Ll_transcript_478026

• Id Trinity: TRINITY_DN44455_c0_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_478026
• Sequence: GGCTACGCAATCTTATCTTCTTAACTCTCTTTATGTCACTGGATTGCAACCTTCAATTCTCAAGCCAACCAATTTTGGATTCTCTGTTAGTAATAACTAT TGAGCTTCATTTTAACCGTTTATTCCCTTTTTGACCTTGTGTGTTCATTTACATGCAGTTTATTTAATACCCAGTTGCAAATATCTGCATTTTTTCTGAT TGGAGTGCTTCCAGCATCTGAATTTGGAAACCCATTTAAGTTTTTTCTTTCAATTGATATTCATGCTAGCTTTTGTATAGAGTTTAGAACGTGTAATGAT GAAAAAAAGGTGTAGGGAGAATTTAGAGTTTGAAAGCTGAATTTTTTTTATGTTAGCATGTGTAAATTGTAATGCCTTGCTTTTAATAATTTTGGTATTT TTAATTTTAGATTAAAGAGGAAAAAAAACAACTTGTGTTCTTCATTGTGTGCCTTGGTTGGTCTGCATAGCTTAATATATGATGGTAGCCCAAAGTGAGT AGAGGGAGCAAAAAAAATTGTTTTTTGTGAATAAAATAAAATTGATACCTCTACCTTTTAACAAGAAATCATGAGAATTAAAGAAATGTTGCTTCAGAAT GTAAGACAATGTGAACCTGTGATTGTTGGTAAGGTATGGCATATTAGCTTTGCTAATTGGTGGCTTTCTCTCTCACTGGCATGAAGGTTTTCAAAATGTT TAGGGGAGCCGTGGCTTCCCCCTATTACATGATGACCGATGCATTCCAAAGCCGCGATATAGGGATTGAAAAATCCAATTATAATTATGAAAACTGTGTT GGGCATTCTAGAGTCTCTCCTGAAAAAGAAGTGAAATTTCTTCGTTTTTTCTCCCTTTGATGATATGCCCATACAGTATTTCCAAAAAAGTCTACATGGG AATGCTTTTCTTTTTTGCCATATGATGCCTGATTAACCTGCATTTTGTGGTTTCTATCTATAAAACATAGTAGGTAAAGCATGAGAAAATTATATTTCTA AATTAGAGCCTATCCTTCTCATATTATCTTTGGTTTTGATCATTGTTAAGGAAAATTACAATTTGTCATTCATTTATCTTGTGATGTTGATTGAACTCAG CTTGAATTGGCTCTCATGTTTACATTAAAATATTGATATATTGAGTAATGATGCTCCTATTAAAACAAAGTTACTAGCTCCACATTGTTTCGCTTGGATA TGCAAAAGTTTTATTCTTGTGTTTATTGTGTCTATCTTTGTCCAATTTGTTTCTGGTACATTAAATTTTCCAGTAAGCTAAATCACTTCGCTGACCTTTG AAAACCATACAGAGTTTACTTTTTGCACTTCAAAATTATCCTGTTATTTTTCTCAACATACTTTCACATTTCAATTGTTGCAGCAAAGTTCAAAATATCC TACTAAACGAAAGGCGAATCCCAGTGCTTCGGGAGCCGTGCAATGCTGCTCATGTCACACAGAAATATTGTATGCAGCTACAATACAGAATTCTCTTGAT TCAGATGCCTTGAACACTCTCAAACTAAGCATACCAGGAACATTATGTCCTTCCACAGATTTCTTCTCCGGGTTGGTTCTTGCCGATCTGGATCCTGGTA CTGCCAAGTTAGCTATTGGATTTCTAGGACCATTTCTCTCAGCTTTTGGTTTTCTTTTTATCTTGAGAATAGTCATGTCTTGGTACCCAAAACTCCCTGT GGGAAAGTTTCCATATGTAATAGCTTATGCTCCCACAGAGCCACTTCTGAGTCCTACCAGAAAAGTGATTCCTCCCCTTGCTGGTGTGGATGTTTCTCCT GTGGTCTGGTTTGGATTGATCAGTTTTCTTAATGAAATATTGGTTGGTCCACAAGGATTACTTGTTCTCCTTTCCCAAAAAATCAATTAGCTTCTATATT TATAGTTTGTGAAGAATGAGATATGGTGATATTTTATCCAATCTTGTTGGATTTATACATAAGTTGCATATGTGAATAACAATGTTTTTCTTCCTTCACA TTTGCCATCTAGAATCATGTTTGAAGATATAAATATTGTTTAGACTTTAGACTTCATACTAACATGTCTGACAATTTCATATAATCATGTTTGGAGCCTC TAGAATCAAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_137728;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_478026

FPKM

• PAB: 2.2
• PNAB: 2.2
• PS1: 1
• PS2: 0.8
• PS3: 1.3
• PW1: 1.9
• PW2: 1.9
• PW3: 2.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_478026

• Blastp: -
• Blastx: Protein COFACTOR ASSEMBLY OF COMPLEX C SUBUNIT B CCB3, chloroplastic from Arabidopsis with 81.65% of identity
• Eggnog: integral membrane protein(COG0762)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G36120)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019449789.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;