Ll_transcript_315921

Id TrinityTRINITY_DN46780_c0_g1_i3
Name TranscriptLl_transcript_315921
SequenceAGGCCACATGTTTCGGTTTCCGAGCGACATTTATTGTGAGGAGAGGGCATGCAGTTGAAAGGATTGGTTGTTTACCGTATGGTGAGGAATGAGGATATCC TTCGTATTCAATAGAACCATCTGGTTGCGTCCAAAATCTACACAAGTTTGTTATTCACTCTGCCAATTGATTCTTGAGTTTTAAATTACAACAACAACAA TAACATCACTTGCTAGTAAGTTTATCTTGTTATCCTAATGTTGATTCAATTTCATTGGCTCAACTCTGAACTCAGCAATGTTTGCGTGTCCCTTCTAAGG GTCAAGCAGTTACATGCTTTGCTTTTCAAGACATATCTCTCACAAGACCCCTTTTATGCAACTAAAATTCTTAGGTTATATGCTCTTAAGAATGACATTA CCACTGCATACCAAGTGTTTGACAAAACTCCTACTCGAAGTGTCTACCTTTGGAATTCCATGATTCGTGCTTTTGCGTGCTCCCCAAGATTTGCCCGCAC AATCTCTCTGTTTCGAACAATGCTTGGGGGTGACATAAGTCCTGACAATTTCACTTATGCTTGCGTTATCCGTGCGTGCTCGGACAATTTTGATTTTGCT ATGCTAAGACTTGTTCATGGAGGGTCTGTAGCTTCTGGTTTGGGATATGACCCTATTTGTTGCAGTGCACTTGTGACTGCTTATTCTAAACTTGGTTTTG TTAATGAAGCATGTAAAGTGTTTAATGGGATCGCAGAACCGGATTTGGTTTTGTGGAATTCACTGATTTCTGGTTATGGGTCCTCTGGTGCATGGGATAG AGGAATGCAAATGTTTAGTTCAATGAGACATGGAGGGAATAAGCCAGATGAATATACACTGGCTGGGTTGCTTGTGGGAATTGGTGATGCTAGCTTGCTG AGTATTGGTCGAGGATTACATGGTTTAATTCTTAAATATAGACTTGATTCTGATTCTCATGTAGGTAGTTTACTGGTGAGTATGTATTCGAGATGTAAGT GCATGGTTTCTGCATACGGAGTCTTTTACAGTATTTTCCAACCTGATTTGGTCACATGGTCTGCTCTTATAACTGGGTATTCCCAATCTGGGGATGATGA GAAGGCACTGATTTATTTCAGGAAATTAAGCATGCAAAACAAGAAGGCAGATTCTGTTTTGATTGCCAGTGTATTAGCTTCTATAGCTCAAACAGCATAT GTAGGACCGGGTTGTGAGATACATGGTTATGTTCTTCGGCATGGATTAGAATCAGATGTCAGAGTCTCCTCTGCTCTCGTGGACATGTATTCAAAGTGTG GTTTCATGCACTTAGGAATTTGTGTTTTCAAGATAATGCCAGAACGGAACATAATTTCTTATAATTCAATCATTTCAGGTCTTGGCTTGAATGGATGTGC TTCTGAGGCTTTCAAGATGTTTCATAAGATTCTAGAGAAAGGATTAGTACCTGATGAAGCCACGTTTTCTGCCCTTCTTTGTGCTTGTTGTCATGCTGGC CTTGTCAAAGATGGCCGGGAGATTTTCCGGAGAATGAAAGATGAATTTGACATCAAACCTAGGCCCGAGCACTATGTTTACATGGTGAAGCTTCTTGGCA ATGCTGGGGAGTTAGAAGAGGCTTACAAACTCACACAGTCCTTACCAGAACCAGTAGACAAGGCCATCCTGGGAGCCTTATTATCATGCTGTAATTCTCG TGGAAATTCTGATTTAGCAGAAATTGTAGCTCAACAGCTTTTTAAAAGTAATCCTGATGATAACGTTTACCAGGTTATGCTTTCTAATATATATGCTGGT GATGGGAGGTGGGATGATGTGAAGAAGTTGAGAGATAAAATAACAGGACTGAGAAAAATGCCGGGAATAAGTTGGATTGAAGGGAGTTTTTGTTAATTCG GAAATTTCAGAAAGATGGTGTAAACTGTAAAGTTGACAGACTGTAACTCCTGTCAGATGTAAAAAGGCTTCTTGCAAAGTTTGTTAGAATGAATTGATTG GAATATCTTCAATGAAGGAGTTCATAACTGTCCCAAATGTAGCTTACACATTAATTGATCCATGCATATAAAGGGTACACACTAACCGATCTTGTTGTGG TTCTTAGCTCAGCATTTGGTCTAATGTTTTTGAAGTCACAAGAATACTATTCAGCATTTATACATTCTTTAAATCACATTAATGACACATGAATAATGCT GTCTTCTTTTCTTTTCTTTTCAAAATCATGCCATTATGCATAAAGCTATATGAAAATGTTCAACCACATATCTTCTTCAGTGGCTAAACTTATGTGATGC