Ll_transcript_6867

• Id Trinity: FTRINITY_DN58536_c0_g1_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_6867
• Sequence: ACATATCATAGTATTTTTTTATATATAATAAATATTAGACATGTGGGTTAATTCTCACTAAGAAAACCAACCTTATTTTTTGTGGTTTAAGTGTCTTCTC CTTAAAGTTTCCAAGTTTCAAAGCTTTCTTGTGTTATGATGGTAAACTAAAATGCATATTTAGAATCAACAAAAGTATTGGTATGCTCATAGCATAGGTT TTATTCACATGGTTAAGAGGGTACCAAAGTTTGGATTTGAAATTGTAAATAACATGGATTGTTTTTGTTGAGCGCTGAATTCTAGTTCTTGGGGTTTTTA TTCCTGAATAAGCGCTCTTAGAATCTTTGGACTAGTGGGTTTTTCTTCTTAATCCAATTTTATTGATGTTTGCTTTTTGTTGTTCTTCAGTTTGGTTCTT CTAAAATGGGTTTGAACTTACTGGGGGCTTTGTGATTTCTCCTATGCTGAGATGGTATTATTAGATGAAGAACTATAGCTGAAAATTGCAAAATTTCTGA GCTTTTTTTCTCAAAGTGACGGCCCTCTTGTCAGCATGGTTAAGGGCAGAACATTATTGCTCTTGGTTTTTGGCTTGTGGATTTCAACTGTGAATTCTGC TGTGTCTTCAAGACCGAAGGTTGTGAAAATTGGAGCCCTTCTTACTTATAATTCTGTCATTGGAAGATCGGCTAAACCAGCAATTGTGGCCGCCGTTGAG GATGTTAATTCTAATAGGAATGTTCTCCCTGGCATTGATCTTCAAGTTATTTTACATGATACAAATTGCAGTGGTTTCCTAGGCACAGTGGAAGCTCTGC AGTTGATGAAGAATGAAGTGGTTGCTGCTGTTGGTCCACAATCTTCAGGAATAGCTCATGTCGTGTCACATGTGGCTAATGAACTACATGTACCTCTTCT ATCATTTGGGGCAACTGACCCAACTCTATCTGCTCTACAATACCCGTATTTCATCAGGACTACCCAGAGTGACTATTACCAGATGCATGCAATTGCAGAT TTTATTGAGTATCACGGGTGGAGGGAGGTCATTGCCATATTTGTAGACGATGATAATGGAAGAAATGGAGTTACTGCATTAGGTGATGCACTGTCAAAGA AACGCAGCAGGATCTCTTACAAGGCTGCATTCCCTCCTGAAGCCTCGCAAAGTTATATCAGTGACTTGTTAAATGAAGTAAACTTAATGGAATCAAGGGT CTATGTTCTACATGTTAATCCTGATTCTGGTTTGACAATCTTTTCCATTGCGAAGAAGCTACGAATGATGAGCACCGGCTATGTTTGGATTGCAACAGAT TGGCTTCCTTCAATGCTGGATTCATTAGTTCGAGCTGATACAGGCACAATGAATATTTTACAGGGGGTTGTGGCTTTCCGTCATCACATTCCTGATACTG ATCTCAAGAAGAGTTTTATCACTAGGCTGAAAAACCTTAAAGACAACAACACTGAAAGCTTCAATTCTTATGCATTTTATGCATATGATTCTGTATGGTT AGCAGCTCATGCCCTTGATGTTTTTCTCAACGAAGGTGGGAATATATCTTTCTCTAGTGACCCCAGGTTGCGTGACACGAAAGGAAGTGTGCTGAATTTA GCAGCTCTTCGCACTTTTGATGGGGGTGATCAGTTTCTCCAGACAATTTTGCGAATGAACTTTACTGGTTTGAGTGGTAAAATTGAGTTTGACCATGATA AGAATTTAATTTACCCAGCATATGATATTCTAAATATTGGTGGAACTGGATCACGTAGTATAGGTTATTGGTCTAATCACTCTGGACTGTCAGTATTAGT TCCTGAAACTTTACACATGAAAAAATCATTCAACACTTCAACAAGCAATCAAAAGCTTTACAGTGTGATATGGCCTGGAGGTGCTACAACTACACCTAAG GGATGGGTATTCCCTAACAATGGTAAGCCACTGCGAATAGCAGTGCCAAACCGAGTAAGTTATAAGGAGTTTGTTGCTAAAGACAAGAACCCTCCAGGGG TACAAGGCTTTTGCATCGATGTCTTTGAAGCAGCCTTAAAGCTGTTGCCTTATCCTGTCCCCCGACAATATATGCTATATGGAAATGGCGATAGGAATCC TAACTATAACAACCTTGTGGATCAGGTTGCACAAAATGTGAGTTTCTAACTCATATGTCAGCATTCACTATGTATAACCTAACCAGAAGTCCAGAACTGC AAGTAGCTATAATATGGATTTCAATTGTGGATATTTTGTAAATGTAGTACCTATTTATTGACATTTAATAGAGCATCTGATTTCTATAGGTGATTGAAGA ACACTTAGAAATCTGCTATTCTGTTAAAATTTGGTACGTATGTTAATTTGCTCCTTTCCTTGTTTAGAACTATGATGCAGCCGTTGGAGATGTTACAATT GTGACAAACAGGACAAGGTTTGTGGATTTTACTCAACCTTTCATGGGATCAGGGCTTGTTATTGTTGTTCCTGCCAAAAAGGGTAAGTCAAGCCCTTGGG CTTTCCTTAAGCCATTCACTGCTCAAATGTGGTGTATCACTGGTGCTTTCTCTCTTTTTGTGGGATCTGTTGTGTGGATTCTTGAGCACCGATTCAACGA AGAGTTCCGTGGTTCACCAAGAACACAACTTATAACAGTCTTTTGGTTTAGTCTCTCAACAATGATTTTCTCACACAGGGAGAACACCGTGAGTACTCTT GGAAGATTAGTGCTGATCATGTGGCTTTTTGTGGTGTTAATTATCAATTCAAGCTACACAGCTAGCTTGACATCCATTCTCACAGTGCAGCAACTATCAT CACAAATTGAAGGAATAGACAGCTTGATCTCAAGTACTCAACCTATTGGAATTCAAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_77888;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_6867

FPKM

• FPAB: 2.1
• FPNAB: 2.3
• LF1: 2.1
• LF2: 2.1
• LF3: 1.7
• LF4: 1.4
• UF1: 1.7
• UF2: 2.1
• UF3: 1.6
• UF4: 1.5

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_6867

• Blastp: Glutamate receptor 3.4 from Arabidopsis with 64.83% of identity
• Blastx: Glutamate receptor 3.4 from Arabidopsis with 61.33% of identity
• Eggnog: PBPe(ENOG410ZZ8P)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G05200)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019453772.1)
• Pfam: Periplasmic binding protein (PF13458.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;