Ll_transcript_170972

Id TrinityFTRINITY_DN57046_c0_g1_i12
Name TranscriptLl_transcript_170972
SequenceGCTTCGTTATCCTTGGGTGCACCATCACCAGTAGTTCATCCACCTATGCAACTAACATCTTCCGCGTTGAGGAATGGACTCCCATCCGGAGCAAAGACCA AGAAGCCAAAACCATGTACAATTACCTTCGACATGAGTTACTAGCAGAAGCCACGTTGCTAATCGAGGAGGTTCTTCGGGTGCCATTGCAACAAATGGAC TTGCTCCTTCCTCTTATGATCTATTGATTGGAAAAAAGTTTGGACAAGGTGGCCTGATGATAATCACTTCTATGAAGTTGTTATTACTAATTATAATCCT GCTGAGGGACGACATGCTTTGGTCTATATGATATGAATTCAGTAGATGAAACATGGGAGTGGGTCAATCTCAAAGAGGTAAAATTCTTGCGATATTCTTC GGTCTGTGGTAAATGGTAATTTTGTAGATGAAACATGATGACTATGTCTTATATGTTGAATCTCAATCCTTGAAATGGGCATGAAAGATCTTATAAATTT AATAAGATAAACATTATATTTCTGTCTTAATAAATGTAGTTGTTTTTGTGGATGAAGGTATTGTCATATAGTCAATATCCTTGGTTGGTTTGAGCCATCA TTGTGGGTGATTTCCTTTGTATAAGTATCTATAATTGATGCAAACAAATAAACTTCAATCTTATATATGATAATTCATTCTAAAGTATAGATCAGGCTAC AATGCAGTAACATACTCATGTTTTTGTTCTCTTAGTTTTATCAGGATGTTCATTAAGCTTGATGCTGCAATTGTTAACATTTTTGTAATGCAACTTTGCA TTTGCTTCCTGAAGCCTTTGTGACTGGCTTTCTCTCTAATTTGTGCTAGAGAAGTTATATGGCCAAATACTCAATGGTTTGGCCAGCAAACCAGCTTGAT AATATTGTAACTTCTTTAAAATCAGAATCAATCAATTGAGATGTTGTTAATATATAGAAACCTTCTACTTTCATTAAACCTCCTCGTGTTTCCATCTGTC AAATCGTGCCATAGTAATATCAAAACATTAATAAGCTTGTTCTTCGCATTAATTGGTTACAATCAGTGAGATGTAGTCTTTATTTTAATCATACACCAAT GTTAAGACAATGCACTACCTTGAAATTAAAATCTTCTTTGCAATTAAAATCCATGCACTAGATAAAGTAGTAATTATGAAAAGTTAATATAGACGAGTGT GCCTAAAAAAACATTCAAAATGTAAGAATTGTTTGCTATGCATCTGATGCTTTGTAATCTGGCTGCTTTGAAGTTCGATTGATATGTTATCCTAATATGT ACCCACTTGTATCCAATGGTTAGCTAATTTGTTCAATTAAATTCAATTTCATTAAACAATTATTTGTACCCACTTTTATATTTTGGTTACTCTTTCATTT TTTCTTATTAATTGATCATTGTTCAAGTAGTCTTGTTTCATTATTGTGTTGTTAATCTCATACTTTCCACTGTACCACAAATCTCAAAACTTTCAAGGTG GTGATGAAGTGATGAAATGGCCAAGACTAGATATTCCATGTGATTATGCGTGAAATTTTTACTATAGAAATATTAATATTTGTGTATTTGTCTTTCCCCG TAGTTGTTAACCGAATTTGGAATGCTTCAACAATTGGTTTGGATGATACATATTATATTAACTTATTAATGCTCGTGTATTTGTGAATTATTTTAAGAAG GTGGTGATAATTTGAGATTTTGGGTCCAATTTCTTAATATTATTTTTTACAATAAGTTTCAATTAATATCAACTATTAATTTCTTAGTATTTACCTTCTA CTATTATATAATTGAGCCG BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_65342; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_170972

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_170972

Blastp-
BlastxProtein EMSY-LIKE 3 from Arabidopsis with 44.14% of identity
EggnogChromosome 11 open reading frame 30(ENOG410YF3T)
KeggLink to kegg annotations (AT5G13020)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019451063.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;