| Id Trinity | FTRINITY_DN58788_c0_g1_i7 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_33222 |
| Sequence | TGGAAATATTACAATCACTCCAAAATTCCATCTTTTAGTACTTATTTACATTTAAATCCAAATTCATTGTTCCTACCCAAACACAAATTTTCTGTTTCAT TACATTTGAAATTAAATTAAGAAAAAAAAATATTAGGGTTTTCAGAATAATTTTCAATTCCCGAATTTTACCAGATCTGATTCATCTGGATTCCAATTCC TCAACTCAATCGCATTCCACGTCAATCATTATCATTATCCCCCTAACAATTTGAACTTTCCATTTCATCTCTGACCCTTCAAAAGTGAGAGAAAGAGAGG GAAAAACAAAAACCCATTATCAAAATGTTTCGTTTGGAGCAGGAAAAGATCCGAAAACGATTTTGATTTCAAAAGTTCTCTCCTTTTCCTCTATCAAGTG GTGGGTTTTTCCATGGCTGACGCTCTCACGGTGATTCCGGCAGCCGTACTCCGCAACCTTTCTGATAAGCTTTATGAGAAGCGAAAGAATGCTGCTCTTG ATGTTTTTCCTTAACCCCTTTTCGTTTCTCGTGATTTTTGATTTTATATTTTGGTCAATTTGGGGTTTTAGGGTTTTGGGCGTGTTTTTTGTGTATAGGT TGAAGGGATAGTGAAGCAGCTTGCTAGTAATGGGGAACATCATAAAATAACTGCTGTTATCAATTTGTTGACCAATGAATTCACTTATTCATCACAAGTA AATCAGAGGAAGGGAGGATTGATAGGATTAGCTGCAGTAACTGTTGGTTTGACTTCTGAAGCAGCTCAGCATCTTGAGCAAATTGTGCCTCCTGTTTTAA ATTCTTTCTCCGACCAAGATAGCAAAGTTCGTTATCATGCGTGCGAAGCACTATATAACATAGCTAAGGTTGTGAGAGGGGACTTTATTATATTCTTCAA CCAGATCTTTAATGCCTTGTGCAAGCTTTCTGCAGACTCAGACGGCGAAGTACAAAGTGCTGCTCACCTCTTAGATCGGCTTGTGAAGGATATTGTGACT GAAAGTGATCAGTTCAGTATTGAAGAATTTATACCACTGTTAAGGGAGCGCATGAATGTATTAAATCCATTTGTCCGCCAGTTTTTGGTTGGATGGATAA CGGTATTGGACAGTGTCCCAGATATTGATATGCTGGGCTTTCTTCCTGATTTTCTTGATGGTTTGTTTAATATGTTAAGTGATTCTAGTCATGAAATACG TCAACAAGCTGATTCAGCTCTTTCAGAGTTTCTTCAAGAGATCAAGAACTCACCGTCTGTAGATTATGGTCGAATGGCTGAAATATTGGTACAGAGGGCA GGTGCTCCAGATGAATTTACTAGGTTAACAGCAATCACATGGATAAATGAGTTTGTCAAACTCAGTGGAGACCAGCTTGTTCCATATTACGCGGTCATTC TTGCAGCCATTTTGCCTTGCATATCAGATAAAGAAGAGAAAATTAGAGTGGTTGCTCGTGATACCAATGAAGAGCTACTTGCCATCAAGGCTGATCTGGC TGAAGCGTTTGATGTAGAAGCAGTCCTCTCAATTGCTAGGAGGTGTAGTTTTTCTGACCTGGGAAAAGTGGCTAGGCAAATATCTAGTGAATGGGAGGCT ACTCGAATTGAAGCTTTGCACTGGATATCAACCCTTTTAAACAGATACCGTACCGAGGTGACTGGGTTGTTTGAGTTTAGGCTGTTGTAAATCTGTAGAG TTCTTCTTTCTTAAGATGCCCATTGAAGTTCCGCTTCTATGTCATTTCAGCTCAACTTCATGACCCATTTTTTGTTTATATTTATTTATGTGGAAACCAG CTATTTTTGATATACTATATCATAATAGGTTTTTGATTTCACTGTATAGGAGCTTTAGTTCCATTGGTGGTTGATGGTTGGTAATTCTCTGTAACAAACT TACAATGCTATTCATTTTTATGTGTGCCTTCCCAGTAGGCAGCATAGTTTCGTTGAAGTTTTTCTAGAAATTATAAATTTCATATAATGATTATTTGACC TGGTTTAATTCTATGACGTCACTTAATAATTATGATGTTTTCAGGTCTAACAAATAATATATAATTTACCTGCGAAACTTTCATTTTGCAAACGTTTTTC TATTAAAGCCAACCCCAGTTTATACTATTTCTGTTCACCTGACGTGTTAAGGTTTTTGTGTGATATACTTTATCCAATGAGAAATTTTGGTATCCCATGC TCTATGTTGACTTTCAATGTCTGAAACAGGTTTTGCAATTTCTGGATGACATATTTGACACCCTAGTTAAGGCACTTTCAGATCCATCTGATGCGGTTGT GCTTCTAGTTCTCGATGTTCATGCATGCATTGCAAAAGATCCTCAGCACTTTCGGCAGCTTGTTGTTTTCCTGGTACACAATTTCCGAGTTGACAATTCC CTTTTGGAGAAGCGCGGTGCTTTGATAATTCGTCGGCTTTGTGTGCTTTTGAATGCTGAGAGAGTTTACCGTGAACTTTCAACAATACTTGAAGGGGAAT CTGATTTGGATTTTGCATCACTTATGGTTCAGGTTGGTTGGTACTTGGTACTTTTCCAAGAGCTTAAATAAAAAGCTGCATTACACTCTAGGTCTATCTC CCACTGAACCCAAAAAACAAATATTTTAATGGAACAGCTACTGAAGCATGTGCCATCTAGTTAATATTATTTATCTGCATGTATCTATGGTCAGGTTATG GTCTACGTCTAATGTTTTTTCCCATTGTTAGCTAATTTATTTTGTGCTTAAACACGAGAAGCCCTATAAGAACTTCATTGTTAGATAATAGACCTACTTC CTCGTTGTCTGTGTTGTACACTAATGAAATTGATATTGATTCATTGCCTAATCCTGCAGGTTGTTTCTTTGACAATATTAAGTGCAATCACTATTTTCGT AAATCATAAATGTTGTCTTGTTGTAGGCTTCACTCAATTATGATCTACTTAACTTCAGCTATAAAAAGAATATTATAGAAATATATGTTAAATTCAGAGC CTATGTTTTGCTTGACCACATTGCAAACAGTTCTATGCCTATAGTTGTGGTCCTCAGTTCCTTCGCGTTATTTTCAAAACATGTACAGTTGTCTTTTTGT TTATCGCTGTATTTAGTTTTCCTTTTTTATGAGCCTGACCTTTACAATCCATTGTGGTGGAGTGGTATTCATCTGCATTTGTTTTTCTTTCTCCCATATA AAAAATTTCCAGGCTTTGAATTTGATCTTGCTTACATCACCGGAGCTCTCTGAAATTCGAGAACTTTTGAAGCAATCGTTGGTAAATACCGCGGGAAAGG ATTTGTATGTTTCATTGTATGCCTCATGGTGCCATTCTCCAATGGCAGTTTTAAGTCTTTGCTTATTAGCTCAGACCTACCAGCATGCGAGTGCCGTGAT TCAATCTCTGGGAGAGGAGGATATGAACACCAAATTTTTAGTCCAGCTGGATAAATTGATTCGCTTGCTGGAAACTCCAACCTTCACATGTCTTAGATTG CAGCTTCTCGAACCTGGAAGATATATATGGTTGTTCAAAACATTGTACGGTCTACTAATGTTGCTTCCTCAGCAAAGCGCCGCCTTTAAGATACTAAAAA CCCGTCTAAAAGCTGTGCCGTCATATTCTTTTGATGGCGAGCAATCGAAGAGAACACCCTCAAGGAGTCCCTACCTATTTCTCCATCACACTGAGGATGG TGACATAACTACAGATGGTGGATATTCACATAATGGTATAAATTTTGCTGCAAGACTACAACAGTTTAAGCAAATGCAGCACCAGCATCGTGTGCATTGG AAAACACAGGCACGATCATGCAAAATGTCCACCTCATTACCAAAGGAGGCACAAAAACAAGAAGAACCAATTTTGCCACAATTGAGTGATGCTGCAACTT CAAGATCATCAAAGAGAGGCCCAGGGTAACTGCAGTGATGCTTTTTGCCCATATATTAGTCCTATTGTGCAATGTGAACTTTGAATAGGATGCTGTATTG ATTTGTATAATTGTAAATCATAGTAGTTCTTTTTATTGTACTCATAATAGAAGGTTGGGATGGTGAAATTTGGATTTGGAATTAAAGATAAAAGCTTGGT CCTTGAGCTATTCTTTTGACCATGTAAACTAATTCCAATGTGATCTCAGAACTTCTGCATCCCTTTCTTCTTTAATCCTTCATGTGTTTTTTTATGTTGA GATTTTTTGTAGTCCTATTTATAGAATTTTTTTGAAGTTTTAC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_80118; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_33222
| Blastp | Protein VAC14 homolog from Arabidopsis with 82.27% of identity |
|---|---|
| Blastx | Protein VAC14 homolog from Arabidopsis with 75.48% of identity |
| Eggnog | vac14 homolog (S. cerevisiae)(ENOG410XP6E) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT2G01690) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019432671.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |