Ll_transcript_312561

• Id Trinity: TRINITY_DN46996_c1_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_312561
• Sequence: CTTCCCATCACCTTCCTTCATCATTTCCATTTCCCATTTTCTCTTAACCACACAAAACCAACTACTCCAAAATTTTCTCTTCTAATTTCACTTTCAATCC TGTTTATTTATTTCAAAACCAAAACCAAAATCAAAACCATTTTCCCATTCTTTCTTTCATCACAGTACTTCCACAATCATAAGAAACTCTTATCCCAAAA AAAAAACCTTGTGGTTCTCTTGAATATCAAACATTTGTCTTATTTCGTTTTTGCTATGTCAAGTACAGATCCATGGTTCTTATCATAAGCTCCACCACAC AATAGCAGAACCCTCCTCTATAAAAAAATAAAAAATAAAACCTTTTTTCACTTAAAACTTGAAGAGAAGAAGATTATGCAGTTCAAGCTCAACAAGCGTG TGACCCGAGTCACTAGATGGATCTTCATAAGGTTCTTTTCGACCCGACCCGGATACCGTCGAATGGGTTCTTCTTCTTCTTCAAGGAAACCCATGACGAA GAAGCTTATTTCATTGGGTCGTAAAATAACGATAAGAGCGAGATCTCTATGTTCTTCTTCGAAGTTCGGGTCAAGATACGGACCGATTGGGTCCGACCCA GTTGAAGATACAGTTCCGAAGGGTCATTTAGCTGTTTACGTTGGTCAGAAAGACGGAGACGGCGAGTTTTGCCGTGTTTTGGTTCCGGTAATATATTTCA ACCACCCGTTGTTTGGGGAGTTGTTGAACAAAGCTGAGAAGGTGAATGGGTTTGAACACCAAGGTGGGATCACGATTCCGTGCCGAGTCGCTGAGTTTGA ACGAGTCAAGACCCGAATTGAGTCCGGGTTCGGTGTTAACAGCGGCGGCTGCCGGAGATTAGCATTGCCGTGGTTTGGTAAATGATTTTTGCAAAACTGA TATAGATTCGTACTAAATCCTCACCCTCCTTCACATATGTTAATACTTTATCTATTAATAATTAATTTATATGGAATTTTTATTACTTTCATAGATTAGT ACGAGAATATAATAGTATAATCTTTTTATAACAAAATAAATATTTGATGAGTTGGTGTGACTCTCTAGAGTTAAAGTCGACCTCATAATTTAAAGATGAT GATGACGATATGGTAACGTGTTGATGCTGATGGTGAAATGATTTTGGTATTTTTATTAGGGTGGTTTTTTTTAAGTAATGAAATTTTTAGGTAGGTTTAG ATATTTGTCCTTGAACATGTGGTGTAATGGAACTTTGAATGTATTTGCATATAGGTTTTCCTTTGCTCCCATCACGTTGTTGTATAGCAATAATAATGTG CGTGCTTTTATAAGATATTAACAATATGTTATATTCTTTATCTTCGTTTTTCCATACAGTAATTAAGTTAGATAAGCTTTAGCTTATTAAAATAACTTAT AAACAGAAAATGACAAAGAACAATTTCAAATTTGACTGATAACAAACTTTTAAATAATAATGAAATAAAGATTTAATTAAAGGGAAATCAGTAATTACAC TTCTAACTCTAAACTTATCTATATGTCAAATTGTCAATGAACTTATCATCTCTAAAGATGAGGATTGCTGTTTCTAATCCTATTATCAACTGTGTATCAA GTCAATCATAATAAAAAGTAGATAATATTATAAATATTTAATTTTTTAATATATCATAATTAATTTGAGATAGACTTTAGAATCTTTCGATACTCTCACT GTCTCACATACTTCCAAATCAGTTTATCCCTTGAAAATTCAACCAATAAATTGTTGCCAACTACGCTAAGCTCAGCCCACTTCAGTCAATTTCTTCTCAT TTTCCATTGTCCTTTGTAGAATAATAACCACACCCTCCCTCATCACAAGTGCCAAAGTCATAAGCAATAAATTCCTTCAAAATTTTGTCATTAAACCATT AAAAGCAATCGGTGCATTCAAGATTTCTTCCTTTCCCCCATGATTATAAATATCTTACCCGGCTAGAAACTGATTCTCCTACCGTTACGAAACGATACGG TAGTTAGACATATTGAATATGTAATTAAATCAGTGAAAACTAATTAAATTGTATCTTACTCTATTAGAATATATATGGTGTTTGTAATATGATGTGTTGT GATATTTGGATTAATAGACTATTATTTTATTGAAGATTTACTTTGTTTCTTAATTTTATTTGAATTTACATATTCTTTATTTTTGTATTTAATTTATTAG ATATTACTTGAGTCATTATTATCTTATTTTATGTAACAACTTTTATCTATATAATAAATAATTGGACTAACTCATATTTGAGTTTGATAAATCTTTACAT TACAATATTTTAAATGATATCAGAGTGGTGTCATCTTTTGTGAGCTAATAATAAGGGTAAAAGTTTGAGCTTGAAGTATTTATGAAAAAATCTAATCTGA TCTAGCCTGTTGTAGGTTGGGTGATAGATCATGATAAGTGGTCTGACCTATTTTTACATATGACCAATTAGGTCACTGTTTTTCTACATAGATGTATAAT CAATCTTTATTATTATAAACTTCTTCAACATAGTGAGTTGTTTGTAACATGGTGAACTTTTAACCATTTCTGAAGTTGAGTATATCTTATAAATAATAAT ATTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_148871;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_312561

FPKM

• PAB: 82.9
• PNAB: 6.3
• PS1: 13.7
• PS2: 3.3
• PS3: 5.9
• PW1: 20.9
• PW2: 35.7
• PW3: 34.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_312561

• Blastp: Auxin-responsive protein SAUR36 from Arabidopsis with 52.08% of identity
• Blastx: Auxin-responsive protein SAUR36 from Arabidopsis with 49.68% of identity
• Eggnog: auxiN-responsive(ENOG410YVYP)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G45210)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019435417.1)
• Pfam: Auxin responsive protein (PF02519.13)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;