Ll_transcript_315920

• Id Trinity: TRINITY_DN46780_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_315920
• Sequence: AGGCCACATGTTTCGGTTTCCGAGCGACATTTATTGTGAGGAGAGGGCATGCAGTTGAAAGGATTGGTTGTTTACCGTATGGTGAGGAATGAGGATATCC TTCGTATTCAATAGAACCATCTGGTTGCGTCCAAAATCTACACAAGTTTGTTATTCACTCTGCCAATTGATTCTTGAGTTTTAAATTACAACAACAACAA TAACATCACTTGCTAGTAAGTTTATCTTGTTATCCTAATGTTGATTCAATTTCATTGGCTCAACTCTGAACTCAGCAATGTTTGCGTGTCCCTTCTAAGG GTCAAGCAGTTACATGCTTTGCTTTTCAAGACATATCTCTCACAAGACCCCTTTTATGCAACTAAAATTCTTAGGTTATATGCTCTTAAGAATGACATTA CCACTGCATACCAAGTGTTTGACAAAACTCCTACTCGAAGTGTCTACCTTTGGAATTCCATGATTCGTGCTTTTGCGTGCTCCCCAAGATTTGCCCGCAC AATCTCTCTGTTTCGAACAATGCTTGGGGGTGACATAAGTCCTGACAATTTCACTTATGCTTGCGTTATCCGTGCGTGCTCGGACAATTTTGATTTTGCT ATGCTAAGACTTGTTCATGGAGGGTCTGTAGCTTCTGGTTTGGGATATGACCCTATTTGTTGCAGTGCACTTGTGACTGCTTATTCTAAACTTGGTTTTG TTAATGAAGCATGTAAAGTGTTTAATGGGATCGCAGAACCGGATTTGGTTTTGTGGAATTCACTGATTTCTGGTTATGGGTCCTCTGGTGCATGGGATAG AGGAATGCAAATGTTTAGTTCAATGAGACATGGAGGGAATAAGCCAGATGAATATACACTGGCTGGGTTGCTTGTGGGAATTGGTGATGCTAGCTTGCTG AGTATTGGTCGAGGATTACATGGTTTAATTCTTAAATATAGACTTGATTCTGATTCTCATGTAGGTAGTTTACTGGTGAGTATGTATTCGAGATGTAAGT GCATGGTTTCTGCATACGGAGTCTTTTACAGTATTTTCCAACCTGATTTGGTCACATGGTCTGCTCTTATAACTGGGTATTCCCAATCTGGGGATGATGA GAAGGCACTGATTTATTTCAGGAAATTAAGCATGCAAAACAAGAAGGCAGATTCTGTTTTGATTGCCAGTGTATTAGCTTCTATAGCTCGAACAGCATAT GTAGGACCAGGTTGTGAGATACATGGTTATGTTCTTCGGCATGGATTAGAATCAGATGTCAGAGTCTCCTCTGCTCTCGTGGACATGTATTCAAAGTCTT GGCTTGAATGGATGTGCTTCTGAGGCTTTCAAGATGTTTCATAAGATTCTAGAGAAAGGATTAGTACCTGATGAAGCCACGTTTTCTGCCCTTCTTTGTG CTTGTTGTCATGCTGGCCTTGTCAAAGATGGCCGGGAGATTTTCCGGAGAATGAAAGATGAATTTGACATCAAACCTAGGCCCGAGCACTATGTTTACAT GGTGAAGCTTCTTGGCAATGCTGGGGAGTTAGAAGAGGCTTACAAACTCACACAGTCCTTACCAGAACCAGTAGACAAGGCCATCCTGGGAGCCTTATTA TCATGCTGTAATTCTCGTGGAAATTCTGATTTAGCAGAAATTGTAGCTCAACAGCTTTTTAAAAGTAATCCTGATGATAACGTTTACCAGGTTATGCTTT CTAATATATATGCTGGTGATGGGAGGTGGGATGATGTGAAGAAGTTGAGAGATAAAATAACAGGACTGAGAAAAATGCCGGGAATAAGTTGGATTGAAGG GAGTTTTTGTTAATTCGGAAATTTCAGAAAGATGGTGTAAACTGTAAAGTTGACAGACTGTAACTCCTGTCAGATGTAAAAAGGCTTCTTGCAAAGTTTG TTAGAATGAATTGATTGGAATATCTTCAATGAAGGAGTTCATAACTGTCCCAAATGTAGCTTACACATTAATTGATCCATGCATATAAAGGGTACACACT AACCGATCTTGTTGTGGTTCTTAGCTCAGCATTTGGTCTAATGTTTTTGAAGTCACAAGAATACTATTCAGCATTTATACATTCTTTAAATCACATTAAT GACACATGAATAATGCTGTCTTCTTTTCTTTTCTTTTCAAAATCATGCCATTATGCATAAAGCTATATGAAAATGTTCAACCACATATCTTCTTCAGTGG CTAAACTTATGTGATGCCTAATTATTTTCTTGCTGCTTTCAGATCTTCACTTTTTTTTAAAGATTCAGAGCTCTACTAACTCTGTGAAATTTAAAGTGAC TTTTCCTTATCGAAGCAACTATAATTAGCCAAATGGATTTGGAAACAGCTATGATGAAGCTGGAAGCACTGTTTATTTTGGCTCTGAACCAGGTTTTTGT AGATGGCCTCATCTGTTTTTGAAAATATGATTTATAGATAACCTGAAACAGTAATGTGGATTTGCATGAGTTTTGTAGTTAATACACTCTTTTTTCTTTT AATATAAATTAAGGGTCAAGGGAGGTTCTCCCATTCCAAAGTCAAGGCATGCTACAAAAATTAGGGTTGGCATTTGAACTTGCATAATATAATATATCCT CTCTTCTTCAGAACTTGCTATTTATTTCTAATAATTATTCTCACAATGATGTTTTCTACTTCAAAATTGCAAATGAAGTATTTGCTGCCAATACATAATC CGATCTGAATACTTATGTTTGTTAATTTCCCTTTGCTCATTATTTTATATGAACTATGAAAGCATGTGCAGAAGTGTATTGCTTTTAAAATCCTCATATT CCAACTGGACTTGTGCATATTTTGCTATTTTTTCATTTGCAGAGAGAGTGTTCATAGAGGGTGCCTTGACACAAGGGTAAGGTCATTGTCTTCTGACCTG AAAGCTGGGGGTCATGTGTTTAAACAGCTCCTCAGTTTGTGGGTGAGGGTGTACATATACTCTCCCCAAAACTAGGTGGGAGTCTCATGCACGTGGTCAC TATTTTTAGATAGGGTTCATATTCCAATAACCTAGGATGCATGGTGTGCGTTTAAATGATAAGATCTTGTGTTACCTCGTAATGATGCCTTGTATTTTAG TTGACAAGTTAGAGAATGTGAATACTGGATGTTATGAGAAACGTTTTTCCTGGGTTCCATTTTCCTCATGAAGAGGTTGAAAATCGGTTAAGCTCTTCTA TGATTTTTGTGCTTATTAAGAGGAAAATTTAAATTTCAATGTCTATTTGTCCTTATTGGCTTTTGCTGAATACCCAAGAAGAGATAATCACAATATATCT ACACTCTAGAAATTCTGTGATTCAAGTAAGCTTCTAAACCTTAATGTTTTGATTCTACCTTTTGTTATTAGTTTCTTTATTACTATTTGGTAATCAACAA AGAAGCTAAATGACCAAGATTTTTCAGC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_147137;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_315920

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0
• PS1: 0
• PS2: 0.3
• PS3: 0
• PW1: 0
• PW2: 0
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_315920

• Blastp: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g64310 from Arabidopsis with 48.16% of identity
• Blastx: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g64310 from Arabidopsis with 48.16% of identity
• Eggnog: Pentatricopeptide repeat-containing protein(ENOG410Z7Z7)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G64310)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019416125.1)
• Pfam: PPR repeat (PF01535.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;