CTAATTATTTTCTTGCTGCTTTCAGATCTTCACTTTTTTTTAAAGATTCAGAGCTCTACTAACTCTGTGAAATTTAAAGTGACTTTTCCTTATCGAAGCA ACTATAATTAGCCAAATGGATTTGGAAACAGCTATGATGAAGCTGGAAGCACTGTTTATTTTGGCTCTGAACCAGGTTTTTGTAGATGGCCTCATCTGTT TTTGAAAATATGATTTATAGATAACCTGAAACAGTAATGTGGATTTGCATGAGTTTTGTAGTTAATACACTCTTTTTTCTTTTAATATAAATTAAGGGTC AAGGGAGGTTCTCCCATTCCAAAGTCAAGGCATGCTACAAAAATTAGGGTTGGCATTTGAACTTGCATAATATAATATATCCTCTCTTCTTCAGAACTTG CTATTTATTTCTAATAATTATTCTCACAATGATGTTTTCTACTTCAAAATTGCAAATGAAGTATTTGCTGCCAATACATAATCCGATCTGAATACTTATG TTTGTTAATTTCCCTTTGCTCATTATTTTATATGAACTATGAAAGCATGTGCAGAAGTGTATTGCTTTTAAAATCCTCATATTCCAACTGGACTTGTGCA TATTTTGCTATTTTTTCATTTGCAGAGAGAGTGTTCATAGAGGGTGCCTTGACACAAGGGTAAGGTCATTGTCTTCTGACCTGAAAGCTGGGGGTCATGT GTTTAAACAGCTCCTCAGTTTGTGGGTGAGGGTGTACATATACTCTCCCCAAAACTAGGTGGGAGTCTCATGCACGTGGTCACTATTTTTAGATAGGGTT CATATTCCAATAACCTAGGATGCATGGTGTGCGTTTAAATGATAAGATCTTGTGTTACCTCGTAATGATGCCTTGTATTTTAGTTGACAAGTTAGAGAAT GTGAATACTGGATGTTATGAGAAACGTTTTTCCTGGGTTCCATTTTCCTCATGAAGAGGTTGAAAATCGGTTAAGCTCTTCTATGATTTTTGTGCTTATT AAGAGGAAAATTTAAATTTCAATGTCTATTTGTCCTTATTGGCTTTTGCTGAATACCCAAGAAGAGATAATCACAATATATCTACACTCTAGAAATTCTG TGATTCAAGTAAGCTTCTAAACCTTAATGTTTTGATTCTACCTTTTGTTATTAGTTTCTTTATTACTATTTGGTAATCAACAAAGAAGCTAAATGACCAA GATTTTTCAGCTGTGAAAGAAGAGAGGTGGATGCCATTGATATGCTGTTTTAATATGTATGACACTGACATATTTCGATCAAATTTTGCAAAGCTCCAGA GCTATTTATCTATAAAGGTGACATCTTCATTGATTTTGATCCCAGGTTGGTCCCTTGAATTTAATGGTTGACTATCCTAAACTTATAAAGCATGCTGAAA TTCATGTCTTATAAGAAGTATTGACCTTTTAGGAGAGTCTATTGCTTACTATTATTAGTAACATTTGCATATTGAAGACCAATGGTTCTTGTGCTATATA TACAGGTTTAAGATTTTGCAATATGTTTTTCACCTCAAGTAATTTACAATTTTCTTGGATGCCTTCCAAGTGTAATTTACATAATTGAAATGTACACTCT CTAGTCCCCAAGATAAATGATTGCTCCCAATTTCATTGTGGTGTTGGTGCCATATTTGAATGGAATTTATTTGGCCCATATGAAAACTGTAGAAGCC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_147137; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_315921

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_315921

BlastpPutative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g64310 from Arabidopsis with 51.47% of identity
BlastxPutative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g64310 from Arabidopsis with 51.47% of identity
EggnogPentatricopeptide repeat-containing protein(ENOG410Z7Z7)
KeggLink to kegg annotations (AT1G64310)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019416125.1)
PfamPPR repeat (PF01535.19)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;