Ll_transcript_477060

• Id Trinity: TRINITY_DN47420_c5_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_477060
• Sequence: AGTTGATGTTGTTTTCTCTTTCTTTTCTTATATTATCAAATAAAATTGTACAATTTTTCTTGCTTTTGGTCGCACTTATGTCCCCATCCCATTACATTTT TGCATTAGTGAAACGAATTGTTTTTTATTTTTCTTTTCACCAACTTAATAGCTTTTCATAGGTAAATATCAATTAAAAATTCCCAAAATTCAACATATTA GGAGGAGAAAGCATTGATTTATTTAGATAAAAGGCAGTCGATAGAAACATCATTATAAAATCGTAGCTTAGGAATTTAATTATTTGAAGAATGCAATGCT ATTAGTTGAAGTTTAACTATGCAAAAATTTGTCACTTTGAAATATCAATTTTGTTATTTATCATGATTATATTTGTTTAACTTCAACAGTATATTGAGAG AGCCCCAGAGGATGGATGGTTGGACAGTGAATTCTATCAATCTGGAAATAAATCAGCCATATTGTTTGGTCCGAAATTCTTATCCTCCAAAATCTACCAA CTCTCCCCTACTGAGGTAATTTCATCATTTTACAACTACTTCCTTAATGAATTGGGGTAAGAGCTGATCTTGGATTGGCTTGGGTGGGAACCACTTTGAT GCTTAAGTTAGTATAAATGTATGCTCTCGAGAGAAATGTTCTATGACCATTACAGGCCCCATGACTTTATCATTTTCAGGTTGATCCATATTCCTCTAGG TTTAGACTTTAGTAACTTAATATGGGATTCTCTTTGGTACGGCGTGAGTATGTTGTATACAATATATTATTACCTGTCAAAGTATTGATATATTAGAGGT ATACTTAGTTAATATGTCTCATATGCTCTTTATAATTATATTATTATGCTTCACTATTAATTAATAATATATTTAAAAATATGAGAATAAAATATCTCCT TATATAAGGAGATAAGTTATCTCCTCCTGTCAGTGAAATTATGACATGTGTCATGTTTCATAATTTTTATAAAAACATTTTTAAATATAAACAAATAAAT TATCCCATAGAAGGAAAATTTAAGGAGATATATTATTTTCTTAAAATATTTTATTTTTACTTTCTTTGATTTAATTCAATAGAAGGAAAACATATTTTAG TCTATCCAAATAAGCTCATCATCACTCGGTATCCAAATATCACATCCTATCAAAACTTAATTTCATTCAAATCCTAATTCATCATCTTCTTCATTGGTTC CGTGGGGGTATTTCCCCTTTTCTCCTCTCCCCTTTCTCTATTTTTTGTTAGGACTATCAGCCTCCTTTTCGATCATATGCCATTGGTGGAGTTGTAACAA TGAATGTATGACAAATTGAAGCTTAGGGATAAGGAAATGATAACTTGTTTTATGGTTTGCTTGGGACTAGGTATCAATACCCAAAACATGGTGTATTAGT TTACAAAAGCGTACTGTGAATCGATACTCACAAATTGATTCGGGTTTCCCGACCAAACCAATGAATTTGGTTTCTATGGTTTTGACTACCTCTAACGTGT GAGCAATGTGACTCTCTACTATTGAGGTGGCGTGACCTTGTCTTTGGGTGAATGAAGGTTGTCTTTGTGTTATACGCTAGCCGAGTGATTTAAATTGTGG CCCAACGTAATATTGCGACCGCATAACACCACAATTGCAGTGTAATTTTGAATCACAACGATGTGGCCGCATCGGCTGCAATGTAACCGCATTGGGCCGT ATCAGACCGTATTTGGACCGCATCAATCCGCATCGAATTCAAAAATAGGTTTTTGTTAGTTATAAAATAATTTGCACTATAATGACCGCAATCCACGTCG CAACGACCACAATAATCGTAATCACAGTCACCGTAACCATTACCGCATTTGGGACCGCAACTAAATGTCATTTAAAACACTACGCTGGCCTTTGGGCAAT AATCACAGTTGTGTGGACCGAATCTTGTCTGCCCTGTTATTGGTATTAATCAAGTGACCGGCCGATATTTTAATGTTTTTGGTTTGATTTAAGCATATGA CACGATCTCTACACAAAAATCCAATTCGCTGGATGGAAAAGTCTTGTTACTTTAATATTATTCCATTGAACTTTCTTTTTCACTTGAAACTTAATAACTT CAATTTATCTATTTTTAGGATCTCGAACTAGCCAAGATTTTGCTTAGGCCAGGGTCACTCTTTGTGGAAGACTTGTCTCAAGAAAACAACTACTTCAAAC AAGGATATGGGTCCGTTCCACGAGCCTTTATCACATGTAATGAGGACCTTGGAATTTCATTGGAATTTCAGCTGTGGATGATCCAAAATGCTGGTATTAA TGACGTGGAGGAGATCAAAGGCGCAGATCATATGGCCATGCTTTCCAAGCCACAAGAACTTTGTGATTCTCTCTTGCTAATAGCTAGTAAATACGAATAA ATTCATGAAGAAGGTTCCCTACTAAAAAAAAGTGTTTATCTGGTAGCATGTCAAGACTCAAGAGTAAAATAATATTTGATAAAAAATCAATCAATTTGGA TGAATGATGGATATGTTTGTCTTAATATATTGGTTTTTAATTAAAGCAAAATTTGTGAGTGTAGAATTTTCTTATACTAAATTGATCATAAACCAGTGTA ATGTATAAACACTAGAGATATATATTAGGAAATTAGAGTCTGCTACACCCAAGTGTGTCGGAAAGCATACAGACAATTAGTGAAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_152446;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_477060

FPKM

• PAB: 2.1
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.6
• PS2: 0
• PS3: 0.6
• PW1: 0.1
• PW2: 0.1
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_477060

• Blastp: -
• Blastx: Salicylic acid-binding protein 2 from Nicotiana with 57.61% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (107791137)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019446743.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;