Ll_transcript_255845

Id TrinityFTRINITY_DN59128_c2_g1_i4
Name TranscriptLl_transcript_255845
SequenceATGATCTTGGCATGTATGAAATAATGCAATTAAGCAACGACATCGTTTAGTTCCCCAGATGCATAGATTCGTCTCCTACTTACTACTCCTTTCTCTCTCT TAACACTGGCAAAGGGCTTCTCTCACACTCAAGAGAAGTTTCATAAAAAAGAAATAAATCCAAAACAATCACAGAAAGGGGGCATTCCAGTAATTTCACA CTCTCGATGTTCACCTCCACACACTTGAACAACAACAACAACGACACCCCTTTCCTCTCCGGCGGTGGCGGCCTCCGCGCCACCTTCTCCTCCTTGATGG CCGACGCGGCCATCCGATCCTCTCCGGTCGTCATATTCACGGCAGTCGCTGGACTCGCTCTCGTCGCCGTCATCTTCTACGGTACCAGTAGGTAAAAAAC CAGAACTAACGTTCAAATGCTATACAAAAACCCTAGCTTCTGTTTTCGATTTTGATTTTGTTCAACTAAAAAGGAAAAATAACTGTAAATTATATAGAAG GAAAATTTTCATAGATGAATCCCCTTAGCCTTAGGCGAAGTCATAATCCCTCTTCAATTTCCTCTCATTCGTCATCGTCTTGGATTCATCTGCCTTCGAT TATATTCGTTGTTACTTTTTCCTCACCAGCTTCTTCTTCACCCTCTTCTTCTGATCGATCTTGCTGTCAGTGTCAGCTTGTGTGTTTTGCGTTATTGTGG TTCACAGTATCTGTTTTCGGTCTCTTCAAAGTTTCCGATCGTGTGGTTCGCTGCTAGAATCGTCCATTTTGGTTGGACCACAATGCTCAAAAAGAAAAAA AAAGAAGCAAATTTGGTTTGTCTGTGAAAGGAGAAGAGGGTTGAGGAGAGATAGATCTTTTGGTTTTCCTGAGAGGGAGATACATACACTTCTTCAGTCT GAACTTCCTTTCCTATCATTCCCTTTTCTCATGTCAAATCAATTGCACTGAAGAAATCATCTTTGTTTGGAGAAAATGCAACTTAATTGTTATCTGCATT GAATATATCTACATACCTGCTTTAGCATTATATATATTCTTTGTATTGTGTCTTCTTAAGATGGAAAGGGGGATCTATGCTAGAGTATATTTAGTGAGAA TGTTCATTTGGAGGCTGGATAAATTTTTTTCTCGACCAAAATATACTTTCGCTGTCTAAAAGATTCAAGAGAATATATTCTAGTCATTGGTCTACGAAGG GGATATTGGTGAAACGGTTAAAGTCCTTCTCAAGCCAAGGAAATCATGGGTTTGAGTTGTGGAATCAGCCCTTTCCTGGACCCTGCACATGTTGGGACTT TTGTTGCACCAAATTGCCCTATTTAGTTGCAATCTGTCAATCTACCTGCCGTGTCAAGGATCATAGTTAGGGGCTTTAAATAATCTGGATTTTTCTCCAG ATATGTGTGTGAGAGCTGGTTTATGACAAAACATAATGCTCTTGTTTAATTAATGTAGCTGACCACACATAGTGGAAAAGCCAAAAAGGCTTTGTTGTCG CTGTTGTTGATGATATCTTCAAGCCTTCAAGCTCAAGGACAATCATTTATAATTTATACCTCTTCCATTTTAAAACAAATATAATTAAATCTTGTGTTCT TGTCCCCATAAATTTTATGCTTGTCATTGTTCTAGTCCCTATAAATTTTATACTTGTGATTGTTCTAGTCCTTCCTCGTCCTCATAATAATAATAAATAT ATGAGAGGGGACTCATTTACTCCAAGAGTAAGTTTGAAAAACCTACTCCACATCTTAGCCATCCATTCTAGGGAAACTGAATGGTTCAGATCCACTACTA ATTCAAATCATTGGATTTCCCTAGAATGAATGACTAAGATATGAGTAAGTTCTTTTTAACTTACTCATAGAGTAAGTGGATCCCCTCCCTAAATAAATTA CAGAAGTTAAAAATTCAATTGATCATAGGTGATTCTGTAATACTTTGGTTGGGATTTGTTATCAGCTGTTTTGATTTTCTAAGGCTTTGTTGAATAACTT TACCAGTAAACAGAGACCCCATTGATGAAATAAGTAGTAGAGCGGTGCTTCTCAACTTGATGTAGTTAGTTTTCATATGTAGATAGAATTAGGTTGTACG AAGTGGATTTATGTGTTTTAGCAATTAGCACAAATGAAATAAGATAGTTAAACATAAACCATTTAACTCCAAAATCTATGAACACTAACAAAAAAATGTA TCAAATGTGACAAAACAATAACCTAATAAACATAGATTTGTTATTGTAAGAACTAAAATATTGTATATGCTTGAAAAAGTTGATTGATCTAGTATAATAG AGCGCTGTGATGTGCTTTTAATCTTGAAGAAGATCAATTTCTATGTACTTTTTTACTCCCCTAAATTTCTTAAATGATTCTTTGCTACTTATTCTCTATT CCAAAACTCATATCCAGGTAGTTGTAATGAGTAATTCTTTTGGGCAAAATTCCAGGGGCCGTCTTAAATCACCATGGTCACGTAGGAAAAGAAAACGTGT CCTTTCATGTCCCCAATGGAAAAGCTTGTTTACAGAAGATGGGAGACTCTGTGATGGTGGAATTAAGTTCCTGAAAAGAGTTCGCAGTGGAGTGAGTTTA CCAGTCTTTTTATCTAGATTTTAAATTTGTATTTCTTTGTTGAATTAATGACACTATATTTGATGCAGGGTGTTGATCCTAGTATTAGGGCTGAAGTTTG GCCTTTCCTACTTGGAGTGTAAGCATGCCATATTTCTTGTTTCATTTCTGATTGAACTTTACTATTTAATTTTTTTGCTAGCATACTTAGGATCTAGGAA GTACGGACAATCATGAGATATAATTACACATGGAGCAAAATCTGTTACCATTTATATTCATGAAATGGCATTGATATCTCTTGTTGTAGGATTTAATTTC ACTTGACACCCTCTTATTTCAGAGGTTATACTCACCTCCCTTCAATTATCGTTGCACTTAAATTATTAGCTTTTAAAATATGAGGGTACCAAGTGTAATC AGGGGAGGTTAGTGTAATTTACCCTTAATATTAATATTTGAAGTGTCAAGCATTGTAATGCTGTCTTGCTCTTTTGAAATTCAAAGTGTCTGTGCTTCAT AGCTTGGTTGGAATGAATACTGATTATCTTTCAGCTTGTAATAGCTGAAACTTGGTTATTTGCTTTAGGGCAAATATTGATTATGGGAATGGATCCTCTC GGTTGTTTTTTCTAGTCAAGTGGTCAGGTAGAGGAGAGAGATAAACACAGGTTATAAAAGAAATTTCACATATCATGCCTGAGCCCACTAAATAAATCTT TTTGTGCCAAGAAAAAAACAATTGGCTGGGTCCATTTTAATGGGTCACCTTCTCTTTTATTTTGTGTGTGATTTGTTACTTTCGGTTCATTTCTGCATGT ATCCTTTTGTATAGGTTAACTTTTGTATGGTTATTGATTACACATTCACTTACGCAGCTATGACTTGGACAGTACCAAAGCAGAACGAGATGTTATAAAA ACTCAAAATAGAAAGGAATATGAGAAACTCCGCAGACAGTGTCGAAAGCAGCTAAAGCAGAGCAATGGAAGCTTCAAGTTAAATGAAAGTGGTGAAGTTA GCTATGAAAGAGATGGTGCAAGTCTTGTTCAAGATTCAGGTTCTGAAGATGCAATGAGTGCCAGGGAATCCCTTTCTAGTGAGGAAAGGAGCCCAGATAC TGAGTATTCGGATGATCCATCTAGTGCCCTGCTGGAAGTTAGCAATTCTGATACCTTCGCAGTGGATACTGATTCCTCTGATTCAGACTCCTCAGAAGGT CTGGAGGTGATTCAGGCATTTCCTTCTGATGTTGTCCAGGAAGAGAACAATTCCAAGGGAGATTCTTCTCCCTCCCAAAGGGAAGTCCCATCAAAACTAC