Ll_transcript_63423

• Id Trinity: FTRINITY_DN55397_c4_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_63423
• Sequence: CTCACTAACAAGCAGCAATTCAATTTCATCACGTCCCAAAAAAATATGGCATGTCATGCTATCCTTATATAGCCCCTCTCTTAGTTATTCTCAATCACAC TACAAAAAAAACACTTAAACTATTCCTCTCCAATCCCTCTTTACCTTGGTGCTTCACTACCCTACTTGTTTTCTTTTCTATAACAAAGAAAATAATGACT TGTCAAGCATGGTCAGAACCTGTGGTTCGTGTCCAATCCTTAGCTGAAAGTGGCCTAAGATTAATTCCTGAATGTTACATCAAACCAAAGTCCCAGAGAC CCACCAATATGAACACAACTTTTGTTCCAAACCATGCTTCTTCATCTCAAAATGATCATGATGACCCTATTAACATTCCTATCATTGACCTTCAAGGCCT CTATGGTGAGGATCAAACCCTCCGGGAGGAGGTGCTCGGCCGCGTCGCGGAGGCATGCCGGGAGTGGGGTTTCTTCCAGGTTGTGAATCATGGTGTTAGC CATGAGTTGATGAAGAGTGCTAAGGAGTTATGGCGTGAGTTTTTTAACCAACCACTTGAGGAGAAAGAGGCTTATGCTAATTCTCCTTCCACTTATGAGG GTTATGGTAGTCGCTTGGGTGTGAAAAAAGGTGCAATTTTGGATTGGAGTGACTACTTTTTTCTCCATTACATGCCTCTTTCTCTTAGGAACCAAGCTAA GTGGCCTTCAATTCCGCAATCTCTTAGGTTTGCATATAATATCTCTCTCACAATATTTCATCAACATCTATTTTTACCAACTTTCATGACATGATAGTTT TACTTTGTCTCATAAACTATTAAGTTATTTGGGAAATTTGTCTAATATTACTACTCTTTTGGCACTACAAAATATCTAGGATTTGATAACATTTTGTTTT CTTTGTTAGAATTATCTCCATGGTAAAGAGTAAATTATCTAAACCATTATTTTTAACCTACTTTTATTGCCTTAAATTTATGGATAATGTTTGGTATACA TCACTCAGAAGCAAACTACTTCACATATGAAAGATGGTATAATCAAAAAGTGGATGTGCACAAAATGAGATGATATAAGCTAAAAAAAGAAAGATATATC ATTATTATAAGGTTGTATATCTATAAATAGAGTTAGGATCTTTTCTATTAATGGAGAGGCAAGTGCATCAAAAATCAAAGAAAAATGCAACTTTGAATAA CATATTTATCCTTTCAATTACCATAAAGTTATATTATTGCCATTAAAAACAAAGGTAAAAATATGGATGAGTAACATCATTGTAAATTTGAGTTTATTAC ATCAATTTTTGAACACGTTTGGTACTGCTTGTTTTTCTCTCTATTTTCCATTTTATACATATATTTCATAGGAGAGATACTCATTTTAAGTTATACCGGT TACATTCAATCTCATACATTCATTTTCTTAGATTTAACGAACCAAATGGGTGATTGAAATAAATGATGAGAGAGAGAATATAAAACTTAAATGATTTTAA AATTTCACTCATTTGGTCCGTTAGATCTAAGAAAATGAATGGATAAGATTGAGTGTAACCAGTATAACTTAAAATGAATGTAAATTGATCCCTCCTCATT TCAGACACAATTAATATATTATCTATTATTTATACACACTATCAGTTAATACATTTTTTTCTCATAAATTAAATAGACATCATGAAACTGTATCCGATAA ATTTATTTTTAGGTATATATGTGTTGGCTAAAAGAAGAATGTAGATATTTTTCTGTTCCGTGTGCTATTTTCTGTTGTTGTTAAATTGTTATTTTCTGAT TTTGTCATGTTTGGTTAGATGTACAAGTAGGTATCTTTATTTATTTAATTAATATTTTGTAACAAATTTATGGGCTACCAACTAATTAAGGTTATATAAT GGGGGTGGGGAGAGGATTATAATGTATAATATCTATATAATGTCAGTGTAAATATTTATATCTTGATATATCATTTATCATTTATTATAATATTTTTTAA AGAATCAATAATGATTAAATATAAATAAATGATACAATAATAGTATATAAAACTCATGTTTTATCAATATATTATTATATGTATAAATAAAAGTTAGGTT