| Id Trinity | TRINITY_DN47362_c0_g1_i4 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_499751 |
| Sequence | AAAAAATAGTATTACTTTGCATTGTAAGAGAATATATGAAATTGGTATAAGGGAATTTTAGTAGTAATGTCTTCACAAGAAATAAGTGGTCCGAAAAGAA ACGACAGTCGTTTAATCTTGCTTTCTCTCTGCGCCATTTGTGGTGTGTGTAACTCCTCATGCTATGATTCTTGATTCTTTATACCAAACTTTTCTTCTTA GGTTATCGCAATTTCAATCCTTCTTCTCTCAATTTATTTACTTCACAGATTCAACTGTTTCTTATTTCACTGCTACTGCACCCAACAAATTGAATTCAAC CACTGGTAAATTCTTTTCATTCTATCGTTCTCTTCATTTAGGGTTTTTAGGTTCTGATTCTCGAATTGAATTTTGTTTCCTCTTTATTTTTGAAATTTGA TTTCTATGTTGATGTTTTAGCTTGTTTGTGGACATTGGCGATTGCTCAAGAAATTTATCACTGCCTAAATTTATGTGAATTTCTCTTTTCATGGTTTTTT TGTTTGTTATTGTAATTACAATAGTATGTTTTTTAATTTATGAATAAATTTGTTTACGAGAAGATTATATGGAGTGTAAATTTAGCAAGAGGTAGATAAA TCCTACTATGAAAGTAAATATTGGAGATTATACCATACTACAAGTTAATAAATTTAAGTATCTTGGGTCAATCCATAAAATATGACGAAAATTGATGGAG ATGTAAACAATAAAATTCAAGGAGGGTGAATGAAATGATGGGATGCATCAAGTGTCATATGTGATATAAAAGTTCTACTCAAACATAAAGGAGATTTTTA CCGCACAACTCTAATATACAAAATGTTATATTATATTGAACATTGGGCAATAACAGGTTAATAAGAGATTAAACTCAATGTAGCATATTTGAAAACTGTT 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| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_151998; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_499751
| Blastp | DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 26 from Arabidopsis with 32.38% of identity |
|---|---|
| Blastx | DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 26 from Arabidopsis with 32.38% of identity |
| Eggnog | purine NTP-dependent helicase activity(COG0513) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT5G08610) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453082.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |