Id Trinity | FTRINITY_DN57191_c2_g1_i14 |
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Name Transcript | Ll_transcript_100154 |
Sequence | ATTTGTTCTTCTTCTTAGAGATTATCCCTCGCACTCTCACCACCGCATATCATTTGAGAGTAGAAATTTGTAAGCCTGAGTTATAAACATTTATTTGGTT CGAAGATATTAAGAAATAGGATTGGATCCGCGTCATTGTCGATAAGGAGGGAGAAATAATAGCCTATGATAAACTTCCTCTTCTAACTTACATTCACTCT TCTTATTCTAATCTCATACATACATAAATACATAACAGATATTATTGTAGTTATAGATAGATAGATAAAGAGAAAACACAAAATGGGTACTAATGATGAT GTTTCTAGTGTTGAAAAACAACTACATGATGCACTTCTCTATGTTTCTCTTAAGATGGAAAACCTTAACGATGCAAACAAACCCATTCATACCCAACTCT TCCCTCATGTTTATGGTTCATTTCCACTTGTTTCTTCTTGGGATCCTCATAAAGCTCTTTCCATGGAAAGGGAATCTGCTTCGACGTGGGAGTTGAGTTT TGTTCTTCCACCTAATCATGAAACATTAGATTTCAAATTCCTCCTAAAGCCCAAGGACATCGATGCACCTTGTTTTGTTGAGGAGGGTCCTAGTCACCTA CTTATTGACGGAGCATTGCAGGAGGATGGCAGGCTTGCTTTGTTTAGGCTTGATAATAATGCAGTTCTTGAGTATCGAGTAGTTGTTGAAGCACGCAGGG TTTCCCCCTTTGATCTCGCAGCTAGTTGGAGGGCATATGAGGAGCATTTCCATCTCCCTGCTGTGCGTGGGATACCCGATGTGAGCATAAATTCAGGAGT TCAGACAGGTGCTGAGGTAAGCCTTCAACTTACAGTTTCCTTTATGTTTTTTTTCCGTTGGTAGATTTGGTTGCAGTGTGATGTATGACATTAAGAATCA GGCACTCTTTAAGAAAGGTACTTCTCTTTTTCTTTGTCTCAAAATTCAGATTATCTAGTTGTCGGTTTTGAAAAACAAAATTCTTCCTCTTGTCACTACC TTCATTTTGCTTCGATCGGTGAGATAAATTTGTCTCTTGGATGGTAACTGTAATTCCTCGTACTCCACTGCACTGTTTGTTGTTAAATTTGTTTCCTTGT TTGTAGCTGTAGAACAGAATGTTACACTGGCTGCAAGTCTTAATATAATGGATGTGGAGTTAAAACCTTTTGTGAATATGCAAGATGTGTTACACTTAAT AATCTGTACTGTCCAATGTGTACGAGTTAAGTATTAAATATGACAATTTGTGTGGATAATCATATAAAGAGCTTTTGTTTACTTTGATTTCAAATTGGCA TTCAACTTTGAAAATGGCTCTAGTAAATTTTTTTATTTTTGAAAATAGTAAATAGTTCCTTTTTTGTAATTAGTGTACAGCTGGGTAAACTTGTAAAAAA TGTTCAATCTTTAGACAAGTAGAAACATAGGTAACTTGCATTTGCACCATGCTGGTTTTCTCCTCCTTTATGTGTTAATTCTCTCTTTCTCTTTTAATAT GCTTTGCCCTATTCCTAATCATAAGCCAAACATTATTTGTTATAGTCAATATTCTTATATGGGTAGTGCAAAATTAAAATAGTCTTTAACTATTGTCAAT GTGATAGTCTGATTAATTTCTCCTTTAGTTGTGTGGAGCACTGGTAAGGGTTTAAGAGTTTTCTTTAATGCCTAGCAACTTTAGCTGTCATACTCCATGG AGCTGTAGTTTGTTCTGTGGTATTTTTCTAACCTGATAGCCCAAAATGGTTGTTATTGTCAAGAGTAAACTGATCAATCTGGTACAACAACACAAGCCTT TTCCTATTAGGGGGGTTGGTTGCTTGCATGAATCAAACGATGTCATTGTGTTCTGTCATAAGCCAAGTCCTCGGAAAGGCCTTGTAGATCTAACTTATGT CCTTCAATAACAAAGTGATTATTATGGTAAAATACAATAAGTTTTTTGTGTGAAAGTGCTTGTACATTTCCATGTATGCATGTGCACTCATCTATCTTTA CTAGTGGCTTGCATATGATAATGCTCCCCAATCTTCTCTTATTCCAACCTATGGTTAACATGTCTCGGAAACAGTTTGTTTGCATACATTACTATGGACC TCATGCTTAACTTTTCCTTTGTTCAGTTTGTCTCTTCTGCGAGTTTGGATCTTGATCTTGAACATTATGTTGTCCCATCACCTTCTACTTGTGTAAGTCC GGAACTTGTATATGCTGCTAACTTGACAGAGGATCCCAGGTCACTAAGTAGTGGATCTGGCAGTGGTTCGTATTCCCTCAGGGATGACACTTTTCCTATC GATCAACCTGCAGTGGTAAAGGTTTAAATTTCAGTTTCACATTTCAAACTTATTATTATACCTTCTAAAGGGATGATTAATAAAAAAGACTGGCAGAACC CTTCTAATGGGTTTTTGACTTTTTGTGCTTACTTGATACATGTTCAGATTATTTTTTAGCAAAACCCTTTTTTGTTGTAATGGATCTGTAGTTGCATTTA CATTTCAAAGACTTCGGTTGATTGAGGAACTAGAATCTAGTGCTCAACCTATCAAATTAGACCGATCTTCTGTAGTTCTTAAGTATGAAACCGACTATTA GGCCGATGCTTGATACTTTAATGTATTAATTTTACTCCCCCTCTCTTCCTTTAATAAGCAACTAAAGCTTTGCTATAAGTAACAAATAGCATTACATATG ATGTTTAAGAGAAAAACTTTTGTATGCAAGTACATATTGACTATCGATATCCCAATATAGCACATCTAATAGGTTATGTTAATGTTCCTACTAAAAGGTG GAGATTATAGTCTCAGATCCATCTGAGGTGTATCAAAGTCCTGGAATGGTTAAATCTAAGTCAGTGGACACAATTTCACCTTTGCGAAAGGAAGATGGTC AGAGGGGGAATTTTGTTGATCGTGGTGTTGGATCTCCTAGACTTGTAAAATGCTCTAGTTCAAATACTTTCACTACTAGCAAGAATTCAATTCCAGAAGC TGCTGGAGCTGTTGCAGCTGCTGCCATTGCTGATCAGATGCTAGGTCCCAAGGAGGACAGACATTTGGCGATTGTCATGGTGAGCCTGCCAGCTCGAGGT AAAACTTATACTGCAGCTAAACTGGCAAGATATCTCCGTTGGTTAGGTCATGATACCAAACACTTCAATGTTGGTAAGTATCGTCGCCTTCGGCATGGAA CTAATCAGTCTTCTGATTTCTTTCGAGCTGACAATCCTCAAGGCATGGATGCACGCAATGAGGTAGCAGTTTTGGCGTTTGAAGATATGATATCTTGGAT GCAAGAAGGGGGCCAGGTTGGGATATTTGATGCCACAAACAGCAGCAAGCAGCGAAGAAAAACACTGATGAAATTGGCTGAAGGAAGATGCAAGATTATC TTTCTGGAAACAATATGCAATGATGTCGACATAATTGAAAGGAACATACGCCTTAAAATTCAGCAAAGTCCTGACTATGCAGAAGTGCAAGATTTTGAGT CTGGATTGCGAGACTTCAAAGACCGTGTAGCCAATTATGAGAAGGTTTATGAGACGGTAGAAGAAGGATCTTACATAAAAATGATTGACATGGCCAGTGG ACATGGTGGGCAAATACAAGGAGGCTGTTCTGACCGTTCACTATTTATTGCTGCACATATTTTGTGCACTCCTTGAGTTTTTTTCTAGCAATTTCAAAAT ATGGTCTACAGTATGACTTTAATTTCTGATTATTCACAGCTTCTATCTTTTCATTTAGGCGAACAATATCAGTGGCTATATTCCTGGCCGGATTGTCTTT TTCTTGGTAAATACTCATCTTACACCACGCCCAATATTACTTACTCGGCATGGAGAAAGTCAGGCTAATGTGAGAGGCCGAATTGGAGGAGATACCGCGT TAAGTGGGAATGGAGAACGTTACAAAAAGAAGCTGGCCAACTTTGTGGAAAAGCGTCTCAGTTCAGAAAGAGCTGCTTCTATATGGACTAGTACACTGCA GCGAACAATTCTGACAGCAGGTCCAATTGTTGGATTTCCCAAGATACAATGGCG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_66584; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_100154
Blastp | 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase from Arabidopsis with 72.79% of identity |
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Blastx | 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase from Arabidopsis with 69.54% of identity |
Eggnog | Phosphoglycerate mutase(COG0406) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G07110) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002894) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019456566.1) |
Pfam | 6-phosphofructo-2-kinase (PF01591.17) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |