Ll_transcript_317078

• Id Trinity: TRINITY_DN44816_c0_g1_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_317078
• Sequence: GTACGTTATATCTTGGAAATAACAATTAGATCTGAAAAGTTTCACTCTTTCAAATGTGCTGTTATAAATAAAATAAAATAATAGTAACAATAACAACACA TAAGAAACTATTGCAATGGAACGTGGCGGTGGTGACCGTGGCCGCGGTGGTGTACGGCGTTCTTCTCCGATGACAATGAAATGGTGTCCTCGTCCTCAAT CTTCCATTCAAACCCCTCCTCCTGTTACAGTTGTTGCAGATCAAAACTCAGCATCACTTTACAACAACAATGACCATAATAATAATAATAATAGTTATAT TTCACCTAAACCTAACACTGTTGCTAATTTTTCATCGTCATCATTGTCTAATGATGTTTCGAACAAGTTAACAATTTCTGAAACTGAAACTGAAACAAGA ACAGAAACAGAGCCATTTGTGTTTGATTTATGTCCACCTAAGTCAACTACTGTTGTTTTAAAACCACCTTTGTTTACCAAGAACAGAGAAAATCGAAGAT TTCAACAGCGTAAAGATAATGTGGGCTCAGTTAATAGTGTGGTGTTAAGGCCCGGTATGGTAATCTTGAAGGGTTACCTTTCTTTACCTGATCAGGTTCC TATTTTTTTTGCTTCTTCATTAAATTAACTGTGTATAATACTATAATACTTGAGTCATGTTTGTTCTAAGTTAGAGATCATGCTTTGTCAAGAACATTGT GGTGTCGTTTAATCTATGTAGCTGACCATGCTTGATGAGATAAAAGTTTGGTTGTTGTTGTTGTTTGTTATAATGCCTTTTATAAAGCAAAATATGCGTA ATTAGGGTTACAATAGTCGAAATTGTCTGTAAGGGAGTGTTTGGCTTGCAGAATGTGAGATCGGGGGTTGAATTGCCCCGGCTTATCTCCTTGTTTGACT AGAGATTGTACGATTATGGACTCAAGTCCTCAGTGGGAGAACTCTGACAATCAAGTTGTTATAGGAGATTATAATGCAGGATTGCAGGGTATAGCTCTCT TAACTGGTTTGCTTGCCAGGGTTGTCTTCATCGTGGGGGCGTCGTTGACCTTAAAGTGTTCCATTGTAATAATGGGATGATCCTATGATTTCTGCCTAAC TTACGAAGCTAATGGCCATTACGGGTTGAGAATTATGGATTTGTTCATAATTGTCAAGATTGCAAAGGAGAATTGTTATTTCATTCCTAAGCATGAAGGG TAAAAATTGGATTTCCACCTTTTTAGGTGGGAAAGTGATTCTCAGGCATCACATTCCCACTTAAGTCTTCCAGCTTTGTGAAACTTTTCCCATATATTGT GTGTGTACTATTTCATTCCTTTTATGATAATTTAGTTTAACATGATGATATGGTTCTACTGGTATGTAGGTGAATATAGTTAAAAGATGCAGGGAGTTGG GGCTGGGTTGTGGAGGATTTTGCCATCCCGGCTATCGTGATGGCGCAAAGTTGCAATTGAAGATGATGTGCCTCGGCAAAAGCTGGGATCCACAGACCGG TCAATACACAGATAACCGTCTATCAGATGGAGCAAAGGCACCTGATTTGCCAACTGAATTCAATCACCTGGTTGAGAAAGCTATTGAGGATTCCCATGCT CTCATCAAACAACATTCTAAAACAAATAATCCACAGAAGATACTTCCCTCCATGTCACCCAACATATGTGTTGTCAATTTTTACACACAAAGTGGCCGAC TAGGTCTTCATCGGGACAAGGATGAGAGTGAAGAAAGTCTGCTTAAAGGTTTACCAATAGTGTCCTTTTCTATTGGAGATTCAGCAGATTTTTTGTACGG CGATGAGAGTGATGTTGTCAAAGCACAAAAAGTTGTACTGGAATCAGGAGATGTTTTGATCTTTGGTGGGAAGTCTAGACATGTATTTCATGGAGTTACT GCAATTAATAAAACGACTGCTCCCAAACTTTTGCTGGAAGAAACGAATCTACGGGCTGGTCGATTGAATCTGACTTTCAGACAGTTTTAGAATGCAGGAC TTTTCTAGGTTGTAAGCTATATGCCATTTGGTCAACCAATCTTTTTGTCGATAAAACGATTGCTAACCAACATATCAGACTCTTTAGCCAGAAAGTTGCA TGTTACTATTGCTATTTATAAAATCAAATATAATGAAATCATGCATATGATATATTTGTACTGCTTTCATTTCCTAGAAGCAAATATATGTTGCTTTCTA TATAGCTGAGAATTAGGTGTTGACCAAATGTTATGCTGATCTTCCATCTATCAGAAAAGAATGGGGGAAGCTGAGCCATGCTGAAAGAGCAGGGTACCTG CTTCATTTAATTAAGTTCCTAGTCTTTCAAGTGCTGCCCTTGTATTGAGCATTATAGGATTCCCACTGGAACAAGTATTGTCTTAGGTAGAGTTTGGTTG TTGGCATAAGTTGAGCTCTTTTCCATTTGTCTCCCTTCTATATCCCCTTACTCTCCCTTCCCATCTCTTGGAAGGGTCTTCAAAATCCTTGATATTGTTC CATTCAAAAACACTTCTCTAAGCTCAATTCTACTTTTATGTGCTTTTAATTTTGGCAAGCACGAAACCTGCTTTTTTACCACATTTTTTCTCTGCTGAAG TGGTTTATCTTTGGACTGTACCAATTTCATGTTTCATGTGATCAATAGCAAACTTTTAACTTTTAATTCATATACAGGGGAACACATATGTTAATGCACG TTTTGTATCATTCCGTG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_138396;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_317078

FPKM

• PAB: 0.8
• PNAB: 2.4
• PS1: 2.1
• PS2: 1
• PS3: 3.2
• PW1: 2.5
• PW2: 1.8
• PW3: 1.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_317078

• Blastp: Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase abh1 from Schizosaccharomyces with 31.46% of identity
• Blastx: Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase abh1 from Schizosaccharomyces with 31.32% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (SPBC13G1.04c)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019423484.1)
• Pfam: 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily (PF13532.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;