| Id Trinity | FTRINITY_DN55378_c3_g2_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_64560 |
| Sequence | CCATTACCTGTCGGCACTTCACTCTCACCCTACGATCATATCACCCCCCCTTAATCAACGGTCATAAATAAACAACATTGTGCTCAGAAAGATTCATCAT TTCATCGTTACACCTTTAAATTCAAACCCACACCTACACCACTCTCTTTAACGAAACATAACATTTCTACACACACCTTCATTGTTTTTTCTGGTATAAC GTTGTTATCTCTGTCTCTTCATTCAAAGCTATGACGGAGCTCCAAACCAAACCTGAAACTGCTCCGGCTCCGACCACGGCTCCGGTGGTGGACCCTCAGC CTCTGGCTGAGGCTTTACCTCTTGCCGTCGTTGTTGATGAGAAAGCAGTGGTTCCAACGGCACCGGTGGTGCCGGTAGAGGAAACCAAGGCTCTTGTTGT TGTTGAGAAAGAGAGTGAGTTGTTTTCAAATTTTGAAACTTTTGTTACATAAAAATTATTTATGGGTTGCTTTCAAAATCTCAACTTGTTCATGAATCAT GATTTATAAGCTTGATAGTTCATATGATAGCTTTGTTTAGTTTATGATTTTAATTAATCAATTACCGTATAATTTAATTATTATTGTTATGGGTTTTCAA GGTCTTTTTCATCAAAGGTTTATATATGGAGCTTGATTTGTACTGTTAGCTCAGTGAACTATTCATTCTTATTCCAATCTTTGTGCTTCAGCAGTTGGTT GTTTTACAGGAAAATATTTACGGGTTTTCATCAAATTTCAGCTATGATTGATGATTAATTTATGACTTTTTCTTATTTTGGTTATTTCAAACTACTCTAG AGTGTGATGTTGTGATTTTTTTCAATTTCTGTTTGGTTTCTGAGAAAGTATTGTAACATGGAAAATAACTCTTCGATTCTATTAGTTACCTTTCAAGACA AGGCCTGTTGCCTAGTTTAACATTGTTCACATTATTGAAGGGTTTTCCCCATCTTTCTGTTTTTAAGTTTATTATCTTGTTTTCTCTTTCATCAATGATT TTTTAGCTAGATTTTTATGATTTTCCATTTTCTTTGTTCCATTTATCCCCCCTCCCTCGTAGCTTACTTATTTTAGGGCTATGTTTCATAGCTTTTAATT CTGACCAATAATCTTCTAACTAAGCATCCATTTCAATGTTAGGATGCTCTTCATTAATGGAGAGGGTAAGTGATGACTTTTACACTTATATACATGGGTA AAATTGCCATATTAATAAATTTTAAGGATTAAAGTAACAAACCATATTATCTTTTTACTCTTGTTTTGGGTGTACTTACCTCTTCATTAATGGTAATGTA GAGGATCCTAATTCCATTTCAATTACTGGATCTGCAAGCTTTCTATTAGTATGTGCCTTCTCTTCTAAATAGGGTAACCATTTAGTTACGGTTTAGTTTC ATAAATGGAGTATTTCACTTGCAAAAGTTAGTTCTCTCTTTCATTAATGCTTATTATTGTCGCATAGCTGTTTATCTACCATTCTACTAACTGTATATAT ACTCCCGTAAAAAAATTATGTATTTATTTATGAATTTAATATATATACAAATCAGTACGAGTATTTTGCATAAATATTAAATTCTTTATTTTTTTATACT TATCTAATTATCTAATTAAGATACTCTATCAATATTCTACCACCGGGGCATATTACACATGATTTCTTGTTATATACATCAATCAATAGTATCTCCCTGT CCCATTAAAGAGAGTCTAATTAGGCCCTCCACGTTCTCGTAAAATATAATTTTGTTCCCCATGTGACTTGCGAGGAAAGTTGTTTGTCCTCTCTGGAAAA TGCTGGTTTGATTTATTGGAAAAGTTTTTGTAAGAGTTTTCAAGGTTATAGTTATATCTTTTATTTCCTCCATATATGACACGCAACCTAATTAAAATTC AATAATGAAAAGAGGCTGGCATTCTTTATATATTTACCTTATTCTAAACATTATTTTCTATTTATGTGGATTATGGTAGCTACATCACTTATATTATGGA GATGCAAGTATTTGTTTCTTTTCATATTTTTAATGATAAAAATATAATTTTATAATAAATAAAAGGATTAAAAGTATCATTACATGTTGTCTTTTATTTG TTATTGTATAATATTTACCTATCTAGTAATGAAGATGATCCTTACTCACCAGATTCATAGAGTTGATATAGTTTTAACCAATCATGGAATGAAATAACTA CATATGATGTTTTGAAGTTGCAACATAGTCATAAGATGTATATTTTCAGTTCCTAATTGCAACACCTTAGTTGATCAAGCATGTTAAGAAAGGTGATAAT TTTAAGTTTTAACATTGAATATAATATTTGATGTAAAGGTCTAATAGTTGAACAAGTGCATGAACTCTTCTACTTAGTTGGTTTCAATGTAATATGATAT AAACACTTCTCCACTTGATGTAATTATCATGGAAATATCATTGCATTTATTTACCATTTTTCTTTTGGTTTATAGAGATACTGGATCCTGTACCTGTGCA TAAGAAAGGATCCCTTGATAGAGATATTGCTCTTGCAGAAGTAGAGAAAGAGAAAAAATTGTCTTATGTAAAGGCATGGGAAGAAAGTGAAAAATCCAAG GCAGAGAATAAAGCTCAAAAGCAACTCTCTGCTGTTGCTGCTTGGGAAAACAGCAAGAAAGCAACTCTTGAAGCTGAGCTGAAAAAAATTGAGGTAATTC ATAACCTGTTGTTAAGTTAATCATTTACATAATAGCATTGCTTTTCTATTATCCTAACATCATAATGCATGTTGGCACAACACTCAGAGAAGCACACCCT TTTTAAAGTTCTAAAGTCTAAACAATATAATAATTATTTCCAAGTTAGGATATAAGATACATCACAATATGATTCTGTTGACAGCCCAAAATATGTTGAC TTTTTGAGCTAGCACATTCCTTTTTCTTCACTTTTCATTATTCTTACCGACATTTGGAACTTTTATTCCAATTATGCTTTTAATTTTGTCAAATGGTATC AAATACGTAGAGCATCCCTAAGTTTAATCTTTTTATTGTTAAGAATATAATATGCTTTTACCAACTAAATAAGTAATTAAGTTAGGAAGGTACTAATACT TTAAAAAATGGTGGCACAGTACACGAGGTCCCATTAGTAGAGTATGAGGAGAGTAGATGTAGTAATATTTTCAGTTGACAAATTTTTGCCATATCCTAAG ATGTGTTGTACTATCTCTTTTTTTTGTTAAACATTACAAAATAGTGATTGTAAAGAAGGGCAGAATATGATTGCAGAACTTATAAATGAGTTCTCCACTG AGGACCCCTTTTCTTTTAGTCTCTTTCCATTCAAAAGATAGTTTAAAATCATGAACTGTGAAGATGGTTAAAAACAGATTTTACTGTGACCGGTAAATTA CTAAATTGAATGCAGCAGTATTATAAGTGTTATATGTACAGCATTTTAGAACTTCTGGCTTAATTGAAAGTCAGCCCTATTCCTTAAGCCAAAAGTTGTT GCCTTTGTTCATTGTCACTTGGATTATAGCAGTTGCGGTGTGAATTATTCTATGATTAAAATATATTTTTGAATCTGATGTGGTACAATACAGCTTGATG CGGTTGTGTTGCGGCCTGATACGACCACATCATTATGACTTGGAATCACACTGTAATTGCGAGATATGATGTGATTGTGGTGCAATATTATGGCCGCATC AGGAGACGAAGTCTGCAATTTAAATAAGTGTTTTGTAGAAATATAATTTTTGAATTGAATAAGGGAGATTCACATAAACATAGAAAAACGCTTTTATTTT ACTACCATGTTTAACACTTGAGTCCTGAGCAGGAACAACTTGAGAAAAAGAAAGCCGAATATGGTGAAAAAATGAAAAACAAGATAGCCTCGGTTCACAA AGTAGCAGAAGAGAAGAGGGCAATGGTTGAAGCCAAGCGTGGTGAAGAACTTCTCAAGGCAGAGGAATTGGCTGCAAAATTTCGTGCAACTGGAACCACT CCAAAGAAGCACATTGGATGCTTTTAAGTGTCATAGCAATAATCAAAATTGTGTCTATATCATTTATTGTTTGGTTATCAATGTTGTTTTTGTGTGTAAG AAAAGTAATCCAAAGAAAAAAAACATAAAGTTTGTGGCATACAGCTTGTATATCTTTTGGCTTAGTTGAAGTGTTCTATGCTGTTTGTTTATTTTTTTAT CAAGAGAATCTCACTCTTAATCATGTATAGAGTTTCTCTCTCTTCATTATTAAAAGGGGACCAAGATCTGCTATCCCAAAACCTGTACCAAACCAATAAT AACATGCCACACCATTCAAAAAAATTAAACA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_50867; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_64560
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Remorin from Solanum with 68.57% of identity |
| Eggnog | Remorin family(ENOG410YI71) |
| Kegg | Link to kegg annotations (102577743) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019413951.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |