| Id Trinity | FTRINITY_DN56167_c1_g3_i7 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_227473 |
| Sequence | AGACTTGGAGTCACGGTGCTCAGACGTTGACAAAGTTGCGGTTTTTTCGGAATCCTTTTAGTGAAGTTGAGCAGAAGCAATTTCAAGTAATCATTATTTT TTTAAAATTTTGGTCAAGCTCTTTTGTGGTAGTGTGTTGTGTGTGTATATTGTTGCATGTTAGCGTTGTATAAAGATTTGACACTCTTATTACAGAACCT GTTGCAAGAAGATGATTTCTATAGGATAAGACTGCCATCTAATGTTTTGACTCCTCCAGGCAGGGACTATATCATTTCTTCTGTGAAAGCTCGATGTCTT CCAGGGGATGGATTGGAGGAGCATTTTGTGATCCACACGGAAGGTGTTAACATATTGGCTGTCAATTATGGTGCCCCTGGAGCGTGCGCTTATCCCCGGC AACTGAAGCGTGTAAGTCAGATTTGCTTCTGACCACTGCACTTATTTCTTGTTTTTCATTAAGCAAAGCTCGAGTTTAACACACTTTTAAAATACTGTTT TGTTCTCATCTATTTTCTCTTCATCTTGCTGCTCTCAGAACTGCCATCTATTAATTATTGAAGTTGTTTAGGTTGTACATGTAGTTAATGTTAATGTTAT TAGCTCTTTCCTTAATTTGCACATAATCAGTAGTTAGTAGATGCACACATTATTCAATATTTTTTTTGTATTTTCTATTGCAATAAATGCAGTTATTAGT CTAAGCAAGCATCTAGAATGATTGTAGCATGTCAGCCCAATGTATCACACAACTCTAGTGGTAATTTTATGACCATACACTTCAAGATAAAAGTGTGATT AGATCCAAAACGACTGTTTAGAGTTTTACAGTTACCTTGTTAATATATTATTGTAATCATTCACTTGTTTGCAAGAGTAAAATTAGCATGTATCATGCCT CTAGAAACTGAATTTAGTCTACCAAAGATTCTACAGGCATGTTTGGTTGATTTTATATCCCACCATGGCTATTCCTTGTTCCAAAAAGTAACCAGCTATG AGAAAACCTTGATAAGCATTGCCTCAAGCCTATTTCATAACCTGGGCAAACCTTAAAATTTGTTATTGAATGCCTGATTTTGTTTTTTGAAAGCTAATCT TTTAAGTTCCTTTTTAAATTTAGCCTACAAGGTGGTCATTCAAGTCCCATACAATTTTGAAGAACACTGAACAGGCACCGAGGTATATTTTTTATGGTTG ACAATGTCACTCTTAATTATTTTTCAATCTAATATTACAACTAGTAACAGAAAGCTGCGTACATAGTGTTCCTGGAGCATGGTTTTCTGTATTTTACTCA AGAAGGTTCTCTCTCTTTTTGTGAACTTAAGAACAAACTGAGGATGGAAAAACTGCTCAGAGTTCTTTGACATTAAGGATAAGGGCTCTTCTGAAGTGAA TTTTTTTCTCTAAATTGATTAAGTAATGGTTTATCACCACTATTTATTTTAACCGGTTAAGATCACAATACACTTTAGAGGAATTGAATGTTTCTTTGGC TCTGAACTGTTTCACTGAATTTAATGTCCAGTTTTACATTTTCAAAACTACCTGTTCGTTTCCAATGGAATCATGTTTTCCTAAAATATTTCATTTGAAA ATGAAAACAGAAATAAAGATTAAAAAATGGGTAGTATGAAGGAGAAAATAGCTTGCCCTACTAAATGTTTGGGTTAACGAAACACTTCACAACTCACCCT GAAAAAAAGAAAGATGAGTAAAACTTTTGCTGTTTAGCTTATTAACATCTTATGTTATGTACATGTGCTATCATTGGGGAAAGTTTTATACCTGTCTATC CTGTGTAATTTTTATTGGACAAATTTTCTGGTTTTGACAGGGCCCCAGTATTTGCCGAAGATGTGTTTGGTGGAGAGGAGGGAGAGAGTGAAATTGTAAA GCCAATAGAAAGGTCTTTTTGGGCTAAATATTGGATGTATGTGATTCCTCTCGGACTCATTGTGATGAATGCTGTTACCCAAGCAATGAATATGCCCGAG GAACAGGCTGGTGGGCAAGCTGGTGCTCAGGCACAGCCTGGAGCAGTGCAGCGTGGAACTAATTCTGCGGGAGATTCCTTGTTATCTTGAATTCTGACGT GGAGAGAGATTATAGCAACACCATTCTTCAGAGTCTACACTTCCATATATGGTGTACCACCATGGTGGCGTTGTTTCTTCATAATGGATTTTTTTTGCCA TTAATATATCCATTATATCGGCATTTGGATCTTGGACCTATTGGTCCACTGGTTCCATTATTATGTATGAATTCTCATATTGATTGGTCCCCGTTTTATT TTGTCTTGAGGAACTTGCTTTATTCACCTTTTGGTAGAACGAGTTATTCACTTGTATTAATCCTTTGCTCTTTTGGAAGTTGGCAAGATTATCACAATGG CTAATGCAAGTGCTCATAGAACTTTCTAGCACATATTCATAAAAATTTATCTGATTTAAATGTTCTTCAAGTTCTTTTCTACAATTTTCCACCAAAGGAT ATGTATCAAAGGTATCCCAAACATAAGCTTGGTTTCTTGAACATGGAAGATTGGCAGCAGGGTGTTGTAATTAGGGCATGTGGACGATGACAATGGTCCT GAGCTTTTGGAAGTTTCTAGCAGGATACTTTCTTGCTCTAGCATTCTCTAGAGCATCATTTAATCTTGCTTGCCACCAGCTTAAAGGTGAAAATCATTCT AATAGAGTCCAAAGCAAATGATTATGATTTTGGAGATCAGTGAGGAACCTGTATGTTGTCTGAGTTTGCAAAGCAACAGGAGTGACATATAAAACAGTGA CACACCATGTGTACCATAGTAGGTCCTCTGGGAGGATATATCTATGGTGAGGATTGATTGAGATGACATTATGGAAAGGATATCTGGATGGAAGAGATTT TCTTGGAAACTATCCTTGTAACCTGTAAGAGCCTTGTGCAAAAAATAGTGAAGACGATTCTTTGCATACTCCTTAAGTTTTCCAGGTGGAAATGACAAAT CTACCCCTGGAGGGAGGTCTCTGGTGGTGGAGGCAAAATCTGGTAAATGATTGACCATTAGGATTAGTGGGAGAGTATTGATAGTAGTGATGAGGCTGAT AGGCTTGTTTGGTCTAGAGAGAAAATCTGGGATTAAATTTTGGTTTCCTTTAATGTGTTTGTAAGTAAAATCATATATAGAAAACCAACTTTTCAACCTG AGTATTTGGGGATCAGGTGGCATCTTGTTTTTGAACTCTAGAATCTTGGGGAGGGAAGAGTTATCCATTTGTACTTCAAATGTATGACCTCTAAGATAAA AATCAAATTTCCGGATTTCATACTTGACAGCAAGAACTTCTTTGTAGGTAATATGATAGTGTTTTTCTGCATTATTGAATTGGCCACTAGCATGCCCACG TGGAATGGAACACAACATGAC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_57913; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_227473
| Blastp | Genome polyprotein from Petuvirus with 42.74% of identity |
|---|---|
| Blastx | Genome polyprotein from Petuvirus with 48.98% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | Link to kegg annotations (921337) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019449848.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |