Ll_transcript_120194

Id TrinityFTRINITY_DN58214_c1_g2_i1
Name TranscriptLl_transcript_120194
SequenceATTTTTCCATTTTTCACTTGCTTCCACTGTAATGGGGTTCTTCAAAGTTTATAGCTTTTAGCTTTTCTGCTTGTTTCTCATACACCCTTTTGGGGGAAGG TGAAGATTTTCCATTGGGTGACAAAAGGGTAGAAAAAATGGTTGATTTTCCTGATGAGGTGATAGAGCATGTATTTAACTACATGAATTCACACAGGGAC AGGAACAATTTGTCTCTTGTGTGTAAAAATTGGTATAGATTAGAGAGATTTAGTAGGAAGAGTGTGTTAATTAGGAATTGCTATTCAATTAGTCCTGAGA GAGTGATAGAAAGGTTTCCTAGGCTAAGGTCTTTAACTTTGAAAGGAAAACCTCACCTTGTTGATTTCAATTTTGTCCCTTATGGTTGGGGTGGTTTTGT ATATCCTTGGATTGATGCATTAGTTAATAGTGAGGTTGAATTGGAGGAGTTGAGGTTGAAGAGAATGGTGGTCACTGATGAGAGCTTGAAATTGATTTCA TGTTCTTTTGTGAATTTTGTGTCTCTTGTTCTTGTTAGGTGTGAAGGGTTCACCACTCATGGCCTTGCAGCTATAGCTGCAAATTGTAGGTAAGATTGGG ATTCATAATTGATACAGGGTGAACTCGGCGCAACGTTGCTTGCCTTGTGGCCTAGAGGTCATGAGTTCAAATATTCGCTTGCGAGCCCAGACTCCACTAG GTGGGAGCTCGTGCACTGAGCCGCCCTTTTATTGGGATTGATAATTGATATCATATTGGTGCTATTATGAAACCATCATGTCATCTATGGTGGGGATATT TACACTCCAAATTACCTATGTGAAATCCTTGTTTATTTTTGTTGATGAATCATACTTTTAGTTTTCTTACTTGCAAAATTATGCTTGATCAATAAGAAGG GTGAGTAGACATTTGAGAATGCCAATAGCCGCACTTCTGTCTCATCTATTTTTTTCGGATTGTTGTCTTTTATCTTTTAATTCGCTTTGATTTGCTATAT TGGGTTTTGTTTGTGTGATTAATGGTTCATATGATCTAAAGTTTTGGAAAAGCTAGACATGAAGGAAGCTTGTAGCCATTTTGGTTGTGTTTGTCGAGTT TCAATTTTTTCGGATGATTGTTTCTTGATTATTGCCTTGCAATGTCTGTGCCTCTGTGGTTAGTGTTTGGAAAAAAGGAATCCAATTACTTGAGTTCAGT GTTTGATTAGTTTGACTATTGCTTTCCATCGAATCAGATTAGCAAAACTTGACATGGTTAAAAGCTACCAGTTTCAATTAGATCGAGAATTGCCTGCAAG ATGTTAATCGTGTTTTCTTGATAGTATTTTCTATCCTAAAATGTAGGTTTCTTAAGGACCTGGACCTGCGGGAAAGTAAAGTTGATGATCACATGGGCCA GTGGTTGAGCTTCTTTCCTGATTGCTGTACATCACTTGTCACTCTCAAATTTGCTTGCCTTAAAGGATCGGTTAATTTGGCGGCTCTCGAGAGACTTGTG GCAAGATCTCCTAACCTTAGGAGTTTGAGGTTAAATGGTAACGTGCCCCTTGACGCACTCAAAAAGATACTGATGCAAGCACCTCAGCTAGTGGACTTGG GTACCGGTTCATTTGTCCATGATCCTTATTCCCAGGCTTTCGCCGGGCTAAGGAATATCATTTCAAAGTGCAAGTCAATAACCAAAATATCAGGATTCTT CAATGTTCTTCCTTACTGCCTATCAGCAATATATCCTATCTGCATGAACTTAACATGCTTGAACCTTTGCCACGCCGCCAGGATTCCTAGCAACAGTCTA ATAAAACTAATAAGCCGATGTGCGAAACTTCATCGTTTGTGGATAATGGATTGGATCGGAGACAAAGGACTAGAAGCTGTAGCTTCGACATGTAAAGATT TGCAAGAGTTAAGGGTTTATGCCTCTTTCCATGTTATTGAAAATGATCTTGCAGGAGTCTCAGAAGAAGGACTCGTTGCAATATCCATAGGTTGCCGTAA GCTTCACTCGTTGCTCTACACCTGCAGGCAGATGACAAATGCTGTCCTCATAACCGTCGCAAAGAACTGCCCAAATTTTATCTGCTTTAGGTTGCGTATC CTTAATCCTAAAAAACCCGATCCTACAACGATGCAGCCATTCGATGAAGGTTTCGGGGCGATTGTGCAGTCTTGCAGGAAACTCAAGCGTCTGACACTCT CCGGCCAGTTGACTGATCAGGTTTTCCTTTACATTGGAATGTACTGTGAGCAGCTTGAAACATTGTCTGTTGCATTTGCTGGAGAAAGTAGCGATGGAAT GATGTACGTGTTGAATGGATGTCAGAAACTTCGCAAACTCGACATAAGAAATAGCCCTTTCGGTAACTCGGCACTTTTGATGGACATGGAGAGGTATGAA ACAATGCAATCCCTTTGGATGTCATCCTGCAATGTCAGCATTGGAGCCTGCAAGATACTAGCTAAGAAGATGCCTAGTCTAAATGTCGAGATCATTAATG GAAATCAACAACCAGTTCGTAGCGCAGATGATGAACAGAGAGTAAATAAGATGTACTTGTATCGAACATTGGTCGGGAAGAGGAAAGATGCACCAGAGTT TGTAATGACCCTCTAGGTCTACGTTAGCCTATTTAAAGTCCTGTTATCGAGCAGTTTGTACTTGATTTTAGGCTTAACTGATTGAGATCGGATTTAAGTC GGGTTTAGTGGTCTGTTAATTTCCTCCCATTTTCTTGTTCATGCATAATGGTTTGATTGTTGTTTCAACTTTCAAGTTTATTGCAACAATTCTAAATTAC ACGAAATAAATTTTAACTTTAAAGGCTATTAA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_75131; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_120194

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_120194

BlastpProtein AUXIN SIGNALING F-BOX 3 from Arabidopsis with 63.41% of identity
BlastxProtein AUXIN SIGNALING F-BOX 3 from Arabidopsis with 63.29% of identity
EggnogF-box and leucine-rich repeat protein(ENOG410XQ54)
KeggLink to kegg annotations (AT1G12820)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019453250.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;