Ll_transcript_129900

Id TrinityFTRINITY_DN53409_c1_g1_i21
Name TranscriptLl_transcript_129900
SequenceTTTCTCCACACTATGAAGTCCACTAAGTGTACTTTTTCTAATATTTTGTGTCTGATACTGTTTGGTATATTCTTTTTCTGTTAGTTCAAATAGTCTCCCC CATTCACTACACTATCACAAAGTTCCCACCTTCACCAAAGCTTTAGCATTTCAGAGAGAGAAGAAAGTGTCTCCCTTCAATGGTGAAACTAGGCCCATCT GAACAACACTTATCTCTTCCTTCTTCTAATAAGCCTGAAAAAGTTCTGAGCTAAGAAGAGACAAAAGATTGTTTTTTTAAGCTAAAAGCTAAATTTAGGA AGTACCCTTTTAATTTCAGTTTGTTAGAGTCATTGGGTCTATGCTTGTTATAGCTTATATGGGTCCAACCATCCCTGAGGTTCAAAAGAAATGGTCTTGT AATAGAAGCCATCGAATCAAATTGCAATTGTGTTTCGTATTTCCACTCTTGATGTGAAGCCAGGAGAAGAAAATATTCCTGTTGAATGGCTAAAGCAGTT CTGGTTACAACTCTTAAATTTTATTGGTTCAAGATATCAACAAATCTTCTTTTGTACCAAATAGATTTCATAGAGAGTGTTTGGCTTCATTCTAGGAGCA AATATTCTTCAATTTAACTTCAAACTTGAAGAGGAAAGTTTCTTTCCTATTTGGCTGTTTGAAGAGTCATTTTTATTGAGCAAACCTCCTTTGACAAAAG TTACTTCGTTTCCTTTGGTTAGGTTCTCTCAGTAAAGACATATATGAATTTTTGCTGGCTTCAGTAAAAATATTACTACTCTGGAGTAATTCCTCTAAAT CTCCTTTGGCATCATTTAGTTATCTTGTTCTGCTTCCTTCAATAGCTAGAAATTTTCCTTCCAACAAGCCACTAAAAAACAAAAACTGAGTCCTAGTTCA CCAATATTCTGTTGTTTGAAACCTCTCTCAACGGTTTCTTTATGAAAATTTTCCAGTCCAAATTGGGCAAATCTCCTTTGGCATTTGGAGTCCTTAATTG ACTCCTATTATCCTATAGCCTATAGGGCAAATCTCCTTTGGCATAAAATCTCATGTTTCAGTGGTCAAGATAATCTTTTGGAGGTACTGACTATCTGTGA CAAAAAAGTTCTATCAAGCAGAAATCCTTTACATTATACACAATTATCCATTGAAGGTCAATACCGGCATTCCAGTCGTGACCGAAATATATACTTACAC TGGGATAGGGTGCTTCATTTTGCTTGAGAAGGCATATTGTCGATGGATGCACTCAGTAGTGATTCAGACTGGGAGACATTCAGTGACAGTAGCTGCAGTG AGGACCAAGAAGAAAATGATTTTCTATATGGTGGTCATGCTCAGAACATATTATCAAGTTTAGAGCAAAGCATTGGGAAGATAGACGATTTTCTCTCATT TCAGAGAACATTTGTTCAAGGAGATTTAGTCTGCTCCTTGCCAGACCAATCTGGACAGATGGGCATGGTCGTAAGTGTCAATGTGTTTATGGATTTAGAA AATGATCACGGGAAAGTATTGAAAGACGTGAGCTCGAAGAAACTGTCAAAGATTCGCTCCATTTCAGAAGGTGATTATGTGATGAAGGGGACGTGGCTAG GTCAGGTTAAAAGGGTGGTGGACAAAGTGACTGTTTTGTTTGATGATGGAGCTAAATGTGCTATCACTGCATCAGAGAGAGAGAACCTTATACCACTGAC TCATAATTTTCCTGAAGATTCAGATTATTCATACTATCCTGGGCAGAGAGTAAAGGTTAAGTCGTCAAGTGCTTATAAAAGAGATAGATGGTTATGTGGC