Id Trinity | TRINITY_DN47096_c1_g1_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_372499 |
Sequence | AAAATAGAGAGAAAATAGTAAAGACGGAAATGACGGAGGTGGGACCCGCTTCAATTGACCCCACTCTTCTCTCGTTCTTATCCATTTCCACTCTCTCAAC CCTTCCTTCTGCCACGTGTCACTCATCCGCTGGCGTCTTCTTTCCACTTTCTTATTCTTCCTTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTTCCTTCACTCTCCTCA ACACAACCCTTCATTCCATTCCACGCTTTTTGCGCTCTCTCACTTTCTCTCTCTATCTCTCTCACTTTCTCTCTCTAAAACATGCTTCGTTAATGGAGTT CTCTTTCTCCACTCATGCTTTACGATTTTCCGAAGTTCGCTCGAACAATGTTTTGCTCTAAAATGGGAACTTGACTTTCTTTGTAGCATTCCATGCATTT ATGAAAAAAGCGTGTAAATAGTTTAAGTGATGGGGGGTATTTGTTCTAGAAAGAGAGATCAACAAGTTATTGAAGACGATTTTCGCAGAGGAGTGTTCGG AAGATATTGTAGAAATGCTAGCACAAAATGGTTAGGAGCTAGAAGTTTACGTTCCAAGGCAAATCATTGCCCTGGAGGGGGAAGCATCCCCTCCCTCATG GAGTTGTGCATATATAAGATACGCGAGGATTTTAGTAAGTACAACTCCTTTTCAATTCTTCCGCGGGACATAAGCCAGCAAATCTTCAATGAATTGGTGG ATTCTCATTGCTTAACGGAAGCATCTCTTGAAGCTTTTCGAGATTGTGCTCTTCAGGATGTTTACTTGGGTGAATATCCTGGAGTCGATGATGGTTGGAT GGATGTCATATCTTCGCAAGGATCATCTTTACTTGCGGTTGACCTTTCTGATTCTCATGTGACAGATAATGGTTTGCGTCTTCTAAAAGTTTGCTCAAAT 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ATAATGTAATTCGTTCTGATCTTGATGTTTCCCATTTTAATAGTTGTTTGCCGATAGATTTAGGTGCTCGGTATTATAGTTTCTTATGTAATTATTGTAA TGTATTCGAATAGAGTTGTGAACATCATGTTATGTGGTTTTTAATTTTCTGTTTTGCCGTATTGCGTGTAATTTGTACACATGTTCTTTATTTGATATTT AATATAGCATGTATTGCAACTAAAAAAAAAAAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_149729; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_372499
Blastp | F-box/LRR-repeat protein 14 from Mus with 31.03% of identity |
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Blastx | F-box/LRR-repeat protein 14 from Homo with 31.03% of identity |
Eggnog | protein ubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process(ENOG410YK3H) |
Kegg | Link to kegg annotations (101358) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000802) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453071.1) |
Pfam | Leucine Rich repeat (PF13516.5) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |