Ll_transcript_158693

Id TrinityFTRINITY_DN54724_c0_g1_i11
Name TranscriptLl_transcript_158693
SequenceCTTTATTCTCATCTTATAAAACACAAAATCAAACTCTAAAAAAGTTGCTAAGCAAAATTCCCTTCTCCAAAAGTATGTTAAAATGAAGTTTCCAATTATT TTTCATTTCAATGAATAATCCAAGACCAAGGGAGGATAAGATTTGTTAGGAAAGAGGAATTAAGGATAGAAACCTAGATGTAAGAAACAATATCCCAAGA ATGACTTTCAATCACATTCTTTTACACTATTAGTATAAGACACGTGAATTGTAAAATATAAGTTGGGTTTGAAATATGAATGAACTAAACCCGAAAAAGA AAAGCCCAACTCCAAAACCCTACAGCAAAACTCTTGGAGGTTCTTCGCTCTTAGCTCCCATCCAAACGTAACGATGTCCGCCGTCGCTGCCAGGTCATTC ATCCGCTCCGCCGCCTCCCGAACGGCCAACTTCGCCGCAAGCAGTAGACCAAGAACAGCCCCGTCTCCGTTTCGGATCCCAAATCAAAGCTCACTCTCTA ACCGCACTTTCAGGTCACCGGCGGTGTTAAGTTTCTGCGTCGAATCGATGCTTCCTTACCACACTGCTACGGCTTCCGCGTTACTCACTTCCATGCTTTC CGCGTGCCCTCGCTCCTACGGTTGGACCCTTGAAGGGCAAGAGAAGACTAGATGAAGCGCAAGCATCAAAGATCACTTGGATTTGTTTCAGTTTTTTTGG TTTTGAAGTATTGAGAACTTCTCTTCTGTAGATTAGGTGGGAGGACATGAGTTTAAATTTAATGCAAAATAAAGTGTTGGGCTGTTGGCTACTTGGCTCC ATGTCTCAAAAACTTAACGAGTTGCTCTTACCCGATCATATTAATTTGTCTTTAGAATCTTCACCCCCCTCCCTCTTAGGAAAGAGCTATACTGGTTTGT CCTATGAAATTGGTGCTCTAGTTCAAATAATGATTTTCAATTTGATGTGACAATGTGGGTTGTTTAATTTGAAAGTGTGTGTTGGTGTGTCTAGCTTTTT ATAATTTTGTGCTAATATGACCTCACCAGATTCTGAGTAATCATGCAAAGTGACTTAAACTTAACCATTATATTAATCAATATAGCTTAAAGGTAATCAT ATGAAAATCAGACTGATTGACTGTATTCATTCAGATTGCAATGATGATGTATGATGCATACAGAGGAATCGAGCAAAGTTGTATGTAGATGAGCTCTAAA AGGTGGTCAAGTAAAGCTTATTCTTTTGTTTTTGTAGGATTTGAAATTGTTACTTCACATTTATGATGTTTAAACAAGAGTTTTGTGGGAGTTTTAGAAT AATGAAAAAAGTCTAGCAATAACAGTTTTTACTTTATAATTGTGCATACAGATTTTTGGATACTGTTGTTAAATTGCATGTATACTGTATGGACTTTGGG TTCTGATTCAAGCCCAACGAGGTTATGATGTAATATGATACATGGGATTGGGAGTGCACTGGTGGGCAGAGTATAAGATTATTGATGTACCATCTCAGGA TGCAATAATACAATCCACTAGGCTATTACAGTCATCAAGAATTGACATATTTTAGTGTTTGTATCAAAGTCATTTTGGACTGTTGTGATTTCGTGTACCT AACTGCATACAATAGCTGAATTCTTATAAGTTTCAAGAATTTATTGTTGAAGTTTTAGGTGTGTTGTTTTTGTAGATTCCTTGTCAGTGTCAGCCTTACC TTCATTTTCAGATACCAAAATGCTACTTGTTTCAATGTAAATTTAATCTATGTCAGTTCTATGCATCTAACGCCTTCGAGTGTGCATAGCATAGATGCTG GGTACAAATTTTGTAGTTCTGTAACTTTTGTCTGTCACACTAAAATTTCTCACATGCAACTATCTGTATAGAATGAGTTCTAGTTCACAAAAATCCAGTT AGTAAATTTTGGGTGCTAAAGATGCCATAATTGTAGCCTCACAAGTGTTTTTTTACTGAGGTGCCCAAAGTAAAATATGGAATTCCATACTTGATTGTGT TTGCAAACTGTAAGCTAAACAAGTTGTTCAAAGGCAAAGCCATTTTATTTCCCTGGTTCCCATTTCCATATTTTTATTGAACATTTGTGTGCACAATTCC ATTTTGACCTGGCTGTTTCCTTGTTTAGGGTCGTGATCATTTGCTGTTTGGCTTAATGCTTGGGGAATGGGAACTTGCCATGTAAAGCCTCTTCATTTAA ACTTGTTTTGCCTTCCCTTGCTAGTTTTACATGTCAGTTTGTATAATATAATATAGTTAAACTTTTATATCTTTATGAATTATTATCTCCACCTTATGGT TGATATATGGGTGTTAGTGTATATTATTGTTGATTTTCTTAAGCAATCTTTGTTTTTTTGCATTGTAGATGGATGATTGTGTTTATGGTTGCGGTGCACA ACTTTCCATGAATTTCAGTTGTTTTTTTGCTTGGCGGGGGATAACTCCAGACTTAAATTTGTGCAAGCATCCAGGGCTAGGAACTATGCTTAGAAATTAA TTGTTATTTTATATCAAACATGATTGATTTCCCCTATTACAATTTACTCCTATATCACAACCGAATCACAAGTTCTGACAAGAGTTACATTAATTTTCAG TATCATGTATTTTTTATATACCAAATATGATACTGCTTTTTTCTTTAGTTCATTAGACACCGCAAAGATGTCCCTTATCATACCTGAGATTGTCATCAAA TATAAAGAGGTCTTGTTTATGTTTAATTGGTTTA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_45171; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_158693

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_158693

Blastp-
BlastxProtein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 51.61% of identity
EggnogNA(ENOG410ZH16)
KeggLink to kegg annotations (AT2G20585)
CantataDBLink to cantataDB annotations (CNT0002336)
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019422607.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;