ACTTGGAGAGACAATCAAGATGAAGGAACTGTTTGTTCTGTGGAAGCAGGTTTCGTGTACATTAACTGGATTGCTTCAGTTCCCGTGTGTTGCGATTTGA GTGTGAATGCTCCCCCGTGCTGGCAAGATTCCATGAACTTGACTGTGTTGTCATGTTTTTCACATGCAAACTGGCAACTTGGTGACTGGTGCATGCTCTC AGCTGCAGACCAAAAGGAACAGGTTATTCAAGATGCACCTATAAGTGATCTTAGAATGGAGCATAGTATGGAAAGAGGAAATAAGATAAGAAACCTTAGC TCTTACATTGGGGAACTATTTATAATTGGGAAGATAAAGACCAAAGTTGACATTGTGTGGCAAAATGGTGAATATACTTTGGGGTTAGGTCCTGAGAGTT TAATACCAGTGAATATAATAAACAATCATGAATTTTGGCCTCATCAGTTTGTGCTGGAAAAAGGTGCTTCTTATGATCCTCTTAACCCTAGAAGTCAAAG ATGGGGTGTTGTCCAATGTGTGGATGCAAAGGAGCATATTGTGAAGGTACAATGGAAAACTGCTTCCATATCCGACCCAGATTATTTGGATGGAGGAAAA ATGGAGGAGACTGTGAGTGCGTACGAGCTTATAGAGCACCCAGACTACTCCTTTTGTTTTGGTGATATTGTGTTCAAGGCGGCTCAAAAACAGCTTGGTT ATCATGCTGAGAAAGATAATGCAAAGTCAGTGATTGACTTGAATGCGGAGGCTGCTCTTAAAGACAGGAACCGAAAGGGCTATCAGGATGAGTTACCTGA TAACCGTATCCTATGCTGTATTGGCAATGTTATTGGTTTCAAAGATGGTGAAGTGCAGGTGAAATGGGCTACTGGTTTCACAACCAAGGTTGCGCCTTGT GAAATTTTTCGGATCGATGAACATGAAGGTTCAAATGTTGAGCAGTTAATTCAAGGGATGATTGAACATGGAAATTTACCTTCTCAACAGAAGGGAAAGG ACATGTCAAATTGTGATGGCATTAGAGAGAATTATGAAAAGTATCCACTTGAGTGTAGTTCCTTTTCCTTTCCCCAAGCTGCCTTAGAACTTTTCTCAAG CATCAAAACAAGTATACTCCAAACACTTGGTGGAACATCACTTTCAGCAGTTTCCTCAGTACCTACATTTGAAGAGGATAATGGATCTGATTTTATTGAT AAGCAGAATTTGGAAACTCGTGACCATTGCACTGAATCACATCCAAATACTCAGTTGCAATCTGCTGAAGATTGCACTTCATATCCACAAGTTATTAGGA TTCATGAGAAGATTGATTTTCCATTTTCTTCAGACAGCAACAGTTCAAACCAGTTTAAGCAGTTTGACGTGATAGAAAATTGCTCTGACCACTACTTTTT GGATGAGGGAGAAGGGTTGAAATTATCTCAGATTAAAAGAAGTTGGATGAAAAAGGTTCAACAAGAATGGAGCATCCTCCAGAAAAATCTTCCTGAAACT ATTTATGTTCGTGTTTTTGAAGAAAGAATGGATCTCATGCGAACGGCAATTGTTGGTGCACGTGGAACCCCTTATCATGATGGGTTGTTTTTCTTTGATA TACATTTCCCTCCAGAATATCCAAATGAACCCCCTATGGTGCACTACAATTCTGGTGGGCTTAGATTAAATCCTAATTTGTATGAGTCAGGGAAAATCTG TCTCAGTCTCCTGAACACTTGGACTGGTACAGGCACTGAAGTGTGGAACCCTGGAGCCTCCACAATTCTTCAACTCCTTCTCTCTCTGCAAGCCCTTGTC CTTAATGACAAGCCTTATTTCAATGAGGCTGGATATGACCAACAAATCGGCCGAGCCGAGGGAGAGAAAAACTCAGTCAGTTACAATGAGAATGTTTTCC TTGTCACAAGCAAATCCATGTTGTATCTATTAAGAAAACCACCCAAGGTAGAATTACTACATCTATAATTTGATTTCTTCCATAGTTGCAGTTTATTCAG