GAACTAATGAAGATTTTCCCACATGGCAACGAATTATCCGACTTGATGCGGTTCGTGCCAATGCAGAATGGATGCCATACTCCCCCTCCCAAGCTATTGT AACGGACAGTAGGGCACATCGTTCTGCTGAGGCTGTTGGATTGAAGGATTATGGTCACCTAGAGGCTGGCAGAATCTTTCATGCTTCTCGACTAGTTGCT ATTCTTGAAGCATATGCACTATACGACCCTGAAATTGGCTACTGCCAGGGTATGAGTGATCTGTTATCTCCCATAATTAGTGTTATACCAGAAGATCATG AGGCTTTCTGGTGTTTTGTTGGATTCATGAAGAAGGCAAGGCAGAATTTCAGGCTTGATGAGGTGGGTATTAGGCGGCAACTTGATATAGTTGCAAAAAT TATCAAGTTTAAGGATGCCCACTTGTTTAGACATTTGGAGAAGCTCCAAGCCGACGATTGTTTTTTCGTGTATAGAATGGTGGTCGTATTGTTTAGAAGG GAGTTAACATTTGAACAGACTCTCTGCCTCTGGGAAGTAATGTGGGCAGATCAAGCAGCAATCAGGGCAGGTGTCGGGAAATCTGCATGGAGCAGAATTA GGCAGCGTCCTCCGCCAACAGATGATTTATTGCTTTATGCCGTAGCAGCCTCGGTGCTACAGCGGAGGAAATTAATTATCGAGAAGTATAGCAGTATGGA TGAGATCATCAAGGAATGCAATGGCATGGCAGGACATCTTGATGTTTGGAAGTTGCTAGATGATGCACATAACTTGGTGGTCACCCTTAATGACAAAATG AAATTGAGAAGTCACTCTAATGATTGAAGCATGGTCTGTTTGTGAGTTGGGTTTTGGAGGGGAATAAATGAAAATGGAAGAATTCAAACCCATTTCGAAA GTGTATTTCATGAACTTGAAGTCTTTCCTTTCCTTCCAAACCCAACTTGCAAACCAACCTTTTAAAAGCAAAACTAGTTTATCTTTACTTCCACATATGA AATAAGCATTGCAATGCTGAATCTATTACTTTGAGGTCTGCTGATTCCTTAAACTGCCATGCTAATTTACAAGGCTTTAAGTTCCAACATTGTTGGCTTA TGTGGATGGAAGTTGGCTAGATTTGCATGGCATCTTTTCTTTTCTTCCTTTTTTGGTTCCCGTCCTTGTGTTTCTTTAAAAATTCTGATATCAAAAGCAC CTTTGCGAAAAGCAGGTGGTGGGTAACATTTGAATGAACTCATAATTATTTGACTCTTTCAGCTGCCTATTTGCACAAGGTTTGATGATGATATGAGAAT GGGATCTGGCTGCTGACTATGAAATCTTATTTTAGTCTATACATAGCTCTTTTTGTGGCGGATCTTAGTGAAAAACATCAATTATTAGGATATTTGCTAG AAGAGATTGACTCAAAAAATTAGTCTTTTATGTGAGAGAATCTAATATTTTAAGTATCACAGGG BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_83061; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_255845

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_255845

BlastpGTPase-activating protein gyp7 from Schizosaccharomyces with 30.38% of identity
BlastxGTPase-activating protein gyp7 from Schizosaccharomyces with 30.38% of identity
Eggnog-
KeggLink to kegg annotations (SPAC630.05)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019417095.1)
PfamRab-GTPase-TBC domain (PF00566.17)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;