Ll_transcript_80153

• Id Trinity: FTRINITY_DN58150_c0_g1_i21
• Name Transcript: Ll_transcript_80153
• Sequence: GTTATATAATCCCACACGCACCAACAAATCAAAATGAAGAAGAAACTTCACAATTCACACTCACAATTTGTTTAGAAAATAAGTAGGAATATTATTTGAT TTTATTTAATTAAATACACAAGCGCGTCCAAAGATAGAATTAGTGAATAACCAACACTTACAAGTATTTCCATTTTTATCACTATCTGTATTCCAATCTC AACGAAAATATAAAACAAAGCAACCGTCACAGTCTCGATTCGCGACGAATTATGAGCTCCAGCGGCGGCGAATCAACATCTTCCGACAAGCAAAAGGAGA AGGCTAGGGTGAGCCGCACCTCCTTGATTCTCTGGCACGCGCACCAAAACGACGCCGCTTCGGTGCGTAAGCTATTGCAAGAGGATCCCTCTCTTGTTAA CGCCAGAGATTACGACAACCGTACTCCTCTCCACGTGGCCTCCCTCCACGGCTGGATCGACGTCGCTAACTGCTTAATCGAATTCGGAGCTGACGTCAAC GCTCAAGATCGCTGGAAAAACACTCCTCTGGCTGATGCGGAAGGAGCTAAACGAAATAGTATGATTCAGCTTTTGAAAACACACGGAGGCTCGTCTTATG GTCAAAATGGGAGCCATTTCGAACCTAACACAGTTCCTCCGCCATTGCCGAACAAGTGTGATTGGGAAGTTGACCCGTCTGAGCTTGATTTCTCTAATTC AGCACGTATTGGAAAGGGCTCTTTTGGTGAGATTTTAAAAGCCCATTGGCGTGGAACACCAGTTGCTGTTAAACGCATTCTTCCCTCTCTTTCAGAAGAT AGATTGGTGATTCAGGACTTCAGGCACGAGGTCAATTTGTTAGTGAAGCTTCGACACCCCAACATAGTTCAGTTTCTTGGAGCTGTTACTGACAGAAAGC CACTTATGTTAATTACTGAGTATCTAAGAGGGGGTGATCTTCATCAGTACCTCAAAGATAAAGGTTCACTTAATACCGCATCTGCTATCAACTTTTCCAT GGATATTGCCAGAGGAATGGCCTATCTTCATAATGAACCAAATGTTATAATTCATCGAGACCTGAAGCCAAGGAATGTTCTTTTAGTTAATTCTAGTGCT GACCATTTAAAAGTTGGAGATTTTGGATTGAGTAAGCTTATCAAGGTCCAAAGTTCTCATGATGTATACAGGATGACTGGTGAAACTGGAAGCTGTGAGT ATTCTTACAAGTTCTTTTAAAACAAGATTAGTCATTTGTGTGCAAAACTCATTTTAATTTCCTTGTTCTTGAGGATATAAAAGATCGCTACATGGCTCCT GAAGTTTTCAAGCACCGGAGATATGATAAGAAGGTTGACGTGTTCTCTTTTGCGATGATTCTATATGAGATGCTTGAAGGTGAACCACCTTTTGCAAATT ATGAACCTCTTGATGGAGCCAAACGGGCAGCAGAAGGACACAGGCCTACTATACGTGCAAAGGGATACACCCCTGAACTGATAGAGTAAGTCATTTATGA TGGCTTTTTTAGGCAATTTAATTGCATGTTATTAAGAGAGTTGATTTTTAACATGTGAGTTCCTCTTTGACCAAATAACAGTTATTGTTGTTATCTTCAA GTGGATTTATTCTTTCTCCACACTTCTAGCCCAAAAGGCTTTCACATGACAGGGCATGTGAGATATAGATCATTGTATAGCTTGCACATGATAGTTGAAG CTTTCAAGACACTAGGCCCTTTAGGATACTAAATTAAAATACTAAATGGAAGTTACAAGTTTTCTATTGAACTTATGTGAATTATTTTGTTTAGTTTCAC TTCTAGACTAACTTAAGAAAAGGAAAGTTGATGTCTTAAAAGACATACTACCAGAAGTCCACCTATTTAGCTGTATCTTGTACAAGTACTTATCAAGATG CTTCCAATGGTAAAGATATTCCAGTTGGAGCATGTAGTCCTACTATTAATTACATCCTCAATATTTTAAGTCTGTCCTCCTAATTTGTCTAAATATCTGA CATTAGGATCGATTTCATGTCTGTACCTTATAAAATCATTTGGTTTGATTTAAGCTCTTCAACTGTATATGCTCTGGTGTGTGCTTAATGCTCAGTGATA TCTGGGCCATGCTGTGCCGTTGCTAATATTACTATTGTATATTGCCCCCAAATCACAAAAAGCATCTCACTCTGTCTCTTCTAATTTTACACCGATCCAG CTTGTATAATCTTTTTATGTATTGGCAGTATGCTTTTAATCTCTGATAGTTTGATTCATTATGCCATACTATAAATAACCTGATGGAATGATTAAGGTTA TGATTTACCCTCCTTCGTCATAGTTCAAGAACATCCAAAAGCTATACGGTTACCTTTGGTATTTCCAATTTCACAAACCCCAAGTATGATTTGCATAAAT GTGATATAAACCTTCTGGCCATTTAGTTAGAGGTTCTGAAATGCTTTGCAAATTAGGCTATTAAAAGTTACAGTTAGTAGTTTATTTTGTTTACTTCAAC TATTCAATATATCAGCCACCAGGAGTTGTCTCACCTAATCAAACTTTTGCCTGTGACAATTACACGACTTAGGATTGAATTCAGGGTTTTCCTTTAAGTA AGCAATTTGTAATTTGGGGTTCCACTTAACCTCTTTGATGTTGGTGTTTTGTGCTACTTTTAGAATAAAGAGATCATCACCTCACTCTTAAGCTCTTAAT TCAAAAAATCAGTTTTTGGCTTTTTTTAGTCATAGGTAATATCACGAACTTTGACCTGGTATGTTCTTAGGTTAACAGAGCAGTGTTGGGCTGCCGACAT GAATCAAAGACCTTCCTTCATAGACATCCTTAAACGGCTTGAAAAGATAAAGGAAAATTTACCATCAGATCATCACTGGCACTTGTTCTCTTCGTAAATG CATAAGAGCATTAACATGTCCAGAAATTCAGATGATTTATTTCCTATTACCATTCCGGTGGTTTGCCTTCTCTACTGGTGCTGGATTTATGGATCGAGCC AACTGGAAAACCTGCCAAGTCAAAATTTGTTCAAACTGTTTGGCTTCTAAATTTTTATTAGCAGGACATGCAATGTTGATAGCTTTTCTTTGGTTTCTGC ATTCCATTCCATTCCATTTTATCTCATTAAAGCTCCCATTCCACTTGAGCATACGCAGATTGTTGTGTAAGTGTAATACATTTTAACTGTACAAAGTAAT TGACGAAAATAGGGTATACATCATAACATCCACTGTTTGATGATGCTGCATGTTTTGTTTAAAAATTTAATAAATAGTTTGCATTCTTGGATTTAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_74624;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_80153

FPKM

• FPAB: 17.4
• FPNAB: 3.8
• LF1: 3.6
• LF2: 4
• LF3: 3.7
• LF4: 7.7
• UF1: 3
• UF2: 3.8
• UF3: 6.8
• UF4: 11.4

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_80153

• Blastp: Probable serine/threonine-protein kinase drkD from Dictyostelium with 43.26% of identity
• Blastx: Dual specificity protein kinase splA from Dictyostelium with 39.7% of identity
• Eggnog: leucine Rich Repeat(COG4886)
• Kegg: Link to kegg annotations (DDB_G0281557)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019445929.1)
• Pfam: Ankyrin repeats (3 copies) (PF12796.6)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;