Ll_transcript_366131

Id TrinityTRINITY_DN46309_c5_g1_i2
Name TranscriptLl_transcript_366131
SequenceTGACTTTTTTGGCTTCCCTTTCTCATTTTCCTATTTTTGAAAATCTCATTATTGCTTTCTCATTCATCAAAACTACTTTCATTAGTTATATGTATCTTCC AAGCAACAAAAACAAAACTTGTCTTTTGTTCTCAATAACGTGTCCACCATTCTCACTTCATTCCTTCCTTCATTCCCCTTTCTTCTTCCTTCTCCTCAAC TCTTCAAACAAAACACATATTTATTCTTTCTTCATTTTTAAACACTGAAACCCAAACCCATAACCCTTTCTTCTCTCTCTCTTTCTATAACCATGCAAGT TTCATATTCCTCAATGAACTCATGGCTCAAAACACGTGTTCCATTGGAACCATGTTCTACTACTTCCACAACGTTATTTACACCTATCTCGTACTCAACA TGTATTAATGTTTTACATTCACCCCAGTATAAGAATAATAACTGTGTTTCGTTTCTGGTATCTCAAAGAAAAGGTTTTACTACTTTGACCCCAGTTTCAC CGATGAAAAAAATGAGCCGAAAAAGAAGATTTTTCACTGTTTCTGCATTATTTGAACGGTTCACGGAAAGAGCAATTAAAGCAATCATGTTTTCTCAAAG GGAAGCGAAATCTCTTGGTAGTGATTTGGTTTATACGCAGCATCTTTTGTTGGGTCTTATATCTGAAGAAGATCGTTCACTTGATGGTTTTCTTTCATCT GGTGTTACTATTGATAAGGCACGTGATGCTGTTCGTAGCATTTGGCACCAAAATGATAATTCGACAAGTGGTGATGGTGATGGTGATGATGATGGTCGAA GAAGTTATGTTTCTGCATCACATATTCCGTTTTCGATTAGCTCGAAGCGCGTGTTTGAGGCTGCTGTGGAGTATTCTAAGTCTCTGGGGCATAAGTTTAT TGCCCCAGAGCATATTTTAGTTGCTTTAGTCAAAGTTGATGATGGAAGTGCAACCCGAGTTCTTTACAGGTACTATTTAAATTGCAGCTTGTGAATTGCG GATAATTGCAGGAAAATGGAGCTCTATTGAATTCAGTTATGATGTGATTGAGTAAAATATGTTAGAATTTCGTTATGATTGGTGAATTACCTAATTTCTA ACTAACTAATTAAGCTATTGTGGGCTTAATTGTGGTTGCAGACAACAATTTAAAACATCATGCCTTAGACTATTTGCTTATTCATGTTCCTTGTTAGAAA AATTGAAGTTATGATTGGCCAGCAAGAAGGGTGAATAAGTAATTACAAGTGTGTATTTTCTATTTTGTTTTGTTTGTTTCATTGCAGAATCTTTGCTCTG CCACGGAATGTTGCAATTTGGCTTTTTATGATAATTATTGGTGGTTCATCCATGTAACTATATTTGTTTGTAGCCCCTTAATGCATTTGAGTTGATTATT GAATATTGATAATGATTTTGAAGTCTTTTACAGAAGCAAATCTCAGTTACTTTATGAAGATTTAAACTTGAATTAGATGGGTTGTGGCTGAGATAGTAAG ATTTGATTTTGGGAATTGGATTCTGGAGTGTGACTAGGCAATATGATATTTTTAATGGCATAGCATAATCTATGGCTGTTGCTCTTGGCAGAATGCTTCC ACTGGTTTATGGCTGCACTAAATTGGAACTTTATGTGGTATTTAAAGTGCATATCTTGCTTTAAAATCTTTTTGCGTATACCACATTTCTAGTTTGAAAA GATTAAGTCGAATTTGTTTTTAACAAGTTTTTGGAGATGCAATATTTTATTATTTGTCAATTTTTCGTTTAACCAGCAAATTCCAATTGTCGGTATGGGC TATGGAGCTATGGGTAGTTGCTAATAATTCCTTAATTCAATATGTGCATCATCCATGTTTGAAATTTGAAAATTAGGGACAAATGCAAGTCAGTTGGCAG TTGTGGCATTCTCCAGACTACAAAAGGAGATTGCTAAAGATGGTAGAGAACCGAATATGGTGTCCAATGGGGTGCATAACAAATCCGTTTCAAGAAAAGG TTCCGATGCAGGATCCTCTGCCACAACAAAAGAGATGAGTGCCCTGTCACAGTTCTGTGTGGATCTCACTGAACGTGCGAGCGAAGGGCTAGTCGATCCA GTCATCGGCCGAGAAGTTGAAGTTCAGAGAATTATTCAAATACTAGGCCGGAAAACAAAAAGCAATCCCATTCTTCTTGGTGAAAGTGGTGTCGGAAAAA CAGCTATTGCGGAGGGGCTGGCAATTCATATTGCTCGGGCGGATATTGCTCCTTTTTTATTGACAAAGCGTATCATGTCGTTGGATGTTGCAATGTTAAT GGCTGGGGCAAAAGAGAGGGGAGAACTAGAGGAACGAGTTACGAAATTAATAAAAGAGATAATAAAGTCAGGTGATGTCATTCTTTTCATTGACGAAGTT CATACACTTGTTCAATCAGGGACAAGTGGGAAAGGAAATAAGGGATCTGGCCTTGACATTTCTAATTTACTTAAACCTGCACTTGGAAGGGGTCAATTTC AGTGTATTGCATCTACCACCATAGACGAATACAGGCTTCATTTTGAAAAAGATAAGGCATTGGCACGAAGATTTCAACCTGTTTGGGTTGACGAGCCAAG TGAGGATGACGCAGTTAAGATACTTATGGGTCTACGCGAGAAATACGAGGCACATCACAAATGCAGATTTACTGAAGATGCCATAAAGGCTGCAGTTAAT TTGTCATCAAGATACATATGTGATAGGTATCTACCTGATAAAGCGATTGACCTCATTGATGAAGCAGGAAGTAGAGCTCATATTGACGACTTTAAGAGGA AAAAGGAACTAGACAATTGCGTACTTTTGAAGAGCCCCACTGATTACTGGCAAGAAATTAGGGATGTCCAGGCCATGCATGAAATGGAGAGCAAACTTAA ATACTATGGCACTTCTAGCATTGATGATACTAGTGAACTTATAGTGGACTCATATTTACCTTCTGAAGCCAATGATAACGAACCTGTAGTAGTTGGACCA GAAGATATAGCAACTGTTGCTTCCATTTGGTCAGGAATTCCTGTTCAGCAGCTCTCTGTTGATCAAAGAACTCTGCTCCTAGATCTTAATAATCAACTTC GCAAACGTGTGATTGGACAAGACGAGGCTGTTCTTGCCATTTCTCGAGCCGTGAAGAGATCACGGGTTGGCCTTAAGGATCCTGATAGACCCATAGCTGC AATGCTATTCTGTGGCCCAACTGGGGTTGGGAAAACTGAACTTGCAAAATCTTTGGCGGCATGCTACTTCGGATCAGTAAGATTTTACACATAATATATG ATTTAGCATTAACAATTAGAAAGTGTTCTTTTTGTAAAAAATGAGGACCATTTCCCCCCTGCTTTTACATAATATGCATCTATTTGGTTGGAATGCTGAT GTGAAATTAAACCCTTTAGAAATCTACTATTTTGTAATGAAAATTGAATTGGGGATAATTTTGTAGGAAAAGTTACACATTACAAGGATTTAAATATAAA AGTATAAAATAACAATACCTAGACTATTAATGATATCGGCAATATAATTCAGTTCACCTTATGGAGTAGTTTTTTTTCCTCGCTGTTAGGGTCCAATCAT AAGGTATATCACATGAGTGCCACATCGGAAGGATGTGATTTTTGTATGGGTTTATACGGCCTTCTGCTCTTGAACCCTAAGGCCTAGCTTTTGTGGTATG GTTTTCAGAACGTCTATATCAATTGGTATCAGACCTTTTCCGCCGAGTCTATTGATTGCAAACACGATGGTGATGTTAGCATTGCCTATTTGCCCAAGAC TAGTCGGAGAGCTAGTGCGCCACCAGCTTGTGTGGGCAAGTTGGCCGATGTTCATGACTTATTGTTATCAATGATCACCTGAACAGGAATGGAAGGACCA CATATTTCCTGTTGCTTTTCTTCTTTGTTTTTTTGGACTACAATGATTATGCTATGGTTGATGCATGCCACATTAATTGTTTATATATAGTTTTTCTTAT TATTATTACTATTTTCAGGAGGCTGCCATGATAAGATTAGACATGAGTGAATATATGGAACGGCATACCGTGAGCAAATTGATAGGATCACCCCCAGGTT ATGTTGGTTATGGAGAGGGGGGCATTTTAACCGAAGCTATTAGAAGAAAACCATTCACACTGTTATTGCTTGATGAAATAGAGAAAGCTCATCCGGATAT ATTCAACATTCTTCTTCAATTGTTAGAAGATGGGCAGCTTACGGATTCTCAGGTTTGTGAATGCTGCTGCAAATCTTAACTTAGTAGGATTGTCAATAAG CTTCGAGATGCAAAACTTTTTCCGTGAAATTGCATTTTTTCTTCATTGCTTCTTTGCCAAGTAAAAGCGAACACTTTATGAATAAAATTATGGACTTTAT ACTACCTGTGTCCTGAATTTTTCTTTTTTGATGTTTGTAAAACTGGCTCTAACAGGGTAGAAAAGTTTCATTTAAAAATGCATTGGTAGTGATGACTTCG AATGTGGGGTCTAGTGCCATTTCGAAGGGCCGGCACAACTCCATAGGGTTCTTGATTTCAGATGACAAGTCTACATCTTATAATGGCATGAAATCAATGG TAATGGAAGAACTGAGGACATATTTTCGCCCAGAATTGCTTAACAGAATAGATGAAGTGGTAGTGTTTAAACCTCTTGAAAAGTCACAGGTTTGTGAATT TTGGTTATAAGTTAGCTCCATGATGATAATCATCTAGAAGAGTCTTCCTCAGTATCATATTGAGCTATTTTTCTTTAGTCTATAACTTGATTTCTTCACA TAAACTAATTTTTTAACTATACCAGGTAGAAGTAGAACTAATCTCTTTGCGTAGAAGTAGAACTAATCTCTTTGCAATTGATAAACTAGGTGACAATTTT TGGTACTAGTAATTCAAATTGTGGACAGCATGACATGACATGATGCGGCTGCAATATTGTGGTTGCAGGGGTCACCAACCACATCACACCATAATTGCGG TGTAACACCGAATCACAATTATGTAGCCCATTAGGCCGCAATGCAACTACATTGGATCGCATTTGGGCTGTATCATGCTACAACGCAACCACATCTGGCC GCATCAATTTCAAAAATAATTTTTTAATCACAGAATAATTTACATTGTAACTACTTCAATCTGCATCGCAACGGCTTTAATGACTGCAATGCGCCAGTGA TTCAAATTATGGACAACACATGATGCAGCTACAATATTGTGGCTATTGTGGTCATCACAACTACATCATACCGCAATTGCGGTGTGACACCGAAACACAA TCATGGGCAATGCAATCGCATCAGGTTGCATTTAGGCTGCATCGTGCCACAACACAACCACATCTGGCCACATTAGACCGCATTGATTTCAAAAATAATT TTTTTAATCGCAGAATAATTTACACTGTAACATTGCAATATGCATTGCAAAGACCATAATGATTGCAATGCAATAACCGTGACCGTAATTACCACCGCAA CTGTAATTTAAAACACTGGTAGATAAATTAATGTGTTTTATTCATTCATTGATTTTGTTACTTTTATTACAGTTGCTCCAAATATTGGATATGCTGCTTC AAGACCTAAAGAAAAGGGTCATGACCCTAGGAATTGATTTAAAGGTGTCAGAATCAGTTAAGAACCTTGTATGCCAACAAGGTTATAACCCAACATATGG TGCCAGGCCTTTAAGGAGGGCTATTACATCAATAATTGAAGACCCCTTGAGTGAAGCATTCTTAGTTGGAAAGTGCAAGCAAGGTGACACTGTCTTCATT GATTTGGATTCCAATGGTAACACCATTGTTACAAATAATATTGATCAGATTGTGAACTTATCTGATACAAATCATCCATGTAATTAACAATTGTATAGAA GTAGTATGATAGGTATACATATATAATTACACATGTATTGAAGTTGTTTTGGCCCTTGAAGCTAGCTTAGGAAGTTTATATAATGTAATTAGCTCATCCA TCATTCTTTGAAATTTATGAAAATATATCCATATTCTCTTATCTTGC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_143669; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_366131

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_366131

BlastpChaperone protein ClpD, chloroplastic from Arabidopsis with 72.33% of identity
BlastxChaperone protein ClpD, chloroplastic from Arabidopsis with 69.77% of identity
EggnogATP-dependent CLP protease ATP-binding subunit(COG0542)
KeggLink to kegg annotations (AT5G51070)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019429737.1)
PfamATPase family associated with various cellular activities (AAA) (PF00004.28)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;