| Id Trinity | FTRINITY_DN55900_c2_g2_i21 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_248927 |
| Sequence | CGTGACACGTGGCAATATATAAAACCTATTGATACGTCACCCCAGTGGGCACCTCCAACACCAACGGGTCATTTTAAAACGTCACTTCCTCTCTCACAAT TCTTTCTCCTCTCATCTTCTCTTCTCTCTCGTCACGTTTTCAATTTCTCTTCATTTTTCCATTTTCTCCGGAACCGATCTCAGATTTCCCTCACTCTTCT CGCCGCCACTCCGCTATTATCCCTCCATTTTAAAACGCTATCATGAATCCCGAGTAGTATGTGCCGTTTCCCTCTCCGCAATACTCAGTATCTCGTTGCG AATCGTTTACTTTGTTTTTTTGTAAATCAATTTTGTGTTGATCTGTTTTAATTATCGTTCGGTGATGTTAAATTTTGTGTTATGTGGAGTGCTGGTTCGA TTTTGTTATGAAATTTCTGTCGGTGCTCGTTTCTGATCGCGATTCAGAAAAATATGTTGCTGATTTAGATCTGTTATATTGTTGATAGATCGATTATTTA GAATTGTTTGTTTTTCTGATCCGGTTTGGGAAATTATTTTTTTGTTTTATTTTGGAATGGTTTTGCTTAATTTTATTTGCAAGGGTGATATAACTGCAGG TTTTATTTTGGGTGTCTAGAAAAATATTTGAACTTTTCTATTAGCTAAACATGTCGGAGTCATAAGGATTTTGTGATTGCTGGGGCTTGCGAATATATGC TAAAATTGATACTTTTAAAGAACGGGAATAATAGTGAATATCTTAATCTAGTTATGTGGGGAGGAACCACATGATTACTGATATTGTATTCTAGTTAGAA ATTGTTTTTGTCTGATTCTTCTGCAAATAGGTTTTTAAGCAATAAATCTGTTTGTAGTTTAGTGTTTGTTGAAGACTTTAAGTTATATAGATGGGTCTGC AAGTTTGATAGTTGACTGACAAGTGGTTCTCTCTAAGATAATTTGGTTTATAAACTTGTAGCAGTTTTTAATTGCTGAGTTCTCTTTAGGGCAGTGATTA AGGAATCAATAAAAAGTAAGTTCTCGCTTGGAAACTGCAAACTCTGCTTTTTAATTTATACAGGATCGAATACAAGTATACAACTACTTGCAATAAAATT TTACTTCCTGTGATTCCTTAGCCAATGCCCTGGTTATCATACTCAAATGATAAATGGGAAAGAGTTGTGTTAGGCAAAAGAACACAACTTTTGTACAAAA CTATTCAATATCATATGCTTTTTGTGCTGACAATGGTTGCACAAGTCTGGAGAGACATTTAATAGTGCTGAATGTGTTGTCTGTGCATGGCTAATCATAT TTTAATGAATGTCCGATATACGTAAAGACCTATGACCTTTTAGAAATGTCATGTTTACCGTGTACTATGGGCTGTGGCACATGTGCTTGTTTACATTGGC ATATTGCTATGTAATGCTCATTCTCTTATAAAATTTATAGACAGTTCCTCATCATTTCTCTCTCTTTGATTGGGCCATCACTGCGTTTATTTTTTGCAGT GACTATTTATTCAAGCTTTTGCTTATTGGAGATTCTGGTGTAGGCAAGTCATGTCTCCTTCTGAGGTTTGCTGATGATTCATACCTTGACAGCTATATTA GTACCATCGGAGTGGACTTCAAAATTCGCACCGTGGAACAGGATGGGAAGACTCTTAAACTTCAAATTGTAAGTCCATGATGGTATTAATGCTTTTTGGA ATTAGGATTTTAAGGTTTGACTCACTTGTTTTTGGTTCTGATGGAAATGTTTTCACGATTATGTCACATTGATTTTTTCACCAGTTACATAAATTGTCTC AATTACTTAAATACACCTTGAAAACACACTCAAACTAAAGTATCTCATTTGTACCCAAGAATGTCTCTATTTTTAATTTGGAAAATGTTCACCTTACACC CCGATATGGAGTGTAAATAGGTGTAGAGAAGAGAGAGAGAAAGTGATAGATGTGATTGGTGGTGTGATATGAATGAAAGAGAGATATAAGAAGGAATTTA AGGTGCAAAAAGTGAGGTAAGAGAAAAAGTTGTAGGAATATATAAGTTACTAATGTTTGATGTAATTACCATATGCTTCATTCACCAAATGTACCCTTTG TGTTTTTCAAGTATTGTCGCCATGTTGACATATTTTATGCATTTTTAATGTATAGTGGGATACTGCTGGTCAAGAACGTTTTCGTACAATCACTAGCAGC TACTATCGAGGGGCTCATGGCATTATTGTGAGTCATTATATAATTGTCCTCCCCTAGCACGTTCCTTTTTAGATTTTTGGAGATTGGTGTAATCATGTTG CATTTTATCTTTCTTTTGCAGGTTGTTTATGATGTCACTGACCAAGAGAGCTTCAACAATGTTAAGCAGTGGCTGAATGAAATTGACCGTTATGCAAGTG AAAATGTTAACAAGCTTTTAGTTGGGAACAAGAGCGATCTCACGGCAAATAAAGTTGTGTCCTATGAGACAGCAAAGGTGGTTTATATATTTCTTGTCTC TGTCATACATGTCCCACTGACATCTATTGAGCTTAAATTCTTCCTTTTGTCTAATAATTAATGGTTTGAAACTTGAGTTTTCTGTTTATCATTCCAGGCA TTTGCAGATGAAATTGGAATTCCTTTCATGGAAACTAGTGCTAAAAATGCCTCCAATGTGGAACAGGCTTTTATGGCCATGGCTGCAGAAATAAAAAACA GGTGCTGTATTCTTATTTGCATTGTTATTAACTGAGGTGTGAGAGAGTTTAGAGTTTAGTCTTACTTATAAAAACATTCCTATAAACTCCTTATAGCTTA TATTGGAGATGCAAGTTATTGCTTTCCCTTTTGCACTTAAGGGTAAAAGTGTCACATGATTTGGCTGAAATCGGTTTCCTCCATTTATAAAATGGAAGAC ATACCGTAATTTTGTGAAGAAAGGGCATCTTTGTTTTTATGACATAGTGAATTCTGATTTGTTAATGACCAAGAGGTATATATATACCTAGATGATTGAC GTTTCTTGATTGTGGTTCTTTTGCACAGAATGGCAAGCCAACCCATGAACAATGCAAGACCTCCAACAGTCCAAATTCGTGGACAGCCAGTGAACCAGAA TTCAGGTTGCTGCTCATCTTAGAGACCAAAGTATTTGCGGTCTTAGAAGTCCTTTATATGTGTCTCCCTGGCATGTAAAACTAGTTTCTCAACTTTAATA TCAAGATTGTTCATCATGATTTGCTACTTATCTTCCCGCTCGTTAAAACTTCAATTCTTTTCAATGTATTTCATTTTAAAAGACCATTTGTACAAAATTA GGAATATTGGTGAATAGTAGTATTTGCCTTGTTCTTTCTCCCATGCCACTTTACTACTTTTCTTTTATGTTTTTGGGAAAAACTAAATACAGTATGTTGT GTTATCTGTCATTAACTTTTTATAGGGTGTATATATTTCTTTAGGAAAAAAATAACTATAGAGTGACACTTGGAATCTTATACCATTTCCACTCACAAAT ATAAAAATTAAAATAAGAGATGCACTTTATGCGCTACTTTTCATCTGTTCAAGTAGCACAGCTGAATACATTACTTGCAGGTCCAAAACCATGTTCCCC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_55473; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_248927
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | GTP-binding protein YPTC1 from Chlamydomonas with 62.2% of identity |
| Eggnog | member RAS oncogene family(ENOG410XQN5) |
| Kegg | Link to kegg annotations (CHLREDRAFT_60490) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421974.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |