| Id Trinity | FTRINITY_DN56624_c0_g1_i21 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_85846 |
| Sequence | AGCTTAATGATATAATTAATAATAATAATGGATAATTGATATGATGAGAGTTACGAAGTGTTGCGATTGAAATAAGAAGAAAAAATAGAAAGGAAAAGGA GTTGCGTAACAACACGACACAAATTTGGCAATCACATCAAAAAGACGTAATTCCATTGCTCTTTCCTTCCTTTAACTCCTTCCTCTGCCCCTCACTCTCA CCTTTATCTATTCCTATTTTTTTCTATACACTATTTTGATTCACTGCTGAAACTTGTTTCTATTTCTTAATCTGAGAGAGATTCTATAAAAATATTAGAA GGTGTGTGAGTCCTGAAGAGTGGTGTAATGGCGTCGGGGAAAGTGGTTGGGTTCGTTGGGTTGGATCAATTAAGCGTGAAGATGGCGTCATCGCTCATTT CCCATGGCTATGCTCTCCAAGCTTTTGAGATAAGTGATCCGACGATCGAAGAGCTTTTGAAGCTTGGAGGAACTAGATGTTCAAGCCCTTGTGAAGCAGG GAGAGATGTTGCTGCTTTAGTTGTCCTAATTTCTCATGTGGATCAAATTAAAGATCTAATTTTTGGTGATGAGGGTGTTTTGAAAGCCCTAAAATCGGAT ACAGTTCTTATTCTCCGTTCAACCATATTACCATCAGCTCTCCATAAACTGGAAAAGGATCTGGCAGAAATTCATGAGATAGCTTATATTGTTGACGCAT ATGTCTCTCATGGGAGGTCTGATGCTATGAATGGAAAAGTTATTATTGCATCATCTGGAAGACCAGATGCCATCGCAAGAGCACGGCCTTTGCTTTCTGC AATGTGTGAAAAGCTTTTCACTTTTGATGGTGAAATTAGTGGTGCCAGTAAGGTTAAAATGGTCACTGAGCTGCTAGAGGCCATTCACTTCATTGCTTCT 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AAGCAGGTTGAAGAGCTTAAATTACAGTGTGGTCATTTTTTAAGAAGCATTGAGGTATCGGTTGAAAAACTTGTGATGCAGCCTATTGAGGAGAGGGAGG AAGAAATCAGTAAAGCAGCTCAATTGGCAGATGTTTATCTTAAATCTCATAAAGACACTCTTATATTGACTAGCCGGAATCTCATAACTGGAAAAAATGC CTCTGAAAGTTTGGACATAAACTTCAAAGTCAGTTCTGCTTTGGTGGAAATAGTGAAAAGAATAACTACAAAACCTCGCTATATACTAGCAAAGGGTGGT ATTACCTCTTCAGATCTTGCTACGAAAGCCCTTGGTGCAAAATGTGCCAAGATAGTTGGACAAGCACTTGCTGGCATTCCCTTGTGGCAATTAGGCACTG AAAGTAGACATCCTGGAGTTCCGTACATTGTTTTCCCTGGTAATGTTGGTGACAGCAGAGCATTGGCAGAAGTTGTGAGGTCTTGGACTCGTCCAACCAG ACTTTCTTCAATAAAAGATATTCTTAACAATGCAGAAAAGGGTGGGTATGCTGTTGGAGCATTTAACGTCTATAATCTGGAAGGCGTTGAGGCTGTTGTT TCTGCTGCAGAGGAAGAACAAAGCCCGGCTATATTACAGATTGACAGACCTAGTTTCTATAGAAAGTTAGTTCAAGGGGGTCTGGATGTCCATAGCTGTG AAACCCAAGAGCTGAGGCTAGATACTGAAGAGTATGTTAGTTGAGATCCAGATCCATCCTGGTGCCTTGAAGCAAGGAGGAATTCCCTTGGTTGCTTGTT GCATTTCTGCTGCAGAGCAAGCCAGTGT BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_61722; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_85846
| Blastp | Fructose-bisphosphate aldolase from Geobacillus with 55.32% of identity |
|---|---|
| Blastx | L-threonate dehydrogenase from Cupriavidus with 51.18% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019457928.1) |
| Pfam | Putative sugar-binding N-terminal domain (PF07005.10) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |