Id Trinity | FTRINITY_DN54671_c1_g2_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_1107 |
Sequence | TAATTAAATTAATTTATCAGTCCAATCAAATAATAATCTGAGATTGATTGAGCACAATGGAGAACCACCACTTGTTCTATATCCTCTTCCACTTTTCCAT CAATTTCATTGGTTCCAACACACCCCATTACAAAAGTTTCACACTTTCTCCTTTTTTCACATTTCCTTCTCATCTGGGTTTTCTTTTCTTCTAAAGCAAT GAATCTTTCACAATTATAAAAACTGTTTTGAGCTTAACCAGTGAAAAATTGTGAATGATGATGGATTCTAAGGCTTTGAGGTTCATAACCCATCAATCAG TATTCTCTACCGTTCGATCTGGGGATCTTGATGGGTTGAAGGAACTAGTGGAGCAGTTGAAGAATGAACAATCATCATTATCTGTTTCTGATGTAATGTT ACTTCAGAATGATGGTGGTGAAACACTTCTTTATATAGCTGCAGAGCATAATCTAGTTGAAGTGTTGAAGTTCTTGATCAAGTTGTGTGATTTTGAAGTG GTTAAGATCAGTTCCAAGGCTGATATGAACCCTTTTCATGTTGCAGCTAAACGTGGCCATCTAGGTTGGTATTCGTTATTTTACTTATTCCTTTCAATTT GATCTTCATTTCAATGTATTAGTTAACTTCAATGAAGGGAGTTTAGGGATGAGTTTAGCTTGACTCAAATATAGTCTAATCACCAACAAGACGTTGGTCT AGATAAGCCAAAAGGTCAGAGAATCGATTCCGGAGAATGATACTTGTTGGAAGTGACAGCCACGCACTTTGTAAGAGACTAATTACTTATCCATAGCGTG TGAGTCTAATGCTAATACTTCGATAGAGTAATTTGCTTTGGCCTGATCATAACCCAATAAGGATTGCAAACATTTAAATTTGATTTGTTGACATAATATA 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Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_44776; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_1107
Blastp | Ankyrin repeat-containing protein At2g01680 from Arabidopsis with 77.22% of identity |
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Blastx | Ankyrin repeat-containing protein At2g01680 from Arabidopsis with 76.29% of identity |
Eggnog | Ankyrin Repeat(COG0666) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G01680) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461949.1) |
Pfam | Domain of unknown function (PF13962.5) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |