| Id Trinity | FTRINITY_DN58387_c0_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_211091 |
| Sequence | ATAATCTCTATCTTCTCCCTTCACCCAAGATTGCAAAGAAAGAGAATGTTCTTTACCCTCTTATCAATTTCTCTCTCTGGCTTTTTCGATTGAAAGAGGC TATTTTTACGCAGTTCGGTTCTTGATCTATTCGCTAAATAGTTCATTATGACCATGAAGACTTTACCCGTGGGAGGAACATCTAGATATAAAAAGCTTGT TTTTGGTTCATTTCGTAGCAAAGATTTGTTAATGTGGATAAAAGATGTTGCTTTGGAACCTGGCAATAAGAAAGCTTCCCACCGTAGACTCTCGATTCAA ATGCTTGAAGTCCGCAAACTTATGAATACTCATGATGATAAAAGTCTCAAGGTATGATATCTTAAAGGGATCAATTCTTTAAAGCTTTTATTATAAGGTA AAGATTCTTGAATACTTTTATATCTTTGAGATGTTGTCTCATTCATAAGGTAGTTAGAAACATAAGCAATGTGGTTGTTGGTTTTAATTTTGTTAAAATT TGATTAATTAAGAAGAATGAATAATCAAAGAACCATTTTCTTAATAAAAAATTCCTTAAAGGTGACATACAAGTGGGATTAAGAATCCATTTGATACTAA GTAGTCAATAACAATGGGATCATGTGTTTTTTCGGATTGCATCTAACCAAAATGCATCATTGGGATGGAATTCTTGATAGCATCTTAGCTCACCATCTCA TTAGGATCTTGTGTGATCATCTTTCATGTCCTTCAATCGAAAAACTACCCTCACCAATCTAAGTTTTCAACTTGTATAACATTCTTTCAAGTCCTCCTTG TCTCATCCCATTTTAGCTATGACATCATCTTAAAATCATTCAAAACTACCATGGCTATCTCCATCTCAATTATGTTGTTATTGGATTTGGGTTTTATGTC ATTGATTTTTGAGCTCTATCGAATTTTAGTTGTGTATAAGATATATTTTGTATTTTTTATATTTGAGCTTTTTTTGTATCTCAAGACTTGATATCCCATT TTTGGGGGGGCAATCACTCCACTTCATTATTTGGGACGAAGGCATTATTGAAATATGTAAACCATAATTTTCTAGTTGTAAAACTGGGTTGTTTAAAACA TGTTTGGTTTCAAAACATTGGTTGAAGAACTAACAAGTCTTCATTTATTTTTTTTTGTTAAAACTCAATTTAGCAAATGCTAATCACAATACACATTGAT TAGTTTTATCTTATGTATTAACTAAACTAATTTTTCTTTTTTTAGAAGAAAAGGAAACTTGAGCATTACATGGACGAAGGTAAATCTACTTGTACTTTTG AACTTTTCAACAAGGAGAAATACAATAACAAAGTTGCTAAAAATCATAAAAAAGGTGAGTCCTCTTCCCTCTCATGCTTAGGGAAGTCCAATGAAAAATG TAGTTTTCAAGGATGGCAAGGACATGTTGCTTTCCTTGTTTCAAATGACATAGTAGAACATTGCAATAGTTGTTGGCAAGATTGTTCTCACTCTAATGAG TCTTCACAAGAAATAAAAGGTAAAGTTTTTCATGCTACAGAGGATGATGAAGATTGTACATTATGTTGCGAAGATTATTCTCAACTAAGTGACTTTGATG AGTCTATACCAAGCCCTATCAAACAAGGCAACTTGAAAGGCCACTTTGAACCTTTTGAGGATAGGAGTAGTGATACGACTATGATATCAATTAAGGAGAA ACAAAATGTAGAATTGTCTGAAGAATTGAAATCATTGATCAATAAAGATTTTGATGACGCCAGTAGTAGGAACTCGTGTTCATTAAGGTTGGGTAAGGGG TATTTGAAAATTGGCCACCAACTCCCTTTTTGTGGTAATCAATGCCCACAACTAGTTATTCCTGTTGGACCTAGGTTCCAAGCTGAAATTCCACAGCTTG AAAACCTAACCAACATAAGGCAACATCATTCTAATGATAATTTAAAATGGGTTTGCAATGAAGTTTGGCCAATGCCTACTATTGTGGAAACTGATACAAA AGGTGTAGGGAATGGTAGGCCTGAGGCATGCTCATGTGACTTTCCCGGATCAATCGATTGTGTTCAACTACACATAAGTGAAGCAAGAGAACGCTTAAAA TTAGAGATTGGTACAACTTTCTTTAGTTGGAAGTTTGATGAGATGGGGGAAGATGTTTCAAAGTCATGGACAATGGAAGAACAAAAAAAGTTCGAATCTT TGAAACAAACTTCACTATCAAATGATATGGATTTTTGGAAGGTTGCAATGGAGAACTTTCCAACCAAATCTATGAAGAGTATGATAAATTACTATTATAA TGTATGCATCCCTAGACGACTGAGCCGAGAGACAAGAGCTTCCTTTGTTCCAATTGATAGTGATGATGATAAACTTATGGATGAAGATGATTATTCAACT ACAACGATGCAAATAGTTCCTATTTGCAAATTGCGTAAATCAAGGAAGACAAACTCCCTCTTTAACTACTTCTAAGAAGTAAGAAACATTGGTTAGTTGT GTATGATATTCAAGTTAGGAGAATTATAAAATCTCTCTTGTTTTTTAAGGAATTTCACCTTAATTAAACTCTTTTAAACTTAATGATACATTTTCTTTGA CATGGAGGATGAAAGAGGAGACTATCTTGCTCATCCACCTTCATCTTTTGTTTTTTTCTATTCAATATTTATCATTATTAAGGATTCTAGACATGTTTTT GAAAAATCGCACCTCCTTCGGGTAAGATGTTACTTGATGGTGATAATATTTTTAGCATTGCGTGGGTTATTCTATGATCTATTATATTTGTTGAGTATTA ATTATTACGATTCACATTTTTTATGTTTGATTACTATTCAAATGATTTGTTGACTTATTTTTATATTTGGAAAATGTGGAATATGAAGTTTGCTTCTTGC AATTGATGTCATTGAATTTCATGACTTTGCTTTCTTAAATTGGCCTAAGGAACTATATTTGTTAATTAGTTTTATGGTAAGATTTGTTCAATGGAATTTA GATCATAACCAGGCTTAGGAATTTGATCCTCAAGGAAGTTTGCATTATGATAATAATAATGTTTATGTTGATTTCAAGGATATGTAACCTATGAAGTACC TAAAATCATATCTTCTAACACTTTTATTTCTTAGGGTTATTTCATGCCATATCATTTTTTAGTCAACTATAAGATGTAATAGGGATTATTTGAATCAACA TCATCTTCTTTTACACAAATCCTCTAAGGATACCAATTTTTGTTGGTCTTGTGGTATAAGATGTCGATCGGTCTTATGTATCCTACAAGGTCAAAGGTGT AAGTTTGATCCTTGATATGGACATTTGCTAGCATGTGAAGTATACATTCTTAAAGGGGTTATTTTATTACTCATAGGATGAATGATATTCTTGTTTAACA CAATGCCATTTTTGATGGCCTAGATAAATAAGATATTTAGTAGGATAAACGTGGGATATGATATGAACATGATAAGTTTTTATTGTATTTATTGTTTTGG CACACACCATATATTAACAATATTATATAAATTATATGCAAACGATAAGATTAGCCTTATAGCAAAATTACATATGACTTGTAATTTTATATTTTTGCCT TAGTGTTAATGGTGAGGGTGGAAGTGATGATGGTGGAGTTGTGGAGGCTATGGTAGTGACAATAAGGAAATAATGGGATGATGCAATAATAGTTTAATGG CGATGATAGTAATATTGGGATGAGGTTATGATGTGGAGGCAATAATCTATGGTATCATATTAGAGGTGACAATGGCAATGGTGTAGGCTAGGGTGATGAT TATATTAATATAGCGGTGACTATGATAATGATGGTATTTATGATGGTAGCATTATTGGTGGGGGTGATGGTTTAAATATTGATTTCAAAATTACAAAGTT TAAATATGTTTAATTAAATAAAATTTATATTTCACAAGTAACATCTATATGATTATACATTTTGAAATGGTCTTGTCATGTTGAATACTTCTCATTAAAT GTAAGTTATAGAGAGTCATTTACACATGTTTTTTTCATATGTTTATGCAATCTATTTTTCACAATTTTTATAGTTGAAAAAAATCATTTCTATAGTTGTA GTGCTAATTTTAAAAGAAGATTAATTAATAGATAAACAATGTGTCTTTGACTTTCAATTAACTCATCATGAAGATTATTTATTCATTTCAAAGAAGTAAA TTTAACACTGTTATGCATATCAATGATATATGTTTTAAGTTGATTATCAAACATCCTCAAATCAGTTGAACAAAAAAATCAAGTGGATAAAACTTTGCAA ATTAAATTAATTGTCATATCAAAACTAGACTCATACAAGACATAAAGAAATAGTCGAGTATTTGTCTCGGATATCTATGATCATGAAGTTCCTTGAGTTG CATATTCATAATATTATAAAACAGTTCAACATAATAATGATTATTTGTTTTTTCACAAGGCATGTCATGTTATTTTTAAAAAAATAAATTTTGGACATGT ACAATTATAAATGAGAGTGTAATATCTATTTATTGTTTAAATATTTAAAGTCACTATATAATTTTCCATTCAAAATAATAGATATTTTTTTTTTCAAAAA ATTCCAAGGGCACACCCTCCAAACTACATAAGAGTGAGGATGATGGTGATGGCATTAGTGGCGGCGAGAATGATGGTGATGGCATTAGTGGCGGCGAGAA TGATGGTGATGGCATTAGTGGC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_76639; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_211091
| Blastp | AT-rich interactive domain-containing protein 2 from Arabidopsis with 35.91% of identity |
|---|---|
| Blastx | AT-rich interactive domain-containing protein 2 from Arabidopsis with 34.88% of identity |
| Eggnog | NA(ENOG410YHCT) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT4G11400) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019431281.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |