| Id Trinity | FTRINITY_DN55281_c4_g1_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_137812 |
| Sequence | ATTTTATATAACATGTGCTTCCATTCATCTAACAGTAAAGTTTGAGATGATTTCCAAAACGTGAAAGATTGAATTTGTGAGCGATAAAGAATATAAAGAA ACAAGAAAGAATAATTGTAGTTTGTTGTTGCAATTGATACTCACTTAGAATCTGAGATCTTGATTTCCCCTTTTCTTTGACCCCAATGGATATAGATCCT CCTCCCAACGGCAACAACTCCGCCGCCACCGCTACCGCCACCGCCACCACCGCCACCGTCAACCCCTCTCGAATCTCCGAATCTCTCAAGCTCGAACACC AGTTCTTGAGGTCCCCTCTCGAGCACTTGAAGAAAACAATCCGAACTAACCACCGCGCCGTCGAGAAAGAGCTCTCCTCCATCTTAAGCGGCGTTAACGA CGCTGCTGCTGCCGACTTCTCTCGTCACGACGCCGTCAACCACCTCAACTCCCTCATCTCCCGCCTCCATGGCCTCAAGAGGAAGGTCACTACTAAACCT AATTCCCAAATTATTTTGATAAATTAGGACATATCTGCATGTTTTTGAATTAAAATTCAATTCATATTCTTTCATCATGAAATACTGTTATATGAAATTC AATTCATACTGTTTTATTGAAAACATATACTTTCTGTAACTTTATGATGATGATCATTTGTGAAATATGTTAAGATAGAAGAAGGAAATCTGGCAGAGGA TATTCAAGCGCAAAGCTGCCGCATACGCATTGATCACTTGAAATCTGCAGATGGAGAAAATATGTCACAATGGAATAACACTCGCTTGAACCGAATTCTT GTTGATTACTTGTTGAGGATGTCATATTATGGAACTGCAGCCAAACTTGCTGAATGCACCAACATACAGGATCTTGTTGACATTGATATATTCCAAGAAG CAAAAAGGGTTATTGATGCTTTGCAAAATAAGGACGTTTCACCTGCCCTTGCGTGGTGTGCTGAAAACAAACCAAGGCTGAAGAAGTCCAAGGTTTATAC TGCCATTTGAGCTTATTAATGTTGCTGCACCATACTTGTAGAATTGGCTTTTGGATTTATTTGTTCTACAGTTTAAGCAATATGCATTTCTTTTAAGGCA TTAAAAACAAAGAAACACCTAAGATATACTGCAACTATAGAAGTGTTATTCATCCAAAAGAGGAAGTTATCCACTGTATGTGGCTGTTGAATGAATATAA GAACTGTTCTAAGTATGGCTCGAAATTGGGGAAAAAAAACTAAATTAATGCTAAGTTAAGAAGCCACCTTTGTTGATGCTTTGTTCTTCCATCTTTGGGT TTTCGCTATCTCGTGGGGTGCTACTTGTCAGTAGCAATTGCATACTTAGGGTATCCCAGCATATCTATTGTCGTTAATTTAGAGTGATTTATTGACAACA GAGCAAATTGGAGTTCCAGTTGAGACTTCAAGAATTCATAGAATTGGTAAGAGCTGAGAACAATTTGCAAGCCATTACGTATGCTAGGAAATATCTTGCA CCATGGGGAGCCACCCACATGAAAGAATTGCAGCGAGTCTTTGCAACAATAGCTTTTAAAAGAGATACTGAATATGCCACATACAAGGTAAGATTGCATC ATGCTTTAGGGTTTTTGTGCCTTAGTTATAAATATTTCTGACCACTTGGCAACATTAATGATATTTAATTTACTGTTGTGCATTAGATTTTAATAATGCT AAATGCAACATTGTCAGGATTATATTTACATCAACAGCTGTTAGAATTACATGATTCACTATTCAGATTTCATGATTTGATAACATTCAGTGAACCAAGG TTCATATCTTGTTGTGAATCACAGATGGTTTTGAATCAGAGCAACTCTGTGTCATAGGTGGATGATTCAGCGAGTCATTATCACCCCACGTTTTCTTTTC AGTTTCCCCCATTAATTCATATCTGAGATTTTGAAGGGGGTAGAGAGGCTTAAATTGTTAAATAAAATGAATTGAGGTGTTATGTATCACACCCTGTTTC TTGCTCTGCTTCGTTTGGAGGGGTAGGGAGGTCTTCTTTGTGTTCATGTTGGAGAGCATTGTTCTCGTTGTATACTTATGACTTATGGTATTATGGGAGT TTGCTATTTCCTAAGTAATATGTAACCTATAGGTACTTATTTGAGATATTTGACTATCTTGTTCATGTTTTTAGGTGTTGAATCATGTAAATTTAAGATT TATTTTTTTGTTGATGTGTTTCTCGATCATGCAATATGTTATGATTCAGAAATTAAGCGAACAATTCTTGATATGCTACACAATTTGAAATCCATGTTTT ATATAATAAGAGTAATTTTTTTGGAAGTGGACATAGCGAAGTCATTTCGTTTCGAATTTTAGTTAAACAACATACTTCATGGTAGAAGAGTGTGTAGTTC ATCAAGTGTCGATAATTTTCTTTGTAGAAAAGAGAATGAATTACAAGCAATGTGCTAATGACTCTATTTATATGTAAATGAATTGCAAATGTTTCTCTTA GTTTTTGTATTTGTTAGTAGTTGTGGTTGACTACCCAAGCTAGCCCTAAGCTGTTTTAACAATCAATATCATTCGCATCATGCATCTCTTACCTATTTCA ACTACAGCTACTCTGTTGATTATGTTAGGAACATGAATATTTATTGACATGAATTTTGATTTTTATGTGATCACTTGTTATCGTAGAAAAAATTCATGTC TGCGGTATTTCCAGTGAGGTCTTTCAACATGATATTGGTCAAACACAGCATTTTGATACTTTTTTATTTGCTGGACTTTTTGCTTAATATTGCATTATTG TTTATTCATTGGGAAGTTCCATTTCAACACTTGGTATATTTCCATTCCCATAATATTTTTACAGGTCTTATTTGAAGCTAAGCAATGGGATTTTCTAGTG GACCAATTCAGACAGGAATTCTGCAAGGTATATGGCATGACTTTAGAGCCTTTGCTTAATATCTATCTGCAAGCTGGCCTTTCTGCCCTCAAGACTCCGT ATCCTAACAACTTAGTAATATTTTGCTAATTGCCTCCTTATTTAACTACTTTTCTTTGTTGGCTTGAGATAGTTTCTTTAAGCGAAATGCATATGATAGT ATGATGTGCTTTATCATTCTTGCATACATAAATCTGAAACCCCTTGGACCCTCCTTATCTTCTTGTGGTACTTGATGGAAGCTTATCAGGTAGTCTATTA AATATTAATTTGAGTTCCGTTGGTTGGGGTGTCACTATTTCTGATAGCATCTTGCAGTCCTCCATAATTAGCAGTCCTAGACCATTCAACAACAACAATC AAGCCTTAGTCCAGTACCATTGATTGTATGATATTTCGTATGCCATTTATTAGTAGTAGGGTTCTGTCACTCTTGTGCTTTTTTCTTTACTCCGTTTAAC GGAAGATTTCAAAGCTAGTACCAATAACACTATAGCCTCTTCCATGGCTTGCATTTTGTCTGTGTTGGTGGTATGCATTGTCTGAGCTAGCTCTGTTGAG ATACACCCCTTAACTTGACAAAGATATTGTTACGAGGATGATTGCACAAAAGAGGACCCTCTATCGCAAGAGTCCTTCCGCACACTTGCCATGTCACTAC CTTATTCGAAGCAGCATCACTCAAAGCTTGTTTGCTATATAAGTAAGGAGATAATGGACACTGAGAATCCACCCCAAGTCTTGCCCAACGGATATGTTTA TAGCACTAAGGCTCTGGAAGAAATGGCTAGGAAGAATGATGGTAGAATCAAATGCCCAAGAACAGGTTTTGTTTGCAACTACACAGAAGTGATGAAGGCA TATATTTCATAAATCTACATGATGCTTAGGCTTGATGATGCCTCAAGCTACTATGCTTGTCTGGTTTGAATTGTGTGTTAGATTACTCTTATGGGTTTCT ATACATTTACTTGTGTTGTGGCAGGTGTTGACTTAAAACATGTACATATGTAAGATGATGTTTCAACCCTTACTGGAATATGACAAACAAGTGAATACAT TTTAGTAAAAGATGTCATGCCACATAGATTTGAACTAAAAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_50094; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_137812
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Macrophage erythroblast attacher from Rattus with 43.69% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_012570281.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |