Ll_transcript_20894

Id TrinityFTRINITY_DN55107_c2_g1_i18
Name TranscriptLl_transcript_20894
SequenceCGTTGGGTTGAGAAATGAGAAATTAATTTTATTTTTGTCTCCTTTTCTCTCCTTTCTCTGTTTATAGCCGTCGTTCCTCATCGTTTTCAATTTTAATTCA TCATCTTCTTCTTCTTCATCATCACCATCTACCATCTCTTCTCTTTCATCCTTCCACCCTGTCATCACAACTACCATAATTCTCTTTCATCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTTCCAGGGTTTTTCTCTTCATTTTCTCTTCTCTTTCTCTTGAATTCAACATTATTCCTTTCAAATTGTGTTCGTGAATGGCATATCA GGGACCTGCTTCGGGATCGAGTTCAACTTCTGGGTTTCAACAAATGAACTCCCCTTTCGGTGACACCACCTACACCAAACTATTCGTTGGAGGATTGGCT TGGGAGACTCAGACCGAAACCATGCGCCGCTACTTTCACCAATTCGGGCATATTCTAGAAGCTGTCGTTATCACTGATAAGAATACTGGCCGATCCAAAG GATATGGTTTTGTGACTTTCCGGGATCCCGAGGCTGCTAGGAGGGCGTGTGCTGATTCAGCTCCAACCATAGATGGTCGAAGGGCTAATTGTAATCTGGC TTCCCTTGGTCGACCACACCCTCCTCTGCCTTATGGTATTAGATACCAACTTCATCACAATTTTTTCATCCAATTTTGTTCTTATCCAATTCTACTCTAT GCTAAAATTTAACTTACATTCCTTTATCATTGCTGCTGTCATCAATTTTGTTCTTGTTATTATTATATCTATTATTATCATGGAGCTGGTTGGAACATGA CATTGACATGCCTATTTTTTTAAAGATAAAGTCAAGTCATTGGCAGTGTTGGATAGAGCTAGAGTACTTATTCATTTCAGTGTATCTTTACTGATTTTTT AATTTATAAAATACTAATATACACTCCTCTCAAAGACACTTCATGTAATGGATAAAGTTCCTACATTTACAGCGTTTCCTGTCTCATTTCCTTAAATTTG CTTTTGTATGTCTGCGACTCAGTATCTGGTCATGTGACATCTGTGTTTACTCTTTACCAATTTTATTTTGCCTCATCAAGTGACATATGTGCTTGCTCTT TCTGATTGACCGTTCTACCAGTTGTGATTTTTTGCTACATACATTTCTGTTAAGCCCATGCAACATTTTTTCTTTCTTTCTTTGATATGGGTAGTATGTG GTAACAGAACCATTCTAGGTTGTTCTTCCTGCATAGGTTACTTCAATTTTGTTCTTACCTCTGTTGTCTTTTATAGAACGGATAAGAGTAGCCTCCCCTT ATATTGGAAGTTTGCAACCAGCTCGCGGTGCTTATGTTGGAGGTTATGGCTACCAGCAACCAGTTCCCTACAATTATCAGCAAGGATTGGTTTATCCTCC TTATGGGTGAGTGGGGGATGTTGTTATACATTGATATTGCAAACATTTTAAGACATTAGTTTTTATTGCTAATTGTTATGTTCTTGCGTTTTCTTTATAT TTGTACTTGTTACATTCATGATTATCTCTATTCTCTACAGTGCTTTATTACATTATCAGTCATTAACTCATGACATTGTTGTTGACTGGTAAATGAGGGT GGTGATTATTGTATCCAACTAGGTACATATTCTGCAACGAACTGAGTTAATCCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGTGTGGCTATCTGCACATAACAACCT CTGGACGAAGCATACTTGTGCAGTGCTTAATCATTGAAAACAAGTATGTGAAAAAATGAGCCAATAGATGTGTAATAAACTAATAGTTATTATTTTATTT ATGCCAATGCGTGGAAGGGGTTCCTGACTGAATACATCTGCGTTGTACATCAGTATATATTACACCAGAATTATGCTCTATAGGTCATCTTTTCAACATT TTATGTGGGTGTTTTATCTTTGCAGGTATACAGCATATGGATCCGAGTACATCTACCCACAGAGCGTGTACAACCCTTACATGGGTCAGCAATACCTTCA GATATATGGAGTGCCTGGGGCAGTGAACACAACAGTTTATCCTTATGGACAGTTAAGCCGGGCTATTCCTAGCAGTCATGGTTATACAGCAATGCAGGGC TATACAGTACCTGGTCATCAGATTGTGCCCTACAGTGGCTCAAATGTTAATGCAATAACAACTTCACATGTGCCTGCGATTCAAGCACCATATACCAGTG GAATTGCTGCACCAGTTCCAGGCCAACCCCAATTTATTGTTCCTGCTCCTTCTCAGTTTATGCAAGGTAGCGGTCCTGACCAAACAGCCGGGTGAGGGAG CAAATAAGGTGGGCTGTTTATCTTACTACATATATTTATTTCCGGTGTAAGCTTGAGTTTTTTTATAAGCGTAAACTTATATTTTGAAAGTATTGTATCA CAAGTATCCTTAGTTTGCAGCAGGACTACGAGCAGTGGATCTGCTACTTGAGTGGCGGGCTTCTCCAATCTAGCCTTGCAAGTTACTTATTTTGCATTCT AGAGGTACTGAGCTTTGTTTTTATGCAATATTATTGCCCCTTAATGGTAAGGTTGTAATAAGTTTAGCCACCCATGAGTAGCTCATAACTCAACTTGTTT ATGATTTGGTAAGTTGAGCTCGTGAGCAATTGAGTTGTGCGTAACTGGCTCATTTAAATGATCCAGACCTCGAGGGTGTGCTCAACTCATTTTCTCATGA GCTTTAGCATAACGGTAAGGTTCCTTGCCCCGTGACCTAGAGATCACGAGCTCAGATCTTGGAAACAACCTTTTCGTTTGCGAGGGTAATGATGGCTGCC TTGTAACATCTTCACACTATGATTATGATTATAATATATTATAAAGTGTTATTACTACTAAGCCTTTGTTAATTACTTAATATAATTATGTATTGGATTA ACTATATTAATAAATACATGTTACTACAAGATTCTGTAATCTTCTTAGAAAATGTCAAATTGATCTCTGCATTTGGGGTTTTCATTGCACAAGAATGATT TCTGTATCGCCAAATGAGGTGACTTGAGAAATTGTAGCACAAACCTAAAGCACCCAAGTTGTGTGCGTACTACAACAATCACATAAGTAGCTACAGTAGA TTATGATAACTAATAATGGTGTGATTGGCCTATTGCACTCAACTCTCAATTTGAATGCTGTGGGTTTATTCAAGAATTTCTTGCAACTGTGAAAAGTGTT GTGTTTATTTGCAATTGAAAACTATGGCATTGGAATCTATATGTTGTTTTAGTATAGGTATAGCTCTTAACGAATCTTATTATGTGCAGGTCATATGTAG TCATGCTCACCAAGTCGTGTCTGAGTCGCTCGTGAAGAAAACTGGACTGTGTGGACTGCTTTTCCATTTGGACATTTACACTCATGTATTTATACCTAGT GCTACTAGTACTCAGGAAGAGTGGTGGTAGTATTGGATCGGATGCCGGAATAGGTCTCTGGCAGCCATGTAGAAATAAACTTGTGTAAAAAATGAAAATC ATGTCTGAATCAAAATATGATTCTTTGTACTTTGTAGTCTTGTGCAGCATTGATTTTGTAGATAATCTCATCAGTGTTGGTGCATTGTGTGAAGATGGAT GGTCCGTCACATTTTTTTGGTGATTTTTGTGCATAGTAGCTGTGTAGTTGTGACAGGTTCTACCAGAAACTCGGGTGTAATTTTATGACTTGTTTTTATG CAAAAAGTAGAATCACCAGTATCTCCAATTAGAGAAGATAGCAGTGGTCCTTGGTGTGTTTTTTACTAGCGTTTAGCAGAAAGTCACATGCTCAACTTTT TCTTAAAACTAATGTTCATCTTTCATTCTTTCTTGTGAAGGACTCAATGTGTCCTTAATACATGTTCTATCTTTTCTAATTAATTCTTACATTCTTGTGT GTATAAGACATCTTTTAGTGTTTTATGTGTAAGTCGCATGCTAAAATTATTACATGTCACTATAAAGGTGCTTGCTTCATACTGGCTTCTACCACTCG BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_48624; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_20894

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_20894

Blastp-
BlastxProbable RNA-binding protein ARP1 from Arabidopsis with 65.93% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019414871.1)
Pfam-
Rfam-
GO-