTTCGTTGACTTTTTCCTTCGATTTACTAAATACAGTTGATTAACTTTACACCAAGATCGTAACCGAAAGCTACATGCCTGCATTCCTGTCATA ATTCAATCGTTCCATTCTTGGTTTCTTGGTGTAGGTGATATTGTAAAATACTTATTTGAGCAATATGGAGAAGGAAGAAGTCCATCACAGGGACTTTTGG AGAGGTATTGGATATAAATCTCATTTTGGATGAGAATATATAACTGACTATTAATCACATATTTAAGACACAAAGAGGTAAATGGAGTACAATCTTCCTC AGAAAATTTCTGCATTTATAGGTTAGGATGAACTAGAATATTTTATGGTAATCGATACATCATATTAGCATGAAAGTAAGTTGTGTAGCATGCTGTGACA CCAATAGTATGTTCCTAATTCTGGGACGACTTGGAAAACAATTGTTATGTTGCTCTGAATAGATTTTCTTAAGATAATATAAATGATTTTTGTGACTGAG ATTATGGCATTTACGGTAGACTTTCTGTGCTGAGATTGTTCCAGATTGCATAGATTTGATAAGGGTCGAATTTCGATTATTTTTGCTCTTAATAACCCTC TTGTGCAGCACTATTTTTACTGGATGGATGCCGACAATACTCCGGGCAGGTAGAGGAATGACACTATGGGAACGTTCAACGCCCGACCCTCCTCCAGGAA AGTTGGAGCTCTTCTCATATGAAAATAATCCTTATGCACGGATTGTTCGAGAGGCGTTATGTGAATTAGAACTTCCATACATTCTTCACAATGTGGGAGA AGGATCTAGTCGAGTGAAGTTACTCGTCGACGCTTCTGGATCTAAAGAGGTTCCTTACTTTATTGATCACAGCACTGGATTTCAATCTGGGGACTACAAG AAGATCTTACATTATTTGTTTGAAACCTATTCAGCAGCAATTGTATAAATTTACACCTTGAGTAACTGAAGTTTTGTGCTTTGAAATCAACACAAAGCCT AAATTATTTATTGTTAAGACAATGATGTGTGATGAGCAAAGCTCCCATGTATATGTAGGCTAGACAAGTTTGTAAAGAACTAATGACACAAAAGCGATAC TTATCGGGAGGGACAGTCACATACTCAAAAAATGATTAGTTCCTTACTTATAGGGTGACGTTAGACATTAAACATTGTTCTCCAACATCAATTAAACCTA TTAAATGAGTTAGATCAATGTGTCTCAAATGTACCAAATATATAGAAAGGTATCATAACCTTGGTTTTCATAAAATTGATTGATTGTGATAGTAATAAAT GTCACTAAAATATGCTTGTCATAATGTGTGAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_31272; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_224404
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019439237.1) |
| Pfam | Glutathione S-transferase, N-terminal domain (PF13417.5) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |