Ll_transcript_521668

Id TrinityTRINITY_DN46592_c5_g1_i3
Name TranscriptLl_transcript_521668
SequenceCCCAGAAGATGTGTTTCTTCCTGTAACCTGCAGTCGTTCATTACATTTACCCTTGCGCTACTCAGATCACACACACCTCCACTCTTCCATTTTCCTCCGC CGCCGTCTCTCCTCGCCGGGGAAGTCTGGAGGATATCCAGGTAGCCACCAGCCAAAGCTGCCTGTGAGCTGCAGCCAGCATTTCCTACTGAAGGAGCAAG TTTTGGATCTTTTGTAGGTTCAGTAAGTTCTGATAAAGCACTCCAAGATATTTTCTTAGCATTTATTGAGAATTGCAACTACTTGATTGCTCCCACTACT TGTTTTTTAGTTGAGTTTCAATTTGTGGAATCTTGTTTACTCAAAATCTTTCGGGAAGCTCTTGGAAGCACTAGTGCTTGACTTTAGAAACATGCTTGAA TGTAGTTCCCTTGTCAGATTTTCTGATTGCTCCCTGTTTCATTAAGTTAATAATTCCATTCCAGTATTTTTAATGACTAGTTTGATTATGTTTCTTAGAA TTTATGCGACAATTAAATAGCACCCTGTAATATTTCTATTTCTATATATGCATGCGAGTTTAAATTTGAGATAAGCAAGGGAGGCAGTATTTAAATGCAA TATTTAATTTAGTTCAAATTCAGATAATAGGGCTAACTCAGCTTGTGGTTGTAGCTCATTATGTAGCACCAAGCATTTCCTGTGCATGGAGTCTAATGGC ATTTTTAACTTGCTTTTTTAAAAGTTGATGTAGAACATGGTGCTTGTTTTTTCATGTGGTAATCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAGAGTAGTAGGCCAGCAT TTAATAGGTAGGTTAAATTTTGTTTTTCTAATGGAATGGGCCAGGGCCACCCTACTTTATATGGGTTATAAATTGTATTTTTAATGGGCTGGCCCCAACC CACATGACCCTTGAGCTTTTTTTGGCTTTGGTTAGTTTTTAGCACTGGCCCATGTGCAGCAGTGGGGTTAAGTGGTGTGGTCTATAATGATGGCCTAATA AAGGATTGACTATATGAGTTTTATAAGTTCCCGACTAAGTCGTAAAATAGTAAAATTCATGGAAAAAATTGCAAAGAACAATTCCAGGGATCAAGTTTGT ATTTTAGTTGGAAAAACTGAAACATATTGTATTAGGCTAGAAAGACATGTGCTAATTTTGGATCAATGTGCTTGGTAGTTGTGACATTTAAAAAGGTAAG AGGAATTAAAAATTGTCACTCTTACCAAGCACATTGATGTTTAGATTGATTTATCTTCAAGGCTAAAATGCAATTTTGGTTCTTCAAGTTTCTGTGCAAT TTTAGCCCCCAACTTTTTTATGTGCGATTTTCATCTTTCGACTTACATAAATGTACAAAAATAGTCTTTTTGTTTACTTTCCATTCAAAACTCTAACGAT GTTTCGTCTGTGGCAGATGTTGTCCAATATGGCATTACATGTGTCATTCGTATGTGACACCTAAGATTATAAGGTGCAGTTTTGATCCCTCTTCTTTCTC ATTTGTACAAAATTTGCCCCCTATTTCATGTGCACTTTTCATCCTCTAACTTATATGATTGTGCAAGAATGGTCATTCTTTCAACATACCTATTAAAAAT ATAATAACTTATGACTTCACAACCTCATCTTCTAGAATTAAATGTGAAGTATCTGTTGTCCTCTGCACACTGACGAAGAACCAATGCATGCTCATAGAGA AGAAAACGAACAACAAAAGAAATTGAAGAATAACATTGTGTTGAGCACTAAACTGTAATTCGTTTTCTTTTCTAATTCCTAACTTATCCAATAATAATCT ATTTTACATACATGGCTTGGTTGATATGATAACATTTTTTTATCCAAACAAATAAAAATGGCTTGTCTTCAAATAAATATTTAATTTTCATTAATTGATT ATTTATATTTTTTTTATTAATTAAAAGATATTTTTATGAATCACTAATTTTATTAAATATAATAACATGGTGACAATTAAGGACCAATACTGTACTTTAT AACATGTGTAATGTCATGATGGACAACATCTTTCGTGTATTTTACATTCAATTCTAAAAGATGAGGTTTGTAATGCATAAGTTATTTGATTGCGAGTATT TATATCAAGTATATTGAAATGAGGACCATTCTTGCACAATCATGAGTCAGATGATGAAATAATGGACATAAAAAATGGCGAACATTGCACAAAAGGAAAA TAATGATTGACCAAAACTGCACTTTATAATTTTGGGTGCCATATAAATGAATAATGATTGTAATTTTGCATTAGACAACATCTGCCACATAGGAAAAGCC ATTAGGATTTTGGAAGGGAAGTTAGTGGATGGACTATTTTTGCACATTCATGTATGTTAGAGGATGAAAATCACGCATAAAAAATAGGGGGACTAAAATC GCACAATGAAGGAACTTGAGGGACCAAAACAACATTTTAGCATATCTTCAATAATTTTGTTCTTATTTTCATTCATGCCATGCATACCCCTTAATTTTGT GGTATAATCCAATTCTGGGTACCAGATGTGCTTACTGGCCCACTGTGAAGTACTGTGCTTAATATAAGTAGCATACATGTCAGGGTTTGGTTTACTGTCG GTATTGATCTATTCTACATCCCTGTTAATCAATAATGCAATTCTTTGGGGGGTCTGAGATCAGTCCATCACCACCTGCGCCAGCAGCTTCTGGAAACAAT GGCCATATGATGTATGTGTTCAATAGGAATGGCATATGTTTGCTGTATAGGGAGTGGAATCGCTCGCTCAGGACACTGAATGCCCAGCAAGACCACAAGT TAATGTTTGGTCTACTTTTCTCACTTAAGTCGTTAACTGCCAAGATGGACCCCACTAGTGCTGAGAAAGGAAACCTTGGCGTGCCTCAGTTACCTGGCCA AGGTTGTTCATTTCACAGTTTTCGCACTAATACATACAAGCTTAGTTTCATGGAAAGTCCTTCTGGGATAAAGGTAAGTTTCAATGATATTCTCGTTCCC TTACATTGGCTTTTGCACATTTATTCATTGATGATTCTAGCTATTTTGGCACTTTGTATTTATCTTATATATATATGTATATATTAATCCCATTTTTAGT CATAAAAATGTTGGATTTATTGATCTAATTTGCGAATGAAAAACTGAAGTGACATGGAACATTAAAAGTAAGAGAAGAAATTTTTTTGAAGGAATATAAA AGTTTAAACACCATATTTTGATCTTTGGATTTTTTGAGAGATCTAATTTTGTGTGACTTGCAAGTTCCTCTGTGTATGAACCAAATATGAGGACGATTGG TTTTTGGCTTTACCACTTCAATGTGCCTTGTGAAGTTGCATGTTGACTGTAGAAAAATAACCAACTAACCATGTTTATATGTTCCTTATTGTCTTGGTTT GAGGCCTTGAAATGAAGAAATAAGAGATGCTTTTGTTTTGTATGAAGAGGAGTGCATATCATGCTGCTTAAGTGACAGTGATTTTGGATGCTTCTGGTGT AGGCTGTTTGTGATCCTTCTTGGAAGAGATAAACCCATTGTCCATTGTATTTTCCAACATTTATGCGTCTAAAGTGGTTATATGATTTGAGTAATCTACC CTTCAACCATTTGGAGAAAAAAAGAAAAACCTGTAAGCTGCAATGATATGAAACAAGAAGGGGGAGGCCAAGGGAAACAGAATGCTCTAAATTATTTCTG ATACACTTATGAAAAGATTCATAAGCCTAAAATGAATAATAAAATCTATAGTGGAAAGTCCAATTTTCCTAATTTTACAACTGTAAGTGACCAAAACTCT AGATTATGTGCTCAAGAAATTTTAATTCAAAATAGGAAAAAAAAGTTGTAATCTGACTAGTAGTAAGATATCTTAAGACCAAAACAACTAAATGTAAGAA TTCTTAGTTATAGTTCAGCAAGAAAATTCATTAAGTGTAAAAGTAATTTCCTTCATCCTCCATCAACAAGCTTGCATATCAATTCAGATGTGGGGAAAGA CGCACATCTATCATAGCATCTGTCAACTTTTCAACCATGGTTTGAATGGAAGCTATATTCATAGTTCCTAATTTTCACGTCCTTATCCTTTTTTCATTTC ATATTTTGTGCCTCACCTGGGCAAATGTTTTACCTTTAGGAAGTGAGTCTGCAAAATTCATATTTCACTAGAAAGATGGTGGGTGTATACTTCCAGTATT TGGTATCATTGTCAAAAACTCAGAATATAAGCTAATGACTAAACTAAGTTCTGTTGTTCTCTCAATTGTTCAGTATGTATTTGGTGGAGGTTGTGATTTG GAATAATTGCATTCAATCTTTTATGATGCTATGATCATTTTGTCTGGCATAGGTATGTTAGCATAAATTGTAGTGGATAACTGAGTTTTGTTGATTGCAT TGAAATTTTCTTTTGGAGAGTTTGTCTTAACATGTTTTGTAAAGATGCATTACGTAGCATAGTAAAACCTAGATCTATTTGGGCAACTAAAGAGATATGG TTACTGAAAACAGTCACAAATACATCAAATTATTCCTCAAATTAATGTATGTTAAAAATTCAATTTTGCAGTATTCATATACATGTGCTTGCTATTATGA TCATATTTTTTTACTGTGCCACTATTTCTTCGCCTCATGCAGATTATCTTGGTGACTCATCCTAGAACCGGTGACCTACGGGAATCCCTGAAGTATATCT ACAACTTGTATGTTGAATATGTTGTCAAGAATCCACTCTATACGCCTGGATCTCCTATTAGGTCTGAGCTGTTCAATACAACATTGGACCAGTATGTCAG AGGCATTGCATAGAAGCTGAGTTGCTCCCATTCACCGTTGTTGACGATGAACACGATTCGTTTATCGCCTTTGTTTTCGATAATGGTGCTTGCATTTGCC CTCAGAGACTCTTGCTAAGCCCTCACTTGATTAAAATGACTTTCCAAGTTACAGCGCTGGATGGTTTGATTATGTTGATACTTGATCAGAAATTCAGTAA TCGTTGTCCAAAATTTAAAGGATGGATCTAATTCTATTATGTAGCATAGAGCAACTCATTTTGGCTGAAGTGAATTTTATTGAACCTTTCCTTTTTATGT TGTGTTTATTATATACAGGTATATCTTCAATAATGAAACTTGTGTATTTTAGTTTTTATTAATTTTTTGCAAAATGTAACTTCGTACCATTTTTAAAAGT TTAGGCTAAGACAAGGATCTGATGTCTCATAAAATGTCCAAATCAATGACAATGAAAGAAAACTGATAATATAATG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_145741; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_521668

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_521668

BlastpTrafficking protein particle complex subunit 1 from Rattus with 38.33% of identity
BlastxTrafficking protein particle complex subunit 1 from Rattus with 40.35% of identity
Eggnogtrafficking protein particle complex(ENOG4111X41)
KeggLink to kegg annotations (287427)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019449715.1)
PfamSybindin-like family (PF04099.11)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;