TTGAAAAGTTTGGACATGTCACATTGGAATGTGCTGGACGAAACCGTGTTAGACATTGGTGAATCTTTAAATTATTAATTTGAGGTAAGAGAAAGACTTA TTGAACACGTGTAAATTATGACACTTGTTGAACACTTCTTTCAAGTGGAAACACGTTATGTTTCTACACCAATATTACACCAACATGTAAAACGTGGACA GAGATCTTTGTCACATAGTCTATCCCCAATTTCTATCCCTGACCAATCAGCTTTGAATAACTAAAATAGAAATATAATATTTTGTCTTTAAAAAAATTAT TTTTATTTATGTGACAATTTTCAATTAGTGAGAACAGGGAATTATGACAGGTTTCGGGACATATAATCCACTCCTTAAAACGTGGTGATATATATCTACG GCAAAGCCAGCTTTTAGCAAATAAGAAGAAAAAACAAATAATGTTATCTTTTCACATAAAAACATATACATGTTCTACCTTTATTCCAATTTAGTGAAAG AAAGAGAAGGTGGAGGAAAAAGTTTTATTTAAATTTTCATTTTAGAAGTCACACATGTAAGGTTGGTATATGAGTTTTGGATATAGGAATATCATAATTG TTAATTGTTATATGTAAAAAATAAACAAAAACTGTATAATTGAGGGGAATAAAATAAAAATAGCTCTTGATAAAATAAATTATATACAAATACAAGGACA TTTGCACCTCATTTTCATTATCTACATCATTCATGAGTTTTTTTGTTAATAAAATAATAAAAATACCCTTTTCACTAAAACACTTTATATGTTTCATCTA TCATAAAAAGTAAAAACAAATTGTGAACATTGTTAATTGTTTTTTTTATTTTTTCATATATGATTTCTTAATATATTTTTCCATCAACCACCTTGGCTGA AACTCACGGTTGATTTAGAAAAGGTTCTTTAGGGCTTAATCTCTTCATATGATCATTAGGAATATATATGTGTGGCTAAAGTCATTAGACATAACTTTTG TTTGATGTTGGTTTCTATCCATAGAATATTTTATATTGATTGTGCAAATCTTATCACTTATTTTTATTAAGAAAAAGCATACCAAATTTTCATTATTAAA TTTATATCCCCCTAATGTTACTTTTTGTGATAATATAGGAAAGTGATTGGTGAATATAGTGAGGAAGTGATTAAGCTAGGAGGAAGGATCCTAAAGATAA TGTCAAAAAATCTTGGCCTAAAAGAAGATGACCTTATAAAAGCATTTGGTGGAGAAAATGAAGTTGGTGGTTGCTTAAGGGTCAATTTTTATCCAAAGTG CCCACAACCTGACCTTACTTTAGGACTATCCTCTCACTCAGACCCTGG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_51045;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_63423

FPKM

• FPAB: 6.9
• FPNAB: 0.9
• LF1: 11.6
• LF2: 14.7
• LF3: 17.4
• LF4: 6.1
• UF1: 7.8
• UF2: 14.7
• UF3: 9.7
• UF4: 5

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_63423

• Blastp: Probable 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase At3g111800 from Arabidopsis with 53.51% of identity
• Blastx: Probable 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase JRG21 from Arabidopsis with 54.86% of identity
• Eggnog: 2OGFe(II) oxygenase(COG3491)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G11180)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019413119.1)
• Pfam: non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal (PF14226.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;