Ll_transcript_499750

Id TrinityTRINITY_DN47362_c0_g1_i3
Name TranscriptLl_transcript_499750
SequenceAAAAAATAGTATTACTTTGCATTGTAAGAGAATATATGAAATTGGTATAAGGGAATTTTAGTAGTAATGTCTTCACAAGAAATAAGTGGTCCGAAAAGAA ACGACAGTCGTTTAATCTTGCTTTCTCTCTGCGCCATTTGTGGTGTGTGTAACTCCTCATGCTATGATTCTTGATTCTTTATACCAAACTTTTCTTCTTA GGTTATCGCAATTTCAATCCTTCTTCTCTCAATTTATTTACTTCACAGATTCAACTGTTTCTTATTTCACTGCTACTGCACCCAACAAATTGAATTCAAC CACTGGTAAATTCTTTTCATTCTATCGTTCTCTTCATTTAGGGTTTTTAGGTTCTGATTCTCGAATTGAATTTTGTTTCCTCTTTATTTTTGAAATTTGA TTTCTATGTTGATGTTTTAGCTTGTTTGTGGACATTGGCGATTGCTCAAGAAATTTATCACTGCCTAAATTTATGTGAATTTCTCTTTTCATGGTTTTTT TGTTTGTTATTGTAATTACAATAGTATGTTTTTTAATTTATGAATAAATTTGTTTACGAGAAGATTATATGGAGTGTAAATTTAGCAAGAGGTAGATAAA TCCTACTATGAAAGTAAATATTGGAGATTATACCATACTACAAGTTAATAAATTTAAGTATCTTGGGTCAATCCATAAAATATGACGAAAATTGATGGAG ATGTAAACAATAAAATTCAAGGAGGGTGAATGAAATGATGGGATGCATCAAGTGTCATATGTGATATAAAAGTTCTACTCAAACATAAAGGAGATTTTTA CCGCACAACTCTAATATACAAAATGTTATATTATATTGAACATTGGGCAATAACAGGTTAATAAGAGATTAAACTCAATGTAGCATATTTGAAAACTGTT GCACCGAATGAGTGAAGTAGTGAAAATACTAAACAAGATAGTATTATGAATAATGCATTAAGTAGAAATTTTGAGTTTCTCCTATTGTAGAAAACAGGGG TGAGCAGGACCCGTCCGACCCGCTTACCCATTTAACATCAATATCGGGCCCAAATATGGTTGGATTTCATTAGGTTTAAGACTGAGTTAAAAAATTAGAC CTGATCAATATTTAAGATTGAGTAAAAGGCAAACATGAACTGACTCAACCAGTCCTATGTTCACTCATTCATCATATTCGTATGTGCCTATTCAATTGTA TATAAAATAATGACATCTTTTTGGCCCAAAATATCATTGGTTCTCTAATTTTTCATCATTTATACATGTGCGTAAATGATTAACAAAATATATACATATA CATAATTTCATATATCAAATTATGTATCCAGAAGAATAAGTTGTATTGAGAAAACTTTATCTAAAATGGGTATGCATTATATTTAATCGAGTCTAGGATA AGGTATGAGTTTAAAAGATGGACTGACCAACATTTGGGTTTGGGTTAGTCTTTGTGTCTAGGGCTGAGTTCGGGTTCAAAAAAATAACCCAACCAACATT TAGATGTTAATGCTTTCTCAATGGACATGATTATGATAGAACATTATGGCATTGTTGTTGGTTGGTAATTTTAAGATTCTGTCTTTTGGACTTTAAGATG TTGTTGTAAACTATATCATCAATCTTGCTTCTGGTTGCTACTTGCACATGGAATGTAGGGTTTAACCTACAAAAGCCAGTTCTTGTTATCACTTTGTGCT ACAGGGATATTGAAATGTTGTTTCCTGTTGTCTGATAATGTCTTTGCTCTCTTTTGATCTGGGCAATACTTTATATATATTGGGATTGTTATGATGCTTG TGATAGCGACATTATAGATATGCCCCAACTCTAACTACCATTGTGTACTCACTGCTTGGTAGATACTTGAGGTGCGTTCCTTTCAGGTGTGTTCCTGTGT GTGTGTGTGAATTTTTCGTTCTTGGGAAATCTGTTTTATTGAGAGGAGAATTATGAATATGATACACCGAATTTGCTTGTTTGATTACGACATGCAACGT AAGTAAGTTCATGTTGGGGGATACAAGCCCTATGCAAATATGGAAATGTGTGGAAACTTGTATAATAGTTAGTTCATTTGGTGTGCCTCTCCTAGGCATT CACTGTTCCCAAACTCTTCTTCTCTGTATCTTATCTGAATTTGTATTATTAACTAGCTCAGGCCTTTTGTTAATTTGGTACTGCGAAGGTCTCATTTAAT ACATGGAATTACTTTCTTGCATAATCAGACTGGGAATGGAATGACCCTTCCTGTTCTGCAGTTTAATTTTCTCAGTAATAGAATTGCATTTTTATTTTTT AATACAATACATGACATTATGCTTTTATGTTTGGTACATAGAATCAATTCATATCAAAATACAAGCATAAATCTGACTACTGAAGATAAATAGGGAATGA GGAAATAAAACAAAATTTAATTTGTTGTAGCCATCAGAAATGTCTATTCTCATGTCTCTTGAACGGAATAGGAATTTGTCTTTAGAAACTTGAGGCATGG AATCAAAGTCCTTCCTACCAAACCTTGTGATCCTTCTCTAATGGAATAGTAGTACTAGTAAGGACTGAATGACAACGTTACATACCAAAATTGTTTATGT TTTTTAGAGTTAGGCCAGTGATTGACATGAGTGAACCTCTTAAGGGAAAAACTTTATTTATTAAAGTTGCACTTCTGCTGAAAATAATGATCAACTTTGC TGGAAATTGGGGCTTGGAAAATTATGATATAATTGTAATTGATTTATATGATGCTTACCAGGTTTCTTACCGATGAAGATGTCCATTAAAAGCGAACAGG GTTGCAATTTCATACTGGTGTAGTGTCTTGTTGAAGAACATTCCACTGTGTCCATGGCTGCTGATCAGAGGAGAAAGCGATTAAATGGCGCGACCATTAT TGGTTATGGTCACAGAGAGCAAAACAGGAATAAAAGAAAGAACTTGGGATCTGCTCAAAATGATTTAAGCATGAAATCTCACATTGCTATTGAGTGGGAT GCTAATCAGAAAAGGGTTGTTTCCAAGCCAGAGCAGATTGGCATCAGTTGGAGGCATATGAAACCATTTGTCAATTTTGTCTCTGAAGATCACAATGTCT TGGCAGACGTGTTTACCATACCTGAAGAAATTTTTGATTTGGACAATTTAACTGAAGTGCTTTCATATGAGGTTTGGAAGACTCATCTATCAGAAAATGA AAAAAGCCTTCTTATGCATTTTCTACCCAGTGCCTTTGAGCCACATCAATCTGTAGAAGAATTACTTTCTGGGAATAAATTTCACTTTGGCAACCCCTTC TTGAAATGGCAAAATCTCTTTCTTTGTATTTCTAGACACATAATCTGCTGTGCTTAGCATTTCATCTATCCATGCATGTAAACATATGCAACATAAAGTT TCTAATTTTGGATGACTGATTGGATTTTAGTTATCGGTTAAATACTAAGCTGGTTAGCTTTATTATTAGTTCCTGGGTTGAGTTGACCATCTTTACCAAT TTTCAGGTATAAATTCTGTTTTGCGGACTTTTTGAAATTCGAAATTCAGTCTAAGTTTCATCATCTTACATGATAATAGTCCGTATGATAGAATAAGGTG AAGGTTAGGATGAGATATAAAGGATCAGGCCTTCAAAATTGTATGGATCACACAGTTACCTCAAGTAACTTCCCTGTCACACTCCGTTACCTAACTGCTG ACGTAGCAGTTTAAGTGTTGTAGTTGGGAAGAAGATATAAGAAAGGGAAGCAAGAGAGAAGAGAGGGTAAAGAAAGTGTAGAAGTAACTCGGTGGGAGAC AAATAGGCACTCTCGAACTTGATTGCCATAATTTGTATTCAGTTTTCAGGTGTTTTTCTTTTGTTTTATCTTTCCATCATCCCCTTTGCTCTTAATATTA CCGTGACATGACATCAGTGAGGGGACTTTTGTGTGTAATTCTGGTCTAATTTTATCTCAGAATATTGATTCACTTTTCTAGAATCTTCCTTTTGCTTCAT AGAAAATTTCTCAATTTTGTAACTTGAAGAGGGATTTCGTTGAATGTGAAGAGGGATTTAGTTGTAATATTTTTCACTGTTCATTGTTTCTACTTAAATT TTGTGGATTCGTTTATTTGGCTACCATTTCAATGATCATCTGGGTTATATGATTTTTTTTTTTGCTCAATTCTGTTGGTGATGACACCTTTTTTCAATCT GCAAAATATCCTTCTTGCTTGCCAAAAAACAATCCTTGTTTCCTTGTAATGTTGGGAAGTATTTCTAAGACATTGAATGAAATTTGTCTAGTTTGGTGAT CATTCACTAAATCTTCTCCTTTGTGAAGTCAAAATTATCCTTTAATATTTATATATATATGCAGGGGTGCTTCACTTTGTCTAGGTGATCTTCATCCAGA TGTGATCATTGACCGGGAGCAGCATCTGAAGTCTGAGAAGAGAGCATACTACTCACAGTTACATAATTATCACAAGGGAATGATTGGATTTCTAACTAGG TTGAAGAAAAGGTGGCAAAGCAGCAAATATCCAGAAAAGGAAATTGCACATAAGATGTGGAGGTCAAGGAATGATGTAGAGAAAATAATGCCATCAAGTG TGAATGGGTCTAGACTTTATGATCATGATGGTAATCTTACACTGACATCTGGGTCTTGTTCCTGGGATGCAGAGGATAGAGCATGTAGCAGTGACAACCA AATTTCTTCACTGAGAAAGGACGATAAACTTCAAAGAAGGGTGCTCGAAAAAGGCCTTGTTAAAGGAAAATCTACAAATTTGATATATTCTTCAGATGAT ATTCTTAATGTGGGAGAAAGGCCCAACAAAGGAGACAAACTACCCAAGCATAACATTCATTCTAGTGAAGGTGACAAATACATGTCATGTATCAAGATTA GTAAGCAGCAGCATGAACTTGTTAAAAATATGAAGCAGTTGGGTAAAAGCATCCAATCTAGGTCTCTTAACCGTGTTTTGGGTAACCTTGATAACATTCA TGTGCAACCATATGAAGTATTTGTCAAAGAAGAACAGAAGAAGTTGCATGAGCATTGGTTGAAATTGGTGAACAAAGACCTCCCTGTGGCATATGCAAAC TGGACACAGAGACAGATACAAAGACATGAAGTGAGAAATTCATTGGTAGCAGAGATGAAGGAAAAATCAAATCCACTCCTGGAGGAAGAGGATAATGTGG ACTCAGGGAGCGATCTTCGGGATCAGGATGAGGATAACATGAGCTCAGGGAGCGATCTTCAGGATCAGGATAATGTTAACTCGAGGAGCAAACTTCAGGA TCAGACTGAGGATAACATGAGCTCAGGGAATGAGCTTCAGGATAAGGATGATGACAATATGAGCTCAGGGAACGACTTTCCGGATCAGGAGGAGGATAAT GTCAGCTCAGGGGGAGAGCTTCAGGATGAGGATAATGTGAACTCGGGGAGCAAACTTCAGGATCAGGATGAGGATAACATGAGCTCAGGGAACGAGCTTC AGGATCAGGTGGAGGATACAGGTGTAAAGAATCCGTCCAACTCAAATGATGATGAAGATTCAATTGTTAGGTCCCCAGAGAACCATTCCCCAAATAATTC TTATCTTAGAGATGAATTCTTCAACCCAATGAGTATGGGTCCCGATAAGAATATTATTTCATCAAAGCGAGCTGATGCTGCACTGAGTGAAGTCGAATAT TCAAGGAATATAAACCCTGAGGATGTTTCTATTAATGAAAGGCCCATACATGATTCTTATCTTAGAGAAGAGAACTCAGTGAGTATGGGTTCAGAAAAGA ATGTTGCTTTATCTAAGCAAGCTGTTGCTTCACCGAATGTTGAGTATTCAAGGAATATGAATACTCAGAATGTTTCCATTAATGAAGGTTCCGCACATAA TCCTTATCTAAGAGATGAATCATTGAACACAGTGAGTACTATGGGTTCAGAAAAGAATATTGTTTCTTCAAGGAATATGAACACTCAGCATGTTTCTATC AACGAAGGAGCATCTTTTGCTTCTGGCAGTGATGTCTGGCAAGCAGTTGAAATGCCACATGCATACTATGATTCTGCTGTGACCCATGAGTATACATCCA GTGGGTTATCACTGGCAAATCCTCAAGTCAATGGAGAGCAACAGACCCGCCTGACTGATATTCAACCTGATTTGGATCACCTAGAGACAGATAAAGAGTT GTTACACCAACAGTTCGGTGATGGAACCTTCAGCTCTTACCAAAATCAAGACCGAAGTAACATTTTCCAATCTCTCTTCAAGGGGGAGGGGATGTTGTCC TATCATCCTGAACAAAAAAGAGATGAAGTAGACTTTAAGCCTTCAAACAATGTTATGATAGGGGATGAACAATTTTCCAGTCATTTTAAGGAGCCATTGC AAACATCACTGACATTGGACCAGGGGCATAGAAGAGCTAATGAGGTTTACTTGCCAGTAAACATGCCAGATAATATTTATTCTGATAGAGGGAGGTACTT AATCCCCACCGCAGATCCACTGGCCTTCACACGACAACCGTTGCCTGTGGTAAGTATGACTGGTTGGTCTGCTAATACTGCTCACATAGCTGCACCTCCT CAATCTAACTTAAATAGCAGAGATTTTATTGATCATCATTGGTTTCCTGCTGACCATCATATTCGTGCTGGCTGGAATGGGTCTAATGACAGTAGTGCTT TGGGTCAGAGTCTTGGCACTCGACCAAACACTGATCCGAGCTTATTTAATATTTTATCACAGAGTGGCCATTTGCGTTCAGGTAACCCTTATGATTCAGT CAGAAACACTGATCAGTTTCTTGCGCCAAGAACATATGGAGAATTAGATGCAGCTATGCCCAGGCCCAATGCTGTAATACCACAGACTCCTCATGCACCA GGTTATTTCAGTGGGCATGAGGCACCTAGTGGTATGGTTCCCGATGATATGGCACGAATGAGCTTGCCGCATCAGAATTCTGCATTACATGATCAAATGG GAAAGTCATACTTGAGGTCATGGAACCAGCAATGAATGTTTTAGCCAGTGTGAGTCAGGGTGCAGAGCTCGACTGAAGATAGAAGAAATGCTCATATGCT GTGTAATAGTATTTAGGCAAAGACTCGATGAAGCTGGTGTTACATACCCCGAGAGAGATAGGTTTCTGTACATACCTATACCGAAGTCAACTCAATACCA TGTACATACCTAGATATTAGATGGGCAGGAAAATCAAAGGGGTAAGATGAGCTTCAAGAATTTCAGGTTGTTAGGCAAGTTATATATTTTATTTTTTATT TGATTTTGGAGACATAATTCAATAATTTTGGAAGTTAAGCAATGCAGGAGGCTGGTGCTCCTTTTGAAGTTATATTTATTTTGGTTCCTTTTCATAATTT CTTCATGTGCTAGTGATGCTGAAATAAATGGTCTTCTTTGGGCATATTTTGATTGTTCCAACCAAACTAAGTTATAGTAATTGGATATAACCCTGTGTAG TGTGTACTGTTGCCTGGGATATAATTGCCTAAATGGACAAAAGAATAAAATCTCTGTAGATGAGCATGGTTAGATGACAACTTTTGGGGTCAATTAGACA CCAAATCTCTTTTTACCAGTAGCTGTTCTTAAACTTTGTAGCTAATTCGTAAGTGATATATAAAGTGATACACTCTAATTCGTAAGTGATATATAAAGTG ATACACTCTAATTCGTAAGTGATATATAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_151998; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_499750

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_499750

BlastpDEAD-box ATP-dependent RNA helicase 26 from Arabidopsis with 30.23% of identity
BlastxDEAD-box ATP-dependent RNA helicase 26 from Arabidopsis with 32.38% of identity
Eggnogpurine NTP-dependent helicase activity(COG0513)
KeggLink to kegg annotations (AT5G08610)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019427421.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;