Ll_transcript_499764

Id TrinityTRINITY_DN47362_c0_g1_i16
Name TranscriptLl_transcript_499764
SequenceAAAAAATAGTATTACTTTGCATTGTAAGAGAATATATGAAATTGGTATAAGGGAATTTTAGTAGTAATGTCTTCACAAGAAATAAGTGGTCCGAAAAGAA ACGACAGTCGTTTAATCTTGCTTTCTCTCTGCGCCATTTGTGGTGTGTGTAACTCCTCATGCTATGATTCTTGATTCTTTATACCAAACTTTTCTTCTTA GGTTATCGCAATTTCAATCCTTCTTCTCTCAATTTATTTACTTCACAGATTCAACTGTTTCTTATTTCACTGCTACTGCACCCAACAAATTGAATTCAAC CACTGGTAAATTCTTTTCATTCTATCGTTCTCTTCATTTAGGGTTTTTAGGTTCTGATTCTCGAATTGAATTTTGTTTCCTCTTTATTTTTGAAATTTGA TTTCTATGTTGATGTTTTAGCTTGTTTGTGGACATTGGCGATTGCTCAAGAAATTTATCACTGCCTAAATTTATGTGAATTTCTCTTTTCATGGTTTTTT TGTTTGTTATTGTAATTACAATAGTATGTTTTTTAATTTATGAATAAATTTGTTTACGAGAAGATTATATGGAGTGTAAATTTAGCAAGAGGTAGATAAA TCCTACTATGAAAGTAAATATTGGAGATTATACCATACTACAAGTTAATAAATTTAAGTATCTTGGGTCAATCCATAAAATATGACGAAAATTGATGGAG ATGTAAACAATAAAATTCAAGGAGGGTGAATGAAATGATGGGATGCATCAAGTGTCATATGTGATATAAAAGTTCTACTCAAACATAAAGGAGATTTTTA CCGCACAACTCTAATATACAAAATGTTATATTATATTGAACATTGGGCAATAACAGGTTAATAAGAGATTAAACTCAATGTAGCATATTTGAAAACTGTT GCACCGAATGAGTGAAGTAGTGAAAATACTAAACAAGATAGTATTATGAATAATGCATTAAGTAGAAATTTTGAGTTTCTCCTATTGTAGAAAACAGGGG TGAGCAGGACCCGTCCGACCCGCTTACCCATTTAACATCAATATCGGGCCCAAATATGGTTGGATTTCATTAGGTTTAAGACTGAGTTAAAAAATTAGAC CTGATCAATATTTAAGATTGAGTAAAAGGCAAACATGAACTGACTCAACCAGTCCTATGTTCACTCATTCATCATATTCGTATGTGCCTATTCAATTGTA TATAAAATAATGACATCTTTTTGGCCCAAAATATCATTGGTTCTCTAATTTTTCATCATTTATACATGTGCGTAAATGATTAACAAAATATATACATATA CATAATTTCATATATCAAATTATGTATCCAGAAGAATAAGTTGTATTGAGAAAACTTTATCTAAAATGGGTATGCATTATATTTAATCGAGTCTAGGATA AGGTATGAGTTTAAAAGATGGACTGACCAACATTTGGGTTTGGGTTAGTCTTTGTGTCTAGGGCTGAGTTCGGGTTCAAAAAAATAACCCAACCAACATT TAGATGTTAATGCTTTCTCAATGGACATGATTATGATAGAACATTATGGCATTGTTGTTGGTTGGTAATTTTAAGATTCTGTCTTTTGGACTTTAAGATG TTGTTGTAAACTATATCATCAATCTTGCTTCTGGTTGCTACTTGCACATGGAATGTAGGGTTTAACCTACAAAAGCCAGTTCTTGTTATCACTTTGTGCT ACAGGGATATTGAAATGTTGTTTCCTGTTGTCTGATAATGTCTTTGCTCTCTTTTGATCTGGGCAATACTTTATATATATTGGGATTGTTATGATGCTTG TGATAGCGACATTATAGATATGCCCCAACTCTAACTACCATTGTGTACTCACTGCTTGGTAGATACTTGAGGTGCGTTCCTTTCAGGTGTGTTCCTGTGT GTGTGTGTGAATTTTTCGTTCTTGGGAAATCTGTTTTATTGAGAGGAGAATTATGAATATGATACACCGAATTTGCTTGTTTGATTACGACATGCAACGT AAGTAAGTTCATGTTGGGGGATACAAGCCCTATGCAAATATGGAAATGTGTGGAAACTTGTATAATAGTTAGTTCATTTGGTGTGCCTCTCCTAGGCATT CACTGTTCCCAAACTCTTCTTCTCTGTATCTTATCTGAATTTGTATTATTAACTAGCTCAGGCCTTTTGTTAATTTGGTACTGCGAAGGTCTCATTTAAT ACATGGAATTACTTTCTTGCATAATCAGACTGGGAATGGAATGACCCTTCCTGTTCTGCAGTTTAATTTTCTCAGTAATAGAATTGCATTTTTATTTTTT AATACAATACATGACATTATGCTTTTATGTTTGGTACATAGAATCAATTCATATCAAAATACAAGCATAAATCTGACTACTGAAGATAAATAGGGAATGA GGAAATAAAACAAAATTTAATTTGTTGTAGCCATCAGAAATGTCTATTCTCATGTCTCTTGAACGGAATAGGAATTTGTCTTTAGAAACTTGAGGCATGG AATCAAAGTCCTTCCTACCAAACCTTGTGATCCTTCTCTAATGGAATAGTAGTACTAGTAAGGACTGAATGACAACGTTACATACCAAAATTGTTTATGT TTTTTAGAGTTAGGCCAGTGATTGACATGAGTGAACCTCTTAAGGGAAAAACTTTATTTATTAAAGTTGCACTTCTGCTGAAAATAATGATCAACTTTGC TGGAAATTGGGGCTTGGAAAATTATGATATAATTGTAATTGATTTATATGATGCTTACCAGGTTTCTTACCGATGAAGATGTCCATTAAAAGCGAACAGG GTTGCAATTTCATACTGGTGTAGTGTCTTGTTGAAGAACATTCCACTGTGTCCATGGCTGCTGATCAGAGGAGAAAGCGATTAAATGGCGCGACCATTAT TGGTTATGGTCACAGAGAGCAAAACAGGAATAAAAGAAAGAACTTGGGATCTGCTCAAAATGATTTAAGCATGAAATCTCACATTGCTATTGAGTGGGAT GCTAATCAGAAAAGGGTTGTTTCCAAGCCAGAGCAGATTGGCATCAGTTGGAGGCATATGAAACCATTTGTCAATTTTGTCTCTGAAGATCACAATGTCT TGGCAGACGTGTTTACCATACCTGAAGAAATTTTTGATTTGGACAATTTAACTGAAGTGCTTTCATATGAGGTTTGGAAGACTCATCTATCAGAAAATGA AAAAAGCCTTCTTATGCATTTTCTACCCAGTGCCTTTGAGCCACATCAATCTGTAGAAGAATTACTTTCTGGGAATAAATTTCACTTTGGCAACCCCTTC TTGAAATGGCAAAATCTCTTTCTTTGTATTTCTAGACACATAATCTGCTGTGCTTAGCATTTCATCTATCCATGCATGTAAACATATGCAACATAAAGTT TCTAATTTTGGATGACTGATTGGATTTTAGTTATCGGTTAAATACTAAGCTGGTTAGCTTTATTATTAGTTCCTGGGTTGAGTTGACCATCTTTACCAAT TTTCAGGTATAAATTCTGTTTTGCGGACTTTTTGAAATTCGAAATTCAGTCTAAGTTTCATCATCTTACATGATAATAGTCCGTATGATAGAATAAGGTG AAGGTTAGGATGAGATATAAAGGATCAGGCCTTCAAAATTGTATGGATCACACAGTTACCTCAAGTAACTTCCCTGTCACACTCCGTTACCTAACTGCTG ACGTAGCAGTTTAAGTGTTGTAGTTGGGAAGAAGATATAAGAAAGGGAAGCAAGAGAGAAGAGAGGGTAAAGAAAGTGTAGAAGTAACTCGGTGGGAGAC AAATAGGCACTCTCGAACTTGATTGCCATAATTTGTATTCAGTTTTCAGGTGTTTTTCTTTTGTTTTATCTTTCCATCATCCCCTTTGCTCTTAATATTA CCGTGACATGACATCAGTGAGGGGACTTTTGTGTGTAATTCTGGTCTAATTTTATCTCAGAATATTGATTCACTTTTCTAGAATCTTCCTTTTGCTTCAT AGAAAATTTCTCAATTTTGTAACTTGAAGAGGGATTTCGTTGAATGTGAAGAGGGATTTAGTTGTAATATTTTTCACTGTTCATTGTTTCTACTTAAATT TTGTGGATTCGTTTATTTGGCTACCATTTCAATGATCATCTGGGTTATATGATTTTTTTTTTTGCTCAATTCTGTTGGTGATGACACCTTTTTTCAATCT GCAAAATATCCTTCTTGCTTGCCAAAAAACAATCCTTGTTTCCTTGTAATGTTGGGAAGTATTTCTAAGACATTGAATGAAATTTGTCTAGTTTGGTGAT CATTCACTAAATCTTCTCCTTTGTGAAGTCAAAATTATCCTTTAATATTTATATATATATGCAGGGGTGCTTCACTTTGTCTAGGTGATCTTCATCCAGA TGTGATCATTGACCGGGAGCAGCATCTGAAGTCTGAGAAGAGAGCATACTACTCACAGTTACATAATTATCACAAGGGAATGATTGGATTTCTAACTAGG TTGAAGAAAAGGTGGCAAAGCAGCAAATATCCAGAAAAGGAAATTGCACATAAGATGTGGAGGTCAAGGAATGATGTAGAGAAAATAATGCCATCAAGTG TGAATGGGTCTAGACTTTATGATCATGATGGTAATCTTACACTGACATCTGGGTCTTGTTCCTGGGATGCAGAGGATAGAGCATGTAGCAGTGACAACCA AATTTCTTCACTGAGAAAGGACGATAAACTTCAAAGAAGGGTGCTCGAAAAAGGCCTTGTTAAAGGAAAATCTACAAATTTGATATATTCTTCAGATGAT ATTCTTAATGTGGGAGAAAGGCCCAACAAAGGAGACAAACTACCCAAGCATAACATTCATTCTAGTGAAGGTGACAAATACATGTCATGTATCAAGATTA GTAAGCAGCAGCATGAACTTGTTAAAAATATGAAGCAGTTGGGTAAAAGCATCCAATCTAGGTCTCTTAACCGTGTTTTGGGTAACCTTGATAACATTCA TGTGCAACCATATGAAGTATTTGTCAAAGAAGAACAGAAGAAGTTGCATGAGCATTGGTTGAAATTGGTGAACAAAGACCTCCCTGTGGCATATGCAAAC TGGACACAGAGACAGATACAAAGACATGAAGTGAGAAATTCATTGGTAGCAGAGATGAAGGAAAAATCAAATCCACTCCTGGAGGAAGAGGATAATGTGG ACTCAGGGAGCGATCTTCGGGATCAGGATGAGGATAACATGAGCTCAGGGAGCGATCTTCAGGATCAGGATAATGTTAACTCGAGGAGCAAACTTCAGGA TCAGACTGAGGATAACATGAGCTCAGGGAATGAGCTTCAGGATAAGGATGATGACAATATGAGCTCAGGGAACGACTTTCCGGATCAGGAGGAGGATAAT GTCAGCTCAGGGGGAGAGCTTCAGGATGAGGATAATGTGAACTCGGGGAGCAAACTTCAGGATCAGGATGAGGATAACATGAGCTCAGGGAACGAGCTTC CAGATCAGGTGGGGGATACAGGTCTAAATGTGCAGTTTAGCTCGAAAGATGATGAAGATTCTATTGGCAGGTCCTCAAAGAACCAGTCCCCACATAATTC TCATCTTGGAGATGCATTGTTCATCCCAGTGAGTATGGGTTCAGAGAAGAATATTGTTTCATCAAAGCAAGCTGATGCTTCACCGAATAAAGTTGAGTAC TCAAGGAATATGAACAATGAGGATGTTTCTATTAATGAAGGGTCCACACATAATTCTTATCTTAGAGATGAATTCTTCAACCCAATGAGTATGGGTCCCG ATAAGAATATTATTTCATCAAAGCGAGCTGATGCTGCACTGAGTGAAGTCGAATATTCAAGGAATATAAACCCTGAGGATGTTTCTATTAATGAAAGGCC CATACATGATTCTTATCTTAGAGAAGAGAACTCAGTGAGTATGGGTTCAGAAAAGAATGTTGCTTTATCTAAGCAAGCTGTTGCTTCACCGAATGTTGAG TATTCAAGGAATATGAATACTCAGAATGTTTCCATTAATGAAGGTTCCGCACATAATCCTTATCTAAGAGATGAATCATTGAACACAGTGAGTACTATGG GTTCAGAAAAGAATATTGTTTCTTCAAGGAATATGAACACTCAGCATGTTTCTATCAACGAAGGAGCATCTTTTGCTTCTGGCAGTGATGTCTGGCAAGC AGTTGAAATGCCACATGCATACTATGATTCTGCTGTGACCCATGAGTATACATCCAGTGGGTTATCACTGGCAAATCCTCAAGTCAATGGAGAGCAACAG ACCCGCCTGACTGATATTCAACCTGATTTGGATCACCTAGAGACAGATAAAGAGTTGTTACACCAACAGTTCGGTGATGGAACCTTCAGCTCTTACCAAA ATCAAGACCGAAGTAACATTTTCCAATCTCTCTTCAAGGGGGAGGGGATGTTGTCCTATCATCCTGAACAAAAAAGAGATGAAGTAGACTTTAAGCCTTC AAACAATGTTATGATAGGGGATGAACAATTTTCCAGTCATTTTAAGGAGCCATTGCAAACATCACTGACATTGGACCAGGGGCATAGAAGAGCTAATGAG GTTTACTTGCCAGTAAACATGCCAGATAATATTTATTCTGATAGAGGGAGGTACTTAATCCCCACCGCAGATCCACTGGCCTTCACACGACAACCGTTGC CTGTGGTAAGTATGACTGGTTGGTCTGCTAATACTGCTCACATAGCTGCACCTCCTCAATCTAACTTAAATAGCAGAGATTTTATTGATCATCATTGGTT TCCTGCTGACCATCATATTCGTGCTGGCTGGAATGGGTCTAATGACAGTAGTGCTTTGGGTCAGAGTCTTGGCACTCGACCAAACACTGATCCGAGCTTA TTTAATATTTTATCACAGAGTGGCCATTTGCGTTCAGGTAACCCTTATGATTCAGTCAGAAACACTGATCAGTTTCTTGCGCCAAGAACATATGGAGAAT TAGATGCAGCTATGCCCAGGCCCAATGCTGTAATACCACAGACTCCTCATGCACCAGGTTATTTCAGTGGGCATGAGGCACCTAGTGGTATGGTTCCCGA TGATATGGCACGAATGAGCTTGCCGCATCAGAATTCTGCATTACATGATCAAATGGGAAAGTCATACTTGAGGTCATGGAACCAGCAATGAATGTTTTAG CCAGTGTGAGTCAGGGTGCAGAGCTCGACTGAAGATAGAAGAAATGCTCATATGCTGTGTAATAGTATTTAGGCAAAGACTCGATGAAGCTGGTGTTACA TACCCCGAGAGAGATAGGTTTCTGTACATACCTATACCGAAGTCAACTCAATACCATGTACATACCTAGATATTAGATGGGCAGGAAAATCAAAGGGGTA AGATGAGCTTCAAGAATTTCAGGTTGTTAGGCAAGTTATATATTTTATTTTTTATTTGATTTTGGAGACATAATTCAATAATTTTGGAAGTTAAGCAATG CAGGAGGCTGGTGCTCCTTTTGAAGTTATATTTATTTTGGTTCCTTTTCATAATTTCTTCATGTGCTAGTGATGCTGAAATAAATGGTCTTCTTTGGGCA TATTTTGATTGTTCCAACCAAACTAAGTTATAGTAATTGGATATAACCCTGTGTAGTGTGTACTGTTGCCTGGGATATAATTGCCTAAATGGACAAAAGA ATAAAATCTCTGTAGATGAGCATGGTTAGATGACAACTTTTGGGGTCAATTAGACACCAAATCTCTTTTTACCAGTAGCTGTTCTTAAACTTTGTAGCTA ATTCGTAAGTGATATATAAAGTGATACACTCTAATTCGTAAGTGATATATAAAGTGATACACTCTAATTCGTAAGTGATATATAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_151998; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_499764

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_499764

BlastpDEAD-box ATP-dependent RNA helicase 26 from Arabidopsis with 32.38% of identity
Blastx-
Eggnogpurine NTP-dependent helicase activity(COG0513)
KeggLink to kegg annotations (AT5G08610)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019427421.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;