TGATAATGGCCTTGAAATAATAGAGAATAATTCTGAGTGGCATTACCAGTTATTTATGTGTTGACCATGGATTTAAGCACAATATGCCAGATGTGTCTCA GAACACAATAAAGACATTGGACACTGCTAGTACCAGGATATTTTTGCATGGTTAAATGAAATATATAATATCTCAAACAAAGAGGAGGTTGTTTGTTTGA GATAAAAAAATTCAAATGTCCTATAATATATACATAAATATACAATAACAATCAAACCTTAATTCCATGTAACCAACCTCATCTAGTGGAATTAAGGATT GGTTATTGTTGGGTATTTTTGTATAAATATTATAGGGCGAGTCTCGATGCAACGATAAGGTGATTTGCTTTGTGACTTGGAGGTCATGGGTTCTAATCTT AGAAATAGTCTCTTCGCTTGTGAAAGTAAGATTGCATACATCTACTCTCCCTTGACCTTACTACGTGGGAGCCTTGTACGTTGGACTACTTTTTTTATAT TCATGTATATTGAGTTTGAGCTTCTGGCATGTCCTTGAGTTTCTGCAGGTTTTCAATTTATTCTAGTAGATTAGATTAAAGCTTTCAGGGTTTGGATCCT TTATGTGGCCTTGTTCTAGATTATTTGAATGTAGACAATAGATAGAGAGAAATGCTTACATAAACTTGAAGTGCCCAAGTTGAGTGCAGTAAGTCAAATA CATCATTAATTATGGTTAATTTTGATAATTAATTATGATATGTATCTATTAATCAATTGTGCAATGGCTCAGTGCACTCAAGTTCAGTGATTTAAGTTTA TGCAAGAATTTCTCATGGATATAAATGGAATTGTAACTGATAGTGATGCCTGATGCAGCATTTTGAGATACTGGTGGAAGAACACTTCAGGAAGCGCTCC CGACATATACTTCGTGCTCGTAAGGCATGTCTTGAAGGAGCTCCCATTGGATGTGCTTTTGGAAGTGGAAAAACTGAACATGAAAACCAAAAGGGAACTT CTACAGGGTTCAAAATTATGCTTGCTAAGATCTTCCCCAAGCTTGTAGAGGCATTTTCTGATAAAGGAATTGATTGCAGTCAGTTTGTTGATATGCAGAA ATAACTCTCATGCTAAGTTTTAAGTAACTCTTCAAGTTTCCCAACCAGGATATTGCAACCTTAAGTGTAATATTAATATATTTACAGGTATTTGTATAAT ATCAAATGTAACCTTGTTAAAGCACCAATCTCTTGAATAAATTAAAGTATGATAAAATGTCATTTTCTCTAGTGTTGTTACAACTAGTCTATTATAACTC TC BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_33536; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_129900

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_129900

BlastpProbable ubiquitin-conjugating enzyme E2 24 from Arabidopsis with 47.84% of identity
BlastxProbable ubiquitin-conjugating enzyme E2 24 from Arabidopsis with 47.84% of identity
Eggnogubiquitin-conjugating enzyme(ENOG410XQ7W)
KeggLink to kegg annotations (AT2G33770)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019423805.1)
PfamUbiquitin-conjugating enzyme (PF00179.25)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;