| Id Trinity | FTRINITY_DN53273_c1_g2_i15 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_164192 |
| Sequence | AATGTACATGGATTTGTTTTGGAGGATAGACCTTTAAGGGCTTGTTTTGGAACAACAAAATATTGTCATGCATGGCTCCGAAATATGCCTTGCAGCAATC CAGATTGTCTATATCTGCATGAGATTGGCTCTCAAGAAGATAGTTTCTCTAAAGATGAAATTAGGTACTTTCATTATGTTGAAGTTTTAATATGAGGCTA ATTGTGAAAGAGGGTATATCCCTTAGATTGGTTTTTAATAACAGAAGATGAAAAAAGTTTACTATCCTCTGGGTACTTTTCTTAGCTCAATTTTTATACG AGGCTTACTATTATTCAGTTGAAAGATAAAATCTGTGGTTGAAATTGGGTGATTTTGATCTTGCTGTTCAAGCCTCTTTAATTGGATAAAGCAGAGAATA CTTTACTATTATTTTCTTGAGAAGATTGTTTCTTTTCATTGGCCATGTAAGCATTGCAGATTAATGAATAATCTTTCACTGTTAGAGGATGTAGCATTAC ATCAACATGTGAGCTTGCTGATGTGTATACAGGGTATTCAGATTCTACTACCTTTCTGACTCTGGCCAGTTTTTCCCACCGGTCTCAGCGTGTTTCTCTG TCTGTTCTTTCTATGCAGACTCAATCCAAGTCTTGTATCCACAAGCCTAGGCTGTTCGTTATGTTACTGCTACCTCACCTTGAGTGTGCAACTGTGACTC AGGTCTTATAACATTGCCATTGGAAGACAATCATGAGTGCTGAGTATGTTGGTCTTCTTGCCAATAGCACATGACTTGGTTCCTCTCCAAGCTATCAAAT TGGGTATCGGTTGTCAATTGGTGTTCTGGGTCAAAGAGTACCCTGATGGGTGCATTAATATGTATGGGGCTTGGTTCGCAATCAAAGGTTTCCATCAACA GTCTGGTTTTACTACATTGAAACCTTCTCACTACTGTTCAAACCTGTGATTGTTGAGCTATCCTAACCTTAGTCCTCAGTAATCACTGGCCTGTCTAACA ACTTGATTATAATAATGCTCTCCTCAGTGGATTCTTAGAGGAAGAAGTTTACACGCAGCAACTTAATGGGTTTGAAAATAAAGAATAATTGCCTTGGACA CTAAACAAGGCTAGATTGAAACATGCACTCATGGCCTTCACTTTTTATTAACGCGGGAGCATAGTCATGCGTCCTTGTCTATATACATGACGTCGTTATT ATTGGCAGTTCTTGATCTTTAATTAAAAGACTATAATCCAAAACGAATTCAATATTTTCCCTCCAACATTTGGGTAATTTGGACTACTTCCTAGTGATTC TTTGCTTCTCCGGCAACAAAGAGCAGATCAAAGAACTTTTCGAAAGGATAAAGTGGGTGAAGCTTAGGGCAAATCTACTCATTTGCTTGTTGGCGGGAAA TTGACCTAGTTTGAGGATATTCACTCCAGACCTCTATAGGTCAGTTGGTGCATTCCAAGCCCACAATCGTTAGATCTGAAATCTGTTATAGTGTGAACAA AATGCATCACTTTCTGCCATAACCTCGGAAAGATTTTTCTAAGTGGTTAAGTGCCTAACAGGGTCCTTAACTTATTGTTTACTGCTGCAGCCATCTCTGC TTCATCCTCCACATCCTCTGCTGATTTGGGCACCATATCCAGATAATCATAGATTAACATCTTGAGTTTGTTTGGGGCCTAATCTCACTTCTTGCTAATC AACATGAACATATCAGTGGTTCCAAGTTCTTGCACTGAATCTTAGTAAAGAAGCCTAGTTAACACTTCAGTAGAGTTACTTTATATTCAGAAACTGCCCA AAGAACACAGTCCCAGTTTTGATGATTGCTATTATCTATGGCTGTGACAACCTAAGCATTGTTTCGCCGATAAATAATCCAATTTCTCTCTCAAAGAGTA CAATATGTAGCATTACATCTGCTTATAATCTTGCTGCCTTTCCAACATAGCTGTGACCAACTTATAGTTAATTATTGTTTTGCCGTGATCTAGGTGGTCT GGACACACTATATATACCTGGAAAAAATCGATTTCTTTTATGTTATTTTTAGTTAGATTTTGTCTTTTTTAAATAGATTTAGATGGGATTCACATTACGT TAAAACTATTTCCATTATGAACATCTTAATATCGTATTTTCAAGAACCATGCTGTTTTTGAACTGCGTGTAGTGCTTTTCATATAATAGTCTAGTCACTT GCTTTATTGTTTTGAAGAGGTCGTGTTCAACAAATTACTGGTGCTGCCAACAATATGCAACAACGGTCAGGGACTGTATTGCCGCCTCCCTTGGATGATT GCATGAATAATTCGCCAGGAAAACCCATTATGAAAAATGTTTCAAGTCAATGCTCTGCTAGCCTTGTAAGAGGTTCACCTCCTAATGGAAGTTCTGGCAG GCCTATGGCTCTTCCTGCTGCTGCCTGGGGTTCACGGGCTACAAATTCTCAGCCTGCTGCTGAAGGTACATTATGCCCAAATGGCCCTTCCATGCCCAGA TCCGATACAATCAGCAATGCACTGTCGTCCTCCTTAGCTGTTGCAGACACAAATCAGGCTTCACTGCATATTGATGTGACAACGAGGCCACTGTCCAGTG ATGAGAGTCATAGTATGACATCTAGGGTAAAAAACGAATCGTTGAAACCTCTTAAACAGTACAACAACGTGGATAGCAGTGTTGGCGAAAAAACCTTACC CACTGATGTTTCTCTTGCATCTTTAAATTTGAACAATCAGTTGTCTTCTCTATCATTAGCCAGAGATAGTGATAAAGGCAGTTGTACTACAACAGACACG ACAAATTCTATTGACATTACTGGGCAACCAGGTAGCTTTGGTCCTGAAGAAGCAATTATTGCTACAAATGAATATTTTCATAATTTATCTTCTGAGTTAT CCTCAATTAACAATGATAGAAGTGTCCGTAATGAACACTACAGCCTAACTGAACCTAGTAGACCACCTTCTGATTCCATCTTAGTCAAATATTCCCAGTC TGAAGGATCACAGGTCAATTCTGACAAATTTAGAGATTCAATGATTACAAATGCAGCTGTATCAGCTTCCACATCAGATAATGGGGTTTGTAATCCAAAG GAATGGTGTGATTTGAGATTTGATTCTCAAACCCTCGTATTATCAGGTAATGCTGAAGTCGAAGACGATGTAGCATCTTTTGATAATCAACGGCTCAAGG ATCCAGAAGTTGTTTCTCGTTCTTATTTGCCAAAGTCATCTAGCTTCCTCAATGCGTCAAACTGTTGCAGTCCTCATCTTCTGCAACATGGTGAACATGT TGTTGCAAATGCTGGTTCCATTTCTATGCCTGATAAAGTTGGGAATGATTCTGTATTGCATGCACCTGACATATTATACAATGGATACCCTAAAAAATTG GAAAGTATCAGCTCTTACAGTTTGCCTCATGATGAAACAAACAAACAATGTAACGGAAGATTGGTTACTGAAGCCGTTAATACAGGAAGTGGTGCTGCTG TGGATAAGGGTGAGAGTACTATAATTTCAAATATATTGTCCATGGAATTCGATGGCTGGGGTGACTCACTAACATCACCTAAGAATTTGGCCAAACTGTT GGGTGACAACACTGATAACCAGAATGGTCCATTGAAGAATTCTAGTACCCGAAAAGTCCAAAGTAACAATCAATCAAGATTTTCTTTTGCAAGGCAAGAG GAATCCAACATTCATGCCTTTAATGTACATCCATCATACAATACCAGCCATCAATTTCCAAATAGCAGGTCACCCATGCTGGAATTTTCAGAAAGAGATG TGTCTCTGGGTAAGTTCGGTATTGCTAATGGCTTCCATGCCAGTAGCCTTGAGGAATCTGAAATTCTACGCAATGGTCATTTGCTTGCGTTTTCTAATAA GCCCTCTGTTGTTTCAAGATCTCAAATTTCAGCGCCGCCAGGATTTTCAGTTCCAAGCAGGCTGCCTCCTCCTGGTTTTTCGTTTAATGAGAGAATGGGT CAGGCTGTTGACTCCTTGTCTGGGAATCGGTTGCTTAACCCTTCTTCCTTACGTAGTAATTCATATCAGACTTCATCAACTGTAAATAATGGTGGTGCTG GAGACATTGAATTTATGGACCCTGCTATTTTAGCTGTTGGTAAGGGGAGACTGCACGGTGCATTAATCAGCCCACTGTCGGACATGCGATCCAATTATCC ACCACAATTAAATTACTTTGAAAATGAGGCCAGACATCAAATACCTATGCAAAGATCTTTCTCACCACAGCAAAATCTTCGGTTTTCTGAATTTGAGAAT AATTTTTCTATGCTTGGTGATTCTTATGGCATTTCTTCAAGGTTAGATCAATCACAAATCGGTAATATGGCCTCATATCCTCAGTTATCTATGCAGCAGT CTAGAAATGCAGCTTTGTCAAATGGGCAGTGGGATGCCTGGAATGAGGTGGAGAGTGGAAATACTATGGATATGGCTGAGCTTTTGAGAAATGAAAGACT TGGACTTAACAAGTCCTATAAAGGATATGATGATTCGAAATATAGGATGCCAAATTCTGCGGATCTTTACAAAAGGACATTTGGGATTTGAATTAGCCAG CTATATTATGTTTGATATTGTTGTCCAAGGTAAGGCCAAGTCAGAAATGGTCAAACCCAATTCTTCTGCATTGCCAAAGATGATGGGAATGATTCATGAT ATGACTGGTTTGTTGTTTGGGATACCTAATGATGAAATTCTCGACGCATAGTTATAGCTGCAGCTGGTAATTATTAAAGCTTCCATCTTTGCTTTGTTTA TGGCTTATAATGGGTATTGCATGTTATGTTTGTGTCAAAAAGTCTTTAACTACATGTTTTCCAAATCTCTATTTTAAAGTATTTTTTCAACTCCTACAAT ATTTCATATTATCTTATGTTCATTATGACATTGCTGTTTACTTTTCATAAAGTAATCATTATTTTTTGTGTAGATTTGGATTTGCGGATGTGAGCAGTGT TGAGATTCAAGATTTTGATCGCCAATCCTTGCAAGATCTAATTGGCAAGTAGATAGTTGTCGAGTGTTATCTTTTAAATACTGTGGAGAATGGGAGCTAG ATGGGCATTCAAATTGATTGATTTATCCCATATTTATTGGAATTGTATCTTTTTCAGTCTAGTTTAAACTAGATTTTTGGATATAAATAGAGGTTTCATA TCATAGCTCTGATTCAATGGATTTGATTTTTGCTGCAGCCTTCCATAGTTTGTGTGATATTCATAGTTGATATGCTTTTTCTATTTGGACTGATCTTGTG GCCTTTTCTCCGGAAGATCTTTTACTAGGTATTTTTTTCTGTGCGTAATTAGTGGTCCTTTTTTT BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_32264; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_164192
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | CCR4-NOT transcription complex subunit 4 from Homo with 46.67% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000387) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019457807.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |