| Id Trinity | FTRINITY_DN57878_c0_g2_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_57821 |
| Sequence | GTATACCTTCCTTAAATATTCATTACATTATTGATTTCAATTCGAAGTATATACATATTTTTCACGTAATTTATTCTCTCGATATAGATAGTTTTTGCAG ATTCCAATCGAGTCTCTAGGGTTTCTAATCCACACAACAACCATGCCCGACGATTCCCAATATTCCGACACGACTCCACCCTCCTTGAAGCGCAAGTACC ACGACCAATCCACGCCGCCGCCGCCGCCGGCATCGAGATTGCTAAACAGAAAGCTCAAGAAGTCGCCGCTCGCCTCTTTAACAATGCCCCTCTTCCTCCT TCTCTTGAACCTTCCAAGCGCTCTAAAACCGATAACGGTTTCGATTCCATTGATGTGAAGGCTCAATACCCGATACCTACAATTTCTCCTTCCGTGGTTT CTTATGGGCACCAGGGTGCTGCAAGCAAGAAGATTGATATTCCTAATGGGAGGGTGGGTGTCATAATTGGCAAAGGTGGTGAGACCATCAAGTACCTTCA GATGCAGTCTGGGGCGAAAATCCAGATTACTCGTGACAGTGATGCTGACCCTAATTCTCCTACTCGAATGGTTGAGATTATGGGTGCTCCTGATGCAATT GCTGCTGCTGAGAAGCTTATCAATGAAGTTCTCGCTGAGGCTGAAGCAGGAGGTTCTGGTGTTGTTACTCGATGACTGACTGGACAAGCTGGGTCTGAAG AATATGTGTCGAAGATCCCAAATAACAAGGTTGGTCGTGTTATTGGTAAAGGGGGAGAAACAATAAAGAATATGCAAGCTTCAAGTGGAGCAAGAATTCA GGTGATTCCTCTTCATCTCCCCCTGGTGACACATCCACTGAAAGAACATTAAAAATTGAAGGGACCCCTGAACAAATTGAGTCTGCAAAACAATTGGTTA ATCAAGTCATCAGTGGTGAGGTATGTTCTGCTGGATTTTGGCCTTGGTTAGCATGTTTTGCTTGCCATGTGCGTAGTCTAATTTGATTTAGAAGTTTTTA ATGTGCACCTTATATTTTCTGTCATGGTTTAGTTTTGATTAAACCAGATGGATTTATGTCTGGATTTATGTCTTTGTTTGCTGAATGATAGTTGGATACC ATGCTCCTAAATCCTATGAGTTCCAGATGAATCTTTATTAATTTCTTGCAATATTAACACATATGACCAGGCCTCATGATCCATTCCTTTTGATTGCTAC TGAAGTTTAGGCCTTATTTCTTTTTTCTGTGATGATTCATTGATTTCAGGGGTAAAAATTGCATTTCCTACTTTCTTAAACTACAATATGTTTAGACATG CTTTTCACGTGATTTGTTGCCTTGTTTCATATAGTGTCTGTTATCTGTTATCGTAATGTTATATTATTTTCTGTGTTTGTTAAAACTCAGACCTCTTGCA ATGGTTAAGCTGCAAATTTAGATGTCATGAAATGGTAATATCTTCTTGGCTAATATATTGTTATCAGATTCAGATCTCTGCAAGTTTCTACATCCTTTAA TAGTTTTCTTGCCCTATCTTTGTTACTGTGCTTGTGCTGCAAGCTTTCAAGCCTGTGTTATAGATAACCGCACAAAAATAAAAGATACTGTAAATTGATG ATGTCCAGTATCTACTGCTAATCTCTACAGTGCAGTTGAATTTTGATTCTCTTCCCTAGTTGAAAACTGATTAGGGAGATGAGCCACTGAAATAGTTTTT CGTATAATCTGTACTTAGTATGTGTTAAAATCTATGCTGTTTCTTGTTCAATTATGACCTGGTTTTCATGGTAACATGCTCTGGTTGGTAGTTTGGTATA GTCACTTTATGAGAATTGGCTTGAACTTCCAGGGCATTTCTAGTTCGTACTTGCCAGGTTTCTTTTGTGAGAGAGTAGGTGCACACAGTTTTTGTTTATC TGTAGTCTTATTTGAAGTAAATGAATACATTTGTAGTTGGCATTTATGTTCACATATCAATAAAACTGGACCATTTGTGATATTGAACCATATTAATATT TTAGTTTCTTCTTGTGATGTATTGTGATATACTGAGTGAGATGTTTTATTCTCATTTTGTACATCTTAAGTTACTTTTATGTTATGTTATGTTATGTGGG GATCTGTATTTTTATTTTTCCTGCAATTTGTTATCATGTAATTATTTATATCTATCAAGTAAATTTCATATCCACGTACCCTGTACCCGGTGTAACACAG ACCACTAGTGGCACCCACATGGAATCCCTTCGTCCTTGTTGGTTTTCCTTCAACATGCCATGGTATGGTTCTAAATCTCAGTTTCAATATTAATTCAGGG GCAGTAAGTCTCTTATTTATGTCTCTGCATCTTCACTGTTGGACTTGATGTATATTATCATGTTGACATCCTTTTATCCTGTAATTTGTGCTTTTCACCT CAAAATTGTTATATACTTGAACAGATTCTTTGCCTTAAGCTGGGCTTACAATTATTTCTGCCCACTCTAAGTCTTTTAGTTATGCAATGTAATAACTAAT AATTTCACTGAATACTAAATTCACATATGATGTCATTTTAAACAATGTTATTTGTGCCTTTCAATTCATACCTTGAAATCACTATTATGTACTTGAAATA AGCTGTCTGTGTCTTAAGCTAGATTTAATCTGGCATAATAAGCTGAAATTTTTTCATGGTGAAGCTCAACTCTTGATTTGTTTTCTATATTACTACTGTC CTTGTTTAGTCTTCTAGGTTTTTCACCTATGATTCTTCACTAATGCCATATGTAATTTTTTAATTGCTTAAATGAACTATTTTATATTTGAAATAGTATT TTTTTTCTGCCTTATGCTGGAGTTACAATTGGCATAATACCTTGAAACTTTTCCATTCTGAAGCTCTTCACTCTTTATCCTATTTTGTTATTTCAGTTTT CTAGTTGTCGCAACTAGGAATTATTGTATGCTCTTCAAGATAATCTATTCTCTTAATTTGTCTGTCATTATTTCTCTAACCTTTTTTAGTTCTTGAACCT GAACTCTCTAAATTTTTAGGACATGTTACCCTTGTTTAGATTACCTTGGTGGTTACGTTACATGTGGTTTTATTTGATGGTTCATTGAGGTTGACCACTT TAGATCGGGTGGATAGATGGTTAAGAGGCTGATTTTCTTCTGTACTTGGAGTGAAGAGAAGTTGTCTTGAGGGACAGCTGTAGATTTTGGATTTATGATT GTGCTCCTTCATCTCTTATACCTCTCTTATGCTGTTGATTTGTGTTAGTTTAGGAACTTAACTTGTAGAATTGCTGTTAATATTTTATATTGTAAAAGTT GGAATATCCCATATTTTGAGATACCATATATAGGATTGCCCTATGAGGAAATAAATATAGTATGCTTGCCGATTTCTTTGGTTTTGCTTTTCTTCTGTAC GGTATGTAGGCCTTTATACCCCTTTCTGGTTCTGAGTGGAATCTGTCAAACATATTATAACCATTATCTTGTGTTATTTTTAGGTTGTATAACTGTTATC TTGTGTTATTTTTATGTTCATTTTTAGTGTGGTATGTTTTACTTGTCTATTTGTTTGTGCTTCTGATGCTGTACGTATTCCCACATCTTGTGTTTGTTAA CTTTTTATTTGGCTTTTTCTTTCTGCAGAATCGTTTTAGAAATCCAGCAATGTCTGGTGGCTATCCTCAGCAAGGTTACCAAGCCCGACCACCAACTAGC TGGGCTCCCCCTGATGCTCTTGCACGACAACCTAGTTATGGCTATGTACAGCCTGGATCATACTCCGGTCCATCATCCCAGTACAACAATCCTCAGCAAC AATATGCTGGCTACCCTCCTCAACCAGCTGGTGGATATTCTAGTGGTTGGGAACAGTCTACTGCACCACCTTTACAGCAGTCTACTCAGGGTGCTGGGTA TGATTACTATAGTCAACAGCCTCCTCAGCAACCACAAAATCCTGGCGGTGCTGTAGCTCCAGGTGACGGGTCTGCTTCATATTACAGTCAACCACCTGCC TCTGGCTATAGCCAGTCCGGGCAGGGCTATGCTCAGGACAGCTATGGTGGGTATCAAGCACCACCACAATCAGGATATGGCACCATCATATGATCAGCAG CAAGGTTATGGTTCTGCCCCCAGCTATGGTAATGGGAACAACTCAGCACAAGAAGGGCATGCCCCCAACTATGGATCACCGGCAGACTCAACTCAGGTTC CACCCGTCCAACCGTCAGCGACCCAGCAAGGTTATGCTACTGGTCAACAGCCTAGCCCACAGGGTACTGCTCAGCCAAATTACGGGGTGCCCCCAACCTC CCAAGCATCTTATGGCAGTCAACCTCAGATACCCTCTGGTTATGGACCCCCCCCCCCCAGTCTCAAAACCCTGGTGCTACTCCACCTGCTTATGGACAGA GTTGATAATGTAGCATGTTAATTTTGGATTGTCTGAATTGTTGGTTTCATAGTATTTTTTGTGGTTGTGACATTGATATACCCAGAGCTTTTCAGTATTG AGATTGAATAATTAGTAAACCTTTGAGCCTTAAATTTAGCAGTGACATTTTCATTTCATGAGTTTGCCATTACTTCCAAAGGAATTGAACTACAAAGCTA AGATGGAGCATTCTATATAATAATTATACTGGCTATACCAAAATCATATCTTTAATGATGATAATAACAACTAACACACTAAGGATACTGAAGGTAGTGC GCCCC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_72376; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_57821
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Far upstream element-binding protein 2 from Gallus with 37.5% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019429868.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |